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Programme 3 : Gestion durable des productions ostréicoles : les apports de la génétique. Convention 2000 RPC-A-530 Ifremer - Région Poitou-Charentes ArchiMer
Boudry, Pierre; Huvet, Arnaud; Fabioux, Caroline; Lapegue, Sylvie; Heurtebise, Serge; Ledu, Christophe; Blouin, Frederic; Phelipot, Pascal; Gerard, Andre.
L'étude de la variabilité génétique de l' huître creuse Crassastrea gigas est un point essentiel dans la mise en place de programmes de gestion des ressources génétiques et de sélection chez cette espèce. C. gigas, originaire du Japon, a été introduite dans de nombreuses régions du monde et représente aujourd'hui plus de 95 % de la production mondiale d' huîtres. Introduite en France au début des années 1970 pour remplacer l' huître portugaise Crassostrea angulata, c'est aujourd 'hui une ressource de première importance pour notre région. Malgré la maîtrise du cycle de reproduction de l'espèce et son importance commerciale, elle n' a pas été génétiquement améliorée et on peut donc considérer les stocks comme « sauvages» ou « non domestiqués ». De plus, la...
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Ressources génétiques; Différenciation génétique; Hybridation; Anomalies chromosomiques; Huîtres creuses; Crassostrea gigas; Crassostrea angulata.
Ano: 2000 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00044/15564/12955.pdf
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Optimization of triploid induction by the use of 6-DMAP for the oyster Crassostrea gigas (Thunberg) ArchiMer
Gerard, Andre; Naciri, Yamama; Peignon, Jean-marie; Ledu, Christophe.
A novel method using 6-dimcthylaminopurinc (6-0MAP) has recently been demonstrated to be a good triploid inductor for bivalve molluscs. The effects of 6-DMAP concentration, timing of treatment after fertilization and treatment duration on survival and triploid induction of Crassostrea gigas (Thunberg) embryos were examined. An influence of sperm concentration was also detected and discussed. Survival to D-stage was inversely related to 6-DMAP concentration and the percentage of triploids was shown to be 6-DMAP dose dependent. Two optimal moments for treatment application were determined corresponding to extrusions of the first and second polar bodies. Optimal treatment of 450 µmol/l 6-DMAP beginning 15 min after fertilization over a 10 min period yielded...
Tipo: Text Palavras-chave: Genetic; Triploid induction; Crassostrea gigas; 6 DMAP; Triploid; Oysters.
Ano: 1994 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/1994/publication-3198.pdf
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CAPRETAR : Etude comparative des caractéristiques cytogénétiques et des performances de survie de naissains sauvages issus du CAPtage PREcoce ou TARdif ArchiMer
Benabdelmouna, Abdellah; Hemissi, Issam; Bodin, Stephane; Robert, Stephane; Ledu, Christophe; Laporte, Philippe.
L'action de recherche CAPRETAR (CAptage PREcoce ou TARdif: 2009-2010) a été réalisée dans le cadre du Contrat de Plan Etat Région - Poitou Charentes (CPER-PC 2007- 2013) développement durable des Pertuis Charentais. Cette action, s 'inscrit dans le cadre d 'un lien direct qui existerait entre la nature précoce/tardive d 'un captage naturel et la qualité des naissains de l'huître creuse C. gigas qui en sont issus (qualité génétique : « R » résistante ou « S » sensible et qualité génomique : taux des aneuploïdies et des dommages à l'ADN). L'objectif de cette action vise à estimer durant l 'année (2010) les performances relatives de survie de naissains issus d 'un captage précoce ou tardif réalisé l'année précédente (2009). Les résultats escomptés visent à...
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Cytogénétique; Captage; Reproduction; Huîtres creuses; Crassostrea gigas.
Ano: 2011 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00062/17283/14794.pdf
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Chromosome loss in tetraploid families of the Pacific oyster Crassostrea gigas ArchiMer
Mccombie, Helen; Lapegue, Sylvie; Cornette, Florence; Ledu, Christophe; Boudry, Pierre.
Alterations of chromosome number have been observed in the somatic tissue of Crassostrea gigas diploids and artificial polyploids bred in this species. Tetraploid animals with lower chromosome counts in some or all of their somatic tissue are considered undesirable as parents either for commercial triploids (produced via a cross with diploids) or for tetraploid breeding because (1) they may confer the tendency to lose chromosomes and revert to lower ploidy levels to their offspring or (2) their offspring could have a lower ploidy directly because of potential links between somatic and gametic chromosome loss. The present study evaluated the phenomenon in bi-parental tetraploid families bred from parents of differing ploidy quality, including a...
Tipo: Text Palavras-chave: Tetraploid; Chromosome; Genetic; Crassostrea gigas; Oyster.
Ano: 2003 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2003/acte-3435.pdf
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Historique, expériences en cours et perspectives du programme de sélection de l'huître plate Ostrea edulis pour la résistance à la bonamiose ArchiMer
Barre, Marc; Naciri, Yamama; Boudry, Pierre; Goyard, Emmanuel; Launey, Sophie; Cochennec, Nathalie; Heurtebise, Serge; Ledu, Christophe; Phelipot, Pascal; Gerard, Andre.
The Aquaculture and Pathological Genetics (GAP) laboratory at La Tremblade has been monitoring three populations of European flat oyster since 1985 or 1989 under selection for higher survival rates in the presence of the parasite Bonamia ostrea. One selection cycle (1985 population) or two (1989 populations) were carried out by mass selection by placing the oysters for several years in a highly infested zone, and then harvesting spawns from survivors.
Tipo: Text Palavras-chave: Huîtres plates; Génétique; Selection génétique; Ostrea edulis.
Ano: 1997 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/1997/acte-3244.pdf
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REGEMO Réseau Génétique Mollusques. Compte rendu de la réunion des 13 et 14 décembre 1993 - Nantes ArchiMer
Gerard, Andre; Naciri, Yamama; Peignon, Jean-marie; Ledu, Christophe; Phelipot, Pascal; Baud, Jean-pierre; Nourry, Max; Haure, Joel; Coatanea, Denis; Oheix, Jocelyne; Vercelli, Catherine; Chabirand, Jean-michel; Borel, Michel; Maurer, Daniele; Heurtebise, Serge; Garnier, Jacqueline; Martin, Anne-genevieve; Tige, Gilbert; Mazurie, Joseph; Langlade, Aime.
Cette réunion des membres du Réseau Génétique Mollusques avait pour objet de faire un bilan provisoire des actions en cours et surtout de mettre en place les protocoles et les calendriers du début de l'année 1994. La première demi-journée a été réservée à un exposé de Yamama NACIRI sur les bases de la Génétique Quantitative et ses applications dans le cadre des programmes de sélection des mollusques.La deuxième demi-journée a été consacrée au bilan des actions de 1993. Les représentants de chaque site, intervenant dans une opération du réseau en 1993, ont fait une présentation orale de leurs résultats. Un résumé de chaque intervention vous est fourni dans ce document. Il est important de souligner que tous ces bilans sont provisoires, en premier lieu parce...
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Sélection génétique; Huître plate; Ostrea edulis; Croissance; Génétique population.
Ano: 1993 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00049/15982/13425.pdf
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Essai d'acclimatation de Crassostrea virginica et performances biologiques comparées avec Crassostrea gigas (2ème partie) ArchiMer
Gerard, Andre; Naciri, Yamama; Peignon, Jean-marie; Ledu, Christophe; Phelipot, Pascal; Baud, Jean-pierre; Heurtebise, Serge; Nourry, Max; Renault, Tristan; Cochennec, Nathalie; Zanette, Yvan; Blachier, Philippe.
Deuxième volet du programme d'essai d'acclimatation de l'huître américaine Crassostrea virginica, ce rapport présente les actions et les résultats de l'année 1993 qui a été consacrée au suivi des performances comparées de croissance des populations de C. gigas et C. virginica produites en 1992, ceci en trois sites différents: • dans le bassin de Marennes-Oléron en claire et sur estran, à la station IFREMER de Bouin en élevage intensif, au CREAA sur l'Ile d'Oléron en marais extensif. Au terme de cette seconde année d'étude, il est d'ores et déjà possible d'affirmer que que la souche anglaise de C. virginica étudiée ne présente pas de caractéristiques de croissance susceptibles de la rendre compétitive par rapport au témoin Crassostrea gigas et cela d'autant...
Tipo: Text Palavras-chave: Mollusques; Acclimatation; Crassostrea virginica; Crassostrea gigas; Génétique; Pathologie.
Ano: 1994 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00077/18846/16419.pdf
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Diversité et différentiation génétique chez l'huître plate européenne : de la population à l'individu (Actes) ArchiMer
Boudry, Pierre; Launey, Sophie; Diaz-almela, A.; Naciri-graven, Yamama; Ledu, Christophe; Mira, S.; Taris, Nicolas; Bonhomme, Francois; Lapegue, Sylvie.
PCR-based DNA markers enable the study of diversity and differentiation of marine organisms at different stages of their life cycle. Our study of European fiat oyster (Ostrea edulis) populations aimed to describe their spatial and temporal dynamics. First, we analyzed adults sampled over the natural range of the species. An Atlantic/Mediterranean differentiation pattern was observed. Similar patterns of variation were found using allozymes, microsatellites and mitochondrial DNA, aIl which support an isolation by distance model. High variability was observed in the range of diversity between populations using a mitochondrial marker, a reflection of small effective population sizes in sorne locations. A 10fold quantitative difference was observed in Fst,...
Tipo: Text Palavras-chave: Recruitment; Diversity; Molecular markers; Population genetics; Ostrea edulis; Flat oyster; Dynamique de recrutement; Diversité génétique; Microsatellites; Marqueurs moléculaires; Génétique des populations; Ostrea edulis; Huître plate.
Ano: 2003 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2003/acte-2851.pdf
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Image analysis : a new method for estimating triploidy in commercial bivalves ArchiMer
Gerard, Andre; Naciri, Yamama; Peignon, Jean-marie; Ledu, Christophe; Phelipot, Pascal; Noiret, Christophe; Peudenier, Isabelle; Grizel, Henri.
For determination of ploidy levels in bivalves, three techniques are now routinely used: karyological determination. microfluorimetry and flow cytometry. This paper proposes an alternative technique which is based on determination of the optical density (OD) of stained nuclei using image analysis. A karyological and image analysis comparative experiment conducted on juveniles of Crassostrea gigas (Thunberg) and Ruditapes philippinarum (Adam & Reeve) is described and highlights the advantages of the image analysis technique. Initially developed on C. gigas and R. philippinarum, the image analysis method was easily extended to other bivalve species and to different developmental stages, as demonstrated by two experiments conducted on Ostrea edulis (L.)....
Tipo: Text Palavras-chave: Estimation bivalve triploidy; Image analysis; Triploid; Genetic; Crassostrea gigas; Oysters.
Ano: 1994 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/1994/publication-3200.pdf
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Acclimatation de nouvelles espèces d'huîtres creuses du genre Crassostrea: hybridation et conservatoire de souches. Amélioration de la qualité chez l'huîtres creuses Crassostrea gigas par sélection de souches performantes - Contrat de Plan Etat Région Poitou-Charentes 1994-1998 - Convention 97 RPC-R-54 "Génétique" - Rapport année 1997 ArchiMer
Boudry, Pierre; Lapegue, Sylvie; Goyard, Emmanuel; Heurtebise, Serge; Ledu, Christophe; Phelipot, Pascal; Gerard, Andre.
Les objectifs pour l'année 1997 étaient les suivants : • Poursuivre les premières reproductions des espèces pour lesquelles nous disposons de géniteurs GO. L'objectif est toujours de limiter le stockage d'animaux importés en produisant une descendance simultanément à des témoins C. gigas qui serviront de comparaison. • Tenter des hybridations inter-spécifiques des différents taxons présents au sein du conservatoire en fonction des connaissances disponibles dans la littérature sur ce sujet (voir pour revue Gaffney et Allen, 1993). • Importer de nouvelles souches ou espèces. Élargir la gamme des espèces présentes au sein du conservatoire de souches (les capacités d'accueil de la salle de quarantaine étant limitée).
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Génétique des Populations; Acclimatation; Hybridation; Marqueurs génétiques; Sélection génétique; Crassostrea gigas.
Ano: 1997 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00044/15519/12906.pdf
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Induced triploidy in the European clam, Ruditapes decussatus (L.) and performance of triploid larvae ArchiMer
Gerard, Andre; Naciri, Yamama; Noiret, Christophe; Ledu, Christophe; Peignon, Jean-marie.
For the first time, effective treatments using cytochalasin B were developed to induce triploidy in the European clam, Ruditapes decussatus (L.). The percentage of triploid embrios was assessed by karyological or image analysis. Two treatments (O.5 or 1 mg of cytochasin B (CB per ml of dimethylsulfoxide in 1 l of sea water) were applied at different times after fertilization (10 to 25 mn), for two different periods (15 and 20 min). Best results were obtained for a CB concentration of 1 mg/l. When treatment was applied 15 min after fertilization for a 20 min period, 94% and 95% of triploid embryos were obtained in two repeated experiments. At metamorphosis, the treated larvae appeared to be no smaller than the control larvae in all experiments. Thowever, in...
Tipo: Text Palavras-chave: Genetic; Ruditapes decussatus; Clam; Induced triploidy.
Ano: 1994 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/1994/publication-3208.pdf
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Etude de la CINétique et DIffusion de la MORtalité (CINDIMOR) chez les juvéniles de l'huître creuse Crassostrea gigas ArchiMer
Benabdelmouna, Abdellah; Guyader, Tanguy; Ledu, Christophe; Laporte, Philippe; Degremont, Lionel.
Depuis son introduction en France, l’huître creuse du Pacifique Crassostrea gigas subit des épisodes répétés de mortalité estivale touchant principalement les juvéniles. A partir de 2008, un nouveau pallier a été franchi et ces épisodes de mortalité estivale se sont accrus en intensité, touchant jusqu’à 90% des lots. Actuellement, ces mortalités touchent l’ensemble des façades maritimes ainsi que plusieurs pays utilisant des naissains d’origine Française. L’ostréiculture Française est basée sur l’utilisation majoritaire de naissains sauvages issus d’un captage naturel (75 à 80%) réalisé au niveau des bassins d’Arcachon et de Marennes Oléron en complément avec l’utilisation de naissains, principalement triploïdes, produits par diverses écloseries privées...
Tipo: Text Palavras-chave: Huître creuse; Crassostrea gigas; Mortalité; Condition d'élevage; Historique des lots.
Ano: 2011 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00063/17405/14910.pdf
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Ressources génétiques chez les huîtres creuses : conservatoire de souche et marqueurs moléculaires ArchiMer
Boudry, Pierre; Heurtebise, Serge; Collet, Bertrand; Cornette, Florence; Ledu, Christophe; Phelipot, Pascal; Gerard, Andre.
The cupped oyster strain bank was created at Ifremer at La Tremblade in 1992. It was funded by the Poitou-Charentes regional council. Its goals were: 1. to study the intra- and interspecific genetic differentiation within the genus Crassostrea. 2. to study acclimatization potential of foreign oysters in French waters in order to identify species that could replace Crassostrea gigas in case of a major disease outbreak in C. gigas or in case of a need or desire to diversify shellfish production. 3. to study the possibility of interspecific hybridisation in the genus Crassostrea and hybrid performance.
Tipo: Text Palavras-chave: Saccostrea commercialis; Crassostrea rhisophorae; Crassostrea gasar; Crassostrea sikamea; Crassostrea virginica; Crassostrea rivularis; Crassotea angulata; Crassostrea gigas; Génétique.
Ano: 1997 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/1997/acte-3242.pdf
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Plan de sauvegarde 2012, 3ème édition : synthèse des résultats 2012-2013 ArchiMer
Degremont, Lionel; Maurouard, Elise; Connes, Coralie; Ledu, Christophe; Benabdelmouna, Abdellah.
Depuis 2008 l’ostréiculture française subit des mortalités massives d'huîtres creuses, Crassostrea gigas, qui menacent les approvisionnements en naissains et, par voie de conséquence, fragilise la filière ostréicole. C’est dans ce contexte qu'a été mis en place à partir de 2010 une opération désignée sous le terme plan de sauvegarde. Cette opération sous forme contractuelle fait intervenir l'Ifremer, des écloseries privées, le Ministère en charge de l'Agriculture et le CNC. Le premier plan de sauvegarde (PS1) a été initié en 2010, suivi par un deuxième en 2011 (PS2), et un troisième en 2012 (PS3). L’objectif premier de ce plan est d’apporter une réponse temporaire au déficit de production grandissant en fournissant aux écloseries des animaux présentant une...
Tipo: Text
Ano: 2014 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00229/34041/32448.pdf
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Contrôle de la gamétogénèse des huîtres creuses et plates. Relations "reproduction" et "génétique" ArchiMer
Gerard, Andre; Naciri-graven, Yamama; Boudry, Pierre; Launey, Sophie; Heurtebise, Serge; Ledu, Christophe; Phelipot, Pascal.
At the end of the 1980s, after two decades of aquaculture research in molluscs, Ifremer initiated its first genetic studies. These new studies quickly revealed the limits of knowledge in aquaculture, particularly in terms of controlling oyster reproduction. This presentation attempts to summarize the available information on genetics in aquaculture. In particular, breeding practices in the 1980s involved populations of broodstock, while genetics requires modern techniques where individuals, not just populations, can be identified. Controlling reproduction at the individual level in oysters raises new questions that existing protocols cannot address, especially in terms of controlling sex determination, individual maturity, spawning synchrony, chemical...
Tipo: Text Palavras-chave: Gamètes; Fécondation; Induction ponte; Reproducteur; Conditionnement; Gamétogénèse; Génétique; Reproduction; Crassostrea gigas; Huîtres.
Ano: 1995 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/1995/acte-3210.pdf
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Amélioration de la qualité chez l'huître creuse Crassostrea gigas par sélection de souches performantes - Contrat de Plan Etat Région Poitou-Charentes 1994-1998 - Rapport année 1995 ArchiMer
Boudry, Pierre; Naciri, Yamama; Heral, Maurice; Collet, Bertrand; Bougrier, Serge; Geffard, Olivier; Ledu, Christophe; Phelipot, Pascal; Heurtebise, Serge; Gerard, Andre.
Le programme de recherche présenté ci-dessous est le fruit d'une réflexion conjointe entre généticiens et physiologistes afin de mettre sur pied un ensemble d'expériences permettant d'étudier les bases génétiques de la variabilité des caractères impliqués dans la croissance chez l'huître creuse, Crassostrea gigas.
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Sélection génétique; Génétique des populations; Croissance; Crassostrea gigas.
Ano: 1995 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00044/15518/12905.pdf
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Acclimatation de nouvelles espèces d'huîtres creuses du genre Crassostrea : hybridation et conservatoire de souches. Contrat Région Poitou-Charentes 1999 - Convention 99 RPC-A-203 "Génétique" ArchiMer
Boudry, Pierre; Heurtebise, Serge; Lapegue, Sylvie; Ledu, Christophe; Phelipot, Pascal; Gerard, Andre.
Dans le cadre du plan Etat-Région 1994-1998, un programme de conservatoire de souches a été initié au Laboratoire IFREMER de La Tremblade. Ce conservatoire a pour objectif d'acclimater différentes espèces ou souches d'huîtres creuses (genres Crassostrea et Saccostrea) afin d'acquérir des connaissances sur ces espèces et d'évaluer l'intérêt qu'elles pourraient présenter pour l'ostréiculture locale. L'importation d'espèces étrangères sur les côtes françaises est désormais strictement réglementée: la dissémination d'une nouvelle espèce peut se révéler néfaste d'un point de vue écologique et nuire aux productions existantes. De plus, ces huîtres peuvent être porteuses de pathogènes qui, s'il venaient à se répandre dans le milieu, pourraient toucher les stocks...
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Acclimatation; Croisement; Crassostrea gigas; Crassostrea ariakensis; Crassostrea sikamea; Hybridation.
Ano: 1999 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00044/15514/12901.pdf
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Plan de sauvegarde 2011 : synthèse de résultats 2011-2012 ArchiMer
Chavanne, Herve; Maurouard, Elise; Yonneau, Caroline; Heroin, Debora; Ledu, Christophe; Degremont, Lionel; Benabdelmouna, Abdellah.
Afin de permettre l’approvisionnement partiel des établissements ostréicoles en naissain « à survie améliorée », un protocole d’approvisionnement partiel de sauvegarde (PSI) a été mis en place en 2010 entre le CNC, les CRCs, les écloseurs et l’Ifremer afin de fournir aux ostréiculteurs du naissain présentant les meilleures chances de survie face aux mortalités estivales. Il avait ainsi été décidé que des écloseries privées produiraient du naissain triploïde « à survie améliorée » en 2010 à partir de géniteurs, femelles diploïdes et mâles tétraploïdes, sélectionnés et fournis par Ifremer. Sur la base notamment des recommandations des Assises de la Conchyliculture, l’opération a été reconduite en 2011 (PSII) et 2012 (PSIII). Suite aux productions réalisées...
Tipo: Text Palavras-chave: Mortalités; Crassostrea gigas; Huîtres creuses; Triploïde R; Sélection Génétique.
Ano: 2013 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00143/25412/23563.pdf
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Acclimatation de nouvelles espèces d'huîtres creuses du genre Crassostrea: hybridation et conservatoire de souches. Amélioration de la qualité chez l'huître creuse Crassostrea gigas par sélection de souches performantes - Rapport année 1996 ArchiMer
Boudry, Pierre; Naciri, Yamama; Collet, Bertrand; Cornette, Florence; Heurtebise, Serge; Ledu, Christophe; Chollet, Bruno; Phelipot, Pascal; Gerard, Andre.
Les objectifs pour l'année 1996 étaient les suivants: Poursuivre les premières reproductions des espèces pour lesquelles nous disposons de géniteurs GO. L'objectif est toujours de limiter le stockage d'animaux importés en produisant une descendance simultanément à des témoins C. gigas qui serviront de comparaison. Tenter des hybridations inter-spécifiques des différents taxons présents au sein du conservatoire en fonction des connaissances disponibles dans la littérature sur ce sujet (voir pour revue Gaffney et Allen, 1993). • Importer de nouvelles souches ou espèces. Élargir la gamme des espèces présentes au sein du conservatoire de souches (les capacités d'accueil de la salle de quarantaine étant Limitée).
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Acclimatation; Hybridation; Crassostrea; Sélection génétique; Saccostrea commercialis.
Ano: 1996 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00044/15516/12903.pdf
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A complementary method for production of tetraploid Crassostrea gigas using crosses between diploids and tetraploids with cytochalasin B treatments ArchiMer
Mccombie, Helen; Ledu, Christophe; Phelipot, Pascal; Lapegue, Sylvie; Boudry, Pierre; Gerard, Andre.
We present a new method to produce tetraploid Crassostrea gigas by cytochalasin B inhibition of polar body 2 expulsion in diploid females crossed with tetraploid males. This offers a means of direct introgression of genetic characters from selected diploid to tetraploid lines, avoiding a triploid step. Offspring larval ploidy shifted over time and depended on size, with tetraploids more frequent among the smaller larvae and triploids among the large. Viable tetraploids were found at 4 and 6 months, indicating the technique was successful. The possibility that gynogenesis occurred was tested by microsatellite analysis to confirm the presence of paternally inherited alleles. These were present in all animals of the 2n x 4n + CB (female first) cross. However,...
Tipo: Text Palavras-chave: Oyster breeding; Gynogenesis; Polar body; Cytochalasin B; Polyploidy; Crassostrea gigas.
Ano: 2005 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2005/publication-632.pdf
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