SABIIA - Sistema Aberto e Integrado de Informação em Agricultura (Sabiia)

Reis,Ricardo Luis dos; Muniz,Joel Augusto; Silva,Fabyano Fonseca e; Aquino,Luiz Henrique de.

Para disponibilizar um sistema de fornecimento de dados que objetivando-se subsidiar pesquisas de Melhoramento Genético Animal direcionadas à comparação de metodologias de avaliação genética, foi avaliado o comportamento da variância genética aditiva de populações selecionadas e não selecionadas, por seis gerações sucessivas, via simulação Monte Carlo. Por meio de um modelo genético aditivo, foram simuladas populações de 40 animais (20 machos e 20 fêmeas), sob seleção e acasalamento aleatório. Da geração zero até a quinta geração notou-se na população selecionada uma redução de 44,4% na variância genética aditiva, devido a um aumento de 11,58% no coeficiente de endogamia. Na população não selecionada a redução da variância genética aditiva foi menor...

Estudo do tamanho de parcelas experimentais em povoamentos de Eucalyptus grandis Hill , usando parcelas lineares

Palavras-chave: Modelo genético aditivo; Simulação Monte Carlo; Variância genética aditiva; Software R.

Ano: 2009

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1413-70542009000100039

Muniz,Joel Augusto; Aquino,Luiz Henrique de; Simplício,Eustáquio; Soares,Antonio Rezende.

Com o objetivo de determinar o tamanho ótimo de parcelas experimentais para Eucalyptus grandis Hill, estimou-se o coeficiente de regressão de Smith, através do método de Hatheway e Williams, para parcelas lineares, a partir de um ensaio em branco com seis anos de idade, instalado no município de Paraibuna, São Paulo. O método considerou as correlações entre as estimativas das variâncias usadas para estimação do coeficiente de heterogeneidade do solo, ponderando os logaritmos das estimativas das variâncias pelos elementos da matriz de informação. As estimativas das variâncias reduzidas à unidade básica foram obtidas através dos componentes de variância associados à análise de variância de um modelo aleatório em classificação hierárquica. O tamanho ótimo da...

Ajuste de modelos de platô de resposta para a exigência de zinco em frangos de corte

Palavras-chave: Coeficiente de heterogeneidade do solo; Tamanho ótimo de parcelas lineares; Número de repetições; Diferença ente médias.

Ano: 2009

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1413-70542009000400009

Rezende,Douglas Messias Lamounier Camargos; Muniz,Joel Augusto; Ferreira,Daniel Furtado; Silva,Fabyano Fonseca e; Aquino,Luiz Henrique de.

Com este trabalho, objetivou-se estudar a técnica platô de resposta utilizando modelos de regressão segmentada para avaliar sua aplicação no estudo da exigência de Zn em frango de corte. Foram utilizados os dados de uma pesquisa com frangos de corte envolvendo um experimento fatorial 2 x 2 x 9, dois experimentos, dois sexos e nove doses de zinco na ração, considerando 8 repetições. As doses de Zn estudados foram: 0, 15, 30, 45, 60, 75, 90, 105, 120 ppm . A variável avaliada foi o teor de Zn na tíbia em ppm. Foram utilizadas rotinas no procedimento não-linear (PROC NLIN do SAS®) para estimação dos parâmetros, utilizando-se as médias da variável resposta nas diversas doses. Dois modelos não-lineares (MNLE1 e MNLE2) e o Modelo Polinomial Quadrático (MPQ),...

Análise da curva de crescimento de machos Hereford

Palavras-chave: Aves de corte; Modelos não-lineares; Platô de resposta.

Ano: 2007

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1413-70542007000200030

Mazzini,Ana Rita de Assumpção; Muniz,Joel Augusto; Aquino,Luiz Henrique de; Silva,Fabyano Fonseca e.

Para estudar a função de melhor ajustamento ao crescimento de bovinos Hereford, foram utilizados dados de 160 machos, ajustando-se as funções de Brody, Gompertz, Logística, Richards e von Bertalanffy. A estimação dos parâmetros para modelos de regressão não-linear foi feita pelo método dos Quadrados Mínimos Ponderado. Para isso, utilizou-se o procedimento MODEL do software Statistical Analysis System (SAS). Foram obtidos ajustes de curvas individuais para os animais em dois diferentes modelos: não-ponderado e ponderado pelo inverso da variância dos pesos, com o objetivo de levar em consideração a heterogeneidade das variâncias. A comparação entre os modelos foi feita pela interpretação biológica dos parâmetros e dos avaliadores da qualidade de ajuste...

Degradability study of neutral detergent fiber of coast cross (Cynodon dactylon x Cynodon nlemfunensis)

Palavras-chave: Regressão não-linear; Heterogeneidade de variâncias; Curva de crescimento.

Ano: 2003

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1413-70542003000500019

Savian,Taciana Villela; Muniz,Joel Augusto; Aquino,Luiz Henrique de; Banys,Vera Lúcia; Ferreira,Daniel Furtado.

The objective of this work was to fit the degradation model proposed by Orskov & McDonald (1979) to data of an in situ degradability trial. Neutral detergent fiber degradations (NDF) of coast cross grass (Cynodon dactylon x Cynodon nlemfunensis) were submitted to twelve cutting ages (30, 60, 90, 120, 150, 180, 210, 240, 270, 300, 330 and 360 days) in a complete block design. At each cutting age, NDF degradation was investigated using nine incubation times (0, 3, 6, 12, 24, 48, 72, 96 and 120 hours) in a split-plot design, taking cutting age as main plots and incubation time as subplots. Each plot comprised a non-lactating cow with a permanent ruminal fistula. Variances of the parameter estimates were also obtained, as well as expressions for the...

Curvas de crescimento e influência de fatores não-genéticos sobre as taxas de crescimento de bovinos da raça Nelore

Palavras-chave: Coast cross; Degradability model; Fitting quality; Non-linear regression.

Ano: 2007

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1413-70542007000400035

Silva,Natascha Almeida Marques da; Aquino,Luiz Henrique de; Silva,Fabyano Fonseca e; Oliveira,Antonio Ilson Gomes de.

Avaliou-se a influência de efeitos não-genéticos sobre as taxas de crescimento de bovinos da raça Nelore nas seguintes fases: do nascimento à desmama, 205 dias, (TX1); da desmama a um ano, 365 dias, (TX2); e de um ano ao sobreano, 550 dias, (TX3). Os dados constam de nove pesagens bimestrais do nascimento aos dois anos de idade, observadas entre 1978 e 1993, em 1.138 animais da raça Nelore, sendo 508 machos e 630 fêmeas. Os modelos não-lineares de Brody, Gompertz, Richards, Bertalanffy e Logístico foram ajustados aos dados de peso-idade de cada animal, para a obtenção de pesos em idades de interesse. O modelo de Gompertz foi o que melhor se ajustou aos dados e, a partir dele, foram calculadas as taxas de crescimento. Foram observadas influências...

Análise de dados de gastroenterite hemorrágica canina para identificar fatores de risco por regressão logística

Palavras-chave: Curva de crescimento; Fatores não-genéticos; Nelore; Taxa de crescimento.

Ano: 2004

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1413-70542004000300022

Mendes,Paula Roberta; Muniz,Joel Augusto; Nunes,Hélio Rubens de Carvalho; Chalita,Liciana Vaz de Arruda Silveira; Aquino,Luiz Henrique de.

No presente estudo, ajustou-se um modelo de regressão logística para prever a probabilidade de óbito de cães acometidos por gastroenterite hemorrágica. O modelo Logístico é recomendado para variáveis-resposta dicotômicas em estudo de Coorte. Registraram-se 176 animais censitariamente atendidos com gastroenterite hemorrágica em quatro clínicas veterinárias da cidade de Lavras, sul de Minas Gerais, entre os anos de 1992 e 1999. Após terem sido selecionadas por meio do teste de <img src="/img/revistas/cagro/v28n2/a18img01.gif"> de Pearson ou teste exato de Fisher, ajustou-se o modelo considerando-se as variáveis sexo, idade, diárias de internação e número de atendimentos. A estimação dos parâmetros foi feita pelo método da máxima verossimilhança....

Comparação bayesiana de modelos com uma aplicação para o equilíbrio de Hardy-Weinberg usando o coeficiente de desequilíbrio

Palavras-chave: Gastroenterite hemorrágica; Epidemiologia; Modelo logístico; Razão de chances; Máxima verossimilhança.

Ano: 2004

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1413-70542004000200018

Reis,Ricardo Luis dos; Muniz,Joel Augusto; Silva,Fabyano Fonseca e; Sáfadi,Thelma; Aquino,Luiz Henrique de.

O equilíbrio de Hardy-Weinberg é um dos principais assuntos estudados pela Genética de populações. Neste contexto, o presente trabalho aborda a análise e a comparação bayesiana de modelos utilizando o coeficiente de desequilíbrio (D A). Para isso, realizou-se um estudo de simulação no qual as seguintes distribuições a priori foram consideradas: Dirichlet (modelo 1); beta - função degrau uniforme (modelo 2); uniforme - função degrau uniforme (modelo 3); e as prioris independentes uniformes (modelo 4). Exemplos de aplicação a dados reais de grupos raciais também são apresentados e discutidos. As amostras das distribuições marginais a posteriori para os parâmetros de interesse foram obtidas mediante o algoritmo Metropolis-Hastings, o qual foi implementado no...

Curva de crescimento de novilhos Hereford: heterocedasticidade e resíduos autorregressivos

Palavras-chave: Fator de Bayes; Genética de populações; Simulação de dados.

Ano: 2011

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782011000500016

Mazzini,Ana Rita de Assumpção; Muniz,Joel Augusto; Silva,Fabyano Fonseca e; Aquino,Luiz Henrique de.

O objetivo do presente trabalho foi ajustar os modelos de crescimento Brody, Gompertz, Logístico e Von Bertalanffy a dados de peso e idade de 152 novilhos Hereford através dos métodos dos quadrados mínimos ordinários (QMO), quadrados mínimos ponderados (QMP), quadrados mínimos ponderados generalizados com erros autorregressivos de primeira (QMPG-AR1) e segunda (QMPG-AR2) ordens. Utilizou-se o procedimento MODEL do software Statistical Analysis System (SAS) através das opções WEIGTH e %AR. Os modelos foram comparados pelos seguintes avaliadores de qualidade do ajuste: percentual de convergência, quadrado médio do resíduo, coeficiente de determinação ajustado e erro de predição médio. Os modelos Gompertz e von Bertalanffy ajustados pelos métodos QMP,...

Inferência Bayesiana na análise genética de populações diplóides: estimação do coeficiente de endogamia e da taxa de fecundação cruzada

Palavras-chave: Curva de crescimento; Gado Hereford; Heterocedasticidade; Autocorrelação residual.

Ano: 2005

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782005000200028

Reis,Ricardo Luis dos; Muniz,Joel Augusto; Silva,Fabyano Fonseca e; Sáfadi,Thelma; Aquino,Luiz Henrique de.

Neste estudo, utilizou-se a metodologia Bayesiana para estimar o coeficiente de endogamia e a taxa de fecundação cruzada de uma população diplóide por meio do modelo aleatório de COCKERHAM para freqüências alélicas. Um sistema de simulação de dados foi estruturado para validar a metodologia utilizada. O algoritmo Gibbs Sampler foi implementado no software R para obter amostras das distribuições marginais a posteriori para o coeficiente de endogamia e para a taxa de fecundação. O método Bayesiano mostrou-se eficiente na estimação dos parâmetros, pois os valores paramétricos utilizados na simulação encontravam-se dentro do intervalo de credibilidade de 95% em todos os cenários considerados. A convergência do algoritmo Gibbs Sampler foi verificada, validando...

Abordagem bayesiana da sensitividade de modelos para o coeficiente de endogamia

Palavras-chave: Parâmetros genéticos; Gibbs Sampler; Simulação de dados.

Ano: 2008

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782008000500009

Reis,Ricardo Luis dos; Muniz,Joel Augusto; Silva,Fabyano Fonseca e; Sáfadi,Thelma; Aquino,Luiz Henrique de.

Este trabalho tem como objetivo realizar uma análise bayesiana de modelos, por meio do fator de Bayes, para o desequilíbrio de Hardy-Weinberg. Pretende-se também testar a metodologia por meio da simulação de dados e aplicá-la a um conjunto de dados reais. Na definição dos modelos, utilizaram-se as prioris Dirichlet (modelo 1), Beta - função degrau Uniforme (modelo 2), Uniforme - função degrau Uniforme (modelo 3) e as prioris independentes Uniformes (modelo 4) relacionadas aos parâmetros coeficiente de endogamia e proporção alélica. Foi implementado um algoritmo no software livre R para realizar a amostragem pelo Metropolis-Hastings das distribuições condicionais a posteriori dos parâmetros dos modelos. A convergência das cadeias foram monitoradas por meio...

Comparação bayesiana de modelos de previsão de diferenças esperadas nas progênies no melhoramento genético de gado Nelore

Palavras-chave: Fator de Bayes; Desequilíbrio de Hardy-Weinberg; Simulação de dados.

Ano: 2009

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782009000600018

PAB

Silva,Fabyano Fonseca e; Sáfadi,Thelma; Muniz,Joel Augusto; Aquino,Luiz Henrique de; Mourão,Gerson Barreto.

O objetivo deste trabalho foi realizar uma análise bayesiana de modelos auto-regressivos de ordem p, AR(p), para dados em painel referentes às diferenças esperadas nas progênies (DEP) de touros da raça Nelore publicados de 2000 a 2006. Neste trabalho, adotou-se o modelo AR(2), indicado pela análise prévia da função de autocorrelação parcial. As comparações entre as prioris, realizadas por meio do Fator de Bayes e do Pseudo-Fator de Bayes, indicaram superioridade da priori independente t-Student multivariada - Gama inversa em relação à priori hierárquica Normal multivariada - Gama inversa e a priori de Jeffreys. Os resultados indicam a importância de se dividir os animais em grupos homogêneos de acordo com a acurácia. Constatou-se também que, em média, a...

Abordagem Bayesiana da curva de lactação de cabras Saanen de primeira e segunda ordem de parto

Palavras-chave: Algoritmos MCMC; Dados em painel; Modelo auto-regressivo.

Ano: 2008

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2008000100006

PAB

Silva,Fabyano Fonseca e; Muniz,Joel Augusto; Aquino,Luiz Henrique de; Sáfadi,Thelma.

O objetivo deste trabalho foi utilizar o método Bayesiano no ajuste do modelo de Wood a dados de produção de leite de cabras da raça Saanen. Dois grupos de animais da primeira e segunda lactação foram considerados. Amostras das distribuições marginais a posteriori dos parâmetros do modelo de Wood e das funções de produção derivadas desses parâmetros - pico de produção, tempo do pico de produção, persistência e produção total de leite - foram obtidas pelo algoritmo Gibbs Sampler. As inferências foram feitas em cada população e os resultados mostraram diferenças na taxa de decréscimo da produção após o pico e na persistência, indicando maior produção nos animais de segunda lactação. Realizou-se um estudo de simulação de dados para avaliar o método Bayesiano...

Bayesian analysis of autoregressive panel data model: application in genetic evaluation of beef cattle

Palavras-chave: Gibbs Sampler; Matriz de covariância; Produção de leite.

Ano: 2005

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2005000100004

Scientia Agricola

Silva,Fabyano Fonseca e; Sáfadi,Thelma; Muniz,Joel Augusto; Rosa,Guilherme Jordão Magalhães; Aquino,Luiz Henrique de; Mourão,Gerson Barreto; Silva,Carlos Henrique Osório.

The animal breeding values forecasting at futures times is a relevant technological innovation in the field of Animal Science, since its enables a previous indication of animals that will be either kept by the producer for breeding purposes or discarded. This study discusses an MCMC Bayesian methodology applied to panel data in a time series context. We consider Bayesian analysis of an autoregressive, AR(p), panel data model of order p, using an exact likelihood function, comparative analysis of prior distributions and predictive distributions of future observations. The methodology was tested by a simulation study using three priors: hierarchical Multivariate Normal-Inverse Gamma (model 1), independent Multivariate Student's t Inverse Gamma (model 2) and...