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| Berthe, Thierry; Fechner, Lise; Barraud, Olivier; Dagot, Christophe; Ploy, Marie-cécile; Michault, Manon; Cotelle, Flora; Gaschet, Margaux; Petit, Fabienne. |
| Ces travaux s’inscrivent dans la continuité de la phase VI du programme Piren-Seine (suivis de contamination et d’impacts écotoxicologiques sur l’axe Seine) et s’appuient sur des acquis d’études menées dans la partie aval du bassin de la Seine (GIPSA). Ils visent à évaluer les effets d’une exposition chronique et multiple aux contaminants chimiques et microbiologiques (gènes de résistances aux antibiotiques, intégrons cliniques) sur les communautés microbiennes de biofilms (premier niveau du réseau trophique), et de la couche superficielle des sédiments. L’étude du résistome des biofilms et des sédiments est utilisée pour évaluer l’adaptation des communautés bactériennes, comme un indicateur de vulnérabilité / ou de résilience du milieu, à la contamination... |
| Tipo: Text |
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| Ano: 2017 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00416/52795/53694.pdf |
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| Petit, Fabienne; Clermont, Olivier; Delannoy, Sabine; Servais, Pierre; Gourmelon, Michele; Fach, Patrick; Oberle, Kenny; Fournier, Matthieu; Denamur, Erick; Berthe, Thierry. |
| The aim of this study was to investigate the diversity of the E. coli population, focusing on the occurrence of pathogenic E. coli, in surface water draining a rural catchment. Two sampling campaigns were carried out in similar hydrological conditions (wet period, low flow) along a river continuum, characterized by two opposite density gradients of animals (cattle and wild animals) and human populations. While the abundance of E. coli slightly increased along the river continuum, the abundance of both human and ruminant-associated Bacteroidales markers, as well as the number of E. coli multi-resistant to antibiotics, evidenced a fecal contamination originating from animals at upstream rural sites, and from humans at downstream urban sites. A strong spatial... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Water; Sediment; Pathogenic E. coli; Virulence gene; Shiga toxin. |
| Ano: 2017 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00378/48887/49328.pdf |
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