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Factorial analysis of bootstrap variances of population genetic parameter estimates Genet. Mol. Biol.
Carlini-Garcia,Luciana Aparecida; Vencovsky,Roland; Coelho,Alexandre Siqueira Guedes.
We presented an alternative way to verify the relative contribution to the total variance, of the sources of variation due to populations (P), individuals within populations (I), the (P*I) interaction, and the standard error of the following parameter estimates: total (F) and intrapopulation (f) fixation indices, and divergence among populations (q). The knowledge of this relative contribution is important to establish sampling strategies of natural populations. To attain these objectives, the bootstrap method was used to resample simultaneously populations and individuals, considering different combinations of P and I. This procedure was repeated five times for a given combination of each analyzed data set. For each data set, five estimates of these...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Population structure; Resampling; Natural populations.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572006000200019
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Combining ability of inbred lines of maize and stability of their respective single-crosses Scientia Agricola
Aguiar,Aurélio Mendes; Carlini-Garcia,Luciana Aparecida; Silva,Adelmo Resende da; Santos,Mateus Figueiredo; Garcia,Antonio Augusto Franco; Souza Jr.,Cláudio Lopes de.
The utilization of diallel crosses for identification of superior combinations is a common practice in maize (Zea mays L.) breeding programs. This methodology allows the estimation of the combining ability of genotypes being evaluated. In this work, five inbred lines were evaluated as to their general (GCA) and specific (SCA) combining abilities, by using a complete diallel scheme. The single-crosses produced between these inbred lines were evaluated in seven environments, along with two checks, by using a randomized complete block design. Traits analized were: grain yield, plant height, ear height, ear placement, and prolificacy. A diallel analysis was carried out, following an adaptation of Griffing's method IV, in addition to hybrid stability and...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Diallel crosses; Genotype vs. environment interaction; Grain yield; Adaptability.
Ano: 2003 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-90162003000100013
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Método bootstrap aplicados em níveis de reamostragem na estimação de parâmetros genéticos populacionais Scientia Agricola
Carlini-Garcia,Luciana Aparecida; Vencovsky,Roland; Coelho,Alexandre Siqueira Guedes.
Marcadores isoenzimáticos ou moleculares têm sido empregados em estudos da estrutura genética e do sistema reprodutivo de populações naturais. Parâmetros genéticos populacionais de interesse são estimados, porém, há pouca informação sobre o erro associado a essas estimativas em função dos diferentes níveis de amostragem. Neste trabalho, o método de reamostragem bootstrap foi aplicado sobre locos, indivíduos, populações e indivíduos e populações concomitantemente, em dados de populações naturais. Para os parâmetros índice de fixação total (F ), índice de fixação intrapopulacional ( f ), diversidade entre populações (teta) e taxa aparente de cruzamento (t a) foram obtidos, em função das fontes de reamostragem, os erros associados às estimativas desses...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Estrutura populacional; Genética de populações; Estimação.
Ano: 2001 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-90162001000400021
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Variance additivity of genetic populational parameter estimates obtained through bootstrapping Scientia Agricola
Carlini-Garcia,Luciana Aparecida; Vencovsky,Roland; Coelho,Alexandre Siqueira Guedes.
Studying the genetic structure of natural populations is very important for conservation and use of the genetic variability available in nature. This research is related to genetic population structure analysis using real and simulated molecular data. To obtain variance estimates of pertinent parameters, the bootstrap resampling procedure was applied over different sampling units, namely: individuals within populations (I), populations (P), and individuals and populations simultaneously (I, P). The considered parameters were: the total fixation index (F or F IT), the fixation index within populations (f or F IS) and the divergence among populations or intrapopulation coancestry (theta or F ST). The aim of this research was to verify if the variance...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Population structure; Resampling; Molecular markers; Natural populations; Simulation.
Ano: 2003 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-90162003000100015
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