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Separomics applied to the proteomics and peptidomics of low-abundance proteins: choice of methods and challenges - a review Genet. Mol. Biol.
Baracat-Pereira,Maria Cristina; Barbosa,Meire de Oliveira; Magalhães Júnior,Marcos Jorge; Carrijo,Lanna Clicia; Games,Patrícia Dias; Almeida,Hebréia Oliveira; Sena Netto,José Fabiano; Pereira,Matheus Rodrigues; Barros,Everaldo Gonçalves de.
The enrichment and isolation of proteins are considered limiting steps in proteomic studies. Identification of proteins whose expression is transient, those that are of low-abundance, and of natural peptides not described in databases, is still a great challenge. Plant extracts are in general complex, and contaminants interfere with the identification of proteins involved in important physiological processes, such as plant defense against pathogens. This review discusses the challenges and strategies of separomics applied to the identification of low-abundance proteins and peptides in plants, especially in plants challenged by pathogens. Separomics is described as a group of methodological strategies for the separation of protein molecules for proteomics....
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Sample preparation; Complex protein extract; Subproteomes; Low-abundance proteins; Cell wall proteins.
Ano: 2012 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572012000200009
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Avaliação da concentração de proteínas e da atividade de α-galactosidases nos cotilédones e no eixo embrionário de sementes de Dalbergia nigra durante a germinação Acta Amazonica
Carrijo,Lanna Clicia; Lima e Borges,Eduardo Euclydes de; Rezende,Sebastião Tavares de; Pontes,Cláudia Aparecida; Silva,Aderlan Gomes da; Lopes,Mariana Rocha.
Este trabalho teve como objetivos a quantificação de proteínas e da atividade da enzima α-galactosidase, no eixo embrionário e nos cotilédones, de sementes de Dalbergia nigra (jacarandá-da-bahia) durante a germinação. As sementes foram colocadas para embeber em água por sete dias, sendo retiradas amostras para a avaliação bioquímica e cinética da enzima. A atividade da enzima α-galactosidase aumenta com a embebição das sementes nos dois compartimentos, embora não esteja presente no eixo embrionário de sementes secas. A diferença na atividade da enzima entre os cotilédones e o eixo embrionário foi significativa. O pH 5,5 foi o de máxima atividade para as enzimas de ambos os compartimentos. A temperatura que mais estimulou a atividade da enzima nos...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Enzima; Jacarandá-da-bahia; Bioquímica.
Ano: 2011 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0044-59672011000400004
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