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Use of ridge regression for the prediction of early growth performance in crossbred calves Genet. Mol. Biol.
Pimentel,Eduardo da Cruz Gouveia; Queiroz,Sandra Aidar de; Carvalheiro,Roberto; Fries,Luiz Alberto.
The problem of multicollinearity in regression analysis was studied. Ridge regression (RR) techniques were used to estimate parameters affecting the performance of crossbred calves raised in tropical and subtropical regions by a model including additive, dominance, joint additive or "profit heterosis" and epistatic effects and their interactions with latitude in an attempt to model genotype by environment interactions. A software was developed in Fortran 77 to perform five variant types of RR: the originally proposed method; the method implemented by SAS; and three methods of weighting the RR parameter lambda. Three mathematical criteria were tested with the aim of choosing a value for the lambda coefficient: the sum and the harmonic mean of the absolute...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Crossbreeding; Epistasis; Genotype by environment interaction; Heterosis; Multicollinearity.
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572007000400006
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Contribuição genética ótima aplicada à seleção de ovinos Santa Inês PAB
Santos,Natanael Pereira da Silva; Sarmento,José Lindenberg Rocha; Carvalheiro,Roberto; Campelo,José Elivalto Guimarães; Sousa,Wandrick Hauss de; Filho,Luiz Antônio Silva Figueiredo; Rego Neto,Aurino de Araújo; Biagiotti,Daniel.
Resumo: O objetivo deste trabalho foi avaliar estratégias de seleção simulada pela contribuição genética ótima quanto ao ganho genético, com restrição sobre a coancestria, para a característica peso aos 84 dias idade, em ovinos Santa Inês. As análises foram definidas conforme um algoritmo de evolução diferencial, que otimizou uma função-objetivo composta pelo mérito genético e a coancestria média dos animais candidatos à reprodução. A estratégia definida como ótima indicou a utilização de 19 carneiros, o que resultaria em ganho médio esperado de 1,1259 unidades de desvio-padrão, e coancestria igual a 0,0249 (estratégia 5). Em comparação à seleção com base apenas no valor genético, a estratégia ótima reduziu a coancestria em 12%, e o ganho genético, em...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Coancestria; Endogamia; Evolução diferencial; Ganho genético; Resposta à seleção..
Ano: 2016 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2016000600745
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Estimativas de efeitos genéticos em bezerros cruzados por diferentes modelos e métodos de estimação R. Bras. Zootec.
Pimentel,Eduardo da Cruz Gouveia; Queiroz,Sandra Aidar de; Carvalheiro,Roberto; Fries,Luiz Alberto.
Os objetivos neste trabalho foram comparar estimativas de parâmetros genéticos obtidas por meio de dois modelos - um contendo apenas efeitos aditivos e de dominância e outro que incluiu os efeitos aditivo-conjunto (complementaridade) e epistático - e testar alternativas de critérios objetivos para determinação do coeficiente lambda na aplicação da regressão de cumeeira. Os resultados obtidos revelaram que a escolha de um critério para determinação do coeficiente lambda em regressão de cumeeira depende não apenas do conjunto de dados e do modelo utilizado, mas, sobretudo, de um conhecimento prévio acerca do fenômeno estudado e do significado prático e da interpretação dos parâmetros encontrados. Pelo uso de modelos mais completos para avaliação de efeitos...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Epistasia; Estimação viesada; Heterose; Multicolinearidade; Regressão de cumeeira.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982006000400012
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Optimum contribution selection using differential evolution R. Bras. Zootec.
Carvalheiro,Roberto; Queiroz,Sandra Aidar de; Kinghorn,Brian.
A program to determine optimum contribution selection using differential evolution was developed. The objective function to be optimized was composed by the expected merit of the future progeny and the coancestry among selected parents. Simulated and real datasets of populations with overlapping generations were used to validate and test the performance of the program. The program was computationally efficient and feasible for practical applications. The expected consequences of using the program, in contrast to empirical procedures to control inbreeding and/or to selection based exclusively on expected genetic merit, would be the improvement of the selection response and a more effective control of inbreeding.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Evolutionary algorithms; Genetic response; Inbreeding; Optimization; Selection.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982010000700005
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Dois critérios de seleção na pré-desmama em bovinos da raça Gir. 1. Estimativas de parâmetros genéticos R. Bras. Zootec.
Muniz,Carolina Amália de Souza Dantas; Carvalheiro,Roberto; Fries,Luiz Alberto; Queiroz,Sandra Aidar de.
Dados de 16.592 animais da raça Gir, provenientes do controle de desenvolvimento ponderal da Associação Brasileira dos Criadores de Zebu, nascidos no período de 1978 a 1994, criados em diversas condições de ambiente no Brasil, foram usados para estimar parâmetros genéticos e ambientais das características ganho médio diário do nascimento à desmama (GMD) e dias para atingir 160 kg do nascimento à desmama (D160). As estimativas dos componentes de variância e herdabilidade foram obtidas pelo método da máxima verossimilhança restrita por modelos animais uni-característica. Foram utilizados dois modelos o modelo 1, com grupo de contemporâneos (GC) como efeito fixo e com efeitos genético aditivo de animal e materno, efeito de ambiente permanente materno e erro...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Correlação genética entre efeitos direto e materno; Dias para atingir 160 do nascimento à desmama; Ganho médio do nascimento à desmama; Herdabilidade do efeito direto; Herdabilidade do efeito materno.
Ano: 2005 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982005000300012
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Comparação de critérios de seleção para precocidade de crescimento em bovinos da raça Guzerá R. Bras. Zootec.
Tanaka,Aila Loise Ribeiro; Carvalheiro,Roberto; Fries,Luiz Alberto; Queiroz,Sandra Aidar de.
Objetivou-se com este estudo comparar a seleção com base no ganho médio diário de peso na pré-desmama (GMD) e no número de dias para ganhar 160 kg nessa fase (D160), com e sem correção para efeitos de grupos de contemporâneos (GC), em bovinos da raça Guzerá. Utilizou-se o banco de dados de desenvolvimento ponderal da Associação Brasileira de Criadores de Zebu (ABCZ) para esta raça. A obtenção dos parâmetros e valores genéticos foi feita pelo método da máxima verossimilhança restrita utilizando-se modelo unicaracterístico com equações de modelos mistos. O modelo utilizado foi composto pelo efeito fixo de grupo genético e pelos efeitos aleatórios, genético aditivo direto e de ambiente permanente, além do erro residual. A média para D160 foi de 270,5 dias e...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Dias para ganhar 160 kg na pré-desmama; Ganho médio diário; Média harmônica; Progênie uniforme.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982009000200010
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Efeitos da Heterogeneidade de Variância Residual entre Grupos de Contemporâneos na Avaliação Genética de Bovinos de Corte R. Bras. Zootec.
Carvalheiro,Roberto; Fries,Luiz Alberto; Schenkel,Flávio Schramm; Albuquerque,Lucia Galvão de.
O objetivo deste estudo foi investigar, por meio de dados simulados, o efeito da heterogeneidade de variância residual entre grupos de contemporâneos (GC) sobre as avaliações genéticas de bovinos de corte, e comparar o uso de uma avaliação genética ponderada (R<FONT FACE=Symbol>¹</FONT>Isigmae²) em relação à avaliação que pressupõe homogeneidade de variância (R=Isigmae²). A característica estudada foi ganho de peso pós-desmame corrigido para 345 dias, sendo esta simulada com variância fenotípica de 300 kg² e herdabilidade igual a 0,4. A estrutura de um conjunto real de dados foi utilizada para fornecer os GC e os pais referentes às observações de cada animal. Cinco níveis de heterogeneidade de variância residual foram considerados de forma que...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Acurácia; Consistência; Estimação ponderada; Simulação.
Ano: 2002 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982002000700010
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Acasalamento dirigido para aumentar a produção de animais geneticamente superiores e reduzir a variabilidade da progênie em bovinos R. Bras. Zootec.
Neves,Haroldo Henrique de Rezende; Carvalheiro,Roberto; Cardoso,Vânia; Fries,Luiz Alberto; Queiroz,Sandra Aidar de.
Por meio da utilização de um programa de acasalamento dirigido e de simulação de dados, foram avaliadas e comparadas estratégias alternativas de acasalamento para aumentar a probabilidade de produzir animais superiores e reduzir a variabilidade da progênie em bovinos. Simularam-se 50 populações, cada uma com 4.800 vacas, 160 touros e 4.800 produtos. Para cada vaca e touro simulados, gerou-se uma variável aleatória, seguindo distribuição normal, reproduzindo um índice composto por diferenças esperadas na progênie (DEP) de diferentes características a ser adotado como critério de seleção. As estratégias de acasalamento simuladas foram: AA - ao acaso; AP - associativo positivo; AN - associativo negativo; C20 - associativo positivo para as vacas 20% superiores...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Associativo negativo; Associativo positivo; DEP; Índice; Simulação.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982009000700006
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Uso combinado de sêmen sexado e acasalamento dirigido sobre uma população de bovinos de corte submetida a seleção: estudo de simulação R. Bras. Zootec.
Neves,Haroldo Henrique de Rezende; Carvalheiro,Roberto; Fries,Luiz Alberto; Queiroz,Sandra Aidar de.
Desenvolveu-se um estudo de simulação estocástica com o objetivo de verificar as consequências do uso combinado de acasalamento dirigido e sêmen sexado em uma população de bovinos de corte sob seleção. Simularam-se seis gerações de seleção para três cenários de acasalamento e uso de sêmen sexado. O primeiro cenário foi caracterizado por acasalamento aleatório e uso exclusivo de sêmen convencional. O segundo cenário caracterizou-se pelo uso de acasalamento associativo positivo nas 40% melhores vacas e acasalamento associativo negativo nas demais, sem uso de sêmen sexado. O terceiro cenário seguiu o mesmo procedimento de acasalamento do segundo, combinando-o com uso de sêmen sexado nas vacas submetidas a acasalamento associativo positivo. O acasalamento...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Acasalamento associativo negativo; Acasalamento associativo positivo; Seleção; Simulação estocástica.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982009001200011
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Dois critérios de seleção na pré- desmama em bovinos da raça Gir. 2. Efeito na classificação dos animais R. Bras. Zootec.
Muniz,Carolina Amália de Souza Dantas; Carvalheiro,Roberto; Fries,Luiz Alberto; Queiroz,Sandra Aidar de.
A utilização de dois critérios de seleção na pré-desmama, ganho médio diário do nascimento à desmama (GMD) e dias para ganhar 160 kg do nascimento à desmama (D160), foi estudada, analisando-se informações de 16.592 animais, provenientes do controle de desenvolvimento ponderal da Associação Brasileira dos Criadores de Zebu, nascidos no período de 1978 a 1994. Foram incluídos no modelo o efeito fixo de grupo de contemporâneos e os efeitos aleatórios genético aditivo de animal e materno, de ambiente permanente materno e o erro. A covariância entre os efeitos direto e materno foi considerada igual a zero. As estimativas dos componentes de variância e herdabilidade foram obtidas pelo método da máxima verossimilhança restrita e os valores genéticos preditos...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Dias para ganhar 160 kg; Ganho médio diário; Média harmônica; Parâmetros genéticos.
Ano: 2005 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982005000300013
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