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The Eukaryote Genome Annotation Platform at Genoscope Nature Precedings
Betina M. Porcel; Franck Aniere; Sylvain Bonneval; Benjamin Noel; Jean-Marc Aury; Corinne Da Silva; Olivier Jaillon; France Denoeud; Claude Scarpelli; Jean Weissenbach; Patrick Wincker; François Artiguenave.
The Genoscope annotation workflow for eukaryote genomes relies on evidence from ab initio gene models predictions combined with homology searches, using collections of expressed sequences - full length cDNAs, ESTs or massive-scale mRNA sequences from the same or closely related organisms – proteins or other genomic sequences. Global analysis of these drafts or complete sequences are then combining both approaches in the form of gene prediction data integration using GAZE, capable to identify a majority of the existing gene features. Although of very good quality, gene-modelling remains still tentative at the end of the process. Even though computational predictors are useful on large scale annotation for global genomics analysis, there is no...
Tipo: Poster Palavras-chave: Genetics & Genomics; Bioinformatics.
Ano: 2009 URL: http://precedings.nature.com/documents/3457/version/1
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