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Genetic evaluation for persistency of lactation in Holstein cows using a random regression model Genet. Mol. Biol.
Cobuci,Jaime Araujo; Euclydes,Ricardo Frederico; Costa,Claudio Napolis; Torres,Robledo de Almeida; Lopes,Paulo Sávio; Pereira,Carmen Silva.
A model for analyzing test day records including both fixed and random coefficients was applied to the genetic evaluation of first lactation data for Holstein cows. Data comprising 87045 test-day milk yield records from calving between 1997 and 2001 from Holstein herds in 10 regions of the Brazilian state of Minas Gerais. Six persistency of lactation measures were evaluated using breeding values obtained by random regression analyses. The Wilmink function was used to model the additive genetic and permanent environmental effects. Residual variance was constant throughout lactation. Ranking for animals did not change among criteria for persistency measurements, but ranking changes were observed when the estimated breeding value (EBV) for persistency of...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Genetic evaluation; Persistency of lactation; Rank correlation; Random regression models.
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572007000300009
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Estimation of genetic parameters for test-day milk yield in Holstein cows using a random regression model Genet. Mol. Biol.
Cobuci,Jaime Araujo; Euclydes,Ricardo Frederico; Lopes,Paulo Sávio; Costa,Claudio Napolis; Torres,Robledo de Almeida; Pereira,Carmen Silva.
Test-day milk yield records of 11,023 first-parity Holstein cows were used to estimate genetic parameters for milk yield during different lactation periods. (Co)variance components were estimated using two random regression models, RRM1 and RRM2, and the restricted maximum likelihood method, compared by the likelihood ratio test. Additive genetic variances determined by RRM1 and additive genetic and permanent environmental variances estimated by RRM2 were described, using the Wilmink function. Residual variance was constant throughout lactation for the two models. The heritability estimates obtained by RRM1 (0.34 to 0.56) were higher than those obtained by RRM2 (0.15 to 0.31). Due to the high heritability estimates for milk yield throughout lactation and...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Random regression models; REML method; Genetic parameters; Test-day milk yield; Holstein cows.
Ano: 2005 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572005000100013
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Reliability of breeding values between random regression and 305-day lactation models PAB
Padilha,Alessandro Haiduck; Cobuci,Jaime Araujo; Daltro,Darlene dos Santos; Braccini Neto,José.
Abstract The objective of this work was to verify the gain in reliability of estimated breeding values (EBVs), when random regression models are applied instead of conventional 305-day lactation models, using fat and protein yield records of Brazilian Holstein cattle for future genetic evaluations. Data set contained 262,426 test-day fat and protein yield records, and 30,228 fat and protein lactation records at 305 days from first lactation. Single trait random regression models using Legendre polynomials and single trait lactation models were applied. Heritability for 305-day yield from lactation models was 0.24 (fat) and 0.17 (protein), and from random regression models was 0.20 (fat) and 0.21 (protein). Spearman correlations of EBVs, between lactation...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Breeding value; Correlation; Legendre polynomials; Reliability.
Ano: 2016 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2016001101848
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Estimativas de tendência genética para características produtivas em um rebanho do ecótipo Mantiqueira R. Bras. Zootec.
Silva,Marcos Vinícius Gualberto Barbosa da; Ferreira,William José; Cobuci,Jaime Araujo; Guaragna,Guilherme Paes; Oliveira,Paulo Rogério Palma de.
Os registros utilizados neste estudo foram provenientes das cinco primeiras lactações de 1406 vacas do ecótipo Mantiqueira, filhas de 113 reprodutores, com partos entre os anos de 1952 e 1997. As informações sobre as características produção total de leite (PL), produção de gordura (PG), duração da lactação (DL) e período seco (PS) foram obtidas do NPZGJRA/IZ/APTA/SAA. Com base nas predições dos valores genéticos, para cada característica estudada, estimaram-se os diferenciais de seleção e as tendências genéticas, por meio de quatro trajetórias de seleção: touros pais de touros (SB), vacas mães de touros (DB), touros pais de vacas (SC) e vacas mães de vacas (DC). Os períodos estudados compreenderam os anos de 1952 a 1976, primeiro período, que representou...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Bovino de leite; Diferencial de seleção; Ecótipo Mantiqueira; Método REML; Modelo animal; Tendência genética.
Ano: 2001 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982001000600013
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Efeito da endogamia sobre características produtivas e reprodutivas de bovinos do ecótipo Mantiqueira R. Bras. Zootec.
Silva,Marcos Vinícius Gualberto Barbosa da; Ferreira,William José; Cobuci,Jaime Araujo; Guaragna,Guilherme Paes; Oliveira,Paulo Rogério Palma de.
Foram analisados registros de genealogia de 2070 animais, bem como informações provenientes das cinco primeiras lactações de 1406 vacas do ecótipo Mantiqueira, filhas de 113 reprodutores, com o objetivo de avaliar a freqüência de animais endogâmicos, a média de endogamia por geração e o possível reflexo do aumento da endogamia sobre algumas características reprodutivas e produtivas. As características avaliadas foram idade ao primeiro parto (IPP), intervalo de partos (IDP), produção total de leite (PL) e duração da lactação (DL). Foram usados modelos que incluíam, para PL, IDP e DL, os efeitos fixos de ano-estação de parto; como covariável, a idade da vaca ao parto, em meses, com termos linear e quadrático, além dos efeitos aleatórios de animal, de...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Bovinos de leite; Endogamia; Ecótipo Mantiqueira; Metodologia REML; Modelo animal.
Ano: 2001 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982001000500016
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Persistency of lactation using random regression models and different fixed regression modeling approaches R. Bras. Zootec.
Cobuci,Jaime Araujo; Costa,Claudio Napolis.
Milk yield test-day records on the first three lactations of 25,500 Holstein cows were used to estimate genetic parameters and predict breeding values for nine measures of persistency and 305-d milk yield in a random regression animal model using two criteria to define the fixed regression. Legendre polynomials of fourth and fifth orders were used to model the fixed and random regressions of lactation curves. The fixed regressions were adjusted for average milk yield on populations (single) or subpopulations (multiple) formed by cows that calved at the same age and in the same season. Akaike Information (AIC) and Bayesian Information (BIC) criteria indicated that models with multiple regression lactation curves had the best fit to test-day milk records of...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Breeding value; Legendre polynomial; Selection; Test-day milk yield.
Ano: 2012 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982012000900005
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Genetic associations between reproductive and linear-type traits of Holstein cows in Brazil R. Bras. Zootec.
Almeida,Tatiana Prestes; Kern,Elisandra Lurdes; Daltro,Darlene dos Santos; Braccini Neto,José; McManus,Concepta; Thaler Neto,André; Cobuci,Jaime Araujo.
ABSTRACT This study aimed to estimate heritability, genetic, and residual correlations between reproductive traits such as age at first calving, calving interval, dry period, and first service period and linear type traits measured in Holstein cows born between the years 1990 and 2008 in Brazil. The (co)variance components were estimated by restricted maximum likelihood, using the MTDFREML software. The heritability for reproductive traits and linear-type traits ranged from 0.02 to 0.03 and from 0.07 to 0.40, respectively. Estimates of genetic correlations between reproductive and linear-type traits ranged from -0.23 (top line) to 0.28 (angularity) to age at first calving, from -0.54 (final score) to 0.34 (foot angle) to calving interval, from -0.23...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Age at first calving; Dairy cattle; Genetic parameters; Reproductive efficiency.
Ano: 2017 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982017000200091
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Respostas correlacionadas em características reprodutivas no programa de melhoramento do ecótipo Mantiqueira para produção de leite R. Bras. Zootec.
Silva,Marcos Vinícius Gualberto Barbosa da; Cobuci,Jaime Araujo; Ferreira,William José; Guaragna,Guilherme Paes; Oliveira,Paulo Rogério Palma de.
Por meio de análises bivariadas entre produção total de leite (PL) e idade ao primeiro parto (IDP), ou intervalo de partos (IDP), ou período de serviço (PSERV), objetivou-se com este trabalho estimar parâmetros genéticos, correlações simples e de ordem entre os valores genéticos, bem como as respostas correlacionadas nas características reprodutivas, utilizando-se registros provenientes das cinco primeiras lactações de 1406 vacas do ecótipo Mantiqueira, filhas de 113 reprodutores, com partos entre os anos de 1952 e 1997, pertencentes ao programa de melhoramento do NPZGJRA/IZ/APTA/SAA-SP. Nas análises, foi utilizado o sistema MTDFREML com modelos que incluíam, para as características PL, IDP e PSERV, os efeitos fixos de ano-estação de parto; como...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Bovino de leite; Correlação de ordem; Ecótipo Mantiqueira; Método REML; Modelo animal; Resposta correlacionada.
Ano: 2001 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982001000500015
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Análises da persistência na lactação de vacas da raça Holandesa, usando produção no dia do controle e modelo de regressão aleatória R. Bras. Zootec.
Cobuci,Jaime Araujo; Euclydes,Ricardo Frederico; Costa,Claudio Napolis; Lopes,Paulo Sávio; Torres,Robledo de Ameida; Pereira,Carmen Silva.
Foram utilizados 87.045 registros de produção de leite, na primeira lactação, de 11.023 vacas da raça Holandesa, obtidos nos anos de 1997 a 2001, em diferentes rebanhos distribuídos em dez núcleos do Estado de Minas Gerais. Foram avaliados seis tipos de mensuração da persistência na lactação utilizando-se os valores genéticos da produção de leite, obtidos por meio do modelo de regressão aleatória - MRA. Utilizou-se a função de Wilmink na descrição dos efeitos aleatórios e fixos, pelo MRA. As estimativas de herdabilidade e de correlação genética, para as várias mensurações da persistência na lactação, variaram em decorrência da definição da persistência. As estimativas de herdabilidade para persistência na lactação variaram de 0,11 a 0,27 e as estimativas...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Correlação genética; Herdabilidade; Modelos de regressão aleatória; Persistência na lactação; Produção de leite no dia do controle; Raça Holandesa.
Ano: 2004 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982004000300004
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Inbreeding depression in Holstein cattle in Brazil R. Bras. Zootec.
Silva,Mário Henrique Magalhães Araújo da; Malhado,Carlos Henrique Mendes; Kern,Elisandra Lurdes; Daltro,Darlene dos Santos; Cobuci,Jaime Araujo; Carneiro,Paulo Luiz Souza.
ABSTRACT The objective of this study was to evaluate inbreeding depression in Holstein cows in Brazil, considering their 305-day milk production (MP), age of first calving (AFC), and calving interval (CI). The effects of inbreeding depression on the traits were determined using four regression models (linear, quadratic, exponential, and Michaelis-Menten) about the errors generated by the animal model. The linear model was significant for CI, and the quadratic model was significant for CI and AFC. The Michaelis-Menten and exponential models were significant for MP, AFC, and CI. Inbreeding depression affected MP and CI. Cows with inbreeding coefficient of 15% produced approximately 260 kg less milk than non-inbred cows. A 1% increase in the inbreeding level...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Calving interval; Inbreeding coefficient; Linear models; Non-linear models.
Ano: 2019 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982019000100307
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Curva de lactação na raça Guzerá R. Bras. Zootec.
Cobuci,Jaime Araujo; Euclydes,Ricardo Frederico; Verneque,Rui da Silva; Teodoro,Roberto Luiz; Lopes,Paulo de Sávio; Silva,Martinho de Almeida e.
Os objetivos deste trabalho foram identificar as funções matemáticas que melhor se ajustam à produção de leite de vacas da raça Guzerá, avaliar os efeitos dos fatores de ambiente sobre a forma da curva de lactação e estimar parâmetros genéticos para a produção de leite e para os componentes responsáveis pela forma da curva de lactação. Foram utilizadas 1130 lactações de 583 vacas da raça Guzerá, filhas de 165 touros, com produções abrangendo o período de 1983 a 1997. Os modelos y = a n e-cn, y = a - cn+ ln(n), y = a - cn e y=a e-c n foram os que melhor se ajustaram à curva de lactação das vacas. Pela análise de variância, verificou-se que, os efeitos de rebanho, ano de parto e idade da vaca ao parto influenciaram as características produção de leite total,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Curva de lactação; Funções matemáticas; Fatores de ambiente; Parâmetros genéticos; Raça Guzerá.
Ano: 2000 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982000000500011
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Aspectos genéticos e ambientais da curva de lactação de vacas da raça Guzerá R. Bras. Zootec.
Cobuci,Jaime Araujo; Euclydes,Ricardo Frederico; Teodoro,Roberto Luiz; Verneque,Rui da Silva; Lopes,Paulo Sávio; Silva,Martinho de Almeida e.
O conhecimento das relações genéticas entre os parâmetros da curva de lactação e a produção de leite é importante para a seleção de vacas e de touros. Os registros de produção de leite de 583 vacas da raça Guzerá, filhas de 165 reprodutores, foram usados para estimação dos parâmetros da curva de lactação em dois modelos matemáticos. As informações referentes às produções de leite foram obtidas usando-se a base de dados extraída do Arquivo Zootécnico Nacional, mantido na Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa Gado de Leite). As análises foram efetuadas usando-se o sistema MTDFREML, sob modelo animal que incluiu os efeitos fixos de rebanho-ano-estação de parto e, como covariável, a idade da vaca ao parto, com termos linear e quadrático. Como...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Correlações genéticas; Curva de lactação; Método REML; Modelos matemáticos; Raça Guzerá.
Ano: 2001 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982001000500011
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Genetic parameters for test day milk yield of first lactation Holstein cows estimated by random regression using Legendre polynomials R. Bras. Zootec.
Costa,Claudio Napolis; Melo,Claudio Manoel Rodrigues de; Packer,Irineu Umberto; Freitas,Ary Ferreira de; Teixeira,Nilson Milagres; Cobuci,Jaime Araujo.
Data comprising 263,390 test-day (TD) records of 32,448 first parity cows calving in 467 herds between 1991 and 2001 from the Brazilian Holstein Association were used to estimate genetic and permanent environmental variance components in a random regression animal model using Legendre polynomials (LP) of order three to five by REML. Residual variance was assumed to be constant in all or in some classes of lactation periods for each LP. Estimates of genetic and permanent environmental variances did not show any trend due to the increase in the LP order. Residual variance decreased as the order of LP increased when it was assumed constant, and it was highest at the beginning of lactation and relatively constant in mid lactation when assumed to vary between...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Covariance components; Dairy cattle; Genetic evaluation; Heritability; Selection.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982008000400003
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Genetic parameters for type traits in Holstein cows in Brazil R. Bras. Zootec.
Campos,Rafael Viegas; Cobuci,Jaime Araujo; Costa,Claudio Napolis; Braccini Neto,José.
Data from 26,558 Holstein cows in 802 herds were used to estimate genetic, residual and phenotypic parameters for 22 type traits. The model included the fixed effects of herd-year, period of classification, classifier, stage of lactation and age of cows at calving (covariate) and random genetic and residual effects. Heritability for type traits ranged from 0.10 to 0.39. The genetic variability in these traits suggested the possibility for moderate genetic gains through selection. The phenotypic correlations were moderated, mainly in the section conformation. Genetic correlations between type traits ranged from -0.44 to 0.85. High genetic correlations indicated that breeding programs could be successful without including all type traits. The selection for...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: (co)variance components; Dairy cattle; Genetic correlations; Heritability; REMLF90; Selection.
Ano: 2012 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982012001000003
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Genetic association between longevity and linear type traits of Holstein cows Scientia Agricola
Kern,Elisandra Lurdes; Cobuci,Jaime Araujo; Costa,Cláudio Napolis; McManus,Concepta Margaret; Braccini Neto,José.
Longevity is a desirable trait in the dairy industry because of its relationship to profitability. The aim of this study was to estimate genetic parameters for longevity measurements related to productive life, or life in the herd, and linear type traits of Brazilian Holstein cows born between the years 1990 and 2008. The (co) variance components were estimated by the restricted maximum likelihood method. The heritability for measurements of longevity and linear type traits ranged from 0.05 to 0.07 and 0.08 to 0.39, respectively. The genetic correlations between measurements of longevity and linear type traits ranged from -0.39 to 0.31. Direct selection for longevity does not necessarily lead to long-lived cows, due to low heritability. Indirect genetic...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Genetic correlation; Mammary system; Productive life; Rear teat placement.
Ano: 2015 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-90162015000300203
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Phenotypic relationships between type traits and productive life using a piecewise Weibull proportional hazard model Scientia Agricola
Kern,Elisandra Lurdes; Cobuci,Jaime Araujo; Costa,Cláudio Napolis; Ducrocq,Vincent.
ABSTRACT: Longevity is an important trait due to its relationship with profitability. Type traits have been used as indirect predictors for productive life. The objective of this study was to evaluate the relationship of 20 type traits on length of productive life in Brazilian Holsteins, using a piecewise Weibull proportional hazard model. Three analyses were performed i) productive life was corrected for within herd level of production as a proxy for functional longevity, which included the time-dependent effects of region within year, class of milk production within herdyear, milk production class within lactation number, fat class and protein contents within herd and (variation in) herd size as well as the time-independent fixed effect of age at first...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Conformation traits; Dairy cattle; Longevity; Culling risk; Survival analysis.
Ano: 2018 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-90162018000600470
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Parâmetros genéticos para produção de leite no dia do controle de vacas da raça Holandesa utilizando modelos de análises de fatores e componentes principais Ciência Rural
Dornelles,Mariana de Almeida; Rorato,Paulo Roberto Nogara; Breda,Fernanda Cristina; Bondan,Carlos; Gama,Luis Telo Lavadinho da; Cobuci,Jaime Araujo; Feltes,Giovani Luis; Michelotti,Vanessa Tomazetti; Prestes,Alan Miranda.
Objetivou-se comparar um modelo multi-característica padrão com modelos de análise de fatores (AF) e de componentes principais (CP) para estimar parâmetros genéticos para a produção de leite no dia do controle (PLDC) de vacas da raça Holandesa. O arquivo de trabalho constituiu-se de 4.616 registros mensais de PLDC de primeiras lactações de vacas da raça Holandesa. As PLDC foram agrupadas em dez classes mensais, entre o 5o e 305o dia da lactação (PLDC1 a PLDC10). Foram realizadas análises considerando 11 modelos diferentes, como segue: multi-característica padrão (MC); cinco modelos de posto reduzido, para a matriz de covariância genética, ajustando um a cinco (CP1 ... CP5) componentes principais; e dois modelos utilizando análise de fatores (F1, F2, F3, F4...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Componentes de variância; Correlações genéticas; Herdabilidade; Posto reduzido.
Ano: 2015 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782015000601087
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Efeitos genéticos e de ambiente em um rebanho do ecótipo mantiqueira: II. Características produtivas Ciência e Agrotecnologia
Silva,Marcos Vinicius Gualberto Barbosa; Ferreira,William José; Cobuci,Jaime Araujo; Oliveira,Paulo Rogério Palma de; Machado,Marco Antônio; Ferreira,Cezar Parreira.
Por meio de análises uni e bicaracterísticas entre a produção total de leite (PL), produção de gordura (PROG), porcentagem de gordura (PERG), duração da lactação (DL) e período seco (PSECO), objetivou-se, com este trabalho, estimar parâmetros genéticos utilizando-se registros provenientes das cinco primeiras lactações de 1.406 vacas do ecótipo Mantiqueira, filhas de 113 reprodutores, com partos entre os anos de 1977 e 1997, pertencentes ao programa de melhoramento do Pólo Regional do Vale do Paraíba da Agência Paulista de Tecnologia dos Agronegócios da Secretaria de Agricultura e Abastecimento do Estado de São Paulo (APTA/SAA-SP), no município de Pindamonhangaba. Os modelos usados para obtenção das médias dos quadrados mínimos incluíram os efeitos fixos de...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Duração da lactação; Ecótipo Mantiqueira; Porcentagem de gordura; Período seco; Produção de gordura; Produção de leite.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1413-70542006000300020
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Influência da informação à priori na escolha de modelos para avaliação genética de suínos Ciência e Agrotecnologia
Fonseca,Ricardo da; Cobuci,Jaime Araujo; Pires,Aldrin Vieira; Araújo,Cláudio Vieira; Costa,André Ribeiro Correa da.
Programas de melhoramento são atividades que se desenvolvem durante anos e, por isso, devem ser flexíveis ao ajuste às novas situações criadas por mudanças nas tendências de mercado, na situação econômica e aquelas causadas por aumento do volume e qualidade dos dados e, também, por novas técnicas propostas pela comunidade científica. O ajuste a essas últimas deve ser feito, principalmente, por meio da substituição e escolha do modelo mais adequado para a descrição do fenômeno, em um determinado cenário. Os dados de ganho de peso médio diário, de um programa de melhoramento de suínos, envolvendo as raças Duroc, Landrace e Large White, foram analisados por meio da teoria bayesiana, por meio de dois modelos candidatos. Foram simulados três níveis de...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Função de verossimilhança; Informação à priori; Suínos; Teoria bayesiana.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1413-70542006000300021
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