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Genetic evaluation for persistency of lactation in Holstein cows using a random regression model Genet. Mol. Biol.
Cobuci,Jaime Araujo; Euclydes,Ricardo Frederico; Costa,Claudio Napolis; Torres,Robledo de Almeida; Lopes,Paulo Sávio; Pereira,Carmen Silva.
A model for analyzing test day records including both fixed and random coefficients was applied to the genetic evaluation of first lactation data for Holstein cows. Data comprising 87045 test-day milk yield records from calving between 1997 and 2001 from Holstein herds in 10 regions of the Brazilian state of Minas Gerais. Six persistency of lactation measures were evaluated using breeding values obtained by random regression analyses. The Wilmink function was used to model the additive genetic and permanent environmental effects. Residual variance was constant throughout lactation. Ranking for animals did not change among criteria for persistency measurements, but ranking changes were observed when the estimated breeding value (EBV) for persistency of...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Genetic evaluation; Persistency of lactation; Rank correlation; Random regression models.
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572007000300009
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An investigation into heterogeneity of variance for milk and fat yields of Holstein cows in Brazilian herd environments Genet. Mol. Biol.
Costa,Claudio Napolis.
Heterogeneity of variance in Brazilian herd environments was studied using first-lactation 305-day mature equivalent (ME) milk and fat records of Holstein cows. Herds were divided into two categories, according to low or high herd-year phenotypic standard deviation for ME milk (HYSD). There were 330 sires with daughter records in both HYSD categories. Components of (co)variance, heritability, and genetic correlations for milk and fat yields were estimated using a sire model from bivariate analyses with a restricted maximum likelihood (REML) derivative-free algorithm. Sire and residual variances for milk yield in low HYSD herds were 79 and 57% of those obtained in high HYSD herd. For fat yield they were 67 and 60%, respectively. Heritabilities for milk and...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Ano: 1999 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47571999000300015
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Estimation of genetic parameters for test-day milk yield in Holstein cows using a random regression model Genet. Mol. Biol.
Cobuci,Jaime Araujo; Euclydes,Ricardo Frederico; Lopes,Paulo Sávio; Costa,Claudio Napolis; Torres,Robledo de Almeida; Pereira,Carmen Silva.
Test-day milk yield records of 11,023 first-parity Holstein cows were used to estimate genetic parameters for milk yield during different lactation periods. (Co)variance components were estimated using two random regression models, RRM1 and RRM2, and the restricted maximum likelihood method, compared by the likelihood ratio test. Additive genetic variances determined by RRM1 and additive genetic and permanent environmental variances estimated by RRM2 were described, using the Wilmink function. Residual variance was constant throughout lactation for the two models. The heritability estimates obtained by RRM1 (0.34 to 0.56) were higher than those obtained by RRM2 (0.15 to 0.31). Due to the high heritability estimates for milk yield throughout lactation and...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Random regression models; REML method; Genetic parameters; Test-day milk yield; Holstein cows.
Ano: 2005 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572005000100013
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Estimação de parâmetros genéticos utilizando-se a produção de leite no dia do controle em primeiras lactações de vacas da raça Jersey R. Bras. Zootec.
Dionello,Nelson José Laurino; Silva,Carlos Alberto Soares da; Costa,Claudio Napolis; Cobuci,Jaime Araújo.
Registros da produção de leite de 3.531 controles de 620 primíparas da raça Jersey foram utilizados para a estimação dos componentes de covariância e dos parâmetros genéticos para a produção de leite por meio dos modelos de repetibilidade e de regressão aleatória. O modelo de repetibilidade (MR) incluiu os efeitos fixos de rebanho-ano-mês do controle, estação do parto e idade da vaca ao parto como covariável, com termos linear e quadrático, e os efeitos aleatórios de animal, de ambiente permanente e residual. O modelo de regressão aleatória incluiu os mesmos efeitos do MR, com o uso da função de Wilmink para a modelagem dos efeitos fixo (estação de parto) e aleatórios (genético de animal e de ambiente permanente). As estimativas de variância genética...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Avaliação genética; Bovinos de leite; Componentes de variância; Herdabilidade; Regressão aleatória; Repetibilidade; Seleção.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982006000600010
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Persistency of lactation using random regression models and different fixed regression modeling approaches R. Bras. Zootec.
Cobuci,Jaime Araujo; Costa,Claudio Napolis.
Milk yield test-day records on the first three lactations of 25,500 Holstein cows were used to estimate genetic parameters and predict breeding values for nine measures of persistency and 305-d milk yield in a random regression animal model using two criteria to define the fixed regression. Legendre polynomials of fourth and fifth orders were used to model the fixed and random regressions of lactation curves. The fixed regressions were adjusted for average milk yield on populations (single) or subpopulations (multiple) formed by cows that calved at the same age and in the same season. Akaike Information (AIC) and Bayesian Information (BIC) criteria indicated that models with multiple regression lactation curves had the best fit to test-day milk records of...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Breeding value; Legendre polynomial; Selection; Test-day milk yield.
Ano: 2012 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982012000900005
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Persistence in milk, fat and protein production of primiparous Holstein cows by random regression models R. Bras. Zootec.
Biassus,Igor de Oliveira; Cobuci,Jaime Araújo; Costa,Claudio Napolis; Rorato,Paulo Roberto Nogara; Braccini Neto,José; Cardoso,Leandro Lunardini.
Total numbers of 56,508, 35,091 and 8,326 records of milk, fat, and protein test-day yields, respectively, were used to estimate genetic parameters for six persistency measures on milk, fat and protein productions of Holstein cows reared in Minas Gerais state. Covariance components for additive genetic effects and permanent environmental effects were estimated by REML in random regression models using Legendre polynomials from the third to the sixth order. Overall, models with the highest orders of Legendre polynomials showed the best quality of adjustments of these productive records. Heritability estimates obtained by the models for persistence in milk, fat, and protein yields ranged from 0.04 to 0.32, from 0.00 to 0.23, and from 0.00 to 0.27,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Genetic correlation; Heritability; Legendre polynomials; Random regression model; Selection.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982010001200009
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Uso de funções ortogonais para descrever a produção de leite no dia de controle por meio de modelos de regressão aleatória R. Bras. Zootec.
Araújo,Cláudio Vieira de; Torres,Robledo de Almeida; Costa,Claudio Napolis; Torres Filho,Rodolpho de Almeida; Araújo,Simone Inoe; Lopes,Paulo Sávio; Regazzi,Adair José; Pereira,Carmen Silva; Cobuci,Jaime Araújo; Sarmento,José Lindenberg Rocha.
Registros de produção de leite de 68.523 controles leiteiros de 8.536 vacas da raça Holandesa, filhas de 537 reprodutores, distribuídas em 266 rebanhos, com parições nos anos de 1996 a 2001, foram utilizados na comparação de modelos de regressão aleatória, para estimação de componentes de variância. Os modelos de regressão aleatória diferiram entre si pelo grau do polinômio de Legendre utilizado para descrever a trajetória da curva de lactação dos animais. Os modelos incluíram os efeitos rebanho-mês-ano do controle, composição genética dos animais, freqüência de ordenhas diárias, regressão polinomial em cada classe de idade-estação de parto para descrever a parte fixa da lactação e regressão polinomial aleatória relacionadas aos efeitos genético direto e...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Herdabilidade; Parâmetros genéticos.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982006000400005
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Heterogeneidade de (Co)variância para as produções de leite e de gordura entre vacas puras e mestiças da raça Gir R. Bras. Zootec.
Costa,Claudio Napolis; Martinez,Mário Luiz; Verneque,Rui da Silva; Teodoro,Roberto Luiz; Ledic,Ivan Luz.
Registros de produção de leite e de gordura de 5086 vacas puras e mestiças da raça Gir de rebanhos de diferentes Estados do Brasil, ajustados para idade adulta, rebanho, ano e estação de parto, foram utilizados para estimar componentes de (co)variância por análises bicaráter e multicaráter com modelo animal pelo método REML. O modelo multicárater para a predição de valores genéticos (VG) para as produções de leite (PL) e de gordura (PG) de vacas puras e mestiças foi comparado com o modelo bicárater (leite e gordura) como alternativa para o ajuste da heterogeneidade de variância da PL (características distintas) entre grupos genéticos (vacas puras e mestiças). As estimativas dos componentes de (co)variância para as produções de leite e de gordura foram...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Heterogeneidade de variância; Parâmetros genéticos; Avaliação genética; Seleção.
Ano: 2004 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982004000300005
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Heterocedasticidade entre estados para produção de leite em vacas da raça Holandesa, usando métodos Bayesianos via amostrador de Gibbs R. Bras. Zootec.
Falcão,Alencariano José da Silva; Martins,Elias Nunes; Costa,Claudio Napolis; Sakaguti,Eduardo Shiguero; Mazucheli,Josmar.
Registros de produção de leite ajustados para 305 dias de lactação (PL305) em vacas da raça Holandesa que pariram entre 1980 e 1993 foram utilizados para investigar a existência de heterogeneidade de variância e a interação genótipo × ambiente. Supondo-se variâncias heterogêneas, as PL305 nos estados de Minas Gerais, São Paulo, Paraná, Santa Catarina e Rio Grande do Sul foram tratadas como características diferentes. Admitindo-se homogeneidade de variância, a PL305 foi analisada segundo um modelo unicaracter. Os componentes de (co)variância e os parâmetros genéticos foram estimados utilizando-se métodos Bayesianos, via amostrador de Gibbs (GS), sob um modelo animal que incluiu os efeitos fixos de estação de parto, grupo genético, ordem de parição e classes...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Componentes de variância; Convergência; Herdabilidade; Inferência Bayesiana; Interação genótipo × ambiente.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982006000200010
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Uso de modelos de regressão aleatória para descrever a variação genética da produção de leite na raça Holandesa R. Bras. Zootec.
Araújo,Cláudio Vieira de; Torres,Robledo de Almeida; Costa,Claudio Napolis; Torres Filho,Rodolpho de Almeida; Araújo,Simone Inoe; Lopes,Paulo Sávio; Regazzi,Adair José; Pereira,Carmen Silva; Sarmento,José Lindenberg Rocha.
Registros de produção de leite de 68.523 controles leiteiros de 8.536 vacas da raça Holandesa, com parições nos anos de 1996 a 2001, foram utilizados na comparação entre modelos de regressão aleatória para estimação de componentes de variância. Os registros de controle leiteiro foram analisados como características múltiplas, considerando cada controle uma característica distinta. Os mesmos registros de controle leiteiro foram analisados como dados longitudinais, por meio de modelos de regressão aleatória, que diferiram entre si pela função utilizada para descrever a trajetória da curva de lactação dos animais. As funções utilizadas foram a exponencial de Wilmink, a função de Ali e Schaeffer e os polinômios de Legendre de segundo e quarto graus. A...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Avaliação genética; Regressão aleatória; Produção de leite.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982006000400006
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Análises da persistência na lactação de vacas da raça Holandesa, usando produção no dia do controle e modelo de regressão aleatória R. Bras. Zootec.
Cobuci,Jaime Araujo; Euclydes,Ricardo Frederico; Costa,Claudio Napolis; Lopes,Paulo Sávio; Torres,Robledo de Ameida; Pereira,Carmen Silva.
Foram utilizados 87.045 registros de produção de leite, na primeira lactação, de 11.023 vacas da raça Holandesa, obtidos nos anos de 1997 a 2001, em diferentes rebanhos distribuídos em dez núcleos do Estado de Minas Gerais. Foram avaliados seis tipos de mensuração da persistência na lactação utilizando-se os valores genéticos da produção de leite, obtidos por meio do modelo de regressão aleatória - MRA. Utilizou-se a função de Wilmink na descrição dos efeitos aleatórios e fixos, pelo MRA. As estimativas de herdabilidade e de correlação genética, para as várias mensurações da persistência na lactação, variaram em decorrência da definição da persistência. As estimativas de herdabilidade para persistência na lactação variaram de 0,11 a 0,27 e as estimativas...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Correlação genética; Herdabilidade; Modelos de regressão aleatória; Persistência na lactação; Produção de leite no dia do controle; Raça Holandesa.
Ano: 2004 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982004000300004
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Genetic parameters for production traits in primiparous Holstein cows estimated by random regression models R. Bras. Zootec.
Biassus,Igor de Oliveira; Cobuci,Jaime Araújo; Costa,Claudio Napolis; Rorato,Paulo Roberto Nogara; Braccini Neto,José; Cardoso,Leandro Lunardini.
The objective of this study was to estimate genetic parameters for milk, fat and protein yields of Holstein cows using 56,508; 35,091 and 8,326 test-day milk records from 7,015, 4,476 and 1,114 cows, calves of 359, 246 and 90 bulls, respectively. The additive genetic and permanent environmental effects were estimated using REML. Random regression models with Legendre polynomials from order 3 to 6 were used. Residual variances were considered homogeneous over the lactation period. The estimates of variance components showed similar trends, with an increase of the polynomial order for each trait. The heritability estimates ranged from 0.14 to 0.31; 0.03 to 0.21 and 0.09 to 0.33 for milk, fat and protein yield, respectively. Genetic correlations among milk,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Fat yield; Herdability; Milk yield; Protein yield; Test-day.
Ano: 2011 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982011000100012
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Heterogeneidade de variância e avaliação genética de bovinos da raça Holandesa no Brasil R. Bras. Zootec.
Torres,Robledo de Almeida; Bergmann,José Aurélio Garcia; Costa,Claudio Napolis; Pereira,Carmem Silva; Valente,Jose; Penna,Vania Maldini; Torres Filho,Rodolpho de Almeida; Araújo,Cláudio Vieira de.
Dados de 109.200 lactações foram utilizados para verificar o efeito da heterogeneidade de variância sobre a avaliação genética de vacas e touros da raça Holandesa criados no Brasil. A produção total de leite ajustada para idade adulta foi usada para classificar os rebanhos em três classes de desvio-padrão fenotípico: baixo (<1427 kg), médio (entre 1427 kg e 1625 kg) e alto (>1625 kg). Dados das primeiras lactações foram analisados considerando a produção total de leite ajustada para idade adulta (TOTAJU) e produção total de leite ajustada para idade adulta e para 305 dias de lactação (TAJU305). As produções de leite médias e os componentes de variância genética, residual e fenotípica aumentaram com o aumento do desvio-padrão da classe. Para as...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Bovinos de leite; Componente de variância; Parâmetro genético.
Ano: 2000 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982000000400015
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Genetic parameters for test day milk yield of first lactation Holstein cows estimated by random regression using Legendre polynomials R. Bras. Zootec.
Costa,Claudio Napolis; Melo,Claudio Manoel Rodrigues de; Packer,Irineu Umberto; Freitas,Ary Ferreira de; Teixeira,Nilson Milagres; Cobuci,Jaime Araujo.
Data comprising 263,390 test-day (TD) records of 32,448 first parity cows calving in 467 herds between 1991 and 2001 from the Brazilian Holstein Association were used to estimate genetic and permanent environmental variance components in a random regression animal model using Legendre polynomials (LP) of order three to five by REML. Residual variance was assumed to be constant in all or in some classes of lactation periods for each LP. Estimates of genetic and permanent environmental variances did not show any trend due to the increase in the LP order. Residual variance decreased as the order of LP increased when it was assumed constant, and it was highest at the beginning of lactation and relatively constant in mid lactation when assumed to vary between...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Covariance components; Dairy cattle; Genetic evaluation; Heritability; Selection.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982008000400003
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Efeitos do número de animais na matriz de parentesco sobre as estimativas de componentes de variância para produção de leite usando os métodos de Máxima Verossimilhança Restrita e Bayesiano R. Bras. Zootec.
Falcão,Alencariano José da Silva; Martins,Elias Nunes; Costa,Claudio Napolis; Mazucheli,Josmar.
Foram estimados os componentes de variância para produção de leite e avaliado o impacto do aumento do número de animais na matriz de parentesco sobre os componentes de variância usando os métodos de Máxima Verossimilhança Restrita (REML) e Bayesiano via amostragem de Gibbs (GS). Utilizaram-se registros de produção de leite de vacas da raça Holandesa dos estados de Minas Gerais, São Paulo, Paraná, Santa Catarina e Rio Grande do Sul. Para cada estado, foram analisados dois conjuntos de dados: no primeiro, pedigree restrito, a matriz de parentesco foi constituída dos animais do respectivo estado; e, no segundo, pedigree completo, foram incluídos na matriz de parentesco os animais de todos os estados. Utilizou-se um modelo animal que incluiu os efeitos da...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Amostragem de Gibbs; Bovinos; Convergência; Herdabilidade; Parentesco.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982009000800011
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Genetic parameters for type traits in Holstein cows in Brazil R. Bras. Zootec.
Campos,Rafael Viegas; Cobuci,Jaime Araujo; Costa,Claudio Napolis; Braccini Neto,José.
Data from 26,558 Holstein cows in 802 herds were used to estimate genetic, residual and phenotypic parameters for 22 type traits. The model included the fixed effects of herd-year, period of classification, classifier, stage of lactation and age of cows at calving (covariate) and random genetic and residual effects. Heritability for type traits ranged from 0.10 to 0.39. The genetic variability in these traits suggested the possibility for moderate genetic gains through selection. The phenotypic correlations were moderated, mainly in the section conformation. Genetic correlations between type traits ranged from -0.44 to 0.85. High genetic correlations indicated that breeding programs could be successful without including all type traits. The selection for...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: (co)variance components; Dairy cattle; Genetic correlations; Heritability; REMLF90; Selection.
Ano: 2012 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982012001000003
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Valores genéticos para as produções de leite do dia do controle e da lactação na raça Holandesa com diferentes modelos estatísticos R. Bras. Zootec.
Melo,Cláudio Manoel Rodrigues de; Packer,Irineu Umberto; Costa,Claudio Napolis; Machado,Paulo Fernando; Patrício,Mateus.
Foram utilizados 263.390 registros de produção de leite do dia do controle (PDC) de 32.448 primeiras lactações de vacas da raça Holandesa paridas no período de 1991 a 2001 para predizer valores genéticos usando diferentes modelos estatísticos e a metodologia REML. Valores genéticos estimados utilizando-se três modelos de regressão aleatória (MRA) foram comparados àqueles estimados utilizando-se um modelo de repetibilidade (MRF) e um modelo para produção até 305 dias (P305). Nos modelos de regressão aleatória, duas curvas foram utilizadas para descrever a trajetória da lactação: a polinomial logarítmica (AS) e a exponencial (W), sob duas formas: padrão e com uma modificação para reduzir a amplitude das covariáveis e contornar problemas de convergência (W*)....
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Avaliação genética; Correlações de ordem e de valores; Modelos de regressão aleatória; Produções do dia do controle.
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982007000600011
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Parâmetros genéticos para a produção de leite de controles individuais de vacas da raça Gir estimados com modelos de repetibilidade e regressão aleatória R. Bras. Zootec.
Costa,Claudio Napolis; Melo,Claudio Manoel Rodrigues de; Machado,Carlos Henrique Crivelari; Freitas,Ary Ferreira de; Packer,Irineu Umberto; Cobuci,Jaime de Araújo.
Registros individuais perfazendo 8.183 controles de produção de leite (PLC) de 1.273 primeiras lactações de vacas da raça Gir de rebanhos supervisionados pela ABCZ no período 1994/2000 foram utilizados para se estimar componentes de variância e parâmetros genéticos para PLC usando-se REML. Foram comparados um modelo de repetibilidade e modelos de regressão aleatória ajustados com as funções logarítmica (Ali &amp; Schaeffer, 1987), exponencial (Wilmink, 1987) e polinômios ortogonais de Legendre (LP) de ordem 3 a 5, sob as pressuposições de homogeneidade e heterogeneidade de variância residual, definidas respectivamente por uma (ME=1) ou quatro classes de medidas de erro temporário (ME=4) ao longo do período de lactação. Também ajustou-se a produção de...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Avaliação genética; Componentes de variância; Heritabilidade; Seleção; Zebu.
Ano: 2005 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982005000500012
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Genetic parameters for milk production by using random regression models with different alternatives of fixed regression modeling R. Bras. Zootec.
Cobuci,Jaime Araújo; Costa,Claudio Napolis; Braccini Neto,José; Freitas,Ary Ferreira de.
Records of test-day milk yields of the first three lactations of 25,500 Holstein cows were used to estimate genetic parameters for milk yield by using two alternatives of definition of fixed regression of the random regression models (RRM). Legendre polynomials of fourth and fifth orders were used to model regression of fixed curve (defined based on averages of the populations or multiple sub-populations formed by grouping animals which calved at the same age and in the same season of the year) or random lactation curves (additive genetic and permanent enviroment). Akaike information criterion (AIC) and Bayesian information criterion (BIC) indicated that the models which used multiple regression of fixed lactation curves of lactation multiple regression...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Test-day milk yield; Genetic correlation; Heritability; Legendre polynomial; Selection.
Ano: 2011 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982011000300013
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