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Comparação de métodos de seleção em populações simuladas de frangos de corte PAB
Oliveira,Claudine Gonçalves de; Cunha,Elizângela Emídio; Carneiro,Paulo Luiz Souza; Euclydes,Ricardo Frederico; Malhado,Carlos Henrique Mendes.
Populações de frangos de corte foram simuladas utilizando-se o programa GENESYS, com o objetivo de avaliar a seleção com base no método da melhor predição linear não-viesada (BLUP - best linear unbiased prediction), a seleção individual para três tamanhos efetivos de população e três sistemas de acasalamento dos reprodutores selecionados. Simulou-se um genoma constituído de uma característica quantitativa, com valor de herdabilidade igual a 0,30, em seleção praticada durante 15 gerações consecutivas, com 30 repetições por geração. Para um mesmo tamanho efetivo e sistema de acasalamento, o BLUP foi sempre superior à seleção individual nas 15 gerações de seleção avaliadas.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: BLUP; Seleção individual; Sistemas de acasalamento; Tamanho efetivo de população.
Ano: 2005 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2005001000004
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Seleção tradicional e associada a marcadores moleculares na avaliação genética animal PAB
Carneiro,Paulo Luiz Souza; Malhado,Carlos Henrique Mendes; Euclydes,Ricardo Frederico; Torres,Robledo de Almeida; Lopes,Paulo Sávio; Carneiro,Antonio Policarpo Souza; Cunha,Elizângela Emídio.
O objetivo deste trabalho foi comparar a seleção, utilizando valores genéticos preditos pelo BLUP clássico (BLUP), BLUP marcadores (BLUPM) e pela seleção individual (SI), usando simulação com o programa Genesys. Para obter a matriz de similaridade genética utilizada no BLUPM, foram simulados cem marcadores moleculares do tipo microssatélite (SSR - Simple Sequence Repeat), por meio de um coeficiente de similaridade correspondente à distância euclideana média para dados quantitativos. A fim de comparar os diferentes métodos, utilizaram-se populações com tamanho efetivo de 66,66 e média de 30 repetições, avaliando-se os valores fenotípicos médios. Os ganhos ao longo das 20 gerações de seleção foram maiores para o BLUP em relação ao BLUPM, e este foi superior...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: BLUP; Seleção fenotípica; Simulação; Sistemas de acasalamento.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2006000400010
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Impactos de se ignorarem os efeitos genéticos não-aditivos de dominância na avaliação genética animal R. Bras. Zootec.
Cunha,Elizângela Emídio; Euclydes,Ricardo Frederico; Torres,Robledo de Almeida; Sarmento,José Lindenberg Rocha; Carneiro,Paulo Luiz Souza; Carneiro,Antonio Policarpo Souza.
Objetivou-se com este estudo avaliar os impactos de se ignorarem os efeitos de dominância sobre a estimação de parâmetros genéticos e a predição de valores genéticos pelo método da máxima verossimilhança restrita sob modelo animal aditivo empregando-se o MTDFREML. Para a mesma arquitetura genômica, foram simulados dois modelos de ação gênica: um deles incluiu apenas efeitos aditivos dos genes e o outro, efeitos aditivos e dominância completa e positiva para 100% dos locos. Sob cada modelo genético, foram geradas três populações-base correspondentes às características com herdabilidades de 0,15 (baixa), 0,30 (média) e 0,60 (alta). A partir das populações-base, foram geradas as populações iniciais, que, submetidas a seleção e a acasalamentos ao acaso,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: BLUP; Componentes de variância; Herdabilidade; Interação intraloco; Modelo animal; Simulação.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982009001200009
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Endogamia, fixação de alelos e limite de seleção em populações selecionadas por métodos tradicionais e associados a marcadores moleculares R. Bras. Zootec.
Carneiro,Paulo Luiz Souza; Malhado,Carlos Henrique Mendes; Euclydes,Ricardo Frederico; Carneiro,Antonio Policarpo Souza; Cunha,Elizângela Emídio.
Objetivou-se avaliar o coeficiente de endogamia, a fixação de alelos e o limite de seleção em populações selecionadas durante 20 gerações. A seleção foi baseada nos valores genéticos preditos pelo BLUP clássico (BLUP) e pelo BLUP marcadores (BLUPM) e na seleção individual (SI) utilizando diferentes sistemas de acasalamento. Para se obter a matriz de similaridade genética utilizada no BLUPM, foram simulados 100 marcadores moleculares do tipo microssatélite, por meio de um coeficiente de similaridade correspondente à distância euclidiana média para dados quantitativos. Para comparar os diferentes métodos de seleção, utilizaram-se populações com tamanho efetivo de 66,66 e média de 30 repetições. Observou-se maior incremento de endogamia para o BLUPM, seguido...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: BLUP; Seleção; Simulação; Sistemas de acasalamento.
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982007000200013
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Behavior of genetic (co)variance components in populations simulated from non-additive genetic models of dominance and overdominance R. Bras. Zootec.
Cunha,Elizângela Emídio; Euclydes,Ricardo Frederico; Lopes,Paulo Sávio; Torres,Robledo de Almeida; Carneiro,Paulo Luiz Souza.
The aim of this work was to investigate the short-term behavior of the genetic variability of quantitative traits simulated from models with additive and non-additive gene action in control and phenotypic selection populations. Both traits, one with low (h² = 0.10) and the other with high (h² = 0.60) heritability, were controlled by 600 biallelic loci. From a standard genome, it was obtained six genetic models which included the following: only the additive gene effects; complete and positive dominance for 25, 50, 75 and 100% of the loci; and positive overdominance for 50% of the loci. In the models with dominance deviation, the additive allelic effects were also included for 100% of the loci. Genetic variability was quantified from generation to...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Closed population; Computer simulation; Dominance deviation; Genetic variability; Intralocus interaction.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982010000900013
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Oscilação genética em populações submetidas a métodos de seleção tradicionais e associados a marcadores moleculares R. Bras. Zootec.
Carneiro,Paulo Luiz Souza; Malhado,Carlos Henrique Mendes; Euclydes,Ricardo Frederico; Torres,Robledo de Almeida; Lopes,Paulo Sávio; Carneiro,Antonio Policarpo Souza; Cunha,Elizângela Emídio.
Com o objetivo de avaliar o efeito da oscilação genética em populações sob seleção com diferentes tamanhos efetivos, foram simulados dados utilizando-se o programa GENESYS. A seleção foi praticada durante 20 gerações consecutivas, com base na seleção individual (SI) e nos valores genéticos preditos pelo BLUP Clássico (BLUP) e pelo BLUP Marcadores (BLUPM), com 30 repetições. A matriz de similaridade adotada no BLUP Marcadores foi obtida utilizando-se 100 marcadores moleculares do tipo microssatélite, por meio de um coeficiente de similaridade correspondente à distância euclidiana média para dados quantitativos. Foram simuladas seis populações de seleção, correspondendo a dois tamanhos efetivos (18,18 e 66,66) e três sistemas de acasalamento dos reprodutores...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Avaliação genética; BLUP; Seleção individual.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982006000100010
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Efeito de tipos de acasalamentos e razões sexuais na seleção baseada no BLUP R. Bras. Zootec.
Cunha,Elizângela Emídio; Euclydes,Ricardo Frederico; Torres,Robledo de Almeida; Lopes,Paulo Sávio; Ribeiro Júnior,José Ivo; Carneiro,Pedro Crescêncio Souza.
Diferentes tipos de acasalamentos foram avaliados, por meio de dados simulados, em populações submetidas à seleção com base no BLUP, durante 50 gerações. Considerou-se uma característica quantitativa de herdabilidade 0,10 e a seguinte estrutura das populações de seleção: valores de razão sexual: 10, 20, 25 e 50; números de machos selecionados por geração: 10, 5, 4 e 2; tamanhos efetivos de população: 36,36; 19,05; 15,38; e 7,84, respectivamente. Em cada valor de razão sexual, as populações foram acasaladas segundo um dos tipos de acasalamentos: acasalamentos preferenciais de meios-irmãos e irmãos completos, acasalamentos preferenciais entre meios-irmãos, acasalamentos ao acaso, exclusão de acasalamentos entre irmãos completos e exclusão de acasalamentos de...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Consangüinidade; Dados simulados; Seleção no longo prazo; Tamanhos efetivos de população.
Ano: 2003 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982003000600003
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Caracterização de genótipos e estimativa de parâmetros genéticos de características produtivas de sorgo forrageiro R. Bras. Zootec.
Cunha,Elizângela Emídio; Lima,João Maria Pinheiro de.
Avaliou-se o desempenho produtivo de 29 genótipos de sorgo forrageiro por meio dos dados de matéria verde, matéria seca, altura da planta, floração inicial e sobrevivência da planta. Além do desempenho, foram estimadas a herdabilidade de cada característica e as correlações genotípicas e fenotípicas entre elas, as quais são úteis nos programas de melhoramento genético empregando-se seleções direta e indireta. Utilizou-se o delineamento em blocos completos ao acaso com três repetições, em análise de variância univariada. Houve variabilidade genética para todas as características, com diferenças significativas entre as médias dos genótipos. A herdabilidade foi elevada, sobretudo para altura da planta. As correlações genotípica e fenotípica da matéria verde...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Alimentação animal; Forragem; Melhoramento genético vegetal; Seleção.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982010000400002
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Razões entre componentes da variabilidade de características quantitativas simuladas com efeitos genéticos de dominância e sobredominância R. Bras. Zootec.
Cunha,Elizângela Emídio; Euclydes,Ricardo Frederico; Torres,Robledo de Almeida; Lopes,Paulo Sávio; Carneiro,Paulo Luiz Souza.
Foram avaliadas as razões entre componentes da variabilidade de características quantitativas simuladas a partir de genoma incorporando efeitos genéticos não-aditivos em populações de acasalamento ao acaso e de seleção fenotípica a curto prazo. Estudaram-se uma característica de baixa (h² = 0,10) e outra de alta herdabilidade (h² = 0,60) influenciadas por 600 locos bialélicos. Cinco modelos de ação gênica foram simulados, dos quais quatro incluíram dominância completa e positiva para 25, 50, 75 e 100% dos locos (D25, D50, D75 e D100, respectivamente); e um modelo incluiu sobredominância positiva para 50% dos locos. Todos os modelos incluíram efeitos aditivos dos alelos para 100% dos locos. As principais razões quantificadas foram d² (variância de...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Efeito genético não-aditivo; Seleção fenotípica; Simulação; Variação fenotípica.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982009001000006
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