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Seleção da matriz de variância-covariância residual na análise de ensaios varietais com medidas repetidas em cana-de-açúcar Ciência Rural
Silva,Emerson Noleto; Duarte,João Batista; Reis,Américo José dos Santos.
Este trabalho objetivou avaliar diferentes estruturas da matriz de variâncias e covariâncias residual (Σ), quanto ao ajustamento de dados longitudinais via modelos mistos, em experimentos varietais de cana-de-açúcar. A seleção adequada desta matriz garante a escolha de um modelo mais representativo dos dados. Em cada modelagem, variou-se ainda a suposição associada aos efeitos de tratamentos (variedades), como fixos e aleatórios. Quatro ensaios varietais, conduzidos entre 2005 e 2009, em três localidades do Estado de Goiás, foram considerados. Cada experimento foi delineado em blocos casualizados com três ou quatro repetições. A variável resposta analisada foi toneladas de colmos por hectare (TCH). Para avaliar a qualidade de ajustamento dos modelos, foram...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Saccharum spp.; Dados longitudinais; Estruturas de covariância; Modelos mistos; Genótipos aleatórios..
Ano: 2015 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782015000600993
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Prediction of hybrid means from a partial circulant diallel table using the ordinary least square and the mixed model methods Genet. Mol. Biol.
Reis,Américo José dos Santos; Chaves,Lázaro José; Duarte,João Batista; Brasil,Edward Madureira.
By definition, the genetic effects obtained from a circulant diallel table are random. However, because of the methods of analysis, those effects have been considered as fixed. Two different statistical approaches were applied. One assumed the model to be fixed and obtained solutions through the ordinary least square (OLS) method. The other assumed a mixed model and estimated the fixed effects (BLUE) by generalized least squares (GLS) and the best linear unbiased predictor (BLUP) of the random effects. The goal of this study was to evaluate the consequences when considering these effects as fixed or random, using the coefficient of correlation between the responses of observed and non-observed hybrids. Crossings were made between S1 inbred lines from two...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Diallel analysis; BLUP; Prediction; Cross-validation.
Ano: 2005 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572005000200023
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Estimadores de componentes de variância em delineamento de blocos aumentados com tratamentos novos de uma ou mais populações PAB
Duarte,João Batista; Vencovsky,Roland; Dias,Carlos Tadeu dos Santos.
O objetivo do trabalho foi comparar, por meio de simulação, as estimativas de componentes de variância produzidas pelos métodos ANOVA (análise da variância), ML (máxima verossimilhança), REML (máxima verossimilhança restrita) e MIVQUE(0) (estimador quadrático não viesado de variância mínima), no delineamento de blocos aumentados com tratamentos adicionais (progênies) de uma ou mais procedências (cruzamentos). Os resultados indicaram superioridade relativa do método MIVQUE(0). O método ANOVA, embora não tendencioso, apresentou as estimativas de menor precisão. Os métodos de máxima verossimilhança, sobretudo ML, tenderam a subestimar a variância do erro experimental (<img SRC="http:/img/fbpe/pab/v36n9/6475s2.gif">) e a superestimar as variâncias...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Modelo misto; Melhoramento vegetal; Seleção recorrente; Autógamas; Parâmetros genéticos.
Ano: 2001 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2001000900009
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Métodos estatísticos para estudo de adaptabilidade e estabilidade fenotípica em soja PAB
Silva,Waldir Camargos Júnior e; Duarte,João Batista.
O objetivo deste trabalho foi avaliar os métodos estatísticos de análise da interação de genótipos com ambientes (GxA), enfatizando a adaptabilidade e a estabilidade fenotípica. Utilizaram-se dados de produtividade de grãos de soja de sete experimentos em Goiás, testando 28 genótipos, dos quais quatro cultivares comerciais. Avaliaram-se os métodos Tradicional, Plaisted &amp; Peterson, Wricke, Finlay &amp; Wilkinson, Eberhart &amp; Russell, Verma, Chahal &amp; Murty, Toler, AMMI (additive main effect and multiplicative interaction), Hühn, Annicchiarico e Lin &amp; Binns. Avaliou-se a associação entre os métodos pela correlação de Spearman. Observou-se forte associação entre os de Plaisted &amp; Peterson e Wricke, cujo uso...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Glycine max; Interação GxA; Adaptação produtiva; Estabilidade de rendimento.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2006000100004
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Estratificação ambiental e otimização de rede de ensaios de genótipos de soja no Cerrado PAB
Branquinho,Rodrigo Gomes; Duarte,João Batista; Souza,Plínio Itamar Mello de; Silva Neto,Sebastião Pedro da; Pacheco,Roberto Miranda.
O objetivo deste trabalho foi estabelecer uma estratificação ambiental consistente, para a recomendação e a avaliação de linhagens experimentais e cultivares de soja na região do Cerrado, a partir de análises da interação entre genótipos e ambientes (GxA) quanto à produtividade de grãos, além de avaliar a atual rede de ensaios de valor de cultivo e uso (VCU) para sua otimização. Os dados provieram de 559 ensaios de competição de linhagens de soja, realizados em 57 localidades, durante sete safras agrícolas (2002/2003 a 2008/2009). Realizaram-se análises conjuntas de variância, pelo modelo AMMI ("additive main effects and multiplicative interaction"), e de estratificação ambiental, pela abordagem correlata de "genótipos vencedores". A interação GxA foi...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Glycine max; Análise AMMI; Genótipo vencedor; Interação genótipo x ambiente; Locais-chave; Mega-ambiente..
Ano: 2014 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2014001000783
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Key locations for soybean genotype assessment in Central Brazil PAB
Pacheco,Roberto Miranda; Duarte,João Batista; Souza,Plínio Itamar Mello de; Silva,Sérgio Abud da; Nunes Junior,José.
The objective of this work was to identify key locations for the establishment of soybean (Glycine max) genetic breeding programs, in the Central Region of Brazil. Grain yield data of three maturity groups of soybean genotypes, from regional trials conducted over three years, at 18 locations in Brazilian Cerrado were used. A key location for the early phases of the breeding program was defined as the site that best classifies the winning genotypes in the region. Key locations for the final phases were defined as those sites that best represent each environmental stratum, in relation to the adaptability of the respective winning genotype. This adaptability was estimated by additive main effects and multiplicative interaction (AMMI) model analysis, using the...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Glycine max; Adaptability; AMMI analysis; Environmental stratification; G×E interaction.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2009000500007
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Emprego da análise AMMI na avaliação da estabilidade produtiva em soja PAB
Oliveira,Adriano Borges de; Duarte,João Batista; Pinheiro,José Baldin.
O objetivo deste trabalho foi avaliar a influência da interação de genótipos com ambientes (GxA) na produtividade de grãos de um conjunto de linhagens de soja (Glycine max L.). Foram utilizados dados de 11 experimentos (ambientes) realizados no Estado de Goiás. Em cada experimento foram avaliados 18 genótipos, sendo quatro cultivares comerciais como testemunhas. O método de análise da interação foi o procedimento AMMI (modelo de efeitos principais aditivos e interação multiplicativa). O padrão significativo das interações GxA foi captado apenas pelo primeiro eixo principal AMMI, o qual explicou 36% da soma de quadrados GxA original, sugerindo contaminação da matriz de interações clássica por ruídos que prejudicam a qualidade das predições de respostas...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Glycine max; Progênie; Interação genótipo-ambiente; Adaptação; Biplot.
Ano: 2003 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2003000300004
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Análise AMMI da produtividade de grãos em linhagens de soja selecionadas para resistência à ferrugem asiática PAB
Yokomizo,Gilberto Ken-Iti; Duarte,João Batista; Vello,Natal Antonio; Unfried,Jair Rogério.
O objetivo deste trabalho foi quantificar os efeitos da interação genótipo x ambiente (GxE) sobre a produtividade de grãos em progênies de soja pré-selecionadas para resistência à ferrugem asiática (Phakopsora pachyrhizi). Doze ensaios de avaliação de progênies (linhagens F6 e F7) foram conduzidos em diferentes ambientes (combinação de locais, anos e tratamentos fungicidas para controle de doenças de final de ciclo, incluindo ou não a ferrugem). A análise "additive main effects and multiplicative interaction" (AMMI) capturou, como padrão da interação GxE, 57% da variação associada aos resíduos de não aditividade, dos quais 44% foram retidos no primeiro componente principal de interação e o restante, no segundo. O primeiro componente associou-se a...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Glycine max; Phakopsora pachyrhizi; Biplot; Interação genótipo x ambiente.
Ano: 2013 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2013001000009
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Spatial statistical analysis and selection of genotypes in plant breeding PAB
Duarte,João Batista; Vencovsky,Roland.
The objective of this study was to evaluate the efficiency of spatial statistical analysis in the selection of genotypes in a plant breeding program and, particularly, to demonstrate the benefits of the approach when experimental observations are not spatially independent. The basic material of this study was a yield trial of soybean lines, with five check varieties (of fixed effect) and 110 test lines (of random effects), in an augmented block design. The spatial analysis used a random field linear model (RFML), with a covariance function estimated from the residuals of the analysis considering independent errors. Results showed a residual autocorrelation of significant magnitude and extension (range), which allowed a better discrimination among genotypes...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Augmented design; Mixed model; Information recovery; Autocorrelation; Correlated data; Geostatistics.
Ano: 2005 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2005000200002
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Estimação e predição por modelo linear misto com ênfase na ordenação de médias de tratamentos genéticos Scientia Agricola
Duarte,João Batista; Vencovsky,Roland.
O presente artigo propôs-se a refletir teoricamente o processo de estimação/predição de médias de tratamentos, nos delineamentos em blocos, com ênfase nas suas aplicações em testes de genótipos, no melhoramento vegetal. Neste sentido, procurou-se comparar as análises baseadas no modelo linear fixo (análise intrablocos) e no modelo linear misto com genótipos aleatórios (análise recuperando informação intertratamentos), buscando identificar os fatores que podem determinar diferentes classificações genotípicas. A análise teórica permitiu constatar que a abordagem de modelo misto (com tratamentos aleatórios), comparativamente às análises tradicionais (médias marginais e análise intrablocos), em geral, leva a: i) maior homogeneidade das médias de tratamentos; e...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Recuperação de informação; Delineamento em bloco; Média BLUP; Seleção genotípica; Ordenamento.
Ano: 2001 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-90162001000100017
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PhenoRoots: an inexpensive non-invasive phenotyping system to assess the variability of the root system architecture Scientia Agricola
Martins,Saulo Muniz; Brito,Giovani Greigh de; Gonçalves,Washington da Conceição; Tripode,Bruna Mendes Diniz; Lartaud,Marc; Duarte,João Batista; Morello,Camilo de Lelis; Giband,Marc.
ABSTRACT: The root system architecture (RSA) of plants and its functioning play a fundamental role in a number of plant growth mechanisms including water and nutrient uptake. Optimization of the RSA is important for stable and increased plant productivity under adverse conditions. Despite its great importance, studying the RSA is notoriously laborious because of the difficulty of accessing the rooting system of plants. We developed a root phenotyping platform, PhenoRoots, which allows for the non-invasive study of plant RSA. The system was built using inexpensive material and was designed to provide medium throughput. Substrate or soil-filled rhizotrons are used to grow plantlets, whose roots are directly visible through a glass plate. An experiment...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Rhizotron; Root traits; Image analysis; Medium-throughput; Cotton.
Ano: 2020 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-90162020000501101
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