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Recent advances in EST sequencing in Crassostrea gigas: towards the sequencing of the Pacific oyster genome ArchiMer
Boudry, Pierre; Huvet, Arnaud; Lapegue, Sylvie; Sauvage, Christopher; Tanguy, A.; Moraga, D.; Goostrey, A.; Prunet, P.; Boulo, Viviane; Gueguen, Y.; Moal, Jeanne; Fleury, Elodie; Samain, Jean-francois; Mathieu, M.; Favrel, P..
Rationale for EST and genome sequencing of the Pacific oyster: • its membership of the Lophotrochozoa, an little studied branch of the Eukaryotes, • its worldwide aquacultural importance (4.2 million metric tons, worth 3.5 billion US dollars), • its high fecundity, with concomitantly high DNA polymorphism, • its use as a biosensor of coastal pollution. In 2004, an international community of biologists, the Oyster Genome Consortium (OGC) led by D. Hedgecock (University of Southern California) and uniting 70 participants from 10 countries, first presented the Pacific oyster Crassostrea gigas as a genome-sequencing candidate to Joint Genome Institute (JGI, USA) (Hedgecock et al., 2005). Besides this project (that remains to be accepted), several EST...
Tipo: Text Palavras-chave: Characteristics; Genome size; Genome; Crassostrea gigas; Oyster; Genetic.
Ano: 2007 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2007/acte-3414.pdf
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Etude transcriptomique, génétique et fonctionnelle de la gamétogenèse chez l'huître creuse Crassostrea gigas ArchiMer
Bigot, L.; Dubos, M. P.; Dheilly, N.; Favrel, P.; Kellner, K.; Lelong, C.; Martinez, A. S.; Riviere, G.; Santerre, C.; Sourdaine, P.; Degremont, Lionel; Flahauw, Emilie; Hatt, Philippe-jacques; Heurtebise, Serge; Lapegue, Sylvie; Azzouzi, N.; Galibert, F.; Boudry, Pierre; Corporeau, Charlotte; Fabioux, Caroline; Guevelou, Eric; Huvet, Arnaud; Sussarellu, Rossana.
Le projet GAMETOGENES vise à améliorer les connaissances des bases physiologiques et génétiques de la reproduction et des métabolismes associés chez un mollusque d'importance économique l'huître creuse, Crassostrea gigas. Il a pour objectifs (1) la définition de marqueurs clés de la gamétogenèse, de l'investissement reproducteur et du déterminisme du sexe chez une espèce hermaphrodite à protandrie irrégulière (2) la recherche de QTL de survie aux mortalités estivales ou à l'effort de reproduction dont le succès repose sur l'augmentation de la densité de marqueurs sur les cartes génétiques existantes (SNP en particulier) et sur les liens qui pourront être établis entre ces cartes de liaison et une carte physique (3) le développement d'outils pour valider la...
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Huître creuse; Crassostrea gigas; Gamétogenèse; QTL; Marqueur; Physiologie.
Ano: 2012 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00107/21781/19355.pdf
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