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Comparison of RAPD, RFLP, AFLP and SSR markers for diversity studies in tropical maize inbred lines Genet. Mol. Biol.
Garcia,Antonio A. F.; Benchimol,Luciana L.; Barbosa,Antônia M. M.; Geraldi,Isaias O.; Souza Jr.,Cláudio L.; Souza,Anete P. de.
In order to compare their relative efficiencies as markers and to find the most suitable marker for maize diversity studies we evaluated 18 inbred tropical maize lines using a number of different loci as markers. The loci used were: 774 amplified fragment length polymorphisms (AFLPs); 262 random amplified polymorphic DNAs (RAPDs); 185 restriction fragment length polymorphisms (RFLPs); and 68 simple sequence repeats (SSR). For estimating genetic distance the AFLP and RFLP markers gave the most correlated results, with a correlation coefficient of r = 0.87. Bootstrap analysis were used to evaluate the number of loci for the markers and the coefficients of variation (CV) revealed a skewed distribution. The dominant markers (AFLP and RAPD) had small CV values...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Diversity studies; Genetic distances; Maize; Molecular markers.
Ano: 2004 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572004000400019
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