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IMGT/Automat: the strategy for the annotation of human and mouse cDNA nucleotide sequences of IG and TR Nature Precedings
Géraldine Folch; Joumana Jabado-Michaloud; Fatena Bellahcene; Laetitia Regnier; Véronique Giudicelli; Marie-Paule Lefranc.
The cDNA sequences of immunoglobulins (IG) and T cell receptors (TR) represent more than one half of the sequences in the IMGT^®^ nucleotide database IMGT/LIGM-DB^1^ and 75% of them are from human and mouse. A few cDNA are germline but the great majority results from a V-D-J or V-J gene rearrangement, spliced to a C gene. The IG and TR genes have been studied extensively in IMGT^®^ ("http://www.imgt.org":http://www.imgt.org) ^2^, which allowed to set up their nomenclature and the corresponding germline reference sequences. These standardized reference directory sets (one for each group of each locus) and the IMGT-ONTOLOGY axioms and derived concepts^3^ are the key elements indispensable to perform the annotation of IG...
Tipo: Poster Palavras-chave: Genetics & Genomics; Immunology; Bioinformatics.
Ano: 2009 URL: http://precedings.nature.com/documents/3159/version/1
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