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Molecular modeling of manganese peroxidase from the lignin-degrading fungus Ceriporiopsis subvermispora and structural comparison with other peroxidases Electron. J. Biotechnol.
Canales,Mauricio; Lobos,Sergio; Vicuña,Rafael.
Ceriporiopsis subvermispora is a white-rot basidiomycete that produces several isoenzymes of manganese peroxidase (MnP· ). A cDNA of one of them (MnP13-1) has been isolated and sequenced. The deduced aminoacid sequence shows about 60% similarity with the MnPs from Phanerochaete chrysosporium. Based on the crystal structures of MnP and lignin peroxidase (LiP) from P. chrysosporium, and of a peroxidase from Arthromyces ramosus (ARP), we have modeled by homology the three dimensional structure of MnP13-1 using standard modeling procedures. Local molecular mechanics optimization performed in the region corresponding to the binding sites of Ca2+ and Mn2+ in MnP13-1 demonstrated that the stereochemistry and the geometry of binding are conserved in both MnPs. A...
Tipo: Journal article
Ano: 1998 URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0717-34581998000200006
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