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| Borba,Tereza Cristina de Oliveira; Brondani,Rosana Pereira Vianello; Breseghello,Flávio; Coelho,Alexandre Siqueira Guedes; Mendonça,João Antônio; Rangel,Paulo Hideo Nakano; Brondani,Claudio. |
| Association analysis was applied to a panel of accessions of Embrapa Rice Core Collection (ERiCC) with 86 SSR and field data from two experiments. A clear subdivision between lowland and upland accessions was apparent, thereby indicating the presence of population structure. Thirty-two accessions with admixed ancestry were identified through structure analysis, these being discarded from association analysis, thus leaving 210 accessions subdivided into two panels. The association of yield and grain-quality traits with SSR was undertaken with a mixed linear model, with markers and subpopulation as fixed factors, and kinship matrix as a random factor. Eight markers from the two appraised panels showed significant association with four different traits,... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Association analysis; Core collection; Genetic structure. |
| Ano: 2010 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572010000300023 |
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| Bueno,Luíce Gomes; Vianello,Rosana Pereira; Rangel,Paulo Hideo Nakano; Utumi,Marley Marico; Cordeiro,Antônio Carlos Centeno; Pereira,José Almeida; Franco,Daniel Fernandez; Moura Neto,Francisco; Mendonça,João Antônio; Coelho,Alexandre Siqueira Guedes; Oliveira,Jaison Pereira de; Brondani,Claudio. |
| O objetivo deste trabalho foi determinar o potencial produtivo e a interação entre genótipos e ambientes em 550 acessos da Coleção Nuclear de Arroz da Embrapa. O desempenho, a adaptação e a estabilidade produtiva de cada genótipo foram avaliados por meio da metodologia de análise dos efeitos principais aditivos e interações multiplicativas (AMMI), em nove experimentos de campo, realizados em seis Estados, em condição de sequeiro e irrigada, durante três anos agrícolas. Foi realizada a análise por meio de modelos lineares mistos, e as estimativas de componentes de variância foram obtidas pelo método de máxima verossimilhança residual (REML), com aplicação do procedimento de melhor predição linear não viesada (BLUP) para a predição dos valores genéticos dos... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Oryza sativa; AMMI; Caracterização agronômica; Modelo linear misto; Recursos genéticos; Variedades tradicionais. |
| Ano: 2012 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2012000200010 |
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| Mendes,Clistiane dos Anjos; Borba,Tereza Cristina de Oliveira; Bueno,Luíce Gomes; Cruzeiro,Gustavo Alencastro Veiga; Mendonça,João Antônio; Pantalião,Gabriel Feresin; Vianello,Rosana Pereira; Brondani,Claudio. |
| O objetivo deste trabalho foi identificar, por meio da análise de mapeamento associativo, os marcadores moleculares relacionados à produtividade do arroz de terras altas e aos seus caracteres componentes. Foram usadas 113 linhagens e cultivares de arroz de terras altas, da Coleção Nuclear de Arroz da Embrapa, com reduzido vínculo genético entre si. Os seguintes caracteres componentes da produtividade foram avaliados: número de panículas por metro, número de grãos por panícula e peso de 100 grãos. Dos 115 marcadores utilizados, 25 (21,7%) associaram-se significativamente a um ou mais caracteres. Entre os 29 SSR ("simple sequence repeats") colocalizados em QTL ("quantitative trait loci") de produtividade de arroz, 12 foram associados aos caracteres avaliados... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Oryza sativa; Coleção nuclear; Desequilíbrio de ligação; Genômica funcional; Mapeamento associativo; Seleção assistida por marcadores.. |
| Ano: 2014 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2014001000771 |
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| Rangel,Paulo Hideo Nakano; Moura Neto,Francisco Pereira; Fagundes,Paulo Ricardo Reis; Magalhães Junior,Ariano Martins de; Morais,Orlando Peixoto de; Schmidt,Andréa Branco; Mendonça,João Antônio; Santiago,Carlos Martins; Rangel,Priscila Nascimento; Cutrim,Veridiano dos Anjos; Ferreira,Márcio Elias. |
| The objective of this work was to develop new irrigated rice lines tolerant to imidazolinone herbicides. The backcross breeding procedure was used to transfer the imidazolinone tolerance allele from mutant 93AS3510 to the recurrent parents 'BRS 7 Taim' and 'BRS Pelota'. Individual herbicide-tolerant plants were selected in each generation, for three backcrossings (RC1 to RC3), followed by three selfing generations (RC3F1 to RC3F3). The best four RC3F3 lines for agronomic traits were genotyped with 44 microsatellite markers. The observed conversion index of the new imidazolinone-tolerant lines varied from 91.86 to 97.67%. Pairwise genetic distance analysis between these lines and 22 accessions from the Embrapa's Rice Germplasm Bank clustered the new lines... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Oryza sativa; Backcrossing; Clearfield rice; Microsatellites; Red rice. |
| Ano: 2010 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2010000700010 |
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