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A novel duplex qPCR assay for stepwise detection of multiple Perkinsea protistan infections of amphibian tissues ArchiMer
Smilansky, Vanessa; Chambouvet, Aurelie; Reeves, Mari; Richards, Thomas A.; Milner, David S..
Alveolate protists within the phylum Perkinsea have been found to infect amphibians across a broad taxonomic and geographic range. Phylogenetic analysis has suggested the existence of two clades of amphibian Perkinsea: a putatively non-pathogenic clade linked to asymptomatic infections of tadpoles in Africa, Europe and South America, and a putatively pathogenic clade linked to disease and mass mortality events of tadpoles in North America. Here, we describe the development of a duplex TaqMan qPCR assay to detect and discriminate between rDNA sequences from both clades of Perkinsea in amphibian tissues. The assay uses a single primer pair to target an 18S small subunit (SSU) ribosomal RNA (rRNA) gene region shared between the two clades, and two...
Tipo: Text Palavras-chave: Frog disease; Alveolate parasites; Quantitative PCR; Perkinsea; NAG01.
Ano: 2021 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00685/79758/82558.pdf
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