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Comparative metagenome of a stream impacted by the urbanization phenomenon BJM
Medeiros,Julliane Dutra; Cantão,Maurício Egídio; Cesar,Dionéia Evangelista; Nicolás,Marisa Fabiana; Diniz,Cláudio Galuppo; Silva,Vânia Lúcia; Vasconcelos,Ana Tereza Ribeiro de; Coelho,Cíntia Marques.
Abstract Rivers and streams are important reservoirs of freshwater for human consumption. These ecosystems are threatened by increasing urbanization, because raw sewage discharged into them alters their nutrient content and may affect the composition of their microbial community. In the present study, we investigate the taxonomic and functional profile of the microbial community in an urban lotic environment. Samples of running water were collected at two points in the São Pedro stream: an upstream preserved and non-urbanized area, and a polluted urbanized area with discharged sewage. The metagenomic DNA was sequenced by pyrosequencing. Differences were observed in the community composition at the two sites. The non-urbanized area was overrepresented by...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Aquatic environment; Urbanization; Microbial community; Metagenomic.
Ano: 2016 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1517-83822016000400835
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ABC transporters in Mycoplasma hyopneumoniae and Mycoplasma synoviae: insights into evolution and pathogenicity Genet. Mol. Biol.
Nicolás,Marisa Fabiana; Barcellos,Fernando Gomes; Nehab Hess,Pablo; Hungria,Mariangela.
ABC transporters represent one of the largest superfamilies of active membrane transport proteins (MTPs) with a highly conserved ATPase domain that binds and hydrolyzes ATP, supplying energy for the uptake of a variety of nutrients and for the extrusion of drugs and metabolic wastes. The complete genomes of a non-pathogenic (J) and pathogenic (7448) strain of Mycoplasma hyopneumoniae, as well as of a pathogenic (53) strain of Mycoplasma synoviae have been recently sequenced. A detailed study revealed a high percentage of CDSs encoding MTPs in M. hyopneumoniae strains J (13.4%), 7448 (13.8%), and in M. synoviae 53 (11.2%), and the ABC systems represented from 85.0 to 88.6% of those CDSs. Uptake systems are mainly involved in cell nutrition and some might be...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: ABC transporters; Bioinformatics; Genomes of microorganisms; Membrane transport proteins; Mycoplasma; Phylogeny of prokaryotes.
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572007000200006
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Identificação de QTL associados à simbiose entre Bradyrhizobium japonicum, B. elkanii e soja PAB
Santos,Maria Aparecida dos; Nicolás,Marisa Fabiana; Hungria,Mariangela.
O objetivo deste trabalho foi identificar QTL (locos de caráter quantitativo), utilizando marcadores do tipo microssatélites (SSR), relacionados à fixação biológica de nitrogênio (FBN), em uma população F2:7 de cultivares de soja (Glycine max) com diferentes capacidades de FBN, Bossier (alta) e Embrapa 20 (média). Foram mapeados 16 marcadores, distribuídos em seis grupos de ligação, cobrindo uma região de 5% do genoma (151,6 cM). A análise de regressão identificou 12 associações significativas em quatro grupos de ligação (B1, C2, D1b e H): três para a massa da parte aérea seca, quatro para número de nódulos, duas para a massa de nódulos e três para a massa média de nódulos. Todos os QTL detectados foram de efeitos menores. Contudo, sete marcadores foram...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Fixação biológica do nitrogênio; Marcadores moleculares; Mapa genético; Microssatélites; Nodulação; SSR.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2006000100010
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