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Can plant DNA barcoding be implemented in species-rich tropical regions? A perspective from São Paulo State, Brazil Genet. Mol. Biol.
Lima,Renato A. Ferreira de; Oliveira,Alexandre Adalardo de; Colletta,Gabriel Dalla; Flores,Thiago Bevilacqua; Coelho,Rubens L. Gayoso; Dias,Pedro; Frey,Gabriel Ponzoni; Iribar,Amaia; Rodrigues,Ricardo Ribeiro; Souza,Vinícius Castro; Chave,Jérôme.
Abstract DNA barcoding helps to identify species, especially when identification is based on parts of organisms or life stages such as seeds, pollen, wood, roots or juveniles. However, the implementation of this approach strongly depends on the existence of complete reference libraries of DNA sequences. If such a library is incomplete, DNA-based identification will be inefficient. Here, we assess if DNA barcoding can already be implemented in species-rich tropical regions. We focus on the tree flora of São Paulo state, Brazil, which contains more than 2000 tree species. Using new DNA sequence data and carefully assembled GenBank accessions, we assembled 12,113 sequences from ten different regions. The ITS, rbcL, psbA-trnH, matK and trnL regions were better...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Biodiversity assessment; Plant barcoding; Species conservation; Tree species.
Ano: 2018 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572018000400661
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Sobrevivência em viveiro de mudas de espécies nativas retiradas da regeneração natural de remanescente florestal PAB
Viani,Ricardo Augusto Gorne; Rodrigues,Ricardo Ribeiro.
O objetivo deste trabalho foi avaliar a sobrevivência em viveiro de plântulas retiradas da regeneração natural de remanescente de Floresta Estacional Semidecidual, localizado em Bofete, SP. Indivíduos com até 30 cm de espécies arbustivo-arbóreos foram coletados em parcelas instaladas previamente em remanescente florestal, transplantados para viveiro sob sombrite 50%, e avaliados periodicamente durante nove meses. Ao todo foram transferidos para o viveiro 2.424 indivíduos, pertencentes a 110 espécies. A taxa média de sobrevivência foi de 69%, com variação nos resultados para as diferentes espécies, famílias e classes de altura dos indivíduos. Embora espécies pioneiras tenham apresentado taxa de sobrevivência significativamente maior que não pioneiras,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Produção de mudas; Plântulas; Transplante de plântulas; Restauração florestal.
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2007000800002
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Seletividade dos herbicidas setoxidim, isoxaflutol e bentazon a espécies arbóreas nativas PAB
Brancalion,Pedro Henrique Santin; Isernhagen,Ingo; Machado,Ronan Pereira; Christoffoleti,Pedro Jacob; Rodrigues,Ricardo Ribeiro.
O objetivo deste trabalho foi avaliar a sensibilidade de espécies nativas usadas em recuperação de áreas degradadas aos herbicidas setoxidim, isoxaflutol e bentazon. As espécies estudadas foram Senna multijuga, Guazuma ulmifolia e Croton urucurana. Os tratamentos de herbicida consistiram de uma testemunha (sem aplicação) e aplicação de um quarto, metade, uma vez, duas vezes e quatro vezes a dose recomendada. As doses recomendadas são 184 g ha-1 de setoxidim, 37,5 g ha-1 de isoxaflutol e 720 g ha-1 de bentazon. Avaliaram-se os sintomas de fitotoxicidade, crescimento em altura, acréscimo no número de folhas e massa de matéria seca de folhas. Em outros experimentos, as doses recomendadas dos mesmos herbicidas foram aplicadas em outras 22 espécies arbóreas...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Fitotoxicidade; Herbicidas seletivos; Recuperação de áreas degradadas; Reflorestamentos; Restauração florestal.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2009000300005
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Composição florística da Reserva Municipal de Santa Genebra, Campinas, SP Rev. Bras. Bot.
Guaratini,Maria Tereza Grombone; Gomes,Eduardo Pereira Cabral; Tamashiro,Jorge Yoshio; Rodrigues,Ricardo Ribeiro.
O inventário florístico de um fragmento de floresta semidecídua foi conduzido durante o período de maio de 1996 a abril de 1998 em um hectare de floresta localizado na região central da Reserva de Santa Genebra (22º49'45" S e 47º06'33" W) a 580-610 m de altitude. Foram identificadas 201 espécies, distribuídas em 57 famílias e 147 gêneros. Fabaceae e Rubiaceae (18 espécies), Myrtaceae (14 spp.), Rutaceae (11 spp.), Solanaceae e Sapindaceae (nove spp.), Bignoniaceae, Meliaceae e Euphorbiaceae (oito spp.), Malvaceae (sete spp.) foram as famílias mais ricas. Cerca de 70% das espécies foram classificadas como secundárias tardias e secundárias tardias de sub-bosque. A comparação de espécies arbóreas com 25 fragmentos do Estado de São Paulo e Norte do Paraná...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Floresta semidecídua; Florística; Grupos sucessionais.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-84042008000200015
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Aspectos ecológicos de um trecho de floresta de brejo em Itatinga, SP: florística, fitossociologia e seletividade de espécies Rev. Bras. Bot.
Ivanauskas,Natália Macedo; Rodrigues,Ricardo Ribeiro; Nave,André Gustavo.
(Aspectos ecológicos de um trecho de floresta de brejo em Itatinga, SP: florística, fitossociologia e seletividade de espécies). No presente trabalho estudou-se um trecho de floresta de brejo localizada na fazenda Santa Irene, de propriedade da EUCATEX Ltda., no município de Itatinga-SP (48º38'52,2"W e 23º17'41,6"S), com uma área de 2 ha. O levantamento fitossociológico foi realizado através do método de censo de 1 ha do remanescente florestal, onde foram amostrados todos os indivíduos com PAP (perímetro à altura do peito) > a 15 cm. Foram amostrados 1310 indivíduos, pertencentes a 28 famílias, 34 gêneros e 39 espécies do estrato arbustivo-arbóreo. As famílias que apresentaram os maiores valores de IVC foram Clusiaceae (53,49), Burseraceae (41,30),...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Phytosociology; Swamp forest; Ciliar forest; Itatinga.
Ano: 1997 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-84041997000200005
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Dinâmica físico-hídrica de uma toposseqüência de solos sob Savana Florestada (Cerradão) em Assis, SP Rev. Bras. Ciênc. Solo
Juhász,Carlos Eduardo Pinto; Cursi,Patrícia Ribeiro; Cooper,Miguel; Oliveira,Thalita Campos; Rodrigues,Ricardo Ribeiro.
Este trabalho teve como objetivo a caracterização morfológica e físico-hídrica de uma toposseqüência de solos sob floresta nativa de uma parcela permanente de 320 x 320 m, instalada na Estação Ecológica de Assis (SP). A vegetação da parcela consiste em um remanescente de Savana Florestada (Cerradão) da zona limítrofe sul do grande domínio do Cerrado. O estudo da geometria bidimensional (horizontal e vertical) dos horizontes em uma toposseqüência possibilitou o detalhamento da morfologia do solo. Para estudar a dinâmica da água no ambiente de desenvolvimento das plantas nativas, foram obtidas curvas de retenção, análise granulométrica e medidas de condutividade hidráulica saturada no campo, utilizando o permeâmetro de Guelph. O monitoramento da umidade do...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Cerrado; Latossolo; Vertente; Umidade do solo; Retenção de água.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-06832006000300002
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Temperatura ótima de germinação de sementes de espécies arbóreas brasileiras Rev. bras. sementes
Brancalion,Pedro Henrique Santin; Novembre,Ana Dionísia Da Luz Coelho; Rodrigues,Ricardo Ribeiro.
O objetivo neste trabalho foi avaliar os aspectos ecológicos e aplicados da temperatura na germinação de sementes de espécies arbóreas brasileiras. Foram analisadas informações, obtidas por meio de dados secundários, sobre o efeito da temperatura na germinação de 272 espécies arbóreas nativas e estabelecidas as relações da temperatura ótima com o bioma de ocorrência e com o grupo sucessional da espécie. As temperaturas de 25 °C e 30 °C foram as mais favoráveis para a germinação, havendo relação entre a temperatura ótima e o bioma de ocorrência da espécie, mas não entre essa temperatura e o grupo sucessional. Com base nos resultados, é possível indicar que o teste de germinação com sementes de espécies arbóreas brasileiras seja conduzido mediante o uso de...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Ecofisiologia; Análise de sementes; Sementes florestais; Dormência; Grupos sucessionais.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0101-31222010000400002
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Permeability - impermeability: canopy trees as biodiversity filters Scientia Agricola
Gandolfi,Sergius; Joly,Carlos Alfredo; Rodrigues,Ricardo Ribeiro.
Each tropical and subtropical forest canopy species may create specific microsite conditions below its crown, which works as a filter for those species that attempt to regenerate below it. In function of the permeability or impermeability level, each canopy species could partially determine a plant community structure and composition beneath its crown projection. Therefore, present and future forest plant community biodiversity could be partially determined by the present structure of the canopy tree species community (filter effect). Some theoretical and practical aftermaths are suggested.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/other Palavras-chave: Tropical forest dynamics; Tree regeneration; Gap dynamics; Ecological filters; Forest biodiversity.
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-90162007000400015
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Plantas visitadas por abelhas africanizadas em duas localidades do estado de São Paulo Scientia Agricola
Marchini,Luís Carlos; Moreti,Augusta Carolina de Camargo Carmello; Teixeira,Erica Weinstein; Silva,Etelvina Conceição Almeida da; Rodrigues,Ricardo Ribeiro; Souza,Vinicius Castro.
O conhecimento das plantas de uma região, sua época de florescimento e as características do pólen, auxiliam na determinação das espécies vegetais que contribuem para a composição do mel. Durante o período de 1994 a 1997 foram inventariadas, semanalmente, em diferentes horários e num raio de aproximadamente 300m dos apiários da USP/ESALQ, em Piracicaba,SP (22°43'S, 47°27'W e 580 m) e do Instituto de Zootecnia, em Pindamonhangaba, SP (22°57'S, 45°27'W e 560 m), as plantas que estavam sendo visitadas por abelhas. Foram anotados o mês e o período de florescimento das plantas inventariadas. Em Piracicaba foram identificadas 94 espécies de plantas pertencentes a 41 famílias (maior número de espécies nas famílias Asteraceae e Myrtaceae) e em Pindamonhangaba, 76...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/report Palavras-chave: Apis mellifera; Abelha; Recurso floral; Similaridade.
Ano: 2001 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-90162001000200028
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Potential of the seedling community of a forest fragment for tropical forest restoration Scientia Agricola
Viani,Ricardo Augusto Gorne; Rodrigues,Ricardo Ribeiro.
Forest restoration projects are usually planted with a reduced number of species as compared to standing forests, largely due to the low availability of native species in seedling nurseries. In the present study, the potential of the native seedling community as a source of seedlings for forest restoration is analyzed. To do so, the seedling community from a forest fragment located in the southeast of Brazil was evaluated. Individuals (tree and shrub species) up to 30 cm height were measured and identified in 20 4 × 4 m plots. Altogether, 6,136 individuals (17 individuals m-2) belonging to 119 species were sampled. The seedling community showed a spatial heterogeneity with respect to the density of individuals and composition of species, and also a spatial...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Ecological restoration; Natural regeneration; Transplants; Seedling production; Forest nurseries.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-90162009000600008
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Priming of pioneer tree Guazuma ulmifolia (Malvaceae) seeds evaluated by an automated computer image analysis Scientia Agricola
Brancalion,Pedro Henrique Santin; Tay,David; Novembre,Ana Dionisia da Luz Coelho; Rodrigues,Ricardo Ribeiro; Marcos Filho,Júlio.
Direct seeding is one of the most promising methods in restoration ecology, but low field seedling emergence from pioneer tree seeds still reduces its large scale applicability. The aim of this research was to evaluate seed priming for the pioneer tree species Guazuma ulmifolia. Priming treatments were selected based on seed hydration curves in water and in PEG 8000 solution. Seeds were primed in water for 16 h and in Polyethylene glycol - PEG 8000 (-0.8 MPa for 56 and 88 h) at 20ºC to reach approximately 30% water content. Half of the seed sample of each treatment was dried back to the initial moisture content (7.2%); both dried and non-dried primed seeds as well as the unprimed seeds (control) were tested for germination (percentage and rate) and vigor...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: SVIS®; Forest seeds; Seed vigor; Restoration ecology; Direct seeding.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-90162010000300004
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Editorial Scientia Agricola
Rodrigues,Ricardo Ribeiro.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/other
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-90162007000400001
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Does crotalaria (Crotalaria breviflora) or pumpkin (Cucurbita moschata) inter-row cultivation in restoration plantings control invasive grasses? Scientia Agricola
César,Ricardo Gomes; Brancalion,Pedro Henrique Santin; Rodrigues,Ricardo Ribeiro; Oliveira,Aretha Medina dos Santos; Alves,Marcelo Corrêa.
Alternative methods to control invasive fodder grasses are necessary to reduce the use of herbicides in forest restoration, which has been carried out primarily in riparian zones. We sought to investigate if inter-row cultivation of crotalaria (Crotalaria breviflora DC) or pumpkin (Cucurbita moschata Duschene ex. Poir) with native tree species is an efficient strategy to control invasive fodder grasses in restoration plantings. We tested five treatments in a randomized block design, namely (1) control of brachiaria grass (Urochloa decumbens (Stapf.) Webster) with glyphosate in the implementation and post-planting grass control of the reforestation, (2 and 3) glyphosate use in the implementation and inter-row sowing of crotalaria (2) or pumpkin (3), and...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Forest restoration; Green manuring; Inter-row cultivation; Native species reforestation; Grass control.
Ano: 2013 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-90162013000400008
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Seed size-number trade-off in Euterpe edulis in plant communities of the Atlantic Forest Scientia Agricola
Brancalion,Pedro Henrique Santin; Rodrigues,Ricardo Ribeiro.
Investigations of seed size and number differences among plant populations growing in contrasting habitats can provide relevant information about ecological strategies that optimize reproductive effort. This may imply important consequences for biodiversity conservation and restoration. Therefore, we sought to investigate seed size-number trade-off in Euterpe edulis populations growing in plant communities in the Brazilian Atlantic Forest. Seed dry mass and seed number per bunch were evaluated in 2008 and 2009 in large remnants of the Seasonally Dry Forest, Restinga Forest and Atlantic Rainforest in southeastern Brazil, in 20 individuals per site and year. Seed size and seed number varied among forest types, but a seed size-number trade-off was neither...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Seed ecology; Seed dispersal; Seed size optimization; Plant reproductive effort; Seedling establishment.
Ano: 2014 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-90162014000300007
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Composição florística de trechos florestais na borda sul-amazônica Acta Amazonica
Ivanauskas,Natália Macedo; Monteiro,Reinaldo; Rodrigues,Ricardo Ribeiro.
Este estudo apresenta a composição florística de trechos de uma faixa de vegetação de transição existente na região centro-leste do Estado de Mato Grosso, mais precisamente no município de Gaúcha do Norte (13° 10'S e 53° 15' O), onde dá-se o contato entre a Floresta Ombrófila e a Floresta Estacional. O levantamento florístico foi realizado em março de 1999 e bimestralmente a partir de agosto de 1999 até março de 2001, em excursões com duração média de 5 dias, por meio de caminhadas na borda e no interior de florestas, sendo coletadas fanerógamas em fase reprodutiva. Também foram incluídas amostras vegetativas de espécies arbustivo-arbóreas, que não floresceram ou frutificaram durante o período de amostragem, amostradas em 3ha destinados ao levantamento...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Amazônia; Floresta amazônica; Flora.
Ano: 2004 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0044-59672004000300006
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Classificação fitogeográfica das florestas do Alto Rio Xingu Acta Amazonica
Ivanauskas,Natália Macedo; Monteiro,Reinaldo; Rodrigues,Ricardo Ribeiro.
Este trabalho propõe a inclusão da categoria Floresta Estacional Perenifólia no sistema oficial de classificação da vegetação brasileira, devido às particularidades florísticas e fisionômicas da floresta da borda sul-amazônica, que atinge maior amplitude geográfica na região do Alto Rio Xingu. Para justificar essa inclusão são apresentadas as características ambientais (clima, solo, hidrologia) e diferenças fisionômicas e florísticas entre as florestas do Alto Xingu e demais florestas ombrófilas da Bacia do Amazonas e estacionais do Planalto Central.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Amazônia; Floresta tropical; Fitogeografia.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0044-59672008000300003
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Estrutura de um trecho de floresta Amazônica na bacia do alto rio Xingu Acta Amazonica
Ivanauskas,Natália Macedo; Monteiro,Reinaldo; Rodrigues,Ricardo Ribeiro.
Este estudo apresenta a estrutura de florestas em Gaúcha do Norte-MT (13° 10'S e 53° 15' O), na borda sul-amazônica. Para o levantamento fitossociológico, três áreas amostrais de 1ha foram subdivididas em 50 parcelas de 10x20m, nas quais foram amostrados todos os indivíduos com perímetro à altura do peito (PAP) >15 cm. Para verificar a similaridade estrutural entre as áreas utilizou-se a Análise de Correspondência. As espécies indicadoras dos ambientes de interflúvio e das áreas sujeitas à inundação foram obtidas através do TWINSPAN e de um sistema de pesos. Concluiu-se que as florestas presentes na bacia do rio Pacuneiro pertencem à mesma unidade fitogeográfica, mas com subtipos florísticos e estruturais de acordo com a posição no relevo, a proximidade...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Amazônia; Xingu; Floresta Amazônica; Estrutura florestal.
Ano: 2004 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0044-59672004000200015
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Species-specific associations between overstory and understory tree species in a semideciduous tropical forest Acta Botanica
Souza,Flaviana Maluf; Gandolfi,Sergius; Rodrigues,Ricardo Ribeiro.
We investigated the occurrence of associations between overstory and understory tree species in a semideciduous tropical forest. We identified and measured all trees of nine canopy species with diameter at breast height ≥4.8 cm in a 10.24 ha plot and recorded all individuals beneath their canopies ("understory individuals") within the same diameter class. The total density of understory individuals did not significantly differ under different overstory species. One overstory species (Ceiba speciosa) showed higher understory species richness compared with five other species. There was a strong positive association between three overstory species (Esenbeckia leiocarpa, Savia dictyocarpa, and C. speciosa) and the density of seven understory species...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Environmental heterogeneity; Facilitation; Plant-plant interaction; Rarefaction; Species richness.
Ano: 2015 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-33062015000100073
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Germinação de Ternstroemia brasiliensis Cambess. (Pentaphylacaceae) de floresta de restinga Acta Botanica
Pires,Luciana Andréa; Cardoso,Victor José Mendes; Joly,Carlos Alfredo; Rodrigues,Ricardo Ribeiro.
A partir de ensaios de germinação no campo e no laboratório, este trabalho visa contribuir para o conhecimento da ecologia da regeneração de Ternstroemia brasiliensis Cambess. em Floresta de Restinga. As sementes são dispersas com teores de água relativamente altos e apresentam baixa tolerância ao armazenamento, podendo ser consideradas recalcitrantes. A germinabilidade é elevada, indiferente à luz e não é afetada pela presença do arilo. A ausência de dormência e a pequena resposta ao vermelho extremo devem permitir pronta germinação no sub-bosque, não constituindo banco de sementes no solo da Restinga. As temperaturas de 25 ºC e 30 ºC podem ser consideradas ótimas para a germinação de T. brasiliensis. A luz pode afetar parâmetros da resposta das sementes...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Ecofisiologia; Graus-dia; Luz; Sementes; Temperatura.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-33062009000100007
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Structure, diversity, and spatial patterns in a permanent plot of a high Restinga forest in Southeastern Brazil Acta Botanica
Lima,Renato Augusto Ferreira de; Oliveira,Alexandre Adalardo de; Martini,Adriana Maria Zanforlin; Sampaio,Daniela; Souza,Vinícius Castro; Rodrigues,Ricardo Ribeiro.
We assessed the structure, diversity and distribution of tree species in a 10.24-ha permanent plot of high Restinga forest (HRF) in southeastern Brazil. We sampled 15,040 individuals belonging to 45 families, 87 genera and 116 species (density= 1,468 trees ha-1, and basal area= 28.0 m² ha-1). Mean richness was lower than other types of tropical forests and other HRFs that have been less intensively sampled, which is probably due to the younger age and hydromorphy of the soils in the study site. Tree density, basal area, species composition, and diversity all varied considerably depending on the size class considered. The studied plot had a density similar to other tropical forests but with a smaller basal area (fewer individuals > 60 cm in diameter),...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Atlantic Forest; Multi-stemmed trees; Species richness; Tree size classes.
Ano: 2011 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-33062011000300017
Registros recuperados: 31
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