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| Registros recuperados: 20 | |
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| BEZERRA, G. B. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; VIEIRA, F. D.; SANTOS, E. H. dos; NARCISO, M. G.; FALCAO, P. R. K.. |
| O modelo matemático da estrutura protéica é fundamental não só para a visualização, mas, principalmente, para o cálculo de parâmetros estruturais como área da superfície e volume. É possível usar a geometria computacional para efetuar o cálculo analítico de tais parâmetros. Neste trabalho, usando Alpha-shapes, um algoritmo para o cálculo analítico de área da superfície e volume de estruturas protéicas do Protein Data Bank (PBD) é descrito. Esta implementação supera as demais, pois consegue calcular tais parâmetros para estruturas protéicas onde as demais implementações falham |
| Tipo: Livros |
Palavras-chave: Bioinformática; Geometria computacional; Triangulação de Delaunay; Teoria Alpha Shapes; Estrutura de proteína. |
| Ano: 2007 |
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1327 |
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| OLIVEIRA, S. R. de M.; YAMAGISHI, M. E. B.; BORRO, L. C.; FALCAO, P. R. K.; SANTOS, E. H. dos; VIEIRA, F. D.; MAZONI, I.; JARDINE, J. G.; NESHICH, G.. |
| Os principais desafios relacionados ao problema de classificação de enzimas em banco de dados de estruturas de proteínas são: 1) o ruído presente nos dados; 2) o grande número de variáveis; 3) o número não-balanceado de membros por classe. Para abordar esses desafios, apresenta-se uma metodologia para seleção de parâmetros, que combina recursos de matemática (ex: Transformada Discreta do Cosseno) e da estatística (ex:.g., correlação de variáveis e amostragem com reposição). A metodologia foi validada considerando-se os três principais métodos de classificação da literatura, a saber; árvore de decisão, classificação Bayesiana e redes neurais. Os experimentos demonstram que essa metodologia é simples, eficiente e alcança resultados semelhantes àqueles... |
| Tipo: Folhetos |
Palavras-chave: Bioinformática; Classificação de proteínas; Mineração de dados. |
| Ano: 2006 |
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/2836 |
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| CASTRO, A. de; ALVES, A. L.; SANTOS, E. H. dos; AMARAL, F. R.; BACCARIN, F. A.; RIVA, J. D.; GONZALES, L. E.; MATTEI, R.. |
| Neste Comunicado Técnico, aspectos gerais de funcionamento e a interface frontal (front-end) do sistema informatizado são apresentados a partir dos resultados obtidos no Acordo de Cooperação Técnica 23800.23/0001-5 (Brasil, 2023a) firmado entre a Embrapa Agricultura Digital e a empresa de rastreabilidade Ferpall Tecnologia Ltda para operar um modelo de plataforma de gestão de dados integrada ao Sibraar. |
| Tipo: Folhetos |
Palavras-chave: Sibraar; Sistema Brasileiro de Agrorrastreabilidade; Agrorrastreabilidade; Blockchain; Integridade da informação. |
| Ano: 2023 |
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1160154 |
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| NARCISO, M. G.; YAMAGISHI, M. E. B.; QUINAGLIA, T.; SANTOS, E. H. dos; VIEIRA, F. D.; JARDINE, J. G.; MAZONI, I.; FALCAO, P. R. K.; NESHICH, G.. |
| O software Sting é um software voltado para a Bioinformática e, d eforma geral, faz análise de estrutura de proteínas e mostra de forma especializada qualquer proteína cuja estrutura está em arquivos .pdf, que contém dados sobre proteínas, podendo ser acessados em Research Collaboratory for Structural Bionformatics. |
| Tipo: Folhetos |
Palavras-chave: Co-evolução; Aminoácidos; Bioinformática; Sting. |
| Ano: 2006 |
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/3005 |
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| GERMANO, E.; NARCISO, M. G.; SANTOS, E. H. dos. |
| Resumo. O crescente número de componentes de software a serem integrados e testados durante o processo de implantação de um sistema exige pleno controle de alocação dos recursos computacionais. A solução utilizada durante o desenvolvimento do GeneMaisLab, "Sistema gerenciador de dados de genotipagem", consiste no uso de serviços da plataforma Docker e do sistema de distribuição de carga HAProxy para o escalonamento dos serviços web. O Docker é uma ferramenta projetada para facilitar a criação, a implementação e a execução de aplicativos usando containers. Esses permitem que um desenvolvedor empacote um aplicativo com todas as partes que precisa, como bibliotecas e outras dependências, e envie tudo como um único pacote de software. A solução utilizada no... |
| Tipo: Folhetos |
Palavras-chave: Plataforma Docker; GeneMaisLab; HAProxy. |
| Ano: 2018 |
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1101381 |
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| SANTOS, E. H. dos. |
| Um dos objetivos da Rede Genômica Animal é a identificação de genes que contribuam para o melhoramento de características de interesse econômico em animais de produção. Uma das ferramentas para prospecção e análise desses genes é o Microarranjo de DNA, uma técnica que permite avaliar a expressão gênica em condições específicas. Apesar de seu uso amplamente difundido na comunidade científica, os procedimentos e as informações de experimentos nem sempre são padronizados, a despeito dos esforços na criação de uma linguagem padrão como o MAGE-ML. Este documento visa apresentar o padrão MAGE-ML para aqueles que ainda não se utilizam desse recurso e gostariam de aprender um pouco a respeito. |
| Tipo: Folhetos |
Palavras-chave: Microarranjo de DNA; MAGE-ML; Expressão gênica; Microarray technology; Gene expression. |
| Ano: 2010 |
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/883658 |
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| NARCISO, M. G.; YAMAGISHI, M. E. B.; QUINAGLIA, T.; SANTOS, E. H. dos; VIEIRA, F. D.; JARDINE, J. G.; MAZONI, I.; FALCAO, P. R. K.; NESHICH, G.. |
| Análise, de forma visual, de como algumas grandezas físico-químico estão presentes na interface proteica. A proteína é mostrada em 3 dimensões(3D). Cada região da cadeia proteic é colorida com uma cor diferente, representando a variaçao de características físico-químicas na cadeia |
| Tipo: Folhetos |
Palavras-chave: Bioinformática; Superfície 3D; Interface proteicas; Sting. |
| Ano: 2006 |
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/3012 |
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| Registros recuperados: 20 | |
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