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Demande de deuxième prolongation de l’ouverture du gisement naturel d’huîtres creuses à éclipse au sein de la zone 44.09 Estuaire Loire ArchiMer
Piquet, Jean-come; Schmitt, Anne; Cochennec-laureau, Nathalie.
Tipo: Text
Ano: 2018 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00467/57845/79477.pdf
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Microbial balance, and triggering of recent mussel mortality events in France: Is there a link? ArchiMer
Guesdon, Stephane; Travers, Marie-agnes; Hervio Heath, Dominique; Derrien, Annick; Genauzeau, Sylvie; Schmitt, Anne; Quintric, Laure; Leroi, Laura; Pepin, Jean-francois.
Since the spring of 2014, the mussel farming of Charente-Maritime and Vendée (French Atlantic coast) has experienced an unprecedented crisis. Mass mortality events of blue mussel (M. edulis) have affected livestock areas, decimating up to 100% of production in some farming areas. Investigation for infectious agents in moribund mussels revealed presence of bacteria capable of inducing mortalities. In this context, the MORBLEU research project (DPMA-Ifremer agreement) was initiated to explore potentially aggravating factors, associated or correlated with mortality of mussels. The aim of the present study is to support the hypothesis that these mortality episodes can be linked to an evolution of microbial communities. Based on historical data from Ifremer...
Tipo: Text
Ano: 2017 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00415/52696/53566.pdf
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Suivi « hydrologie » et « phytoplancton » des masses d'eau du bassin hydrographique Adour-Garonne en 2007-2012 ArchiMer
Auby, Isabelle; D'Amico, Florence; Barbier, Claire; Maurer, Daniele; Gouriou, Laure; Plus, Martin; Rigouin, Loic; Rumebe, Myriam; Tournaire, Marie-pierre; Trut, Gilles; Oger-jeanneret, Helene; Derrien, Annick; Genauzeau, Sylvie; Schmitt, Anne; Charpentier, Gabriel; Seugnet, Jean-luc; Grizon, James; Geairon, Philippe; Guilpain, Patrice; Thomas, Gerard; Guesdon, Stephane; Chabirand, Jean-michel; Soudant, Dominique; Lamoureux, Alice; Llevot, Gerard; Beaugrand, Philippe; Michel, Valérie; Petrau, Christian; Bariou, Jean; Landier, Pascal; Miguel, Valérie.
Ce rapport rend compte des résultats acquis entre 2007 et 2012 sur les paramètres hydrologiques et le phytoplancton, dans le cadre des réseaux REPHY et ARCHYD (pour les points du Bassin d’Arcachon), et celui du contrôle de surveillance des masses d'eau du district Adour-Garonne qui ne faisaient pas l’objet de suivi avant la mise en œuvre de la DCE. Ce document contient des résultats concernant les éléments de qualité physico-chimique (oxygène dissous et nutriments pour les deux types de masses d’eau, température et transparence pour les masses d’eau côtières exclusivement) selon des méthodes présentées dans quatre documents (Daniel, 2009 a et b ; Daniel et Soudant, 2010, 2011), qui sont rapportées dans une annexe de ce rapport. Sont également inclues dans...
Tipo: Text
Ano: 2013 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00152/26281/24364.pdf
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Demande de prolongation de l'arrêté d'exploitation du gisement naturel d'huîtres creuses au sein de la zone 44.09 Estuaire Loire ArchiMer
Piquet, Jean-come; Schmitt, Anne; Cochennec-laureau, Nathalie.
Tipo: Text
Ano: 2018 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00436/54737/79479.pdf
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Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole. Département de Loire-Atlantique. Edition 2021 ArchiMer
Schmitt, Anne; Piquet, Jean-come.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et la méthode d’interprétation des résultats, ce rapport décrit les résultats obtenus en 2020 pour le réseau de surveillance de la contamination microbiologique REMI et du réseau d’observation de la contamination chimique ROCCH du département de Loire-Atlantique. Il présente l’estimation de la qualité microbiologique et chimique des zones de production de coquillages classées. En 2020, il y a eu 32 alertes déclenchées : 24 de niveau 0, 7 de niveau 1 et 1 de niveau 2. Sur 29 zones classées, deux zones présentes des discordances de classement et quatre zones n’ont pas suffisamment de données pour être classées. Sur les deux zones dont le classement sanitaire ne concorde pas avec l’estimation de la qualité, les...
Tipo: Text Palavras-chave: Ifremer; REMI; Escherichia coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Estimation de la qualité sanitaire des zones de production; Département de Loire-Atlantique.
Ano: 2021 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00691/80289/83402.pdf
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Rapport d'activités 2017 du Laboratoire Environnement Ressources du Morbihan Pays de Loire ArchiMer
Cochennec-laureau, Nathalie; Bizzozero, Lucie; Blouin, Antoine; Bonneau, Francoise; Bouget, Jean-francois; Collin, Karine; Fortune, Mireille; Gabellec, Raoul; Le Merrer, Yoann; Manach, Soazig; Mellor, Alice; Pierre-duplessix, Olivier; Reboul, Sebastien; Retho, Michael; Schapira, Mathilde; Schmitt, Anne; Souchu, Philippe; Stanisiere, Jean-yves; Treguier, Cathy.
Ce rapport présente les activités d'observation et de surveillance de la qualité des eaux littorales du Morbihan, de la Loire Atlantique et du Nord Vendée et les résultats des projets de recherche.
Tipo: Text Palavras-chave: Réseaux de surveillance et d’observation; Qualité des écosystèmes marins littoraux du Morbihan; Pays de Loire; Microbiologie; Phytoplancton; Eutrophisation; Ressources exploitées; Huîtres; Moules.
Ano: 2018 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00439/55061/56484.pdf
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Suivi « hydrologie » et « phytoplancton » des masses d'eau du bassin hydrographique Adour-Garonne en 2006-2011 ArchiMer
Auby, Isabelle; D'Amico, Florence; Neaud-masson, Nadine; Rumebe, Myriam; Barbier, Claire; Duval, Magali; Tournaire, Marie-pierre; Trut, Gilles; Plus, Martin; Maurer, Daniele; Ryckaert, Mireille; Derrien, Annick; Margat, Sylvie; Schmitt, Anne; Charpentier, Gabriel; Seugnet, Jean-luc; Grizon, James; Geairon, Philippe; Guilpain, Patrice; Thomas, Gerard; Guesdon, Stephane; Llevot, Gerard; Beaugrand, Philippe; Carrere, Christian; Michel, Valerie; Petrau, Christian; Bariou, Jean; Landier, Pascal; Debinski, Olivier; Le Mao, André; Miguel, Valérie.
Ce rapport rend compte des résultats acquis entre 2006 et 2011 sur les paramètres hydrologiques et le phytoplancton, dans le cadre des réseaux REPHY et ARCHYD (pour les points du Bassin d’Arcachon), et celui du contrôle de surveillance des masses d'eau du district Adour-Garonne qui ne faisaient pas l’objet de suivi avant la mise en œuvre de la DCE. Ce document contient des résultats concernant les éléments de qualité physico-chimique (oxygène dissous pour les deux types de masses d’eau, température et transparence pour les masses d’eau côtières exclusivement) selon des méthodes présentées dans trois documents (Daniel, 2009 a et b ; Daniel et Soudant, 2011), qui sont rapportées dans une annexe de ce rapport. Sont également inclues dans ce document les...
Tipo: Text
Ano: 2012 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00111/22193/19862.pdf
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Directive cadre sur l’eau Bassin Loire-Bretagne. Contrôles de surveillance et opérationnel dans les masses d’eau côtières et de transition. Actions menées par Ifremer en 2011 ArchiMer
Oger-jeanneret, Helene; Allenou, Jean-pierre; Cheve, Julien; Collin, Karine; Dagault, Francoise; Derrien, Annick; Doner, Anne; Duval, Audrey; Faure, Sandra; Fortune, Mireille; Gabellec, Raoul; Genauzeau, Sylvie; Le Merrer, Yoann; Queau, Julie; Piriou, Jean-yves; Retho, Michael; Schmitt, Anne; Truquet, Isabelle.
La Directive Cadre sur l’Eau 2000/60/CE établit un nouveau cadre pour une politique communautaire dans le domaine de l’eau. Elle fixe comme objectif général l’atteinte, à l’horizon 2015, d’un bon état écologique et chimique des masses d’eau souterraines et de surface, ces dernières incluant les eaux côtières et de transition (estuaires en particulier). Les masses d’eau côtières et de transition sont des unités géographiques cohérentes, qui ont été définies sur la base de critères physiques ayant une influence avérée sur la biologie : * critères hydrodynamiques (courant, marnage, stratification, profondeur… ), * critères sédimentologiques (sable, vase, roche… ). Dans le bassin Loire-Bretagne, qui s’étend du Mont Saint-Michel à La Rochelle, le groupe de...
Tipo: Text
Ano: 2012 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00108/21940/19534.pdf
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Bilan des observations hydrologiques du secteur côtier au large de la Loire et de la Vilaine en 2016 ArchiMer
Retho, Michael; Bizzozero, Lucie; Le Merrer, Yoann; Manach, Soazig; Collin, Karine; Fortune, Mireille; Schmitt, Anne; Gabellec, Raoul; Souchu, Philippe; Cochennec-laureau, Nathalie.
Ce rapport décrit le contexte hydrologique du littoral côtier du Morbihan, de la Loire Atlantique et de la Vendée Nord, sous l'influence des deux fleuves la Loire et la Vilaine, durant l'année 2016. Il s'appuie sur les suivis environnementaux réalisés dans le cadre des réseaux REPHY et DCE, complétés par les données acquises en haute fréquence sur la bouée MOLIT (réseau COAST HF-HOSEA).
Tipo: Text Palavras-chave: Hydrologie; DCE; Nutriment; Loire Bretagne; REPHY; Phytoplancton.
Ano: 2017 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00416/52720/53593.pdf
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Etude sanitaire du traict de Pen Bé. Zone N° 44.03. Département de Loire-Atlantique ArchiMer
Treguier, Cathy; Schmitt, Anne; Cochennec-laureau, Nathalie; Piquet, Jean-come.
L’étude de zone sanitaire du traict de Pen Bé (44.03) a été menée afin d’envisager un découpage en deux sous-secteurs Nord et Sud de l’actuelle zone classée pour les coquillages fouisseurs, et de déterminer les points de suivis REMI associés pour la surveillance ultérieure. Cette étude sanitaire a été réalisée par l’Ifremer dans le cadre de ses missions d’appui à l’Etat pour la définition d’une stratégie de surveillance pertinente, conforme aux exigences du règlement (CE) n°854/2004. L’étude comprend une étude de dossier identifiant les sources de contamination microbiologiques et une évaluation de leurs impacts sur les zones de pêche ou d’élevage des coquillages fouisseurs, puis une analyse des résultats des suivis réalisés à la fois dans le cadre du...
Tipo: Text Palavras-chave: REMI; E. Coli; Contamination bactériologique des coquillages; Contaminants chimiques; Milieu marin; Étude sanitaire; Traict de Pen Bé; Département de Loire-Atlantique.
Ano: 2018 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00425/53629/54464.pdf
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Note sur les eaux colorées observées au large de la Loire et de la Vilaine en avril 2017 ArchiMer
Souchu, Philippe; Retho, Michael; Schapira, Mathilde; Fortune, Mireille; Manach, Soazig; Schmitt, Anne; Cochennec-laureau, Nathalie.
Tipo: Text
Ano: 2017 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00385/49642/81466.pdf
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Rapport d'activités 2019 du Laboratoire Environnement Ressources du Morbihan Pays de Loire ArchiMer
Cochennec-laureau, Nathalie; Bizzozero, Lucie; Bonneau, Francoise; Bouget, Jean-francois; Bouvier, Calypso; Collin, Karine; Fortune, Mireille; Gabellec, Raoul; Le Merrer, Yoann; Manach, Soazig; Pierre-duplessix, Olivier; Retho, Michael; Roux, Pauline; Schapira, Mathilde; Schmitt, Anne; Souchu, Philippe; Stanisiere, Jean-yves; Villedieu, Anouk.
Activités d’observation, de surveillance de la qualité des eaux littorales du Morbihan, Pays de la Loire et Nord Vendée et résultats des projets de recherche 2019
Tipo: Text Palavras-chave: Réseaux de surveillance et d’observation; Qualité des écosystèmes marins littoraux du Morbihan; Pays de la Loire; Microbiologie; Phytoplancton; Eutrophisation; Ressources exploitées; Huîtres; Moules.
Ano: 2020 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00630/74217/73849.pdf
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Suivi « hydrologie » et « phytoplancton » des masses d'eau du bassin hydrographique Adour-Garonne en 2008-2013 ArchiMer
Auby, Isabelle; D'Amico, Florence; Barbier, Claire; Ganthy, Florian; Maurer, Daniele; Gouriou, Laure; Rigouin, Loic; Rumebe, Myriam; Tournaire, Marie-pierre; Trut, Gilles; Oger-jeanneret, Helene; Robert, Serge; Guesdon, Stephane; Derrien, Annick; Chabirand, Jean-michel; Charpentier, Gabriel; Genauzeau, Sylvie; Schmitt, Anne; Geairon, Philippe; Grizon, James; Seugnet, Jean-luc; Thomas, Gerard; Bechemin, Christian; Soudant, Dominique; Lamoureux, Alice; Llevot, Gerard; Beaugrand, Philippe; Michel, Valerie; Dupin, Michel; Bariou, Jean; Landier, Pascal; Miguel, Véronique.
Ce rapport rend compte des résultats acquis entre 2008 et 2013 sur les paramètres hydrologiques et le phytoplancton, dans le cadre des réseaux REPHY et ARCHYD (pour les points du Bassin d’Arcachon), et celui du contrôle de surveillance des masses d'eau du district Adour-Garonne qui ne faisaient pas l’objet de suivi avant la mise en œuvre de la DCE. Ce document contient des résultats concernant les éléments de qualité physico-chimique (oxygène dissous et nutriments pour les deux types de masses d’eau, température et transparence pour les masses d’eau côtières exclusivement) selon des méthodes présentées dans une annexe de ce rapport. Sont également inclues dans ce document les données d'évaluation de la qualité des masses d'eau vis-à-vis de l'indicateur «...
Tipo: Text
Ano: 2014 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00225/33615/32015.pdf
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Suivi hydrologie et phytoplancton des masses d'eau du bassin hydrographique Adour-Garonne en 2003-2008 ArchiMer
Auby, Isabelle; D'Amico, Florence; Duval, Magali; Neaud-masson, Nadine; Plus, Martin; Rumebe, Myriam; Tournaire, Marie-pierre; Trut, Gilles; Ryckaert, Mireille; Derrien, Annick; Genauzeau, Sylvie; Schmitt, Anne; Charpentier, Gabriel; Grizon, James; Seugnet, Jean-luc; Thomas, Gerard; Llevot, Gérard; Beaugrand, Philippe; Carrere, Christian; Michel, Valérie; Petrau, Christian; Bariou, Jean; Debinski, Olivier; Le Mao, André.
La Directive Cadre sur l’Eau 2000/60/CE établit un nouveau cadre pour une politique communautaire dans le domaine de l’eau. Elle fixe comme objectif général l’atteinte, à l’horizon 2015, d’un bon état écologique et chimique des masses d’eau souterraines et de surface, ces dernières incluant les eaux côtières et de transition (estuaires en particulier).
Tipo: Text
Ano: 2010 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00032/14354/11640.pdf
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Demande d'exploitation d'un gisement naturel à éclipse "44.09 Estuaire de la Loire" ArchiMer
Piquet, Jean-come; Schmitt, Anne; Cochennec-laureau, Nathalie.
Tipo: Text
Ano: 2017 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00403/51484/79481.pdf
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Optimisation of growth conditions for continuous culture of the hyperthermophilic archaeon Thermococcus hydrothermalis and development of sulphur-free defined and minimal media ArchiMer
Postec, Anne; Pignet, Patricia; Cueff-gauchard, Valerie; Schmitt, Anne; Querellou, Joel; Godfroy, Anne.
The hyperthermophilic archaeon Thermococcus hydrothermalis was cultivated in continuous culture in a gas-lift bioreactor in the absence of elemental sulphur on both proteinaceous and maltose-containing media. Optimal conditions (pH, temperature and gas flow rate), determined on complex media that yielded maximal growth rate and maximal steady state cell density, were obtained at 80degreesC, pH 6 and gas sparging at 0.2 v v(-1) min(-1). Higher steady state cell densities were obtained on a medium containing maltose and yeast extract. In order to design a defined and minimal media, the nutritional requirements of T hydrothermalis were then investigated using continuous culture in the absence of elemental sulphur in the gas-lift bioreactor. First, the complex...
Tipo: Text Palavras-chave: Bioreactor; Defined and minimal media; Culture optimisation; Gas lift bioreactor; Thermococcus hydrothermalis.
Ano: 2005 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2005/publication-365.pdf
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Expertise sur le contexte hydro-climatologique de la Baie de Pénestin pour décrire les conditions physico-chimiques environnementales et l'impact possible sur les mortalités de moules ArchiMer
Cochennec-laureau, Nathalie; Schapira, Mathilde; Bouget, Jean-francois; Manach, Soazig; Retho, Michael; Le Merrer, Yoann; Schmitt, Anne; Pierre-duplessix, Olivier; Gabellec, Raoul; Normand, Julien; Combette, Agnes.
Tipo: Text
Ano: 2018 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00457/56879/79184.pdf
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Suivi hydrologie et phytoplancton des masses d'eau du bassin hydrographique Adour-Garonne en 2005-2010 ArchiMer
Auby, Isabelle; D'Amico, Florence; Barbier, Claire; Duval, Magali; Neaud-masson, Nadine; Plus, Martin; Rumebe, Myriam; Tournaire, Marie-pierre; Trut, Gilles; Ryckaert, Mireille; Derrien, Annick; Margat, Sylvie; Schmitt, Anne; Charpentier, Gabriel; Seugnet, Jean-luc; Thomas, Gerard; Guesdon, Stephane; Llevot, Gerard; Beaugrand, Philippe; Carrere, Christian; Michel, Valérie; Petrau, Christian; Bariou, Jean; Landier, Pascal; Debinski, Olivier; Le Mao, André.
Ce rapport rend compte des résultats acquis entre 2005 et 2010 sur les paramètres hydrologiques et le phytoplancton, dans le cadre des réseaux REPHY et ARCHYD (pour les points du Bassin d’Arcachon), et celui du contrôle de surveillance des masses d'eau du district Adour-Garonne qui ne faisaient pas l’objet de suivi avant la mise en œuvre de la DCE. Ce document contient des résultats concernant les éléments de qualité physico-chimique (oxygène dissous pour les deux types de masses d’eau, température et transparence pour les masses d’eau côtières exclusivement) selon des méthodes présentées dans trois documents (Daniel, 2009 a et b ; Daniel et Soudant, 2011), qui sont rapportées dans l’annexe 1 de ce rapport. Sont également inclues dans ce document les...
Tipo: Text
Ano: 2011 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00069/18021/15553.pdf
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Suivi « hydrologie » et « phytoplancton » des masses d'eau du bassin hydrographique Adour-Garonne sur la période 2009-2014 ArchiMer
Auby, Isabelle; D'Amico, Florence; Meteigner, Claire; Ganthy, Florian; Maurer, Daniele; Gouriou, Laure; Rigouin, Loic; Rumebe, Myriam; Tournaire, Marie-pierre; Trut, Gilles; Oger-jeanneret, Helene; Guesdon, Stephane; Derrien, Annick; Chabirand, Jean-michel; Charpentier, Gabriel; Genauzeau, Sylvie; Schmitt, Anne; Geairon, Philippe; Grizon, James; Seugnet, Jean-luc; Thomas, Gerard; Bechemin, Christian; Soudant, Dominique; Lamoureux, Alice; Beaugrand, Philippe; Noureau, Bruno; Michel, Valérie; Dupin, Michel; Bariou, Jean; Landier, Pascal; Miguel, Véronique.
Ce rapport rend compte des résultats acquis entre 2009 et 2014 sur les paramètres hydrologiques et le phytoplancton, dans le cadre des réseaux REPHY et ARCHYD (pour les points du Bassin d’Arcachon), et celui du contrôle de surveillance des masses d'eau du bassin Adour-Garonne qui ne faisaient pas l’objet de suivi avant la mise en oeuvre de la DCE. Ce document contient des résultats concernant les éléments de qualité physicochimique (oxygène dissous pour les deux types de masses d’eau, azote inorganique dissous pour les masses d’eau côtières et les masses d’eau de transition peu turbides, température et transparence pour les masses d’eau côtières exclusivement) selon des méthodes présentées dans trois documents (Daniel, 2009 a et b ; Daniel et Soudant,...
Tipo: Text
Ano: 2015 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00280/39141/37696.pdf
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Première évaluation de la diversité des communautés microbiennes planctoniques au cours d'épisodes de mortalité des moules bleues en France : utilisation de l'approche de métabarcoding pour l'analyse de l'ADN environnemental ArchiMer
Pepin, Jean-francois; Bouget, Jean-francois; Chabirand, Jean-michel; Chasselin, Leo; Costes, Louis; Grizon, James; Lejolivet, Aurore; Le Noc, Sandrine; Palvadeau, Hubert; Schmitt, Anne; Seugnet, Jean-luc; Soletchnik, Patrick; Travers, Marie-agnes; Tourbiez, Delphine; Guesdon, Stephane.
Since 2014 in France, in Charente maritime and Vendée, farmed and stocks of blue mussels experienced strong mortality events. In this context, the « MORBLEU » research project (DPMA-Ifremer agreement) was initiated to explore potentially aggravating factors, associated or correlated with mortality of mussels. Here, the work is to study biotic factors in mussels environment, looking for describe diversity and evolution of microbial communities (water column) before, during and after mortality events using NGS technology (metabarcoding) for environmental DNA analysis. We present, sampling strategy used from 2015 to 2018, Material & Methods and some preliminary results.  
Tipo: Text Palavras-chave: MORBLEU; Moules; Mortalité; ADN environnemental; EDNA; Metabarcoding; Communautés microbiennes.
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00505/61664/65579.pdf
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