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The gill chamber epibiosis of deep-sea shrimp Rimicaris exoculata: an in-depth metagenomic investigation and discovery of Zetaproteobacteria ArchiMer
Jan, Cyrielle; Petersen, Jillian M.; Werner, Johannes; Teeling, Hanno; Huang, Sixing; Gloeckner, Frank Oliver; Golyshina, Olga V.; Dubilier, Nicole; Golyshin, Peter N.; Jebbar, Mohamed; Cambon-bonavita, Marie-anne.
The gill chamber of deep-sea hydrothermal vent shrimp Rimicaris exoculata hosts a dense community of epibiotic bacteria dominated by filamentous Epsilonproteobacteria and Gammaproteobacteria. Using metagenomics on shrimp from the Rainbow hydrothermal vent field, we showed that both epibiont groups have the potential to grow autotrophically and oxidize reduced sulfur compounds or hydrogen with oxygen or nitrate. For carbon fixation, the Epsilonproteobacteria use the reductive tricarboxylic acid cycle, whereas the Gammaproteobacteria use the Calvin–Benson–Bassham cycle. Only the epsilonproteobacterial epibionts had the genes necessary for producing ammonium. This ability likely minimizes direct competition between epibionts and also broadens the spectrum of...
Tipo: Text
Ano: 2014 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00177/28874/28622.pdf
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