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	Provedor de dados Genet. Mol. Biol. (2) Autor Silva,Felipe R. da (2) Telles,Guilherme P. (2) Braga,Marília D.V. (1) Dias,Zanoni (1) Meidanis,João (1) Quitzau,José A.A. (1) Tzy-Li,Lin (1) Mais... Tipo do documento Info:eu-repo/semantics/article (2) Ano 2001 (2) País Brazil (2) Idioma Inglês (2)		Ordenar por:  Relevância Autor Título Ano Registros recuperados: 2 Primeira ... 1 ... Última Bioinformatics of the sugarcane EST project Genet. Mol. Biol. Telles,Guilherme P.; Braga,Marília D.V.; Dias,Zanoni; Tzy-Li,Lin; Quitzau,José A.A.; Silva,Felipe R. da; Meidanis,João. The Sugarcane EST project (SUCEST) produced 291,904 expressed sequence tags (ESTs) in a consortium that involved 74 sequencing and data mining laboratories. We created a web site for this project that served as a ‘meeting point’ for receiving, processing, analyzing, and providing services to help explore the sequence data. In this paper we describe the information pathway that we implemented to support this project and a brief explanation of the clustering procedure, which resulted in 43,141 clusters. Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Ano: 2001 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572001000100003 Trimming and clustering sugarcane ESTs Genet. Mol. Biol. Telles,Guilherme P.; Silva,Felipe R. da. The original clustering procedure adopted in the Sugarcane Expressed Sequence Tag project (SUCEST) had many problems, for instance too many clusters, the presence of ribosomal sequences, etc. We therefore redesigned the clustering procedure entirely, including a much more careful initial trimming of the reads. In this paper the new trimming and clustering strategies are described in detail and we give the new official figures for the project, 237,954 expressed sequence tags and 43,141 clusters. Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Ano: 2001 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572001000100004 Registros recuperados: 2 Primeira ... 1 ... Última

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