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Uso da taxonomia polifásica para caracterização de isolados de rizóbio de feijão comum em solos do Mato Grosso do Sul. Repositório Alice
COSTA, M. R.; RIBEIRO, R. A.; MERCANTE, F. M.; HUNGRIA, M..
2016
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Bactéria; Nitrogênio; Feijão.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1058016
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Draft genome sequence of Pantoea ananatis Strain 1.38, a bacterium isolated from the rhizosphere of Oryza sativa var. puntal that shows biotechnological potential as an inoculant. Repositório Alice
MEGÍAS, E.; REIS JUNIOR, F. B. dos; RIBEIRO, R. A.; OLLERO, F. J.; MEGÍAS, M.; HUNGRIA, M..
bitstream/item/183333/1/e01547-17.full.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Rizosfera; Irrigação; Arroz.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1096128
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Avaliação de genótipos de girassol no Nordeste do Estado do Pará. Repositório Alice
AZEVEDO, R.; ALVES, R. M.; CUNHA, R. L.; RIBEIRO, R. A..
2008
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Girassol; Prática cultural; Genótipo; Genética vegetal; Nordeste Paraense; Pará; Amazônia; Brasil.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/408950
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Utilização da técnica de MLSA em estudos taxonômicos e filogenéticos com Bradyrhizobium e sua importância na descrição de novas espécies. Repositório Alice
DELAMUTA, J. R. M.; RIBEIRO, R. A.; HUNGRIA, M..
RESUMO: A metodologia de MLSA (Multilocus Sequence Analysis) tem sido cada vez mais utilizada como ferramenta para se inferir a taxonomia, a filogenia e a evolução de bactérias simbióticas fixadoras de nitrogênio, conhecidas como rizóbios. Como exemplo, o emprego do MLSA foi decisivo para a recente descrição da nova espécie Bradyrhizobium diazoefficiens por nosso grupo de pesquisa (Delamuta et al., 2013). Neste estudo, utilizando-se a sequência concatenada dos genes atpD, glnII e recA, as relações filogenéticas de 13 estirpes de Bradyrhizobium foram determinadas e os resultados indicam a existência de possíveis novas espécies dentro do gênero.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Fixação de nitrogênio.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/971094
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Genome sequence of Bradyrhizobium stylosanthis Strain BR 446T, a Nitrogen-Fixing Symbiont of the legume Pasture stylosanthes guianensis. Repositório Alice
DELAMUTA, J. R. M.; RIBEIRO, R. A.; GOMES, D. F.; SOUZA, R. C.; CHUEIRE, L. M. de O.; HUNGRIA, M..
Bradyrhizobium stylosanthis BR 446T is a nitrogen-fixing symbiont of the tropical legume pasture Stylosanthes guianensis. Its draft genome contains 8,801,717 bp and 8,239 coding sequences (CDSs). Several putative genes that might confer high competi- tiveness and saprophytic capacity under the stressful conditions of tropical soils were identified in the genome.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Fixação de nitrogênio; Nitrogen fixation.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1063360
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Estudo das relações filogenéticas de estirpes de rizóbios através da metodologia Multilocus Sequence Analysis (MLSA) com identificação de espécies novas. Repositório Alice
HELENE, L. C. F.; DELAMUTA, J. R. M.; RIBEIRO, R. A.; HUNGRIA, M..
Os microrganismos são muito utilizados hoje em dia, fazendo parte de diversos produtos do nosso cotidiano, variando de alimentos até produtos de tratamento ambiental. O estudo dos organismos vivos gerou uma necessidade de se identificar e classificar os animais e plantas em grupos relacionados, inferindo nomes a eles. Hoje, os parâmetros utilizados para elucidar a filogenia entre os microrganismos envolvem a análise de moléculas biológicas amplamente distribuídas entre eles em conjunto com a caracterização morfofisiológica dos indivíduos. Em análises biomoleculares conhecidas como Multilocus Sequence Analysis (MLSA), os cientistas têm utilizado sequencias concatenadas dos chamados genes housekeeping como marcadores filogenéticos, comparado também com dados...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Rizóbios.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1044006
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Hematological and biochemical responses of pirarucu (Arapaima gigas, Arapaimidae) fed with diets containing a glucomannan product derived from yeast and algae. Repositório Alice
HOSHINO, M. D. F. G.; MARINHO, R. das G. B.; PEREIRA, D. F.; YOSHIOKA, E. T. O.; TAVARES-DIAS, M.; OZORIO, R. O. de A.; RODRIGUEZ, A. F. R.; RIBEIRO, R. A.; FARIA, F. S. E. D. V. de..
The hematological and biochemical responses of pirarucu fingerlings (Arapaima gigas) fed with diets containing different concentrations of a glucomannan product derived from yeast and algae were evaluated in order to ascertain the effect of these diets on fish physiology. Four treatments were conducted, with three replications, with 12 fish in each tank. The product evaluated (MycosorbA+®) was incorporated into the commercial diet, at four concentrations: 0, 1, 2 and 4 g.kg-1, called M0%, M0.1%, M0.2% and M0.4%, respectively. After 45 days of feeding, blood samples from six fish in each replicate were collected to perform the analyses. Their weight and length were determined to calculate the condition factor and weight gain, but no differences (P >...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Chlorella vulgaris; Peixe de água doce; Glóbulo branco; Albumina; Freshwater fish; White blood cell; Albumin.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1068544
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Draft genome sequence of Pseudomonas fluorescens strain ET76, isolated from rice Rhizosphere in Northwestern Morocco. Repositório Alice
AARAB, S.; ARAKRAK, A.; JAVIER OLLERO, F.; MEGÍAS, M.; GOMES, D. F.; RIBEIRO, R. A.; HUNGRIA, M..
Pseudomonas fluorescens ET76 was isolated from rice rhizosphere in northwestern Morocco. Its draft genome was estimated to be 6,681,652 bp with 5,789 coding sequences (CDSs). Genes encoding for type I to VI secretion systems, PvdQ, proteases, siderophores, hydrogen cyanide synthase, ACC-deaminase, among others, highlight its potential use in biological control of plant pathogens.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Pseudomonas fluorescens; Arroz; Oryza sativa L; Rice.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1063357
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Draft genome sequence of agrobacterium deltaense strain CNPSo 3391, isolated from a soybean nodule in Mozambique. Repositório Alice
SCHERER, A. J.; DELAMUTA, J. R. M.; RIBEIRO, R. A.; CHIBEBA, A. M.; KYEI-BOAHEN, S.; NOGUEIRA, M. A.; HUNGRIA, M..
bitstream/item/196489/1/2019-Am-J-Microb-Draft-Genome-Agrobac-Mozambique-Scherer-et-al.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Soja; Nódulo; Genoma; Soybeans; Genome.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1108516
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Estudo filogenético da diversidade do gênero Bradyrhizobium por MLSA e utilização desta técnica para designar possíveis novas espécies. Repositório Alice
HELENE, L. C. F.; DELAMUTA, J. R. M.; RIBEIRO, R. A.; HUNGRIA, M..
Bactérias simbióticas fixadoras de nitrogênio, também chamadas popularmente de rizóbios, têm grande relevância agronômica, pois fornecem quantidades significativas de N para as plantas e colaboram para a recuperação de solos e ambientes degradados. Nos últimos anos, com o avanço das técnicas moleculares e das análises genéticas, diversos trabalhos têm demonstrado que essas bactérias apresentam uma elevada diversidade genética, resultando em reclassificações taxonômicas e na descrição de novas espécies. Apesar do gene ribossomal 16S (16S RNAr) ainda ser utilizado em análises filogenéticas de procariotos, sua alta conservação não é capaz de revelar diferenças entre espécies de diversos gêneros, incluindo Bradyrhizobium. Outras metodologias, como o MLSA...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Fixação de Nitrogênio; Bradyrhizobium; Nitrogen fixation.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1010717
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Genome sequence of Bradyrhizobium tropiciagri Strain CNPSo 1112T , isolated from a root nodule of Neonotonia wightii. Repositório Alice
DELAMUTA, J. R. M.; GOMES, D. F.; RIBEIRO, R. A.; CHUEIRE, L. M. O.; SOUZA, R. C.; ALMEIDA, L. G. P.; VASCONCELOS, A. T. R.; HUNGRIA, M..
CNPSo 1112T is a nitrogen-fixing symbiont of perennial soybean, a tropical legume forage. Its draft genome indicates a large genome with a circular chromosome and 9,554 coding sequences (CDSs). Operons of nodulation, nitrogen fixation, and uptake hydrogenase were present in the symbiotic island, and the genome encompasses several CDSs of stress tolerance.
Tipo: Nota Técnica/Nota Científica (ALICE) Palavras-chave: Fixação de nitrogênio; Nitrogen fixation.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1032022
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Caracterização genética e morfofisiológica da "Coleção de culturas de microrganismos multifuncionais da Embrapa Soja". Repositório Alice
CHUEIRE, L. M. de O.; RIBEIRO, R. A.; DELAMUTA, J. R. M.; FERREIRA, E.; NOGUEIRA, M. A.; HUNGRIA, M..
A degradação do meio ambiente gera uma grande preocupação com a sustentabilidade do planeta para os anos futuros. A principal maneira de reverter essa situação é através do aproveitamento da biodiversidade em prol de sistemas de baixa emissão de carbono, biorremediação, produção de medicamentos, vacinas entre outros. Dentre os vários ecossistemas, o solo apresenta importante destaque, pois apesar da alta diversidade procariótica que possui, ainda precisa ser mais explorado para que essas informações sejam utilizadas a favor do aumento de produtividade da agricultura. A criação e a manutenção de coleções de culturas são de extrema importância para o estudo nas áreas biológicas e agronômicas. Nesse sentido, o Laboratório de Biotecnologia do Solo da Embrapa...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Fixação de nitrogênio; Bacteriologia do solo; Nitrogen fixation; Nitrogen-fixing bacteria; Soil bacteria.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/934640
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Atividades da coleção de culturas de microrganismos multifuncionais da Embrapa Soja. Repositório Alice
CHUEIRE, L. M. O.; RIBEIRO, R. A.; DELAMUTA, J. R. M.; FERREIRA, E.; AQUINO, M.; SANTOS, H. C.; CUNHA, M. H..
2011
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Microbiologia.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/918546
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Genome sequence of Rhizobium esperanzae type strain CNPSo 668, isolated from Phaseolus vulgaris nodules in Mexico. Repositório Alice
HELENE, L. C. F.; RIBEIRO, R. A.; HUNGRIA, M..
bitstream/item/167156/1/2017HeleneetalGenomeAnnounc-Resperanzae.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Fixação de nitrogênio; Feijão; Simbiose; Nitrogen fixation; Beans; Symbiosis.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1080304
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Taxonomia e filogenia de estirpes de Bradyrhizobium com base na metodologia de MLSA (Multilocus Sequence Analysis). Repositório Alice
DELAMUTA, J. R. M.; RIBEIRO, R. A.; MENNA, P.; HUNGRIA, M..
O gênero Bradyrhizobium compreende um grupo diverso de bactérias com capacidade de estabelecer simbiose com plantas da família Leguminosae. Estudos com Bradyrhizobium têm demonstrado diversidade genética elevada, principalmente com estirpes isoladas em regiões tropicais. A análise do gene ribossomal 16S (16S RNAr) tem sido a principal ferramenta utilizada em estudos de diversidade, taxonomia e filogenia bacteriana, mas devido ao alto nível de conservação da sequência nucleotídica deste gene, as informações obtidas podem limitar a determinação de novas espécies, como é o caso do gênero Bradyrhizobium. Desse modo, a metodologia de MLSA (Multilocus Sequence Analysis) tem sido recentemente proposta como uma ferramenta complementar em estudos de filogenia e...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Microbiologia.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/918573
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Gradients in N-cycling attributes along forestry and agricultural land-use systems are indicative of soil capacity for N supply. Repositório Alice
FAGOTTI, D. S. L.; MIYAUCHI, M. Y. H.; OLIVEIRA, A. G.; SANTINONI, I. A.; EBERHARDT, D . N.; NIMTZ, A.; RIBEIRO, R. A.; PAULA, A. M.; QUEIROZ, C. A. S.; ANDRADE, G.; ZANGARO, W.; NOGUEIRA, M. A..
Indicators of soil quality associated with N-cycling were assessed under different land-use systems (native forest ? NAT, reforestation with Araucaria angustifolia or Pinus taeda and agricultural use ? AGR) to appraise the effects on the soil potential for N supply. The soil total N ranged from 2 to 4g⁄ kg (AGR and NAT, respectively), and the microbial biomass N ranged from 80 to 250 mg⁄ kg, being higher in NAT and A. angustifolia, and lower in P. taeda and AGR sites. Activities of asparaginase (ca. 50?200 mg NH 4 + -N ⁄ kg per h), glutaminase (ca. 200?800 mg NH -N ⁄ kg per h) and urease (ca. 80?200 mg NH -N ⁄ kg ⁄ h) were also more intense in the NAT and A. angustifoliareforested soils,...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Solo; Qualidade; Nitrificação; Amonificação; Soil quality; Nitrification; Ammonification.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/940939
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Desempenho agronômico de híbridos de canola em diferentes épocas de semeadura em Dois Vizinhos, PR. Repositório Alice
HRCHOROVITCH, V. A.; POSSENTI, J. C.; SULZBACHER, J. B. W.; RIBEIRO, R. A.; LORENZETTI, B. R. D. L.; TOMM, G. O..
2014
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Canola; Brassica napus; Produtividade; Adaptação; SLAC.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1039204
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Draft genome sequences of Azospirillum brasilense strains Ab-V5 and Ab-V6, commercially used in inoculants for grasses and legumes in Brazil. Repositório Alice
HUNGRIA, M.; RIBEIRO, R. A.; NOGUEIRA, M. A..
bitstream/item/189945/1/Hungria-2-p.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Genoma; Inoculante; Legume; Inoculation methods; Genome; Azospirillum brasilense; Legumes.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1103262
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Lethal dose and clinical signs of Aeromonas hydrophila in Arapaima gigas (Arapaimidae), the giant fish from Amazon. Repositório Alice
DIAS, M. K. R.; SAMPAIO, L. S.; PROIETTI-JÚNIOR, A. A.; YOSHIOKA, E. T. O.; RODRIGUES, D. P.; RODRIGUEZ, A. F. R.; RIBEIRO, R. A.; FARIA, F. S. E. D. V.; OZÓRIO, R. O. A.; TAVARES-DIAS, M..
Aeromonas hydrophila is causing substantial economic losses in world aquaculture. This study determined the tolerance limit (LD50-96h) of A. hydrophila in Arapaima gigas, and also investigated the clinical signs after intradermal inoculation.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Pirarucu; Peixe de água doce; Bacteria; Infecção; Inoculação; Freshwater; Infection; Inoculation.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1049072
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Genome Sequence of Paraburkholderia nodosa Strain CNPSo 1341, a N2-Fixing Symbiont of the Promiscuous Legume Phaseolus vulgaris. Repositório Alice
DALL'AGNOL, R. F.; COSTA, M. R.; RIBEIRO, R. A.; DELAMUTA, J. R. M.; CHUEIRE, L. M. de O.; HUNGRIA, M..
Bradyrhizobium stylosanthis BR 446T is a nitrogen-fixing symbiont of the tropical legume pasture Stylosanthes guianensis . Its draft genome contains 8,801,717 bp and 8,239 coding sequences (CDSs). Several putative genes that might confer high competitiveness and saprophytic capacity under the stressful conditions of tropical soils were identified in the genome.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Fixação biológica de nitrogênio.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1056822
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