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Use of regularized quantile regression to predict the genetic merit of pigs for asymmetric carcass traits PAB
Santos,Patricia Mendes dos; Nascimento,Ana Carolina Campana; Nascimento,Moysés; Silva,Fabyano Fonseca e; Azevedo,Camila Ferreira; Mota,Rodrigo Reis; Guimarães,Simone Eliza Facioni; Lopes,Paulo Sávio.
Abstract: The objective of this work was to evaluate the use of regularized quantile regression (RQR) to predict the genetic merit of pigs for asymmetric carcass traits, compared with the Bayesian lasso (Blasso) method. The genetic data of the traits carcass yield, bacon thickness, and backfat thickness from a F2 population composed of 345 individuals, generated by crossing animals from the Piau breed with those of a commercial breed, were used. RQR was evaluated considering different quantiles (τ = 0.05 to 0.95). The RQR model used to estimate the genetic merit showed accuracies higher than or equal to those obtained by Blasso, for all studies traits. There was an increase of 6.7 and 20.0% in accuracy when the quantiles 0.15 and 0.45 were considered in...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Sus scrofa; Blasso; Shrinkage.
Ano: 2018 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2018000901011
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Validação e correção de fenótipos na seleção genômica ampla PAB
Almeida,Ísis Fernanda de; Cruz,Cosme Damião; Resende,Marcos Deon Vilela de.
Resumo: O objetivo deste trabalho foi avaliar a influência da distribuição dos efeitos de QTL, do tipo de população de validação e da correção dos fenótipos sobre a acurácia da seleção genômica ampla. Duas populações de irmãos completos, com 500 indivíduos, foram simuladas, tendo-se considerado, genotipicamente, 1.000 locos marcadores - 100 ligados a QTL. Os efeitos de QTL apresentaram distribuição uniforme ou exponencial. Na validação 1, uma amostra com 100 indivíduos constituiu a população de validação; na validação 2, aplicou-se a validação cruzada, com amostra de 100 indivíduos em cinco repetições; e na 3, uma segunda geração constituiu a população de validação. As metodologias de análise utilizadas foram RR-Blup e Blasso, com modelos mistos para...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Acurácia; Blasso; Genotipagem em larga escala; Marcadores moleculares; RR-Blup.
Ano: 2016 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2016001201973
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