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Self-organizing maps in the study of genetic diversity among irrigated rice genotypes Agronomy
Santos, Iara Gonçalves dos; Carneiro, Vinícius Quintão; Silva Junior, Antônio Carlos da; Cruz, Cosme Damião; Soares, Plínio César.
This study presents self-organizing maps (SOM) as an alternative method to evaluate genetic diversity in plant breeding programs. Twenty-five genotypes were evaluated in two environments for 11 phenotypic traits. The genotypes were clustered according to the SOM technique, with variable topology and numbers of neurons. In addition to the SOM analysis, unweighted pair group method with arithmetic mean clustering (UPGMA) was performed to observe the behavior of the clustering when submitted to these techniques and to evaluate their complementarities. Genotype ordering according to SOM was consistent with UPGMA results, evidenced by the basic structure of UPGMA groups being preserved in each group of the maps. Regarding genotype arrangement and the group...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Oriza sativa L.; Computational intelligence; Clustering technique; SOM. Genética melhoramento de plantas.
Ano: 2018 URL: http://periodicos.uem.br/ojs/index.php/ActaSciAgron/article/view/39803
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