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Xylella fastidiosa: An in vivo system to study possible survival strategies within citrus xylem vessels based on global gene expression analysis Electron. J. Biotechnol.
Federici,María Teresa; Marcondes,Jackson A; Picchi,Simone Cristina; Stuchi,Eduardo S; Fadel,André Luiz; Laia,Marcelo L; Lemos,Manoel Victor F; Lemos,Eliana Gertrudes Macedo.
Xylella fastidiosa inhabits the plant xylem, a nutrient-poor environment, so that mechanisms to sense and respond to adverse environmental conditions are extremely important for bacterial survival in the plant host. Although the complete genome sequences of different Xylella strains have been determined, little is known about stress responses and gene regulation in these organisms. In this work, a DNA microarray was constructed containing 2,600 ORFs identified in the genome sequencing project of Xylella fastidiosa 9a5c strain, and used to check global gene expression differences in the bacteria when it is infecting a symptomatic and a tolerant citrus tree. Different patterns of expression were found in each variety, suggesting that bacteria are responding...
Tipo: Journal article Palavras-chave: Citrus; Microarray; Xylella fastidiosa.
Ano: 2012 URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0717-34582012000300004
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Xylella fastidiosa gene expression analysis by DNA microarrays Genet. Mol. Biol.
Travensolo,Regiane F.; Carareto-Alves,Lucia M.; Costa,Maria V.C.G.; Lopes,Tiago J.S.; Carrilho,Emanuel; Lemos,Eliana G.M..
Xylella fastidiosa genome sequencing has generated valuable data by identifying genes acting either on metabolic pathways or in associated pathogenicity and virulence. Based on available information on these genes, new strategies for studying their expression patterns, such as microarray technology, were employed. A total of 2,600 primer pairs were synthesized and then used to generate fragments using the PCR technique. The arrays were hybridized against cDNAs labeled during reverse transcription reactions and which were obtained from bacteria grown under two different conditions (liquid XDM2 and liquid BCYE). All data were statistically analyzed to verify which genes were differentially expressed. In addition to exploring conditions for X. fastidiosa...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Xylella fastidiosa; DNA microarray; Gene expression.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572009000200022
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Carbohydrate metabolism of Xylella fastidiosa: Detection of glycolytic and pentose phosphate pathway enzymes and cloning and expression of the enolase gene Genet. Mol. Biol.
Facincani,Agda Paula; Ferro,Jesus Aparecido; Pizauro Jr.,João Martins; Pereira Jr.,Haroldo Alves; Lemos,Eliana Gertrudes de Macedo; Prado,Alessandro Luis do; Ferro,Maria Inês T..
The objective of this work was to assess the functionality of the glycolytic pathways in the bacterium Xylella fastidiosa. To this effect, the enzymes phosphoglucose isomerase, aldolase, glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase and pyruvate kinase of the glycolytic pathway, and glucose 6-phosphate dehydrogenase of the Entner-Doudoroff pathway were studied, followed by cloning and expression studies of the enolase gene and determination of its activity. These studies showed that X. fastidiosa does not use the glycolytic pathway to metabolize carbohydrates, which explains the increased duplication time of this phytopatogen. Recombinant enolase was expressed as inclusion bodies and solubilized with urea (most efficient extractor), Triton X-100, and TCA....
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Enolase; Entner-Doudoroff; Enzyme; Glycolysis; Xylella fastidiosa.
Ano: 2003 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572003000200015
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Hidden Markov models applied to a subsequence of the Xylella fastidiosa genome Genet. Mol. Biol.
Silva,Cibele Q. da.
Dependencies in DNA sequences are frequently modeled using Markov models. However, Markov chains cannot account for heterogeneity that may be present in different regions of the same DNA sequence. Hidden Markov models are more realistic than Markov models since they allow for the identification of heterogeneous regions of a DNA sequence. In this study we present an application of hidden Markov models to a subsequence of the Xylella fastidiosa DNA data. We found that a three-state model provides a good description for the data considered.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: DNA; Xylella fastidiosa; Hidden Markov models.
Ano: 2003 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572003000400018
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COMO identificar o amarelinho dos cítros: programa 40. Infoteca-e
bitstream/item/69884/1/PGM40NE-como-identificar-o-amarelinho-dos-citros.mp3
Tipo: Prosa Rural (INFOTECA-E) Palavras-chave: CVC; Amarelinho; Citricultura; Cigarrinha; Xylella fastidiosa; Praga.
Ano: 2012 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/939395
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Análise faunística de cigarrinhas (Hemiptera: Cicadellidae) na cultura da videira no Rio Grande do Sul Neotropical Entomology
Ringenberg,Rudiney; Lopes,João R S; Botton,Marcos; Azevedo-Filho,Wilson S de; Cavichioli,Rodney R.
In some American countries, grapevines are affected by Pierce's disease (PD), which is caused by a particular strain of Xylella fastidiosa not yet reported in Brazil. In order to investigate the potential for PD spread in Brazil in case of pathogen introduction, we conducted a faunistic analysis of leafhoppers (Hemiptera: Cicadellidae) associated to vineyards in the State of Rio Grande do Sul, with emphasis in the subfamily Cicadellinae (sharpshooters), which includes the main potential vectors of X. fastidiosa. Leafhopper samplings were carried out fortnightly during two years (9/2004-9/2006) in four Vitis vinifera vineyards in the municipalities of Bento Gonçalves and Farroupilha (RS). Thirtyfour leafhopper and six spittlebug species were collected, but...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Xylella fastidiosa; Vitis vinifera; Pierce's disease; Sharpshooter vector; Cicadellinae.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1519-566X2010000200007
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Aspectos biológicos das cigarrinhas Acrogonia gracilis (Osborn), Dilobopterus costalimai Young e Oncometopia facialis (Signoret) (Hemiptera: Cicadellidae) em Citrus sinensis L. Osbeck Neotropical Entomology
Paiva,Paulo E.B.; Benvenga,Sérgio R.; Gravena,Santin.
Foram estudados os aspectos biológicos das cigarrinhas Acrogonia gracilis (Osborn), Dilobopterus costalimai Young e Oncometopia facialis (Signoret) em plantas jovens de laranja Citrus sinensis L. Osbeck em condições controladas de 25±2ºC, 60±10% de umidade relativa e 12h de fotofase. Essas cigarrinhas são vetoras de Xylella fastidiosa Wells em citros. Foram observados cinco ínstares em D. costalimai e O. facialis e seis em A. gracilis. O período médio de duração de ovo a adulto e a longevidade foram, respectivamente, 54,5 e 72,4 dias para A. gracilis, 54,7 e 36,4 dias para D. costalimai e 67,1 e 15,5 dias para O. facialis.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Insecta; Cicadellinae; Xylella fastidiosa; Vetores; Desenvolvimento biológico.
Ano: 2001 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1519-566X2001000100005
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Zoneamento ecológico de Dilobopterus costalimai Young, Oncometopia facialis Signoret e Acrogonia citrina Marucci & Cavichioli (Hemiptera: Cicadellidae) para Santa Catarina Neotropical Entomology
Milanez,José M.; Pandolfo,Cristina; Hammes,Luís A.; Parra,José R.P..
O objetivo deste trabalho foi identificar as regiões de Santa Catarina, com condições térmicas favoráveis para o desenvolvimento das espécies Dilobopterus costalimai Young, Oncometopia facialis Signoret e Acrogonia citrina Marucci & Cavichioli , transmissoras da bactéria Xylella fastidiosa Wells, causadora da doença Clorose Variegada dos Citros (CVC), baseando-se em dados de exigências térmicas das espécies. Embora as regiões do Oeste e do Litoral sejam as mais recomendadas para o plantio de citros, o zoneamento ecológico foi realizado para todo o estado, por serem as cigarrinhas também vetoras da bactéria para outras frutíferas como pessegueiro, videira e ameixeira. As temperaturas médias mensais foram estimadas pela latitude, longitude e...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Exigências térmicas; Número de gerações; Cigarrinha; Xylella fastidiosa.
Ano: 2005 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1519-566X2005000200018
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Fluxo de seiva e fotossíntese em laranjeira 'Natal' com clorose variegada dos citros PAB
Machado,Eduardo Caruso; Oliveira,Ricardo Ferraz de; Ribeiro,Rafael Vasconcelos; Medina,Camilo Lázaro; Stuchi,Eduardo Sanches; Marin,Fábio Ricardo; Silva,José Aliçandro Bezerra da; Silva,Simone Rodrigues da.
O objetivo deste trabalho foi avaliar os efeitos da clorose variegada dos citros (CVC), no fluxo de seiva, trocas gasosas e atividade fotoquímica em laranjeira 'Natal', com e sem CVC, em condição de campo. O curso diário do fluxo de seiva, potencial da água na folha, assimilação de CO2, transpiração, condutância estomática e eficiência quântica máxima e efetiva do fotossistema II foram avaliados. O delineamento experimental foi em blocos ao acaso com cinco repetições. O fluxo de seiva foi 1,9 vez superior nas plantas sadias em relação às doentes. Em plantas doentes ocorreu queda de 43, 28 e 33% na assimilação de CO2, condutância estomática e transpiração, respectivamente. As plantas com CVC apresentaram fotoinibição dinâmica. Uma vez que a eficiência...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Citrus sinensis; Xylella fastidiosa; Assimilação de CO2; Condutância estomática; Fluorescência da clorofila; Transpiração.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2006000600003
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GUS gene expression driven by a citrus promoter in transgenic tobacco and 'Valencia' sweet orange PAB
Azevedo,Fernando Alves de; Mourão Filho,Francisco de Assis Alves; Schinor,Evandro Henrique; Paoli,Luis Gustavo de; Mendes,Beatriz Madalena Januzzi; Harakava,Ricardo; Gabriel,Dean W.; Lee,Richard F..
The objective of this work was the transformation of tobacco and 'Valencia' sweet orange with the GUS gene driven by the citrus phenylalanine ammonia-lyase (PAL) gene promoter (CsPP). Transformation was accomplished by co-cultivation of tobacco and 'Valência' sweet orange explants with Agrobacterium tumefaciens containing the binary vector CsPP-GUS/2201. After plant transformation and regeneration, histochemical analyses using GUS staining revealed that CsPP promoter preferentially, but not exclusively, conferred gene expression in xylem tissues of tobacco. Weaker GUS staining was also detected throughout the petiole region in tobacco and citrus CsPP transgenic plants.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Xylella fastidiosa; PAL; Citrus variegated chlorosis; Cultivar resistance.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2006001100008
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Caracterização da comunidade bacteriana endofítica de citros por isolamento, PCR específico e DGGE PAB
Lacava,Paulo Teixeira; Andreote,Fernando Dini; Araújo,Welington Luiz; Azevedo,João Lúcio.
O objetivo deste trabalho foi caracterizar a comunidade bacteriana endofítica de plantas assintomáticas (escapes) e afetadas pela clorose variegada dos citros (CVC) por meio de isolamento em meio de cultura, técnica de gradiente desnaturante em gel de eletroforese (DGGE) e detecção de Methylobacterium mesophilicum e Xyllela fastidiosa por meio de PCR específico, para estudar esta comunidade e sua relação com a ocorrência da CVC. A análise da comunidade bacteriana via DGGE permitiu a detecção de X. fastidiosa, bem como Klebsiella sp. e Acinetobacter sp. como endófitos de citros. Foram observados também Curtobacterium sp., Pseudomonas sp., Enterobacter sp. e Bacillus spp. Utilizando primers específicos, Methylobacterium mesophilicum e X. fastidiosa também...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Citrus sinensis; Xylella fastidiosa; Methylobacterium; Bactérias endofíticas.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2006000400013
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Evaluation of Xylella fastidiosa genetic diversity by fAFPL markers Rev. Bras. Frutic.
Kishi,Luciano Takeshi; Wickert,Ester; Lemos,Eliana Gertrudes de Macedo.
The first phytopathogenic bacterium with its DNA entirely sequenced is being detected and isolated from different host plants in several geographic regions. Although it causes diseases in cultures of economic importance, such as citrus, coffee, and grapevine little is known about the genetic relationships among different strains. Actually, all strains are grouped as a single species, Xylella fastidiosa, despite colonizing different hosts, developing symptoms, and different physiological and microbiological observed conditions. The existence of genetic diversity among X. fastidiosa strains was detected by different methodological techniques, since cultural to molecular methods. However, little is know about the phylogenetic relationships developed by...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: FAFLP; Xylella fastidiosa; Genetic diversity; DNA fingerprinting.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-29452008000100037
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Avaliação de tangerinas, tangores e tangelos em relação à clorose variegada dos citros Rev. Bras. Frutic.
Silva,Simone Rodrigues da; Oliveira,João Carlos de; Stuchi,Eduardo Sanches; Donadio,Luiz Carlos; Souza,Paulo Sérgio de; González-Jaimes,Elena Paola.
A Clorose Variegada dos Citros (CVC), causada pela bactéria Xylella fastidiosa, é uma séria ameaça à citricultura brasileira, constituindo-se, atualmente, numa das principais doenças dos citros no Brasil. O objetivo desse trabalho foi avaliar cultivares de citros introduzidas quanto à suscetibilidade ou resistência à CVC, em condições de campo. O trabalho foi conduzido em Bebedouro-SP. Os materiais genéticos estudados foram cultivares de tangerinas e híbridos (tangores e tangelos) introduzidas de bancos de germoplasma da Itália, Portugal, Espanha e Córsega. O trabalho foi constituído por 56 parcelas, com três plantas das quais uma foi inoculada, empregando-se o método de encostia, utilizando-se de mudas previamente infectadas como fontes da bactéria. Foram...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Citrus reticulata Blanco; Inoculação; Melhoramento; Resistência; Variedades; Xylella fastidiosa.
Ano: 2004 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-29452004000100016
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First record of the genus Homalodisca (Hemiptera: Cicadellidae) from Argentina and redescription of the female of H. ignorata Rev. Soc. Entomol. Argent.
Dellapé,Gimena; Paradell,Susana L..
The genus Homalodisca Stål and the species H. ignorata are recorded for the first time in Argentina, from specimens collected in Misiones province. This contribution adds diagnostic characters of the female of H. ignorata and compiles information about the geographical distribution and association with diseases of all known species of the genus.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/report Palavras-chave: Sharpshooters; Proconiini; Homalodisca; Xylella fastidiosa.
Ano: 2011 URL: http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0373-56802011000200021
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Doenças com período de incubação variável em função da fenologia do hospedeiro Trop. Plant Pathol.
BERGAMIN FILHO,ARMANDO; AMORIM,LILIAN.
Um período de incubação de cinco dias significa, no contexto da epidemiologia de doenças de plantas, que as infecções que deram origem aos sintomas visualizados no tempo t ocorreram no tempo t-5. Há um grupo de doenças, no entanto, que se comporta de modo diferente, isto é, o momento da infecção não pode ser inferido a partir da visualização dos sintomas. Esse grupo de doenças pode ser dividido, para fins didáticos, em função do órgão da planta que exibe os sintomas: (i) brotações jovens; (ii) perfilhos jovens; (iii) frutos recém-amadurecidos. Nesses três subgrupos, a expressão dos sintomas é função do estádio fenológico do órgão afetado e tem pouca relação com o momento da infecção. Para essas doenças, maior ênfase é recomendada para estudos que visem a...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/other Palavras-chave: Xylella fastidiosa; Guignardia citricarpa; Ustilago scitaminea.
Ano: 2002 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-41582002000600001
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Geostical analysis of spatial dynamics of Citrus Variegated Chlorossis Trop. Plant Pathol.
ROBERTO,SÉRGIO R.; FARIAS,PAULO R. S.; BERGAMIN FILHO,ARMANDO.
The spatial dynamics of Citrus Variegated Chlorosis (CVC) was studied in a five-year old commercial orchard of 'Valencia' sweet orange (Citrus sp.) trees, located in the northern region of the state of São Paulo, Brazil. One thousand trees were assessed in 25 rows of 40 trees, planted at 8 x 5 m spacing. Disease incidence data were taken beginning in March 1994 and ending in January 1996, at intervals of four to five months. Disease aggregation was observed through the dispersion index analysis (Ib), which was calculated by dividing the area into quadrants. CVC spatial dynamics was examined using semivariogram analysis, which revealed that the disease was aggregated in the field forming foci of 10 to 14 m. For each well-fitted model, a kriging map was...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: CVC; Xylella fastidiosa; Epidemiology.
Ano: 2002 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-41582002000600007
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Comportamento sazonal da clorose variegada dos citros em três regiões do Estado de São Paulo Trop. Plant Pathol.
Laranjeira,Francisco F.; Bergamin Filho,Armando; Amorim,Lilian; Lopes,João Roberto S..
Caracterizou-se a evolução de variáveis relacionadas à clorose variegada dos citros em plantas de três regiões do Estado de São Paulo (Noroeste, Centro e Sul), visando determinar diferenças no padrão sazonal do patógeno, dos vetores, do hospedeiro e da doença. Foram avaliadas mensalmente 20 plantas sintomáticas em talhões de laranja (Citrus sinensis) 'Pêra' enxertada em limão (Citrus limonia) 'Cravo', em três regiões do Estado de São Paulo, no período de dezembro de 1998 a dezembro de 2000, utilizando-se as seguintes variáveis: número de brotações novas (bn); percentagem de ramos sintomáticos (prs); percentagem de ramos assintomáticos infetados (prai); percentagem total de ramos infetados (ptri) e estimativa de concentração bacteriana (ecb). Em cada região...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: CVC; Xylella fastidiosa; Epidemiologia.
Ano: 2003 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-41582003000600009
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Dinâmica espacial da clorose variegada dos citros em três regiões do Estado de São Paulo Trop. Plant Pathol.
Laranjeira,Francisco F; Bergamin Filho,Armando; Amorim,Lilian; Gottwald,Tim R.
A Clorose Variegada dos Citros (CVC) tem sido considerada a mais importante doença citrícola no Brasil, mas diversos aspectos de sua epidemiologia ainda não são bem conhecidos. O presente trabalho objetivou estudar o arranjo espacial das plantas afetadas, visando caracterizar a dinâmica da doença em três regiões do Estado de São Paulo (Noroeste, Centro e Sul). Por meio de avaliação de sintomas visuais, foram mapeados, quinzenalmente, três talhões de laranja-doce (Citrus sinensis) Pêra enxertada em limão Cravo (Citrus limonia), em três regiões do Estado de São Paulo, desde julho de 1998 até dezembro de 2000. Para o estudo da dinâmica espacial, foram aplicadas as seguintes análises: seqüências ordinárias; áreas isópatas; lei de Taylor modificada; índice de...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Citros; CVC; Xylella fastidiosa; Epidemiologia; Padrão espacial.
Ano: 2004 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-41582004000100009
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Dinâmica temporal da Clorose Variegada dos Citros em três regiões do Estado de São Paulo Trop. Plant Pathol.
Laranjeira,Francisco F.; Bergamin Filho,Armando; Amorim,Lilian; Berger,Richard; Gottwald,Tim R..
Este trabalho objetivou esclarecer se o progresso da Clorose Variegada dos Citros (CVC) diferia entre três regiões de São Paulo, distintas quanto à incidência da CVC em citrus (Citrus spp.). Foram avaliadas três áreas, Noroeste, Centro e Sul de São Paulo, durante dois anos, em avaliações quinzenais, quando eram mapeadas as plantas sintomáticas. Tentou-se o ajuste de nove modelos ao progresso da doença, além do ajuste de três modelos a segmentos das curvas originais. Foram estimadas também as diferenciais e as diferenciais secundárias de cada curva de progresso. Apenas quando as curvas foram divididas é que foram obtidos bons ajustes aos modelos de progresso. A diferencial (velocidade da doença) e diferencial secundária (aceleração do aparecimento de novas...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: CVC; Xylella fastidiosa; Epidemiologia; Diferencial.
Ano: 2003 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-41582003000500003
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Incidência de Dilobopterus costalimai Young e Acrogonia citrina Marucci & Cavichioli, em pomares cítricos no noroeste paranaense - DOI: 10.4025/actasciagron.v30i3.3502 Agronomy
Gonçalves, Alline Maria Orbolato; UEM; Molina, Rúbia de Oliveira; UEM; Nunes, William Mário de Carvalho; UEM; Zanutto, Carlos Alexandre; UEM.
As cigarrinhas das famílias Cicadellidae e Cercopidae são vetores da bactéria Xylella fastidiosa Wells, causadora da Clorose variegada dos citros. Esta doença traz sérios prejuízos à lavoura de citros no Noroeste Paranaense, e é estudada no Brasil desde 1987, quando foi descoberta pela primeira vez na região de Colina, São Paulo. Os vetores transmitem a X. fastidiosa quando se alimentam sugando a seiva do xilema, local onde a bactéria se instala, obstruindo a passagem da seiva. Este trabalho teve o objetivo de avaliar a ocorrência das cigarrinhas vetoras Dilobopterus costalimai e Acrogonia citrina em pomar comercial de citros. O experimento foi realizado no sítio “Laranjeiras I”, município de Nova Esperança, região noroeste do Paraná, no período de julho...
Palavras-chave: 5.01.00.00-9 Agronomia Cicadellidae; Citrus sinensis; Xylella fastidiosa; Clorose Variegada dos Citros Fitossanidade Cicadellidae; Citrus sinensis; Xylella fastidiosa; Citrus variegated chlorosis.
Ano: 2008 URL: http://periodicos.uem.br/ojs/index.php/ActaSciAgron/article/view/3502
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