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A 3K Axiom SNP array from a transcriptomewide SNP resource sheds new light on the genetic diversity and structure of the iconic subtropical conifer tree Araucaria angustifolia (Bert.) Kuntze. Repositório Alice
SILVA, P. I. T.; SILVA JUNIOR, O. B.; RESENDE, L. V.; SOUSA, V. A.; AGUIAR, A. V.; GRATTAPAGLIA, D..
High-throughput SNP genotyping has become a precondition to move to higher precision and wider genome coverage genetic analysis of natural and breeding populations of non-model species. We developed a 44,318 annotated SNP catalog for Araucaria angustifolia, a grandiose subtropical conifer tree, one of the only two native Brazilian gymnosperms, critically endangered due to its valuable wood and seeds. Following transcriptome assembly and annotation, SNPs were discovered from RNA-seq and pooled RAD-seq data. From the SNP catalog, an Axiom® SNP array with 3,038 validated SNPs was developed and used to provide a comprehensive look at the genetic diversity and structure of 15 populations across the natural range of the species. RNA-seq was a far superior source...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Araucária Angustifólia.
Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1124676
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Sustentabilidade com práticas conservasionistas convencionais do município de Aspásia - SP, através do programa de microbacias hidrográficas. Repositório Alice
COLOMBO, A. de S.; LOPES, A. C. S.; AGUIAR, A. V.; GUIMARÃES, O.; GUIMARÃES, O.; PELINSON, G. J. B.; NOGUEIRA, N. A. M.; TOMAZ, B. V..
2008
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Microbacia hidrográfica; Solo; Recuperação; Voçoroca.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/290828
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