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Análise in silico de aquaporinas potencialmente envolvidas com o estresse hídrico nas interações café- e citros-Xylella fastidiosa. Repositório Alice
RABELO, F. R.; CARAZZOLLE, M. F.; MARTINS, N. F.; CAMPOS, M. A.; SILVA, M. S.; SILVA, A. C.; SOUZA, A. A. de; AMARAL, A. M. do; REIS, A. M. dos.
No Brasil, um dos importantes problemas enfrentados por produtores de café e citros envolve os danos causados pela bactéria Xylella fastidiosa. Esta bactéria causa o entupimento dos vasos do xilema e impede a passagem de água e nutrientes, o que causa uma condição biológica de estresse hídrico. Os genomas de citros e café têm sido investigados funcionalmente e várias seqüências expressas (ESTs) foram identificadas a partir de diversas condições biológicas. Bibliotecas de EST utilizando folhas e ramos infectados com X. fastidiosa foram construídas em citros e café, respectivamente. A análise in silico das ESTs nesses tecidos revelou genes comuns expressos em ambas as culturas. Alguns destes genes codificam para proteínas relacionados com a resposta de...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: EST; Filogenia; Aguaporina; Drought-induced protein Di19-like protein DIP; Fiber protein Fb2.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/906023
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Avaliacao do coeficiente de variacao como medida da precisao na experimentacao com citros. Repositório Alice
AMARAL, A. M. do; MUNIZ, J. A.; SOUZA, M. de..
O presente trabalho foi executado com dados de coeficientes de variacao (CV) de varios trabalhos publicados no Brasil, com enfase em citricultura, e suas variaveis mais correntemente estudadas (altura e producao de frutos por planta; diametro e peso dos frutos; rendimento, pH, "ratio", solidos soluveis e acidez do suco). O objetivo foi o de propor faixas de CV que orientem o pesquisador na avaliacao de cada variavel. Apos o agrupamento dos dados, procedeu-se ao teste de normalidade de Lilliefors, revelando que todas as variaveis utilizadas tiveram distribuicao aproximadamente normal. Com isso, atraves de tabela sugerida para trabalhos com especies florestais que relaciona a media e o desvio padrao [CV +-Var (CV)], foi construida uma tabela como sugestao de...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Citrus spp; Estatistica; Variaveis; Statistics; Variables.
Ano: 1997 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/86504
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Bacteria causing important diseases of citrus utilise distinct modes of pathogenesis to attack a common host. Repositório Alice
VOJNOV, A. A.; AMARAL, A. M. do; DOW, J. M.; CASTAGNARO, A. P.; MARANO, M. R..
bitstream/item/181883/1/Vojnov2010-Article-BacteriaCausingImportantDiseas.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Disease; Citrus.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/877193
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Brazilian microbiome project: revealing the unexplored microbial diversity - challenges and prospects. Repositório Alice
PYLRO, V. S.; ROESCH, L. F. W.; ORTEGA, J. M.; AMARAL, A. M. do; TÓTOLA, M. R.; HIRSCH, P. R.; ROSADO, A. S.; GÓES-NETO, A.; SILVA, A. L. da C.; ROSA, C. A.; MORAIS, D. K.; ANDREOTE, F. D.; DUARTE, G. F.; MELO, I. S. de; SELDIN, L.; LAMBAIS, M. R.; HUNGRIA, M.; PEIXOTO, R. S.; KRUGER, R. H.; TSAI, S. M.; AZEVEDO, V..
The Brazilian Microbiome Project (BMP) aims to assemble a Brazilian Metagenomic Consortium/Database. At present, many metagenomic projects underway in Brazil are widely known. Our goal in this initiative is to co-ordinate and standardize these together with new projects to come. It is estimated that Brazil hosts approximately 20 % of the entire world's macroorganism biological diversity. It is 1 of the 17 countries that share nearly 70 % of the world's catalogued animal and plant species, and is recognized as one of the most megadiverse countries. At the end of 2012, Brazil has joined GBIF (Global Biodiversity Information Facility), as associated member, to improve the access to the Brazilian biodiversity data in a free and open way. This was an important...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Diversidade microbiana; Biodiversidade; Microrganismo; Biodiversity.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1000621
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Huanglongbing (ex-greening) dos citros: desenvolvendo abordagens biotecnológicas de manejo Repositório Alice
FREITAS ASTÚA, J.; MONNERAT, R.; DELLA COLETTA FILHO, H.; CARLOS, E. F. C.; LOCALI-FABRIS, E.; BOSCARIOL CAMARGO, R.; AMARAL, A. M. do; LOPES, J. R. S.; MACHADO, M. A..
O huanglongbing (HLB, ex-greening) dos citros é considerado a principal doença da cultura em todo o mundo e tem causado prejuízos significativos ao Brasil. O controle da doença tem sido realizado através da erradicação de plantas sintomáticas e aplicação de inseticidas, mas há uma grande demanda por estratégias alternativas, menos onerosas e menos danosas ao ambiente.O projeto propõe, como estratégia de manejo a curto prazo, uma nova abordagem de controle do vetor, utilizando-se estirpes de Bacillus thuringiensis. Propõe também abordagens de médio e longo prazos, como genoma funcional de laranja infectada, transformação genética e genoma completo de citros dentro do Consórcio Internacional (ICCG). Para tanto, agregará ferramentas de biotecnologia,...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Greening; Citros; Doença de planta.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/191275
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Identification of defence-related genes expressed in coffee and citrus during infection by Xylella fastidiosa. Repositório Alice
CARAZZOLLE, M. F.; RABELLO, F. R.; MARTINS, N. F.; SOUZA, A. A. de; AMARAL, A. M. do; FREITAS-ASTUA, J.; PEREIRA, G. A. G.; MACHADO, M. A.; MEHTA, A..
One of the phytosanitary problems of coffee cultivation in Brazil is Coffee Leaf Scorch (CLS) disease, caused by the phytopathogenic bacterium Xylella fastidiosa. Due to the economic importance of coffee to Brazil and the losses caused by X. fastidiosa, a cDNA library (RX1) was constructed using infected coffee stems. This library is one of the 37 coffee EST libraries constructed using different organs and tissues and biological conditions (Coffee Genome Project-CafEST). The objective of this study was to identify genes potentially involved in defence processes in response to X. fastidiosa infection by in silico analysis of the transcripts from the RX1 library as well as compare the coffee ESTs to citrus Xylella-infected ESTs. Clustering analysis of the...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Doença de planta; Xylella fastidiosa; Plant disease.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/896465
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Mutation in the xpsD gene of Xanthomonas axonopodis pv. citri affects cellulose degradation and virulence. Repositório Alice
BAPTISTA, J. C.; MACHADO, M. A.; HOMEM. R. A.; TORRES, P. S.; VOJNOV, A. A.; AMARAL, A. M. do.
bitstream/item/181844/1/gmb-33-1-146.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Citrus canker; Transposome; Type II secretion system.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/871473
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O programa BLAST: utilização para estudos de recursos genéticos e biotecnologia. Infoteca-e
AMARAL, A. M. do; REIS, M. da S.; SILVA, F. R. da..
2007
Tipo: Documentos (INFOTECA-E) Palavras-chave: BLAST; Ferramenta de busca; Similaridade; Seqüências biológicas; DNA; Aminoácidos.
Ano: 2007 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/189557
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Rapid and sensitive detection of Citrus Bacterial Canker by loop-mediated isothermal amplification combined with simple visual evaluation methods. Repositório Alice
RIGANO, L. A.; MARANO, M. R.; CASTAGNARO, A. P.; AMARAL, A. M. do; VOJNOV, A. A..
bitstream/item/181850/1/1471-2180-10-176.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Citrus Bacterial Canker (CBC); Variation; Detection methods; Bacterial isolation.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/871635
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Reaction of genotypes of citrus species and varieties to Xanthomonas citri supsp. citri under greenhouse conditions. Repositório Alice
AMARAL, A. M. do; CARVALHO, S. A.; SILVA, L. F. C; MACHADO, M. A..
bitstream/item/181888/1/198-198-1-PB.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Bacterial leafspot; Citrus canker; Disease resistance.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/877630
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Structure-function analysis of the HrpB2-HrcU interaction in the Xanthomonas citri type III secretion system. Repositório Alice
CAPPELLETTI, P. A.; SANTOS, R. F. dos; AMARAL, A. M. do; HOMEM, R. A.; SOUZA, T. dos S.; MACHADO, M. A.; FARAH, C. S..
bitstream/item/183506/1/journal.pone.0017614.PDF
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Citrus canker; Xanthomonas Citri.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/913033
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Subcellular localization of proteins labeled with GFP in Xanthomonas citri ssp.citri : targeting the division septum. Repositório Alice
MARTINS, P. M. M.; LAU, I. F.; BACCI, M.; BELASQUE, J.; AMARAL, A. M. do; TABOGA, S. R.; FERREIRA, H..
bitstream/item/181886/1/310-1-76.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Citrus canker; A-amylase; Cell division.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/877250
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Transformation of Xanthomonas axonopodis pv. citri by electroporation. Repositório Alice
AMARAL, A. M. do; TOLEDO, C. P.; BAPTISTA, J. C.; MACHADO, M. A..
bitstream/item/177946/1/ID-26619-1.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Xanthomonas axonopodis pv; Citri; Citrus Canker; Mutant; Citrus spp; Cancro Cítrico; Mutante; Electroporation.
Ano: 2005 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/187027
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