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An integrated analysis of mRNA and sRNA transcriptional profiles in Coffea arabica L. roots: insights on nitrogen starvation responses. Repositório Alice
SANTOS, T. B. dos; SOARES, J. D. M.; LIMA, J. E.; SILVA, J. C.; IVAMOTO, S. T.; BABA, V. Y.; SOUZA, S. G. H.; LORENZETTI, A. P. R.; PASCHOAL, A. R.; MEDA, A. R.; NISHIYAMA JÚNIOR, M. Y.; OLIVEIRA, U. C. de; MOKOCHINSKI, J. B.; GUYOT, R.; JUNQUEIRA-DE-AZEVEDO, I. L. M.; FIGUEIR, A. V. O.; MAZZAFERA, P.; R. JÚNIO, O.; VIEIRA, L. G. E.; PEREIRA, L. F. P.; DOMINGUES, D. S..
Coffea arabica L. is an important agricultural commodity, accounting for 60% of traded coffee worldwide. Nitrogen (N) is a macronutrient that is usually limiting to plant yield; however, molecular mechanisms of plant acclimation to N limitation remain largely unknown in tropical woody crops. In this study, we investigated the transcriptome of coffee roots under N starvation, analyzing poly-A+ libraries and small RNAs. We also evaluated the concentration of selected amino acids and N-source preferences in roots. Ammonium was preferentially taken up over nitrate, and asparagine and glutamate were the most abundant amino acids observed in coffee roots.We obtained 34,654 assembled contigs by mRNA sequencing, and validated the transcriptional profile of 12...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Nitrogen transport; Differential gene expression; RNA-seq; MicroRNA.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1108713
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Atividade de nucleação de gelo na patogenicidade de Pantoea ananatis, agente causal da mancha branca do milho. Repositório Alice
SAUER, A. V.; BABA, V. Y.; PEDRO, E. S.; MEIRELLES, W. F.; ANDRADE, C. G. T. J.; PACCOLA-MEIRELLES, L. D..
2010
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: INA; Patogenicidade; Ice nucleation.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/865399
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Diferenças na anatomia foliar em plantas resistentes e suscetíveis à mancha branca do milho. Repositório Alice
BABA, V. Y.; PEDRO, E. S.; MEIRELLES, W. F.; PACCOLA-MEIRELLES, L. D..
2008
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Pantoea ananatis; Estômatos; Mancha foliar de phaeosphaeria.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/491671
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Efeito da ferrugem e da supressão de nitrogênio no nível transcricional do gene nitrato redutase (CaNR) em Coffea arabica L. Repositório Alice
SANTOS, T. B. dos; BABA, V. Y.; SOARES, J. D. M.; CARVALHO, K. de; BRAGHINI, M. T.; PEREIRA, L. F. P.; DOMINGUES, D. S..
O objetivo do trabalho é avaliar se a ferrugem do cafeeiro (Hemileia vastatrix) pode modular a resposta transcricional de um gene-chave na assimilação de nitrogênio (N), a nitrato redutase, em função da restrição do nutriente e da resposta do cultivar ao patógeno. Sabe-se que o estado nutricional da planta pode influenciar a severidade do ataque por patógenos. A ferrugem no cafeeiro é um problema recorrente em todas as regiões de cultivo, afetando desde a produtividade até a qualidade final da bebida. A despeito da importância da nutrição mineral para a produtividade e seu impacto na resposta à ferrugem, existem poucos estudos relacionados ao estabelecimento da relação molecular entre o estado nutricional do cafeeiro e resposta de defesa a patógenos. Duas...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Ferrugem do cafeeiro; Assimilição de nitrogênio; Padrão nutricional; Resposta genotípica.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/975229
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Expressão gênica em larga escala de raizes de Coffea arabica L. Repositório Alice
SANTOS, T. B. dos; SILVA, J. C.; SOARES, J. D. M.; BABA, V. Y.; PEREIRA, L. F. P.; VIEIRA, L. G. E.; DOMINGUES, D. S..
A utilização de novas tecnologias de sequenciamento em larga escala (454-mRNAseq) é uma frente inovadora de estudos para a biotecnologia do cafeeiro, promovendo a identificação e caracterização de novos componentes genômicos de interesse . Mudas de cafeeiro foram mantidas sob supressão de fontes nitrogenadas e suas raízes foram utilizadas para construção de bibliotecas de cDNA, que foram sequenciados utilizando a plataforma GS-FLX Titanium da Roche. Foram gerados um total 809.517 reads, os quais geraram 34.654 contigs. Por meio dos transcritos gerados pelo mRNAseq de raiz espera-se identificar e caracterizar molecularmente os genes envolvidos no transporte e metabolismo de nitrogênio no cafeeiro
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Nutrição mineral; Sequenciamento de nova geração; Café.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1040102
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Pantoea ananatis, agente causal da Mancha Branca do Milho, sobrevive epifiticamente sobre as folhas de milho. Repositório Alice
SAUER, A. V.; BABA, V. Y.; PEDRO, E. S.; MEIRELLES, W. F.; FIGUEIREDO, J. E. F.; MARRIEL, I. E.; PACCOLA-MEIRELLES, L. D..
2010
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Zea mays; Seqüenciamento; Biolog; Local de isolamento; Semelhança.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/868218
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Screening of inbred popcorn lines for tolerance to low phosphorus. Repositório Alice
SANTOS, O. J. A. P.; GONÇALVES, L. S. A.; SCAPIM, C. A.; SOUSA, S. M. de; CASTRO, C. R.; BABA, V. Y.; OLIVEIRA, A. L. M. de.
Increasing phosphorus use efficiency in agriculture is essential for sustainable food production. Thus, the aims of this study were: i) to identify phosphorus use efficiency (PUE) in popcorn lines during the early plant stages, ii) to study the relationship between traits correlated with PUE, and iii) to analyze genetic diversity among lines. To accomplish this, 35 popcorn lines from Universidade Estadual de Maringá breeding program were studied. The experiment was conducted in a growth chamber using a nutrient solution containing two concentrations of phosphorus (P): 2.5 ?M or low P (LP) and 250 ?M or high P (HP). After 13 days in the nutrient solution, root morphology traits, shoot and root dry weight, and P content of the maize seedlings were measured....
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: WinRHIZO; Estresse abiótico; Pipoca; Fósforo.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1057666
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Sobrevivência de Pantoea ananatis, agente causal da mancha branca do milho, em restos culturais de milho. Repositório Alice
SAUER, A. V.; FIGUEIREDO, J. E. F.; BABA, V. Y.; PEDRO, E. S; MEIRELLES, W. F.; PACCOLA-MEIRELLES, L. D..
2010
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Sequenciamento; Palha; Pinta branca do milho; Inoculo.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/868305
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Viabilidade de isolados de Pantoea ananatis agente causal da Mancha Branca do milho, em laboratório. Repositório Alice
PEDRO, E. S.; BABA, V. Y.; MEIRELLES, W. F.; PACCOLA-MEIRELLES, L. D..
2008
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Doença de planta.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/491170
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