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ABC transporters in Mycoplasma hyopneumoniae and Mycoplasma synoviae: insights into evolution and pathogenicity. Repositório Alice
NICOLÁS, M. F.; BARCELLOS, F. G.; HESS, P. N.; HUNGRIA, M..
ABC transporters represent one of the largest superfamilies of active membrane transport proteins (MTPs) with a highly conserved ATPase domain that binds and hydrolyzes ATP, supplying energy for the uptake of a variety of nutrients and for the extrusion of drugs and metabolic wastes. The complete genomes of a non-pathogenic (J) and pathogenic (7448) strain of Mycoplasma hyopneumoniae, as well as of a pathogenic (53) strain of Mycoplasma synoviaehave been recently sequenced. A detailed study revealed a high percentage of CDSs encoding MTPs in M. hyopneumoniaestrains J (13.4%), 7448 (13.8%), and in M. synoviae53 (11.2%), and the ABC systems represented from 85.0 to 88.6% of those CDSs. Uptake systems are mainly involved in cell nutrition and some might be...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Transportadores ABC.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/467160
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Análise estrutural do plasmídio simbiótico de Rhizobium tropici CFN299. Repositório Alice
BINDE, D. R.; HUNGRIA, M.; CHUEIRE, L. M. de O.; LUCAS, I. H.; NICOLÁS, M. F.; VASCONCELOS, A. T. R.; GONZAGA, L. de P.; MARTINEZ-ROMERO, E.; BARCELLOS, F. G.; SILVA, M. F. da..
2006
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Plasmídio simbiótico.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/455089
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Análise filogenética de rizóbios, utilizados em inoculantes comerciais brasileiros, com base no sequenciamento do gene ribossomal 16S. Repositório Alice
MENNA, P.; BARCELLOS, F. G.; BATISTA, J. S. da S.; BANGEL, E.; CAMPO, R. J.; HUNGRIA, M..
2005
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Inoculante; Inoculação.
Ano: 2005 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/469395
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Avaliação da eficiência na fixação biológica do nitrogênio com a cultura da soja e caracterização genotípica e da diversidade de estirpes de Bradyrhizobium japonicum. Repositório Alice
BARCELLOS, F. G.; MENNA, P.; BATISTA, J. S. da S.; HUNGRIA, M..
2005
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Soja; Fixação de nitrogênio.
Ano: 2005 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/469087
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Avaliação qualitativa e quantitativa da microbiota do solo e da fixação biológica do nitrogênio pela soja. Repositório Alice
SOUZA, R. A. de; HUNGRIA, M.; FRANCHINI, J. C.; CHUEIRE. L. M. de O.; BARCELLOS, F. G.; CAMPO, R. J..
O objetivo deste trabalho foi definir, para as condições edafoclimáticas do Brasil, níveis aceitáveis de dispersão de alguns parâmetros biológicos, utilizados em estudos de impacto ambiental de novas tecnologias usadas na cultura da soja. Dois ensaios com soja convencional e transgênica foram conduzidos em 11 municípios de seis estados e no Distrito Federal; os parâmetros avaliados foram: carbono e nitrogênio da biomassa microbiana, respiração basal e quociente metabólico microbiano, eletroforese do DNA do solo em géis desnaturantes (DGGE), fixação biológica do nitrogênio, população de rizóbios, número e massa de nódulos secos, ocupação dos nódulos pelas estirpes de Bradyrhizobium, massa de matéria seca da parte aérea, nitrogênio total e nitrogênio como...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Bradyrhizobium; Glycine max; Biomassa microbiana; DGGE; Monitoramento ambiental; Transgênicos.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/470564
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Caracterização da estirpe de Sinorhizobium fredii CPAC 402: provável evento de transferência lateral de genes simbióticos em solos dos Cerrados entre gêneros distintos de rizóbios. Repositório Alice
BATISTA, J. S. da S.; BARCELLOS, F. G.; MENNA, P.; BALLATI, P. A.; HUNGRIA, M..
2006
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Solos; Cerrado.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/469088
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Comparative genomics of Bradyrhizobium japonicum CPAC 15 and Bradyrhizobium diazoefficiens CPAC 7: elite model strains for understanding symbiotic performance with soybean. Repositório Alice
SIQUEIRA, A. F.; ORMEÑO-ORRILLO, E.; SOUZA, R. C.; RODRIGUES, E. P.; ALMEIDA, L. G. P.; BARCELLOS, F. G.; BATISTA, J. S. S.; NAKATANI, A. S.; MARTÍNEZ-ROMERO, E.; VASCONCELOS, A. T. R.; HUNGRIA, M..
The soybean-Bradyrhizobium symbiosis can be highly efficient in fixing nitrogen, but few genomic sequences of elite inoculant strains are available. Here we contribute with information on the genomes of two commercial strains that are broadly applied to soybean crops in the tropics. B. japonicum CPAC 15 (=SEMIA 5079) is outstanding in its saprophytic capacity and competitiveness, whereas B. diazoefficiens CPAC 7 (=SEMIA 5080) is known for its high efficiency in fixing nitrogen. Both are well adapted to tropical soils. The genomes of CPAC 15 and CPAC 7 were compared to each other and also to those of B. japonicum USDA 6T and B. diazoefficiens USDA 110T. Differences in genome size were found between species, with B. japonicum having larger genomes than B....
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Soja.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/989259
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Diversidade de estirpes de Bradyrhizobium isoladas de diferentes leguminosas, com base na análise do gene ribossomal 16S e dos genes de nodulação nodY/KA. Repositório Alice
MENNA, P.; BATISTA, J. S. da S.; BARCELLOS, F. G.; BANGEL, E.; HUNGRIA, M..
2006
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Leguminosas.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/469068
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Diversidade de estirpes de Bradyrhizobium japonicum e Bradyrhizobium elkanii estabelecidas por inoculação em solos dos cerrados. Repositório Alice
BATISTA, J. S. da S.; BARCELLOS, F. G.; MENNA, P.; MENDES, L. C.; HUNGRIA, M..
2005
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Inoculação; Bactéria.
Ano: 2005 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/469107
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Diversidade funcional de genes com potencial biotecnológico em um solo agrícola no Norte do Paraná. Repositório Alice
SOUZA, R. C.; CANTÃO, M. E.; NOGUEIRA, M. A.; VANSCONCELOS, A. T. R.; BARCELLOS, F. G.; VICENTE, V. A.; HUNGRIA, M..
2013
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Solo.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/968585
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Diversity and ecology of rhizobial strains used in commercial inoculants in Brazil. Repositório Alice
HUNGRIA, M.; MENNA, P.; CHUEIRE, L. M. de O.; MENDES, I. de C.; BANGEL, E. V.; BARCELLOS, F. G.; BATISTA, J. S. S.; RIBEIRO, R. A.; BINDE, D. R.; REIS JUNIOR, F. B. dos; OLIVEIRA, L. R.; RODRIGUES, E. P.; MARCELINO, F. C.; CAMPO, R..
2009
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Fixação de nitrogênio.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/574317
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Expressão dos genes nodC, nodW e nopP em Bradyrhizobium japonicum estirpe CPAC 15 avaliada por RT-qPCR. Repositório Alice
BORTOLAN, S.; BARCELLOS, F. G.; MARCELINO, F. C.; HUNGRIA, M..
Resumo - O objetivo deste trabalho foi avaliar a expressão, por RT-qPCR, dos genes de nodulação nodC e nodW e do gene nopP da estirpe CPAC 15, que provavelmente atuam na infecção das raízes da soja. Foram realizados dois experimentos. No primeiro, a expressão dos genes foi avaliada nas células após a incubação com genisteína por 15 min, 1, 4 e 8 horas. Os resultados revelaram que os três genes apresentaram maior expressão imediatamente após o contato com o indutor (15 min). No segundo experimento, a bactéria foi cultivada na presença de indutores (genisteína ou exsudatos de sementes de soja) por 48 horas. A expressão dos três genes foi maior na presença de genisteína, com valores de expressão para nodC, nodW e nopP superiores ao controle. Os resultados...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Genes de nodulação; Sistema de secreção tipo III; Glycine max; Flavonoide.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/662038
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Expressão dos genes nodC, nodW e nopP em Bradyrhizobium japonicum estirpe CPAC 15 avaliada por RT-qPCR. Repositório Alice
BORTOLAN, S.; BARCELLOS, F. G.; MARCELINO, F. C.; HUNGRIA, M..
Resumo O objetivo deste trabalho foi avaliar a expressão, por RT-qPCR, dos genes de nodulação nodC e nodW e do gene nopP da estirpe CPAC 15, que provavelmente atuam na infecção das raízes da soja. Foram realizados dois experimentos. No primeiro, a expressão dos genes foi avaliada nas células após a incubação com genisteína por 15 min, 1, 4 e 8 horas. Os resultados revelaram que os três genes apresentaram maior expressão imediatamente após o contato com o indutor (15 min). No segundo experimento, a bactéria foi cultivada na presença de indutores (genisteína ou exsudatos de sementes de soja) por 48 horas. A expressão dos três genes foi maior na presença de genisteína, com valores de expressão para nodC, nodW e nopP superiores ao controle. Os resultados...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Genes de nodulação; Sistema de secreção tipo III.; Nodulation genes; Type III secretion system; Soja; Flavonóide; Fixação de nirogênio; Nodulação; Soybeans; Flavonoids; Gene expression; Nitrogen fixation; Nodulation.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/631360
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Filogenia dos genes glta e glnII como suporte para a classificação de espécies no gênero Rhizobium. Repositório Alice
RIBEIRO, R. A.; BARCELLOS, F. G.; HUNGRIA, M..
2008
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Filogenia.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/457948
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Genome of Herbaspirillum seropedicae Strain SmR1, a Specialized Diazotrophic Endophyte of Tropical Grasses. Repositório Alice
PEDROSA, F. O.; MONTEIRO, R. A.; WASSEM, R.; CRUZ, L. M.; AYUB, R. A.; COLAUTO, N. B.; FERNANDEZ, M. A.; FUNGARO, M. H. P.; GRISARD, E. C.; HUNGRIA, M.; MADEIRA, H. M. F.; NODARI, R. O.; OSAKU, C. A.; PETZL-ELER, M. L.; TERENZI, H.; VIEIRA, L. G. E.; STEFFENS, M. B. R.; WEISS, V. A.; PEREIRA, L. F. P.; ALMEIDA, M. I. M.; ALVES, L. R.; MARIN, A.; ARAUJO, L. M.; BALSANELLI, E.; BAURA, V. A.; CHUBATSU, L. S.; FAORO, H.; FAVETTI, A.; FRIEDERMANN, G.; GLIENKE, C.; KARP, S.; KAVA-CORDEIRO, V.; RAITTZ, R. T.; RAMOS, H. J. O.; RIBEIRO, E. M. S. F.; RIGO, L. U.; ROCHA, S. N.; SCHWAB, S.; SILVA, A. G.; SOUZA, E. M.; TADRA-SFEIR, M. Z.; TORRES, R. A.; DABUL, A. N. G.; SOARES, M. A. M.; GASQUES, L. S.; GIMENES, C. C. T.; VALLE, J. S.; CIFERRI, R. R.; CORREA, L. C.; MURACE, N. K.; PAMPHILE, J. A.; PATUSSI, E. V.; PRIOLI, A. J.; PRIOLI, S. M. A.; ROCHA, C. L. M. S. C.; ARANTES, O. M. N.; FURLANETO, M. C.; GODOY, L. P.; OLIVEIRA, C. E. C.; SATORI, D.; VILAS-BOAS, L. A.; WATANABE, M. A. E.; DAMBROS, B. P.; GUERRA, M. P.; MATHIONI, S. M.; SANTOS, K. L.; STEINDEL, M.; VERNAL, J.; BARCELLOS, F. G.; CAMPO, R. J.; CHUEIRE, L. M. O.; NICOLÁS, M. F.; PEREIRA-FERRARI, L.; SILVA, J. L. da C.; GIOPPO, N. M. R.; MARGARIDO, V. P.; MENCK-SOARES, M. A.; PINTO, F. G. S.; SIMÃO, R. de C. G.; TAKAHASHI, E. K.; YATES, M. G.; SOUZA, E. M..
The molecular mechanisms of plant recognition, colonization, and nutrient exchange between diazotrophic endophytes and plants are scarcely known. Herbaspirillum seropedicae is an endophytic bacterium capable of colonizing intercellular spaces of grasses such as rice and sugar cane. The genome of H. seropedicae strain SmR1 was sequenced and annotated by The Parana´ State Genome Programme?GENOPAR. The genome is composed of a circular chromosome of 5,513,887 bp and contains a total of 4,804 genes. The genome sequence revealed that H. seropedicae is a highly versatile microorganism with capacity to metabolize a wide range of carbon and nitrogen sources and with possession of four distinct terminal oxidases. The genome contains a multitude of protein secretion...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Plant recognition; Colonization; Nutrient; Herbaspirillum seropedicae.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/902450
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Genome of Herbaspirillum seropedicae Strain SmR1, a specialized diazotrophic endophyte of tropical grasses. Repositório Alice
PEDROSA, F. O.; MONTEIRO, R. A.; WASSEM, R.; CRUZ, L. M.; AYUB, R. A.; COLAUTO, N. B.; FERNANDEZ, M. A.; FUNGARO, M. H. P.; GRISARD, E. C.; HUNGRIA, M.; MADEIRA, H. M. F.; NODARI, R. O.; OSAKU, C. A.; PETZL-ERLER, M. L.; TERENZI, H.; VIEIRA, L. G. E.; STEFFENS, M. B. R.; WEISS, V. A.; PEREIRA, L. F. P.; ALMEIDA, M. I. M.; ALVES, L. R.; MARIN, A.; ARAUJO, L. M.; BALSANELLI, E.; BAURA, V. A.; CHUBATSU, L. S.; FAORO, H.; FAVETTI, A.; FRIEDERMANN, G.; GLIENKE, C.; KARP, S.; KAVA-CORDEIRO, V.; RAITTZ, R. T.; RAMOS, H. J. O.; RIBEIRO, E. M. S. F.; RIGO, L. U.; ROCHA, S. N.; SCHWAB, S.; SILVA, A. G.; SOUZA, E. M.; MICHELLE Z. TADRA-SFEIR; TORRES, R. A.; DABUL, A. N. G.; SOARES, M. A. M.; GASQUES, L. S.; GIMENES, C. C. T.; VALLE, J. S.; CIFERRI, R. R.; CORREA, L. C.; MURACE, N. K.; PAMPHILE, J. A.; PATUSSI, E. V.; PRIOLI, A. J.; PRIOLI, S. M. A.; ROCHA, C. L. M. S. C.; ARANTES, O. M. N.; FURLANETO, M. C.; GODOY, L. P.; OLIVEIRA, C. E. C.; SATORI, D.; VILAS-BOAS, L. A.; WATANABE, M. A. E.; DAMBROS, B. P.; GUERRA, M. P.; MATHIONI, S. M.; SANTOS, K. L.; STEINDEL, M.; VERNAL, J.; BARCELLOS, F. G.; CAMPO, R. J.; CHUEIRE, L. M. O.; NICOLÁS, M. F.; PEREIRA-FERRARI, L.; SILVA, J. L. da C.; GIOPPO, N. M. R.; MARGARIDO, V. P.; MENCK-SOARES, M. A.; PINTO, F. G. S.; SIMÃO, R. de C. G.; TAKAHASHI, E. K.; YATES, M. G.; SOUZA, E. M..
The molecular mechanisms of plant recognition, colonization, and nutrient exchange between diazotrophic endophytes and plants are scarcely known. Herbaspirillum seropedicae is an endophytic bacterium capable of colonizing intercellular spaces of grasses such as rice and sugar cane. The genome of H. seropedicae strain SmR1 was sequenced and annotated by The Paraná State Genome Programme?GENOPAR. The genome is composed of a circular chromosome of 5,513,887 bp and contains a total of 4,804 genes. The genome sequence revealed that H. seropedicae is a highly versatile microorganism with capacity to metabolize a wide range of carbon and nitrogen sources and with possession of four distinct terminal oxidases. The genome contains a multitude of protein secretion...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Genoma; Fixacao nitrogenio; Graminea tropical; Genome; Herbaspirillum seropedicae; Nitrogen fixation; Grasses.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/897676
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Limited vegetative compatibility as a cause of somatic recombination in: Trichoderma pseudokoningii. Repositório Alice
BARCELLOS, F. G.; HUNGRIA, M.; PIZZIRANI-KLEINER, A. A..
With the aim of a better characterization of the somatic recombination process in Trichoderma pseudokoningii, a progeny from crossings between T. pseudokoningii strains contrasting for auxotroph markers was characterized by RAPD markers and PFGE (electrophoretic karyotype). Cytological studies of the conidia, conidiogenesis and heterokaryotic colonies were also performed. The genotypes of the majority of the recombinant strains analyzed were similar to only one of the parental strains and the low frequency of polymorphic RAPD bands suggested that the nuclear fusions may not occur into the heterokaryon. In some heterokaryotic regions the existence of intensely staining hyphae might be related to cell death. We proposed that a mechanism of somatic...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Somatic recombination.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/916731
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Panorama genômico da estirpe de Bradyrhizobium japonicum CPAC 15, recomendada para o uso em inoculantes comerciais para a cultura da soja. Repositório Alice
GODOY, L. P.; CHUEIRE, L. M. de O.; BARCELLOS, F. G.; VASCONCELOS, A. T. R.; GONZAGA, L. de P.; NICOLÁS, M. F.; HUNGRIA, M..
2005
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Soja; Inoculação; Bactéria; Genoma.
Ano: 2005 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/469110
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Panorama genômico da estirpe de Bradyrhizobium japonicum CPAC 15, recomendada para o uso em inoculantes comerciais para a cultura da soja. Repositório Alice
GODOY, L. P.; CHUEIRE, L. M. de O.; BARCELLOS, F. G.; VASCONCELOS, A. T. R.; GONZAGA, L. de P.; NICOLÁS, M. F; SOUZA, R. C.; HUNGRIA, M..
2006
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Inoculares; Cultura da soja.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/469205
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Sequenciamento do plasmídeo simbiótico da estirpe CFN 299 de Rhizobium tropici. Repositório Alice
BINDE, D. R.; CHUEIRE, L. M. de O.; LUCAS, I. H.; NICOLÁS, M. F.; VASCONCELOS, A. T. R.; GONZAGA, L. de P.; MARTINEZ-ROMERO, E.; BARCELLOS, F. G.; SILVA, M. F. da; GARCIA, J. E.; HUNGRIA, M..
2005
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Biotecnologia; Bactéria.
Ano: 2005 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/469077
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