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An overall evaluation of the resistance (R) and pathogenesis-related (PR) superfamilies in soybean, as compared with Medicago and Arabidopsis. Repositório Alice
WANDERLEY-NOGUEIRA, A. C.; BELARMINO, L. C.; SOARES-CAVALCANTI, N. da M.; BEZERRA-NETO, J. P.; KIDO, E. A.; PANDOLFI, V.; ABDELNOOR, R. V.; BINNECK, E.; CARAZZOLE, M. F.; BENKO-ISEPPON, A. M..
Plants have the ability to recognize and respond to a multitude of pathogens, resulting in a massive reprogramming of the plant to activate defense responses including Resistance (R) and Pathogenesis-Related (PR) genes. Abiotic stresses can also activate PR genes and enhance pathogen resistance, representing valuable genes for breeding purposes. The present work offers an overview of soybean R and PR genes present in the GENOSOJA (Brazilian Soybean Genome Consortium) platform, regarding their structure, abundance, evolution and role in the plantpathogen metabolic pathway, as compared with Medicago and Arabidopsis. Searches revealed 3,065 R candidates (756 in Soybean, 1,142 in Medicago and 1,167 in Arabidopsis), and PR candidates matching to 1,261 sequences...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Bioinformática; Biotic stress; Pathogen response; Soja; Resposta da planta; Doença de planta; Gene; Genoma; Soybeans; Bioinformatics; Plant diseases and disorders; Genome; Genes.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/926612
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Análise transcricional de Vigna unguiculata infectada por potyvírus (CABMV) através de LongSAGE. Repositório Alice
BARBOSA, P. K. A; CALSA JUNIOR, T; PANDOLFI, V.; KIDO, E. A.; ROCHA, M. de M.; SITTOLIN, I. M; ANDRADE, G. P; PIO-RIBEIRO, G.; BENKO-ISEPPON, A. M..
2008
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Tags; Estresse biótico; CABMV; SAGE.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/70618
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Brazilian cowpea transcriptome project: over five million expressed sequence tags to understand salinity and virus resistance. Repositório Alice
KIDO, E. A.; PANDOLFI, V.; BARBOSA, P. K. A.; SILVA, L. C. B. da; SILVA, A. B. da; MONTE, S. J. H. do; BRANDÃO, R. M. S. de S.; ARAUJO, A. de S.; CASTRO, J. A. F. de; SOARES-CAVALCANTI, N. da M.; CALSA-JUNIOR, T.; ROCHA, M. M.; WINTER, P.; KAHL, G.; ROTTER, B.; HORRES, R.; MOLINA, C.; JUNGMANN, R.; AMORIM, L. L. B.; ONOFRE, A. V. C.; FARIAS NETO, J. C.; GRANJEIRO, T. B.; LIMA, A. S.; LOBO, M. D. P.; HOULLOU-KIDO, L. M.; CARVALHO, R. de; WANDERLEY-NOGUEIRA, A. C.; BARROS, P. dos S.; VIEIRA-MELLO, G. S.; BRASILEIRO-VIDAL, A. C.; BORTOLETI, K. C. de A.; PEDROSA-HARAND, A.; ANDRADE, P. P. de; ANDRADE, G. P. de; PIO-RIBEIRO, G.; SITTOLIN, I. M.; FREIRE FILHO, F. R.; CASTRO, L. A. B. de; BENKO-ISEPPON, A. M..
bitstream/item/182776/1/Congresso-p25.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Caupi; Genética; Vírus.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/513094
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Caracterização estrutural de peptídeos antimicrobianos da classe cistatina em acessos de videira inoculados com Xanthomonas citri pv. viticola. Repositório Alice
OLIVEIRA, M. F. de; SILVA, R. L. de O.; BEZERRA NETO, J. P.; ARAÚJO, A, C. C. de; MELO, N. F. de; BENKO-ISEPPON, A. M..
O objetivo do presente trabalho foi identificar e caracterizar sequências candidatas à cistatinas em acessos de Vitis spp. inoculados com X. citri.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Videira; Xanthomonas Citri; Uva; Doença; Melhoramento Genético Vegetal; Defesa Vegetal; Vitis.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1104729
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Caracterização molecular por ISSR de acessos de melancia do Banco Ativo de Germoplasma de Cucurbitáceas. Repositório Alice
SILVA, M. L. da; QUEIROZ, M. A. de; FERREIRA, M. A. J. F.; BENKO-ISEPPON, A. M..
2012
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Citrullus lanatus; Variabilidade genética; Marcadores ISSR; Melancia; Watermelon.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/935172
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Citogenética comparativa em leguminosas cultivadas. Repositório Alice
BRASILEIRO-VIDAL, A. C.; BORTOLETI, K. C. A.; BENKO-ISEPPON, A. M.; VASCONCELOS, E. V. V.; FONSÊCA, A.; PEDROSA-HARAND, A.; OLIVEIRA, A. R. S.; BELARMINO, L. C.; AMORIM, L. L. B.; ABDELNOOR, R. V.; PANDOLFI, V.; MELO, N. F..
2011
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Microssatélites.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/919348
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Cytogenetics and cytotaxonomy of Velloziaceae. Repositório Alice
MELO, N. F. de; GUERRA, M.; BENKO-ISEPPON, A. M.; MENEZES, N. L. de..
Chromosome number and other cytological features are reported from 35 species of Velloziaceae, including several african and brazilian populations. All analyzed species show areticulate interphase nuclei and prophase/prometaphase chromosomes with proximal early condensation. Most heteropycnotic blocks do not seem to correspond to heterochromatin since, at least in Vellozia patens, they do not stain differentially after C-banding procedures. Regarding the chromosome number, three main groups could be identified. The first comprised diploid species of the genera Nanuza, Vellozia and the brazilian species of Xerophyta with 2n=14 or 16; the second comprised tetraploid species with 2n=34, and included all brazilian species of subfam. Barbacenioideae; the third...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Cytotaxonomy; Heterochromation; Citotaxonomia; Cromossoma; Velloziaceae; Chromosomes.
Ano: 1997 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/132531
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Desenvolvimento de marcadores moleculares AFLP para mapeamento genético em feijão-caupi. Repositório Alice
CORREIA, C. N.; SILVA, R. L. de O.; FERREIRA NETO, J. R. C.; ALMEIDA, J. C. Q. P. de; SILVA, M. D. da; ROCHA, M. de M.; FREIRE FILHO, F. R.; BENKO-ISEPPON, A. M.; KIDO, E. A..
bitstream/item/182816/1/cong2740.pdf
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Feijão de Corda; Marcador Molecular; Melhoramento Genético Vegetal.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/630762
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Differential transcriptional profiling of phakopsora pachyrhizi-infected soybean revealed by high-thoughput supersage. Repositório Alice
KIDO, E. A.; PANDOLFI, V.; FERREIRA NETO, J. R. C.; BARBOSA, P. D. de A.; ANDRADE, P. P. de; LANE, R.; GUIMARÃES, F. C. M.; ABDELNOOR, R. V.; BENKO-ISEPPON, A. M..
2013
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Soja.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/952758
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Distribuição de microssatélites no genoma de leguminosas mediante hibridização in situ fluorescente. Repositório Alice
BORTOLETI, K. C. A.; ABDELNOOR, R. V.; BENKO-ISEPPON, A. M.; BELARMINO, L. C. S.; OLIVEIRA, A. R. S.; NASCIMENTO, I. R.; BRASILEIRO-VIDAL, A. C..
Os microssatélites consistem em unidades de repetição (1 a 5pb) distribuídas em tandem, que podem estar dispersas ao longo dos genomas ou associadas a regiões heterocromáticas. Tais características têm permitido sua utilização na construção de mapas cromossômicos mediante hibridização in situ fluorescente (FISH), auxiliando no entendimento da organização genômica entre espécies proximamente relacionadas. O presente trabalho caracterizou a distribuição de oligonucleotídeos sintéticos (AG)8, (AAG)5, (ACC)5, (CTC)5 e (TGA)6 em Phaseolus vulgaris, P. lunatus, Vigna unguiculata, V. radiata e Glycine max, identificando marcas cromossômicas para a comparação destas leguminosas. Lâminas foram hibridizadas com sondas de oligonucleotídeos e rehibridizadas com DNAr...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Microssatélites.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/873953
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Genetic diversity among cowpea cultivars as revealed by ISSR and DAF markers. Repositório Alice
AMORIM, L. L. B.; LEITE, N. G. A.; ONOFRE, A. V. C.; COSTA, A. F.; DAMASCENO-SILVA, K. J.; ROCHA, M. de M.; FREIRE FILHO, F. R.; KIDO, E. A.; BENKO-ISEPPON, A. M..
2010
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Feijão-caupi; Variedade; Melhoramento genético.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/881703
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GENOSOJA - The Brazilian Soybean Genome Consortium: high throughput omics and beyond. Repositório Alice
BENKO-ISEPPON, A. M.; NEPOMUCENO, A. L.; ABDELNOOR, R. V..
Plant genomes are among the most complex and large ones of our planet, with high levels of redundancy when compared to other eukaryotic groups, leading to intricate processes for gene regulation and evolution. Such a complexity demands interdisciplinary and multidimensional approaches in order to allow a better understanding of the processes able to exploit the whole potential of the existing genes in different species, including crop plants. Among cultivated plants, soybean [Glycine max (L.) Merr.] occupies an outstanding position due to its importance as source of protein and oil that may also be converted into biodiesel. The seeds are rarely consumed in natura, but many traditional food products have been consumed, as soymilk, and tofu, as well as...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Soja; Genoma; Gene; Soybeans; Genome; Genes.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/926437
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Identificação de marcas moleculares associadas à resistência ao vírus do mosaido severo do feijão-caupi. Repositório Alice
ONOFRE, A. V. C.; AMORIM, L. L. B.; SITTOLIN, I. M.; ROCHA, M. de M.; FREIRE FILHO, F. R.; ANDRADE, G. P. de; PIO-RIBEIRO, G.; KIDO, É. A.; BENKO-ISEPPON, A. M..
Este trabalho teve como objetivo buscar associação entre marcadores moleculares e a resistência ao vírus do mosaico severo do feijão-caupi (CPSMV, Cowpea Severe Mosaic Virus), visando auxiliar no mapeamento fino desta característica. Foram avaliados 77 marcadores DAF (DNA Amplification Fingerprinting) e 12 SSR (Simple Sequence Repeat) nos parentais e bulks segregantes (análise de BSA, Bulked Segregant Analysis) a partir de uma progênie F6-7 de feijão-caupi segregando para resistência ao CPSMV. Dentre os marcadores testados, três (dois DAF e um SSR) se mostraram relacionados ao caráter de resistência. Na próxima etapa a distância de cada marcador com o loco de interesse será avaliada aplicando-se os marcadores selecionados em população segregante (F6-7) já...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Feijão de Corda; Marcador Molecular; Vírus.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/657063
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In silico identification of known osmotic stress responsive genes from Arabidopsis in soybean and Medicago. Repositório Alice
SOARES-CAVALCANTI, N. N.; BELARMINO, L. C.; KIDO, E. A.; WANDERLEY-NOGUEIRA, A. C.; BEZERRA-NETO, J. P.; CAVALCANTI-LIRA, R.; PANDOLFI, V.; NEPOMUCENO, A. L.; ABDELNOOR, R. V.; NASCIMENTO, L. C.; BENKO-ISEPPON, A. M..
Plants experience various environmental stresses, but tolerance to these adverse conditions is a very complex phenomenon. The present research aimed to evaluate a set of genes involved in osmotic response, comparing soybean and medicago with the well-described Arabidopsis thaliana model plant. Based on 103 Arabidopsis proteins from 27 categories of osmotic stress response, comparative analyses against Genosoja and Medicago truncatula databases allowed the identification of 1,088 soybean and 1,210 Medicago sequences. The analysis showed a high number of sequences and high diversity, comprising genes from all categories in both organisms. Genes with unknown function were among the most representative, followed by transcription factors, ion transport...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Osmotic stress; Stress-responsive genes; Soja; Genoma; Gene; Stress; Soybeans; Genes; Plant stress.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/926644
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Karyological features and banding patterns in Arachis species belonging to the heteranthae section. Repositório Alice
SILVA, S. C.; MARTINS, M. I. G.; SANTOS, R. C. dos; PENALOZA, A. D. P. de S.; MELO FILHO, P. A.; BENKO-ISEPPON, A. M.; VALLS, J. F. M.; CARVALHO, R..
2010
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Evolução cromossômica; CMA/DAPI; Espécie de amendoim; Arachis.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/872574
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Mapa genético de feijão-caupi com marcadores derivados de marcadores gênicos e não codificantes. Repositório Alice
AMORIM, L. L. B.; ONOFRE, A. V. C.; FERREIRA NETO, J. R. C.; SILVA, R. L. O. da; CORREIA, C. N.; SILVA, M. D. da; CARVALHO, R. de; HORRES, R.; MORETZSOHN, M. de C.; SITTOLIN, I. M.; ROCHA, M. de M.; FREIRE FILHO, F. R.; MONTE, S. J. H.; PANDOLFI, V.; ANDRADE, G. P.; PIO-RIBEIRO, G.; KIDO, É. A.; BENKO-ISEPPON, A. M..
O presente estudo buscou a construção de um mapa genético de feijão-caupi, incluindo genes de resistência ao vírus do mosaico severo do caupi (CPSMV), bem como sua associação a marcadores moleculares. Para isso, uma população de 94 RILs F6, segregando para reação ao vírus foi genotipada a partir de quatro categorias de marcadores: SSR-EST, ISSR, DAF e CAPS. Adotando o LOD de 2,0 e uma frequência máxima de recombinação de 0,40, foram mapeados 53 locos em 11 grupos de ligação cobrindo uma distância de recombinação total de 716,2 cM. O gene de resistência ao CPSMV foi mapeado no grupo de ligação 1, entre dois marcadores SSR-EST, a 6,1 cM do primeiro e 24,1 do segundo. As etapas seguintes envolvem o mapeamento fino desta região, visando identificar marcadores...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Feijão de Corda; Marcador Molecular; Vírus.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/657084
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Mapeamento genético e marcadores moleculares associados à resistência do feijão-caupi ao vírus do mosaico severo. Repositório Alice
AMORIM, L. L. B.; ONOFRE, A. V. C.; FERREIRA NETO, J. R. C.; SILVA, R. L. O. da; CORREIA, C. N.; SILVA, M. D. da; CARVALHO, R. de; HORRES, R.; MORETZSOHN M. de C.; SITTOLIN, I. M.; ROCHA, M. de M.; FREIRE FILHO, F. R.; PANDOLFI, V.; BARBOSA P. F. de A.; ANDRADE, G. P. de; PIO-RIBEIRO, G.; MONTE, S. J. H. do; KIDO, E. A.; BENKO-ISEPPON, A. M..
bitstream/item/182870/1/Pag3.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Caupi; Marcador Molecular; Vírus.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/513544
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Mineração de motivos SSR em sequências expressas de feijão-caupi contendo TAGS supersage diferecialmente expressas sob desidratação radicular. Repositório Alice
SANTOS, R.; BASANTE, C.; FERREIRA NETO, J. R. C.; PANDOLFI, V.; ROCHA, M. de M.; SILVA, K. J. D. e; NEPOMUCENO, A.; BRONDANI, R. P. V.; BENKO-ISEPPON, A. M.; KIDO, E. A..
O feijão-caupi é uma planta importante na nutrição e na economia de pequenos produtores das regiões Norte e Nordeste do Brasil. Entretanto, sua produtividade ainda é pequena, quando comparada com seu potencial e o de outras leguminosas. Uma das alternativas para auxiliar o melhoramento genético da cultura e associar tecnologias modernas, como o desenvolvimento de marcadores moleculares do tipo microssatélites (SSR) e a identificação de genes importantes em resposta a estresses, via estudos de transcriptômica, proporcionados pela técnica SuperSAGE. Nesse sentido, tags SuperSAGE de 26 pb, de genótipo tolerante a desidratação radicular, que foram observadas sendo induzidas após aplicação do estresse (até 150 min), em relação ao controle sem estresse, foram...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Vigna unguiculata; Estresse abiótico; Biblioteca genômica; Bioinformática.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/963655
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Mineração de motivos SSR em sequências expressas de feijão-caupi contendo TAGS supersage diferecialmente expressas sob desidratação radicular. Repositório Alice
SANTOS, R.; BASANTE, C.; FERREIRA NETO, J. R. C.; PANDOLFI, V.; ROCHA, M. de M.; SILVA, K. J. D. e; NEPOMUCENO, A.; BRONDANI, R. P. V.; BENKO-ISEPPON, A. M.; KIDO, E. A..
O feijão-caupi é uma planta importante na nutrição e na economia de pequenos produtores das regiões Norte e Nordeste do Brasil. Entretanto, sua produtividade ainda é pequena, quando comparada com seu potencial e o de outras leguminosas. Uma das alternativas para auxiliar o melhoramento genético da cultura e associar tecnologias modernas, como o desenvolvimento de marcadores moleculares do tipo microssatélites (SSR) e a identificação de genes importantes em resposta a estresses, via estudos de transcriptômica, proporcionados pela técnica SuperSAGE. Nesse sentido, tags SuperSAGE de 26 pb, de genótipo tolerante a desidratação radicular, que foram observadas sendo induzidas após aplicação do estresse (até 150 min), em relação ao controle sem estresse, foram...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Vigna unguiculata; Estresse abiótico; Biblioteca genômica; Bioinformática.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/965091
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Mining plant genome browsers as a means for efficient connection of physical, genetic and cytogenetic mapping: an example using soybean. Repositório Alice
BELARMINO, L. C.; OLIVEIRA, A. R. da S.; BRASILEIRO-VIDAL, A. C.; BORTOLETI, K. C. de A.; BEZERRA-NETO, J. P.; ABDELNOOR, R. V.; BENKO-ISEPPON, A. M..
Physical maps are important tools to uncover general chromosome structure as well as to compare different plant lineages and species, helping to elucidate genome structure, evolution and possibilities regarding synteny and colinearity. The increasing production of sequence data has opened an opportunity to link information from mapping studies to the underlying sequences. Genome browsers are invaluable platforms that provide access to these sequences, including tools for genome analysis, allowing the integration of multivariate information, and thus aiding to explain the emergence of complex genomes. The present work presents a tutorial regarding the use of genome browsers to develop targeted physical mapping, providing also a general overview and examples...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Bioinformática FISH; BAC; SSR Soja Genoma Gene Soybeans Bioinformatics Aquaporins Genes Genome.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/926648
Registros recuperados: 31
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