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A new closterovirus found in arracacia xanthorrhiza by next generation sequencing. Repositório Alice
COSTA, G. A.; GOMES, S. S. V. S. F.; BLAWID, R.; NAGATA, T.; INOUE-NAGATA, A. K.; RESENDE, R. O.; ORÍLIO, A. F..
2016
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Mandioquinha-salsa; Virus; Arracacia xanthorrhiza.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1066095
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A novel cythorhabdorivirus in arracacha (Arracacia Xanthorrhiza). Repositório Alice
GOMES, S. S. V. S. F.; BLAWID, R.; COSTA, G. A.; NAGATA, T.; MADEIRA, N. R.; INOUE-NAGATA, A. K. I.; RESENDE, R. O.; ORÍLIO, A. F..
2016
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Mandioquinha-salsa; Virus; Arracacia xanthorrhiza.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1064995
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Análise da expressão gênica pela técnica de PCR quantitativa em tempo real: princípios e fundamentos. Infoteca-e
MORGANTE, C. V.; BLAWID, R..
Neste trabalho são apresentados os conceitos fundamentos da análise da expressão gênica pela técnica de PCR e reúne informações importantes para aqueles que se dedicam ao estudo da genética vegetal. Sumário: Introdução; Rermos básicos utilizados na qPCR; Sistemas para a detecção da fluorescência; Etapas anteriores à reação de qPCR; Parâmetros para a padronização da qPCR; Métodos de quantificação gênica; Referências; Glossário.
Tipo: Documentos (INFOTECA-E) Palavras-chave: PCR; Metodologia de análise; Biologia molecular; Genética vegetal; Biotecnologia; Biotechnology.
Ano: 2016 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1066218
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Busca de fontes de resistência ao vetor Bemísia tabaci e ao Tomato chlorotic mottle vírus (ToCMoV) em germoplasma de Solanum melongena. Repositório Alice
PINHEIRO-LIMA, B.; BRANT, P. M.; CALAÇA, M. M.; BEZERRA, B. M.; BOITEUX, L. S.; BLAWID, R.; RESENDE, R. O.; PEREIRA-CARVALHO, R. C..
O objetivo desse trabalho foi buscar fontes de resistência à mosca branca e ao ToCMoV em berinjela (S. melongena).
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Begomovírus; Tomate; Mosca branca; Variedade resistente; Virus; Solanum lycopersicum.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1009777
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Cucurbit aphid-borne yellows virus from melon plants in Brazil is an interspecific recombinant. Repositório Alice
COSTA, T. M.; BLAWID, R.; ARANDA, M. A.; FREITAS, D. M. S.; ANDRADE, G. P.; INOUE-NAGATA, A. K.; NAGATA, T..
Melon plants with severe yellowing symptoms from in Brazil were analyzed by high-throughput sequencing. Sequences homologous to the genome of the polerovirus cucurbit aphid-borne yellows virus (CABYV) were frequently retrieved. Two draft CABYV genomes were assembled from two pooled melon samples that contained an identical putative recombinant fragment in the 3 region with an unknown polerovirus. The complete genomes of these isolates revealed by Sanger sequencing share 96.8% nucleotide identity, while both sequences share 73.7% nucleotide identity with a CABYV-N isolate from France. A molecular-clock analysis suggested that CABYV was introduced into Brazil 68 years ago.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Amarelão do meloeiro; Melão; Doença; Vírus; Melons.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1098342
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Discovery and molecular characterization of a novel enamovirus, Grapevine enamovirus-1. Repositório Alice
SILVA, J. M. F; RWAHNIH, M. A.; BLAWID, R.; NAGATA, T.; FAJARDO, T. V. M..
Abstract In this study, we describe a novel putative Enamovirus member, Grapevine enamovirus-1 (GEV-1), discovered by high-throughput sequencing (HTS). A limited survey using HTS of 17 grapevines (Vitis spp.) from the south, southeast, and northeast regions of Brazil led to the detection of GEV-1 exclusively on southern plants, infecting four grapevine cultivars (Cabernet Sauvignon, Semillon, CG 90450, and Cabernet franc) with a remark-able identity of around 99% at the nucleotide level. This novel virus was only detected in multiple-virus infected plants exhibiting viral-like symptoms. GEV-1 was also detected on a cv. Malvasia Longa by RT-PCR. We performed graft-transmissibility assays on GEV-1. The organization, products, and cis-acting regulatory...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: High-throughput sequencing; Luteoviridae; Grapevine enamovirus-1; GEV-1.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1071596
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Discovery and partial characterization of a novel virus, tentatively named Grapevine virgalike virus. Repositório Alice
SILVA, J. M. F.; PEREIRA, B. R. de M.; AI RWAHNÍH, M.; BLAWID, R.; BLAWID, R.; NAGATA, T.; FAJARDO, T. V. M..
The families Bromoviridae and Virgaviridae are composed of viruses with a single-stranded positive sense RNA genome possessing an alpha-like replication complex and a 3'-t-RNA-like structure.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Grapevine virgalike virus; Phylogenetic analysis; High-throughput sequencing (HTS); Bromoviridae; Virgaviridae; Nucleotides; Viruses.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1090655
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Diversidade de endossimbiontes em Bemisia tabaci coletadadas no tomateiro e diferentes hospedeiras em localidades do Centro Oeste. Repositório Alice
NOGUEIRA, I.; FONSECA, M. E. de N.; RESENDE, R. O.; BLAWID, R.; INOUE=NAGATA, A. K.; PEREIRA-CARVALHO, R. C..
O objetivo do trabalho foi identificar endossimbiontes em populações de B. tabaci de vários locais e plantas hospedeiras.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Praga de planta; Inseto; Mosca branca; Bemisia tabaci.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/943671
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Fluorescence in situ hybridization analysis of endosymbiont genera reveals novel infection patterns in a tomato-infesting Bemisia tabaci population from Brazil. Repositório Alice
BLAWID, R.; MORGADO, F. S.; SOUZA, C. A.; BOITEUX, L. S.; PEREIRA-CARVALHO, R. C..
2015
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Bemisia tabaci; Tomate; Solanum lycopersicum; Endosymbionts; Tomato.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1030368
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Immunostaining of root tissue of nicotiana benthamiana infected with pepper risngpot virus. Repositório Alice
TAVARES, M. L.; BLAWID, R.; NAGATA, T.; NAGATA, A. K. I..
2016
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Tobravirus; Tobacco rattle virus.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1066090
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In silico detection of a defective genomic RNA of Grapevine leafroll-associated virus 4 strain 5 in High-Throughput Sequencing data. Repositório Alice
SILVA, J. M. F.; BLAWID, R.; NAGATA, T.; FAJARDO, T. V. M..
Grapevine leafroll disease (GLRD) is one of the most economically important viral diseases affecting grapevines (Maliogka et aI., 2015).
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Grapevine; Genomic; Grapevine leafroll disease (GLRD); Family Closteroviridae; Positive-sense ssRNA genome; Viruses.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1090663
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Metagenomic analysis of viral species in native plants from the cerrado biome. Repositório Alice
SANTOS, E. M. B.; BRANT, P. M.; BLAWID, R.; MELO, F. L.; ORÍLIO, A.; RESENDE, R. O.; LIMA, M. F.; RIBEIRO, S.; PEREIRA-CARVALHO, R. C..
The main objective of this work is to detect novel viral species infecting native plants from Cerrado with the aid of metagenomics.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Cerrado.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1033036
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Molecular and biological characterization of corchorus mottle virus, a new begomovirus from Brazil. Repositório Alice
BLAWID, R.; FONTENELE, R. S.; LACORTE, C. C.; RIBEIRO, S. da G..
bitstream/item/156231/1/art3A10.10072Fs00705-013-1764-x.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Corchorus hirtus; Orinoco jute; Begomovirus.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/974850
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Molecular characterization of grapevine enamo-like virus, a novel putative member of the genus enamovirus. Repositório Alice
SILVA, J. M. F.; FAJARDO, T. V. M.; AL RWAHNIH, M.; BLAWID, R.; NAGATA, T..
2016
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Doença de planta; Vírus; Virus; Doenca de planta; Grapevine.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1053686
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Molecular characterization of Grapevine enamolike virus, a novel putative member of the genus Enamovirus. Repositório Alice
SILVA, J. M. F.; FAJARDO, T. V. M.; AL RWAHNIN, M.; BLAWID, R.; NAGATA, T..
2016
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Family Luteoviridae; Pea enation mosaic virus 1 (PEMV1); Alfalfa enamovirus1 (AEV1); Citrus vein enation virus (CVEV); Virus ENAMO-LIKE; Caracterização molecular; Virus; Doenca de planta.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1053684
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Reference gene selection for qPCR analysis in tomato-bipartite begomovirus interaction and validation in additional tomato-virus pathosystems. Repositório Alice
LACERDA, A. L. M.; FONSECA, L. N.; BLAWID, R.; BOITEUX, L. S.; RIBEIRO, S. G.; BRASILEIRO, A. C. M..
bitstream/item/181971/1/journal.pone.0136820.PDF
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Solanum lycopersicum L; Tomato.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1030840
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Resposta ao tomato chlorotic mottle virus (ToCMoV) e a Bemísia tabaci de espécies do bioma 'Cerrado'. Repositório Alice
SANTOS, F. M. B.; SOUZA, C. A.; BRITO,S. M.; OLIVEIRA, D. V. V.; BEZERRA, M. B.; ALMEIDA, N. N.; BLAWID, R.; RESENDE, R. O.; BOITEUX, L. S.; PEREIRA-CARVALHO, R. C..
2014
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Espécies florestais; ToCMoV; Doença de planta; Bemisia tabaci; Floresta; Virus.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1009709
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Resposta de espécies florestais do Cerrado à espécies virais dos gêneros Repositório Alice
FARIAS, P. C.; BATISTA, J. G.; CALAÇA, M. M.; DIANESE, E. C.; BOITEUX, L. S.; LIMA, M. F.; RESENDE, R. O.; BLAWID, R.; PEREIRA-CARVALHO, R. de C..
Este trabalho objetivou a avaliação do potencial de espécies florestais como hospedeiras de vírus economicamente importantes. Espécies de Potyvirus (Potato virus Y - PVY) e de Tospovirus (Groundnut ringspot virus - GRSV e Tomato spotted wilt virus -? TSWV) foram inoculadas mecanicamente via extrato vegetal tamponado em 22 espécies em plantas nativas do Bioma Cerrado.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Potyvirus; Tospovírus; Cerrado; Doença de planta; Virus.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1009755
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The complete genome sequence of melon yellowingassociated virus determined by nextgeration sequencing. Repositório Alice
COSTA, T. M.; COSTA JUNIOR, A. C.; MORIYA, N. M. N.; ARAGÃO, F. A. S.; LIMA, M. F.; NAGATA, A. K. I.; BLAWID, R.; NAGATA, T..
2016
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Melão; Virus; Melon.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1066094
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