SABIIA - Sistema Aberto e Integrado de Informação em Agricultura (Sabiia)

COSTA, G. A.; GOMES, S. S. V. S. F.; BLAWID, R.; NAGATA, T.; INOUE-NAGATA, A. K.; RESENDE, R. O.; ORÍLIO, A. F..

2016

A novel cythorhabdorivirus in arracacha (Arracacia Xanthorrhiza).

Palavras-chave: Mandioquinha-salsa; Virus; Arracacia xanthorrhiza.

Ano: 2016

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1066095

GOMES, S. S. V. S. F.; BLAWID, R.; COSTA, G. A.; NAGATA, T.; MADEIRA, N. R.; INOUE-NAGATA, A. K. I.; RESENDE, R. O.; ORÍLIO, A. F..

2016

Análise da expressão gênica pela técnica de PCR quantitativa em tempo real: princípios e fundamentos.

Palavras-chave: Mandioquinha-salsa; Virus; Arracacia xanthorrhiza.

Ano: 2016

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1064995

Infoteca-e

MORGANTE, C. V.; BLAWID, R..

Neste trabalho são apresentados os conceitos fundamentos da análise da expressão gênica pela técnica de PCR e reúne informações importantes para aqueles que se dedicam ao estudo da genética vegetal. Sumário: Introdução; Rermos básicos utilizados na qPCR; Sistemas para a detecção da fluorescência; Etapas anteriores à reação de qPCR; Parâmetros para a padronização da qPCR; Métodos de quantificação gênica; Referências; Glossário.

Tipo: Documentos (INFOTECA-E)

Palavras-chave: PCR; Metodologia de análise; Biologia molecular; Genética vegetal; Biotecnologia; Biotechnology.

Ano: 2016

URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1066218

Busca de fontes de resistência ao vetor Bemísia tabaci e ao Tomato chlorotic mottle vírus (ToCMoV) em germoplasma de Solanum melongena.

PINHEIRO-LIMA, B.; BRANT, P. M.; CALAÇA, M. M.; BEZERRA, B. M.; BOITEUX, L. S.; BLAWID, R.; RESENDE, R. O.; PEREIRA-CARVALHO, R. C..

O objetivo desse trabalho foi buscar fontes de resistência à mosca branca e ao ToCMoV em berinjela (S. melongena).

Cucurbit aphid-borne yellows virus from melon plants in Brazil is an interspecific recombinant.

Palavras-chave: Begomovírus; Tomate; Mosca branca; Variedade resistente; Virus; Solanum lycopersicum.

Ano: 2014

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1009777

COSTA, T. M.; BLAWID, R.; ARANDA, M. A.; FREITAS, D. M. S.; ANDRADE, G. P.; INOUE-NAGATA, A. K.; NAGATA, T..

Melon plants with severe yellowing symptoms from in Brazil were analyzed by high-throughput sequencing. Sequences homologous to the genome of the polerovirus cucurbit aphid-borne yellows virus (CABYV) were frequently retrieved. Two draft CABYV genomes were assembled from two pooled melon samples that contained an identical putative recombinant fragment in the 3 region with an unknown polerovirus. The complete genomes of these isolates revealed by Sanger sequencing share 96.8% nucleotide identity, while both sequences share 73.7% nucleotide identity with a CABYV-N isolate from France. A molecular-clock analysis suggested that CABYV was introduced into Brazil 68 years ago.

Discovery and molecular characterization of a novel enamovirus, Grapevine enamovirus-1.

Palavras-chave: Amarelão do meloeiro; Melão; Doença; Vírus; Melons.

Ano: 2018

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1098342

SILVA, J. M. F; RWAHNIH, M. A.; BLAWID, R.; NAGATA, T.; FAJARDO, T. V. M..

Abstract In this study, we describe a novel putative Enamovirus member, Grapevine enamovirus-1 (GEV-1), discovered by high-throughput sequencing (HTS). A limited survey using HTS of 17 grapevines (Vitis spp.) from the south, southeast, and northeast regions of Brazil led to the detection of GEV-1 exclusively on southern plants, infecting four grapevine cultivars (Cabernet Sauvignon, Semillon, CG 90450, and Cabernet franc) with a remark-able identity of around 99% at the nucleotide level. This novel virus was only detected in multiple-virus infected plants exhibiting viral-like symptoms. GEV-1 was also detected on a cv. Malvasia Longa by RT-PCR. We performed graft-transmissibility assays on GEV-1. The organization, products, and cis-acting regulatory...

Discovery and partial characterization of a novel virus, tentatively named Grapevine virgalike virus.

Palavras-chave: High-throughput sequencing; Luteoviridae; Grapevine enamovirus-1; GEV-1.

Ano: 2017

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1071596

SILVA, J. M. F.; PEREIRA, B. R. de M.; AI RWAHNÍH, M.; BLAWID, R.; BLAWID, R.; NAGATA, T.; FAJARDO, T. V. M..

The families Bromoviridae and Virgaviridae are composed of viruses with a single-stranded positive sense RNA genome possessing an alpha-like replication complex and a 3'-t-RNA-like structure.

Diversidade de endossimbiontes em Bemisia tabaci coletadadas no tomateiro e diferentes hospedeiras em localidades do Centro Oeste.

Palavras-chave: Grapevine virgalike virus; Phylogenetic analysis; High-throughput sequencing (HTS); Bromoviridae; Virgaviridae; Nucleotides; Viruses.

Ano: 2018

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1090655

NOGUEIRA, I.; FONSECA, M. E. de N.; RESENDE, R. O.; BLAWID, R.; INOUE=NAGATA, A. K.; PEREIRA-CARVALHO, R. C..

O objetivo do trabalho foi identificar endossimbiontes em populações de B. tabaci de vários locais e plantas hospedeiras.

Fluorescence in situ hybridization analysis of endosymbiont genera reveals novel infection patterns in a tomato-infesting Bemisia tabaci population from Brazil.

Palavras-chave: Praga de planta; Inseto; Mosca branca; Bemisia tabaci.

Ano: 2012

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/943671

BLAWID, R.; MORGADO, F. S.; SOUZA, C. A.; BOITEUX, L. S.; PEREIRA-CARVALHO, R. C..

2015

Immunostaining of root tissue of nicotiana benthamiana infected with pepper risngpot virus.

Palavras-chave: Bemisia tabaci; Tomate; Solanum lycopersicum; Endosymbionts; Tomato.

Ano: 2015

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1030368

TAVARES, M. L.; BLAWID, R.; NAGATA, T.; NAGATA, A. K. I..

2016

In silico detection of a defective genomic RNA of Grapevine leafroll-associated virus 4 strain 5 in High-Throughput Sequencing data.

Palavras-chave: Tobravirus; Tobacco rattle virus.

Ano: 2016

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1066090

SILVA, J. M. F.; BLAWID, R.; NAGATA, T.; FAJARDO, T. V. M..

Grapevine leafroll disease (GLRD) is one of the most economically important viral diseases affecting grapevines (Maliogka et aI., 2015).

Metagenomic analysis of viral species in native plants from the cerrado biome.

Palavras-chave: Grapevine; Genomic; Grapevine leafroll disease (GLRD); Family Closteroviridae; Positive-sense ssRNA genome; Viruses.

Ano: 2018

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1090663

SANTOS, E. M. B.; BRANT, P. M.; BLAWID, R.; MELO, F. L.; ORÍLIO, A.; RESENDE, R. O.; LIMA, M. F.; RIBEIRO, S.; PEREIRA-CARVALHO, R. C..

The main objective of this work is to detect novel viral species infecting native plants from Cerrado with the aid of metagenomics.

Molecular and biological characterization of corchorus mottle virus, a new begomovirus from Brazil.

Palavras-chave: Cerrado.

Ano: 2015

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1033036

BLAWID, R.; FONTENELE, R. S.; LACORTE, C. C.; RIBEIRO, S. da G..

bitstream/item/156231/1/art3A10.10072Fs00705-013-1764-x.pdf

Molecular characterization of grapevine enamo-like virus, a novel putative member of the genus enamovirus.

Palavras-chave: Corchorus hirtus; Orinoco jute; Begomovirus.

Ano: 2013

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/974850

SILVA, J. M. F.; FAJARDO, T. V. M.; AL RWAHNIH, M.; BLAWID, R.; NAGATA, T..

2016

Molecular characterization of Grapevine enamolike virus, a novel putative member of the genus Enamovirus.

Palavras-chave: Doença de planta; Vírus; Virus; Doenca de planta; Grapevine.

Ano: 2016

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1053686

SILVA, J. M. F.; FAJARDO, T. V. M.; AL RWAHNIN, M.; BLAWID, R.; NAGATA, T..

2016

Reference gene selection for qPCR analysis in tomato-bipartite begomovirus interaction and validation in additional tomato-virus pathosystems.

Palavras-chave: Family Luteoviridae; Pea enation mosaic virus 1 (PEMV1); Alfalfa enamovirus1 (AEV1); Citrus vein enation virus (CVEV); Virus ENAMO-LIKE; Caracterização molecular; Virus; Doenca de planta.

Ano: 2016

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1053684

LACERDA, A. L. M.; FONSECA, L. N.; BLAWID, R.; BOITEUX, L. S.; RIBEIRO, S. G.; BRASILEIRO, A. C. M..

bitstream/item/181971/1/journal.pone.0136820.PDF

Resposta de espécies florestais do Cerrado à espécies virais dos gêneros

Palavras-chave: Solanum lycopersicum L; Tomato.

Ano: 2015

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1030840

FARIAS, P. C.; BATISTA, J. G.; CALAÇA, M. M.; DIANESE, E. C.; BOITEUX, L. S.; LIMA, M. F.; RESENDE, R. O.; BLAWID, R.; PEREIRA-CARVALHO, R. de C..

Este trabalho objetivou a avaliação do potencial de espécies florestais como hospedeiras de vírus economicamente importantes. Espécies de Potyvirus (Potato virus Y - PVY) e de Tospovirus (Groundnut ringspot virus - GRSV e Tomato spotted wilt virus -? TSWV) foram inoculadas mecanicamente via extrato vegetal tamponado em 22 espécies em plantas nativas do Bioma Cerrado.

The complete genome sequence of melon yellowingassociated virus determined by nextgeration sequencing.

Palavras-chave: Potyvirus; Tospovírus; Cerrado; Doença de planta; Virus.

Ano: 2014

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1009755

COSTA, T. M.; COSTA JUNIOR, A. C.; MORIYA, N. M. N.; ARAGÃO, F. A. S.; LIMA, M. F.; NAGATA, A. K. I.; BLAWID, R.; NAGATA, T..

2016