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Análise da variabilidade genética de variedades tradicionais de arroz (Oryza sativa L.) através de marcadores moleculares microssatélites. Repositório Alice
BORBA, T. C. de O.; ZUCCHI, M. I.; BRONDANI, R. V.; RANGEL, P. H. N.; MAGALHÃES, M. R.; BRONDANI, C..
Este trabalho teve como objetivo avaliar a variabilidade genética através de marcadores moleculares SSR em uma amostra de variedades tradicionais oriundas de coletas, conduzidas entre os anos de 1978 e 1996, em lavouras de pequenos agricultores no Brasil.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Coleção nuclear; Arroz; Oryza sativa; Recurso genético; Marcador molecular.
Ano: 2003 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/936126
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Desenvolvimento de marcadores microssatélites para análise de populações de Magnaporthe grisea. Repositório Alice
GARRIDO, L. R.; BRONDANI, R. V.; AMARAL, Z. P.; BUSO, G. S. C.; FERREIRA, M. E..
2000
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE)
Ano: 2000 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/186767
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Desenvolvimento de sistemas de genotipagem semi-automatizada baseada em microsatélites para espécies de Eucalyptus. Repositório Alice
KIRST, M.; CIAMPI, A. Y.; BRONDANI, R. V.; GRATAPAGLIA, D..
1998
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Caracterização biológica.
Ano: 1998 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/189186
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Desenvolvimento e otimização de locos ssr para estudos de espécies nativas em risco de extinção no Brasil. Repositório Alice
SILVEIRA, F. Q. de P.; BRONDANI, R. V.; MISSIAGGIA, A. A.; GAIOTTO, F. A.; GRIBEL, R.; COUTINHO, S.; GRATAPAGLIA, D..
1998
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Caracterização biológica.
Ano: 1998 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/189187
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Desenvolvimento e transferibilidade de marcadores microssatélites no gênero Cedrela (meliaceae). Repositório Alice
SOARES, C. N.; BRONDANI, R. V.; CIAMPI, A. Y.; GRATTAPAGLIA, D..
1998
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Caracterização biológica.
Ano: 1998 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/189159
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Determinação de genótipos superiores de eucaliptos com base em marcadores microssatélites. Repositório Alice
RIBEIRO, V. J.; BRONDANI, R. V.; CIAMPI, A. Y.; GRATTAPAGLIA. D..
1998
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Caracterização biológica.
Ano: 1998 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/189166
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Evaluation of the number and information content of fluorescent-labeled SSR markers for rice germplasm characterization. Repositório Alice
BORBA, T. C. de O.; BRONDANI, R. V.; RANGEL, P. H. N.; BRONDANI, C..
The use of fluorescent-labelled simple sequence repeat (SSR) markers allows the simultaneous analysis of diverse loci in multiplex series, providing an enhanced precision of the determination of the allele size when a large number of genotypes is used. Twenty-five fluorescent-labelled SSR markers were used to genotype 242 accessions of the Brazilian Rice Core Collection. Based on the Polymorphism Information Content (PIC) values of each marker, groups with 5, 10, 15 and 20 markers were formed. The average PIC values varied from 0.67 to 0.89 and the number of alleles sampled per group, from 70 to 377. In the case of rice, which has a narrow genetic base, the conclusion was drawn that it is of fundamental importance that the genotypes must be evaluated by...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Oryza sativa; Diversidade genética; Recursos genéticos; Genetic diversity; Genetic resources; Rice; Arroz.
Ano: 2005 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/213598
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Genetic variability analysis of elite upland rice genotypes with SSR markers. Repositório Alice
BRONDANI, C.; CALDEIRA, K. da S.; BORBA, T. C. O.; RANGEL. P. N.; MORAIS, O. P. de; CASTRO, E. da M. de; RANGEL, P. H. N.; MENDONÇA, J. A.; BRONDANI, R. V..
Rice is one of the staple foods consumed worldwide, and rice breeding programmes have become important to warrant high yield levels and grain quality in upland rice. Laboratory experiments were conducted to study the genetic variation of 30 elite genotypes from a VCU trial, of the upland rice breeding programme of Embrapa, Brazil, using 25 SSR markers. A total of 131 alleles were obtained, with an average of 5.2 alleles per locus and a mean PIC equal to 0.61. Results indicated that genetically different elite parents from the breeding programme and selection in segregating families have given rise to broad-based rice genotypes. Based on the analysis of different combinations of 10 SSR markers, it was observed that the use of more informative markers is...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Arroz; Oryza sativa; Rice; Recurso genético; Marcador microssatélite; Distância genética; Genetic Resources; Microsatellite markers; Genetic distance.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/214369
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Genetic variability of Brazilian rice landraces determined by SSR markers. Repositório Alice
BORBA, T. C. de O.; MENDES, C. dos A.; GUIMARÃES, E. P.; BRUNES, T. O.; FONSECA, J. R.; BRONDANI, R. V.; BRONDANI, C..
O objetivo deste trabalho foi avaliar a variabilidade genética de variedades locais de arroz (Oryza sativa), coletadas em pequenas propriedades rurais. Doze marcadores microssatélites (SSR) caracterizaram 417 variedades locais, coletadas em 1986, 1987 e 2003, no Estado de Goiás. O número de variedades locais com tipo de grão longo e fino aumentou no intervalo de tempo avaliado, provavelmente em razão da demanda de mercado. Conforme os dados moleculares, houve aumento na variabilidade genética e, por meio da análise fatorial de correspondência, observou-se que a maior parte dos acessos foi agrupada de acordo com o ano de coleta. A incorporação de cultivares modernas de arroz às áreas de cultivo das variedades locais e a seleção realizada pelos pequenos...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Variabilidade genética; Microsatélite; Genotipagem; Arroz; Oryza sativa; Melhoramento; Genótipo; Rice; Microsatellite repeats; Genetic resources; Genotype.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/428289
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Genetic variability of Brazilian rice landraces determined by SSR markers. Repositório Alice
BORBA, T. C. de O.; MENDES, C. dos A.; GUIMARÃES, E. P.; BRUNES, T. O.; FONSECA, J. R.; BRONDANI, R. V.; BRONDANI, C..
Abstract ? The objective of this study was to evaluate the genetic variability of rice (Oryza sativa) landraces collected in Brazilian small farms. Twelve simple sequence repeat (SSR) markers characterized 417 landraces collected in 1986, 1987 and 2003, in the state of Goiás, Brazil. The number of landraces with long and thin grain type increased in the evaluated period, probably due to market demand. Based on the molecular data, the genetic variability increased during this period and, as per to the factorial correspondence analysis, most of the accessions were grouped according to the year of collection. The incorporation of modern rice cultivars in landrace cultivation areas and the selection carried out by small farmers are the most probable factors...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Genotyping; Participatory breeding; Rice breeding; Oriza sativa; Microsatellites.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/631815
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Herança de locos microssatélites e estimativa de fecundação cruzada em populações fragmentadas de sumaúma. Repositório Alice
MISSIAGGIA, A. A.; SILVEIRA, F. Q. de P.; BRONDANI, R. V.; GRIBEL, R.; GRATTAPAGLIA, D..
1998
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Caracterização biológica.
Ano: 1998 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/189174
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Identificação de seqüências expressas etiquetadas (ESTs) envolvidas na interação de arroz e do fungo causador da brusone (Magnaphorte grisea). Repositório Alice
BEVITORI, R.; REIS, M. S.; DIÓGENES, R.; BRONDANI, R. V.; DA SILVA, F. R.; DE PAULA, A. W. M.; GROSSI DE SA, M. F..
Considerando que um dos requisitos primordiais para o uso das novas ferramentas biotecnológicas é a identificação de genes, duas bibliotecas subtrativas foram construídas utilizando-se mRNA isolado de folhas de arroz infectadas por M. grisea, com o objetivo de construir um banco de ESTs visando analisar a expressão de genes induzidos ou suprimidos durante a interação patógeno-hospedeiro. Ate o presente momento, 1232 ESTs foram geradas e a análise das mesmas, utilizando métodos computacionais, encontra-se em andamento. Adicionalmente, a fornecer informações do modelo de expressão de genes de defesa do arroz, este estudo disponibilizará genes para estudos de genômica funcional e desta maneira poderá elucidar o mecanismo de resistência da planta a este fungo.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Arroz; Oryza sativa; Rice; Magnaphorte grisea; Brusone; Doença de planta; Fungo.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/216681
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Identificação de seqüências expressas etiquetadas (ESTs) envolvidas na interação de arroz e do fungo causador da brusone (Magnaphorte grisea). Repositório Alice
BEVITORI, R.; REIS, M. S.; DIÓGENES, R.; BRONDANI, R. V.; DA SILVA, F. R.; DE PAULA, A. W. M; GROSSI DE SÁ, M. F..
2007
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Arroz; Magnaphorte grisea; Brusone; Doença de planta; Fungo.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/190065
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Identification of SSR markers linked to rust resistance in andean common bean PI 260418. Repositório Alice
PASTOR-CORRALES, M. A.; PEREIRA, P. A. A.; LEWERS, K.; BRONDANI, R. V.; BUSO, G. C.; FERREIRA, M. A.; MARTINS, W. S..
The objective of this study was to identify molecular markers linked to the rust resistance gene or genes present in PI 260418. These markers will be very useful in the introgression of this new resistance into dry and snap bean cultivars.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Doença de planta; Uromyces appendiculatus; Molecular markers; Marcador molecular; Rust; Resistência.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/213937
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Identification of SSR markers linked to rust resistance in andean common bean PI 260418. Repositório Alice
PASTOR-CORRALES, M. A.; PEREIRA, P. A. A.; LEWERS, K.; BRONDANI, R. V.; BUSO, G. C.; FERREIRA, M. A.; MARTINS, W. S..
The objective of this study was to identify molecular markers linked to the rust resistance gene or genes present in PI 260418. These markers will be very useful in the introgression of this new resistance into dry and snap bean cultivars.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Molecular markers; Rust; Doença de Planta; Feijão; Marcador Molecular; Phaseolus Vulgaris; Resistência; Uromyces appendiculatus.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/190615
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Mapeamento genético comparativo em E. urophylla e E. grandis com marcadores RAPD e SSR. Repositório Alice
ATHAYDE, S. A. L.; BRONDANI, R. V.; GRATTAPAGLIA, D..
1998
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Caracterização biológica.
Ano: 1998 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/189185
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Microarray analysis of eucalyptus gene expression. Repositório Alice
PASQUALI, G.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; BASTOLLA, F. M.; VOM ENDT, D.; BRONDANI, R. V.; COELHO, A. S. G.; BROMMONSCHENKEL, S. H.; PEREIRA, G. A. G.; CASCARDO, J. C. M.; GRATTAPAGLIA, D..
bitstream/item/200788/1/Pasquali-XXXV-Reuniao-Anual-da-SBBq.pdf
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Eucalyptus genome; Eucalipto; Genoma.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/187590
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