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16s rDNA-metagenomic sequencing of bone lesions caused by femoral head necrosis in broilers. Repositório Alice
ZANELLA, R.; CANTAO, M. E.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; PANDOLFI, J. R. C.; COUTINHO, L. L.; RHOADS, D. D.; AL-RUBAYE, A.; WIDEMAN, R. F.; LEDUR, M. C..
2014
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Melhoramento genético animal; Galinha; Animal genetics; Chickens.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1014240
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Age effects on gene expression related to the bacterial chondronecrosis with osteomyelitis in broiler. Repositório Alice
CANTAO, M. E.; ZANELLA, R.; PEIXOTO, J. de O.; IBELLI, A. M. G.; PANDOLFI, J. R. C.; SETTLES, M.; LEDUR, M. C..
2015
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Gene expression; Proteomics; Metabolomics.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1037119
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Assessment of bacterial and archaeal community structure in swine wastewater treatment processes. Repositório Alice
SILVA, M. L. B. da; CANTAO, M. E.; MEZZARI, M. P.; MA, J.; NOSSA, C. W..
2015
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Archaeal; Bacterial; Pyrosequencing; Swine wastewater.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1033273
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Associations of the osteopontin gene with performance traits in a paternal broiler line. Repositório Alice
IBELLI, A. M. G.; FORNARI, M. B.; NEIS, K. L.; ZANELLA, R.; TESSMANN, A. L.; PANDOLFI, J. R. C.; CANTAO, M. E.; LEDUR, M. C.; PEIXOTO, J. de O..
2013
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: SNPs; Genética; Frango de corte; Genetic; Broiler chickens; Gallus gallus.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/971303
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Biological processes related to ribosome and mitochondrial functions might be involved in the osteochondrosis latens manifestation in gilts. Repositório Alice
IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; SAVOLDI, I. R.; CARMO, K. B. do; MORES, N.; MORES, M. A. Z.; CANTAO, M. E.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C..
Abstract: The articular osteochondrosis (OC) is a disturbance of endochondral ossification occurring in humans and livestock animals. In pigs, OC is one of the major causes of leg weakness, leading to economic losses and reducing the animal welfare. The aim of this study was to evaluate the differential gene expression related to OC latens in femoral articular cartilage in swine. Thus, samples of MS115 5-months-old gilts, normal (control group) and affected with OC latens (affected group), were collected and submitted to histopathological and gene expression analysis. A total of 1,734 genes was differentially expressed (DE) between the two groups. Several biological processes (BP) were enriched including those already known as involved with OC, such as...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Desenvolvimento ósseo; Características do fêmur; Osteocondrose articular; Problemas de locomoção; Locomotor problems; RNA-Seq; Melhoramento Genético Animal; Suíno; Gene; Osso; Fêmur; Animal genetic resources; Swine; Osteochondrosis; Gene expression; Lameness; Leg weakness.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1093227
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Caracterização metagenômica do microbioma intestinal de aves de corte através do sequenciamento parcial do gene 16S-rRNA. Repositório Alice
SAVOLDI, I. R; DAL PIZZOL, M. S.; CARMO, K. B. do; IBELLI, A. M. G.; KRAMER, B.; MORES, M. A. Z.; PEIXOTO, J. de O.; CANTAO, M. E.; JAENISCH, F. R. F.; AVILA, V. S. de; KRABBE, E. L.; LEDUR, M. C.; PANDOLFI, J. R. C..
2016
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: 16S rRNA; Frangos de corte; Microbioma intestinal; Alistipes; Ruminococcaceae; Lachnospiraceae.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1059132
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Comparative characterization of the archaeal community in the amazon forest: native forest and oil palm plantation by high-throughput sequencing. Repositório Alice
DOMENECH, D.; CANTAO, M. E.; COSTA, O. Y.; CARVALHO B., J.; KYAW, C. M.; KRUGER, R. H.; QUIRINO, B. F..
2014
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Floresta amazônica; Óleo de palma; Sequenciamento de alto rendimento; Mata nativa; Comunidades microbianas; Archaeae; Solo cultivado.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1014172
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Comparative study of poultry gut and litter microbiota through a metagenomic approach. Repositório Alice
PANDOLFI, J. R. C.; SILVA, V. S.; KRAMER, B.; PEIXOTO, J. de O.; CANTAO, M. E.; LOYOLA, W.; COLDEBELLA, A.; RECH, D. V.; TREVISOL, I. M.; ESTEVES, P. A.; JAENISCH, F. R. F.; KLEIN, T. A. P.; VAZ, C. S. L.; CARON, L.; SCHIOCHET, M. F.; LOPES, L. dos S.; IBELLI, A. M. G.; TESSMANN, A. L.; MORES, N.; BRENTANO, L.; SANTOS, F. B. de O.; LEDUR, M. C.; IANISKI, F.; SILVA, M. L. B. da.
2012
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Microbiologia; Produção animal; Metagenomics; Broiler chickens; Poultry production.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/953157
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Condronecrose bacteriana com osteomielite (BCO): um problema subestimado na avicultura de corte. Infoteca-e
PEIXOTO, J. de O.; IBELLI, A. M. G.; CANTAO, M. E.; LEDUR, M. C..
A Embrapa Suínos e Aves, em uma de suas linhas de pesquisa, vem desenvolvendo estudos em genômica com foco em problemas locomotores, tanto em aves como em suínos. Em aves, a variação genética normal de características de integridade óssea e os fatores genéticos associados à BCO estão sendo investigados.
Tipo: Artigo de divulgação na mídia (INFOTECA-E) Palavras-chave: Problemas locomotores; Gênomica; Frango de corte; Melhoramento genético animal; Broiler chickens; Livestock breeding; Breeding and Genetic Improvement; Animal genetics.
Ano: 2015 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1031511
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Continuous circulation of human-origin seasonal influenza A viruses in swine in Brazil. Repositório Alice
SCHAEFER, R.; GAVA, D.; HAACH, V.; CANTAO, M. E.; ZANELLA, J. R. C..
2015
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Influenza A; Swine; Human-origin; Circulation.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1033915
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Detecting levels of autozygosity in two pure lines of pigs using genomic and pedigree data. Repositório Alice
ZANELLA, R.; PEIXOTO, J. de O.; CANTAO, M. E.; CARDOSO, F. F.; FREITAS, L.; OTAVIANO, A.; CAETANO, A. R.; LEDUR, M. C..
2014
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Melhoramento genético; Avicultura; Biologia molecular.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1013818
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Draft genome sequence of Pasteurella multocida strain 11246. Repositório Alice
CANTAO, M. E.; OLIVEIRA FILHO, J. X. de; KICH, J. D.; KLEIN, C. S.; ZANELLA, R.; MORES, M. A. Z.; REBELATTO, R.; MORES, N..
2013
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Pneumonia; Suíno; Pasteurella multocida; Bacterial pneumonia.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/979713
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Estrutura populacional de uma linha paterna de frangos de corte usando análise de registros de pedigree. Repositório Alice
CARVAJAL, A. B.; MARCHESI, J. A. P.; BERNARDES, P. A.; CANTAO, M. E.; PEIXOTO, J. de O.; FIGUEIREDO, E. A. P. de; LEDUR, M. C.; MUNARI, D. P..
2016
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Endogamia; Número efetivo de fundadores; Aves; Tamanho efetivo populacional.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1058966
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Estudo de associação global do genoma revela novos genes e regiões genômicas associadas à conversão alimentar em frangos de corte. Repositório Alice
MARCHESI, J. A. P.; ONO, R. K.; IBELLI, A. M. G.; BUZANSKAS, M. E.; CANTAO, M. E.; PEIXOTO, J. de O.; MUNARI, D. P.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C..
Resumo: Nos últimos anos, diversos foram os esforços para identificar a base genética de características de eficiência alimentar em frangos, tendo como resultado a descoberta de diversas regiões gênicas que controlam estas características. No entanto, devido à natureza complexa e poligênica de características como a conversão alimentar (CA), muitas regiões de menor efeito ainda não puderam ser identificadas. Assim, o objetivo deste trabalho foi identificar novas regiões e genes candidatos associados à CA em frangos de corte. Para isso, foram utilizadas 1.433 aves provenientes da expansão de uma linha paterna genotipadas com o painel 600 K Affymetrix® Axiom® HD. A análise de associação global do genoma foi realizada utilizando o programa Qxpak 5.0 com dois...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Melhoramento genético animal; Frango de corte.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1077742
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Estudo dos segmentos de homozigose em uma população de suínos. Repositório Alice
JOAQUIM, L. B.; NASCIMENTO, G. B. do; MARCHESI, J. A. P.; SAVEGNAGO, R. P.; CANTAO, M. E.; LEDUR, M. C.; MUNARI, D. P..
Resumo: Marcadores do tipo SNP (Polimorfismo de nucleotídeo único) são úteis em estudos de estrutura da população e conservação genética, permitindo obter informações sobre a história de uma população e parentesco entre seus indivíduos. Para investigar o histórico de seleção de uma linhagem comercial materna de suínos, 300 fêmeas e 25 machos foram analisados utilizando um painel de SNPs de 60K para a detecção de segmentos de homozigose (ROH, do inglês Runs of Homozygosity) com alta frequência populacional. As regiões de ROH em mais de 30% dos animais foram investigadas para identificar possíveis regiões conservadas. Um grande número de ROHs longos (> 5Mb) foi encontrado podendo indicar recentes eventos de endogamia na população estudada. Nas regiões de...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Reprodução animal; Melhoramento genético animal; Suíno; Polimorfismo; Linhagem.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1077688
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Evolution of novel influenza a viruses os human origin in swine in Brazil. Repositório Alice
SCHAEFER, R.; NELSON, M. I.; GAVA, D.; CANTAO, M. E.; ZANELLA, J. R. C..
2015
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Novel; Influenza a viruses; Human origin; Swine.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1037086
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Expressão gênica diferencial envolvida com Condronecrose bacteriana com osteomielite em frangos de corte com 35 dias de idade. Repositório Alice
PEIXOTO, J. de O.; IBELLI, A. M. G.; CANTAO, M. E.; ZANELLA, R.; JAENISCH, F. R. F.; GIACHETTO, P. F.; SETTLES, M. L.; PANDOLFI, J. R. C.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C..
Resumo: A incidência de problemas ósseos é considerada uma das principais preocupações para a indústria avícola devido à perdas econômicas significativas e ao impacto negativo no bem-estar. As vias metabólicas e os genes envolvidos nas patologias ósseas permanecem desconhecidos. A condronecrose bacteriana com osteomielite (BCO) é uma das principais doenças ligadas a problemas locomotores em frangos. Na tentativa de esclarecer os mecanismos genéticos envolvidos na manifestação da BCO, objetivou-se identificar os genes diferencialmente expressos no fêmur de frangos de corte normais e afetados por esta desordem, por meio da tecnologia de RNA-Seq. Neste estudo foram utilizados frangos de corte comerciais machos aos 35 dias de idade sendo 4 normais e 4 com BCO...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: BCO; Differentially expressed genes; RNA-Seq; Bacterial Chondronecrosis with Osteomyelitis; Patologia óssea; Genes; Ontologia gênica; Genes.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1024034
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Expressão gênica diferencial envolvida com condronecrose bacteriana com osteomielite em frangos de corte com 35 dias de idade. Repositório Alice
PEIXOTO, J. de O.; IBELLI, A. M. G.; CANTAO, M. E.; ZANELLA, R.; JAENISCH, F. R. F.; GIACHETTO, P. F.; SETTLES, M. L.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C..
A incidência de problemas ósseos é considerada uma das principais preocupações para a indústria avícola devido a perdas econômicas significativas e ao impacto negativo no bem-estar. As vias metabólicas e os genes envolvidos nas patologias ósseas permanecem desconhecidos. A condronecrose bacteriana com osteomielite (CBO) é uma das principais doenças ligadas a problemas locomotores em frangos. Na tentativa de esclarecer os mecanismos genéticos envolvidos na manifestação da CBO, objetivou-se identificar os genes diferencialmente expressos no fêmur de frangos de corte normais e afetados por esta desordem, por meio da tecnologia de RNA-Seq. Neste estudo foram utilizados frangos de corte comerciais machos aos 35 dias de idade, sendo 4 normais e 4 com CBO...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: CBO; Genes diferencialmente expressos; GO; RNA Seq.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1033043
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Full genome sequencing of a human-like H1N2 swine influenza virus. Repositório Alice
SCHAEFER, R.; CANTAO, M. E.; ROCHA, C. S.; GAVA, D.; ZANELLA, J. R. C..
2012
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Influenza.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/953471
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Ganhos em acurácia com a utilização de informações genômicas na avaliação genética de suínos. Repositório Alice
GARCIA, D. A.; LOPES, J. S.; FARAH, M. M.; OTAVIANO, A. R.; CANTAO, M. E.; LEDUR, M. C..
Objetivou-se avaliar o impacto da inclusão de informações genômicas nos ganhos em acurácia no momento da seleção e a associação dos valores genéticos na seleção com futuras predições de alta acurácia (rEBV). As características idade para atingir 110 kg (ID110), conversão alimentar (CA) e número de leitões viáveis ao quinto dia (LV5) foram estudadas nas raças Landrace (LA) e Large White (LW). As análises foram realizadas reproduzindo um período de avaliação genética semanal em que tanto o valor genético tradicional (EBV)quanto o valor genético genômico (GEBV)dos animais genotipados estivessem disponíveis . Ganhos em acurácia e correlação entre EBV e GEBV foram avaliados. Além disso, foram mensuradas as associações entre EBVs e GEBVs com os valores genéticos...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Seleção genômica; Single step; Large White; Landrace.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1032817
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