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Acurácia da imputação de marcadores SNPs em bovinos das raças Hereford e Braford. Repositório Alice
MILANO, J. N.; CARVALHO, H. G. de; SOLLERO, B. P.; YOKOO, M. J. -I.; CARDOSO, F. F..
Devido ao alto custo que as genotipagens em larga escala apresentam para estudos na área de genômica, fazem-se necessárias estratégias que viabilizem a genotipagem de forma menos onerosa.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Predição; Marcador molecular; Método de melhoramento; Gado de corte.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1027902
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Consumindo microsserviços rest em um simulador web para bovinos de corte em sistemas pecuários de ciclo completo. Repositório Alice
MOREIRA, M. S.; CARVALHO, H. G. de; LAMPERT, V. do N..
Resumo.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Pecuária; Programa de Computador.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1099553
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Controversies about the process of technology transfer from public research institutions in Brazil: the case of the Brazilian agricultural research corporation: Embrapa. Repositório Alice
BASSI, N. S. S.; SILVA, C. DA S.; SCHNEIDER, A. H.; CARVALHO, H. G. de.
This article investigates the process of technology transfer in the Embrapa - Brazilian Agricultural Research Corporation, one of the most important center for tropical agricultural technology in the world. Our research is survey-based, and a questionnaire was applied to the employees working at strategic and operational level of a research unit of Embrapa. The results demonstrate that the technology transfer from Embrapa needs instruments, standards and standardized strategies. The lack of standardization of the can lead to disjointed actions among professionals and researchers, and may to make the Embrapa is seen in a fragmented form. Is important to explore new alternatives to treat simultaneously the issues of planning, research and development,...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Transferência de tecnologia; Modernização; Instituição de pesquisa.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1003379
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Desenvolvimento de um banco de dados com interface web como repositório de informações sobre raças taurinas do projeto Pologen. Infoteca-e
CARVALHO, H. G. de; SOLLERO, B. P.; CARDOSO, F. F..
Estrutura do repositório de dados; Inserção de dados; Funções; Alertas
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E) Palavras-chave: Processamento da informação; Bovino; Touro.
Ano: 2017 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1083995
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Easy LD Estimates for Galaxy: manual do usuário ? versão 1.0. Infoteca-e
COELHO, W. D.; CARDOSO, L. L.; CARVALHO, H. G. de; CARDOSO, F. F..
Dados de entrada e formatação dos dados; Mapa dos SNP; Arquivo de haplótipos; Como rodar o programa; Acesso ao Galaxy; Upload dos arquivos; Preenchimento do formulário e selecionar arquivos; Arquivos de saída
Tipo: Outras publicações técnicas (INFOTECA-E) Palavras-chave: Bioinformática; Plataforma web; Análise de dados; Melhoramento genético animal.
Ano: 2018 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1090173
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Genotype imputation of Hereford and Bradford bovine breeds from Brazil. Repositório Alice
MUDADU, M. de A.; CARVALHO, H. G. de; YOKOO, M. J. I.; CARDOSO, F. F..
The bovine breeding programs in Brazil are trying to adopt the use of genetic markers, a procedure called genomic selection (GS). GS consists in genotyping a given reference population with known phenotype and in the discovery of the associated genetic markers. The effect of the markers are estimated and validated so it is possible to predict the genetic values of the candidates of selection based on their genotypes.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Marcadores genéticos; Bioinformática; Genetic markers; Cattle; Bioinformatics; Genotype.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1067528
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Imputação de genótipos em bovinos: um guia passo a passo. Infoteca-e
MUDADU, M. de A.; CARVALHO, H. G. de; YOKOO, M. J. I.; CARDOSO, F. F..
O programa de melhoramento genético no Brasil está implementando o uso de marcadores genéticos, um procedimento chamado seleção genômica (SG). SG consiste em genotipar uma população de referência com fenótipos conhecidos e na descoberta de marcadores genéticos associados. O efeito dos marcadores são estimados e validados de forma a tornar possível predizer os valores genéticos dos cadidatos à seleção baseado nos seus genótipos. A genotipagem de alta densidade tem custo elevado, de forma que usa-se genotipar a população de referência usando chips de alta densidade de marcadores e genotipar com menor custo os candidatos a seleção usando chips de baixa densidade de marcadores. A imputação de genótipos é então aplicada para expandir os dados de genotipagem dos...
Tipo: Documentos (INFOTECA-E) Palavras-chave: Genotipagem em alta densidade; Imputação de genótipos; Bioinformática; Genotyping; Bioinformatics.
Ano: 2016 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1064163
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Mapeamento de genes a partir de marcadores SNPs identificados em análise de associação genômica. Repositório Alice
OLIVEIRA, K. da S. V.; SOLLERO, B. P.; CARVALHO, H. G. de; YOKOO, M.; CARDOSO, F. F..
O carrapato Rhipicephalus (Boophilus) microplus parasita bovinos e acarreta prejuízos econômicos ao setor agropecuário. Portanto, a identificação de animais geneticamente mais resistentes ao carrapato é de grande interesse, sendo possibilitada pela seleção genômica.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Bioinformática; Carrapato; Bovino.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1027636
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Otimizando o processo de uso de ferramentas desenvolvidas em R. Repositório Alice
COELHO, W. D.; CARVALHO, H. G. de; CARDOSO, F. F..
2014
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Análise de dado.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/999891
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Utilização de banco de dados para armazenamento de dados de programas de melhoramento animal. Repositório Alice
MILANO, J. N.; CARVALHO, H. G. de; YOKOO, M. J. I.; CARDOSO, F. F..
Com o grande volume de dados utilizados diariamente nas pesquisas de melhoramento genético, buscou-se uma solução para armazenar os dados dos programas de forma ágil, segura e prática.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Análise de dados; Melhoramento genético animal.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1062512
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Utilização de sistemas de gerência de banco de dados na computação científica. Repositório Alice
ABREU, E. S.; CARVALHO, H. G. de; CARDOSO, F. F..
2014
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: MySQL; Linguagem de programação.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/999226
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