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Desenvolvimento de um banco de dados com interface web como repositório de informações sobre raças taurinas do projeto Pologen. Infoteca-e
CARVALHO, H. G. de; SOLLERO, B. P.; CARDOSO, F. F..
Estrutura do repositório de dados; Inserção de dados; Funções; Alertas
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E) Palavras-chave: Processamento da informação; Bovino; Touro.
Ano: 2017 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1083995
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Easy LD Estimates for Galaxy: manual do usuário - versão 1.0. Infoteca-e
COELHO, W. D.; CARDOSO, L. L.; CARVALHO, H. G. de; CARDOSO, F. F..
Dados de entrada e formatação dos dados; Mapa dos SNP; Arquivo de haplótipos; Como rodar o programa; Acesso ao Galaxy; Upload dos arquivos; Preenchimento do formulário e selecionar arquivos; Arquivos de saída
Tipo: Outras publicações técnicas (INFOTECA-E) Palavras-chave: Bioinformática; Plataforma web; Análise de dados; Melhoramento genético animal.
Ano: 2018 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1090173
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Imputação de genótipos em bovinos: um guia passo a passo. Infoteca-e
MUDADU, M. de A.; CARVALHO, H. G. de; YOKOO, M. J. I.; CARDOSO, F. F..
O programa de melhoramento genético no Brasil está implementando o uso de marcadores genéticos, um procedimento chamado seleção genômica (SG). SG consiste em genotipar uma população de referência com fenótipos conhecidos e na descoberta de marcadores genéticos associados. O efeito dos marcadores são estimados e validados de forma a tornar possível predizer os valores genéticos dos cadidatos à seleção baseado nos seus genótipos. A genotipagem de alta densidade tem custo elevado, de forma que usa-se genotipar a população de referência usando chips de alta densidade de marcadores e genotipar com menor custo os candidatos a seleção usando chips de baixa densidade de marcadores. A imputação de genótipos é então aplicada para expandir os dados de genotipagem dos...
Tipo: Documentos (INFOTECA-E) Palavras-chave: Genotipagem em alta densidade; Imputação de genótipos; Bioinformática; Genotyping; Bioinformatics.
Ano: 2016 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1064163
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