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A genome-wide scan shows evidence for local adaptation in a widespread keystone Neotropical forest tree. Repositório Alice
COLLEVATTI, R. G.; NOVAES, E.; SILVA JUNIOR, O. B. da; VIEIRA, L. D.; LIMA-RIBEIRO, M. S.; GRATTAPAGLIA, D..
bitstream/item/199571/1/s41437-019-0188-0.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Conservation genomics; Genetic variation.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1110632
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Design and evaluation of a sequence capture systemfor genome-wide SNP genotyping in highly heterozygous plant genomes: a case studywith a keystone Neotropical hardwood tree genome. Repositório Alice
SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D.; NOVAES, E.; COLLEVATTI, R. G..
bitstream/item/185941/1/dsy023.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Target enrichment; Sequence capture; SNPs; Handroanthus.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1099287
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Development and characterization of new microsatellites for Eugenia dysenterica DC (Myrtaceae). Repositório Alice
TELLES, M. P. C.; SILVA, J. B.; RESENDE, L. V.; VIANELLO, R. P.; CHAVES, L. J.; SOARES, T. N.; COLLEVATTI, R. G..
Microsatellite markers were developed for population genetic analyses of the Neotropical tree Eugenia dysenterica DC (Myrtaceae), after construction of a shotgun genomic library for microsatellite discovery. Nine primers were designed, of which 5 yielded amplified product. These primers were polymorphic for 97 individuals collected in 3 distinct localities. The number of alleles per locus (primer) ranged from 3 to 11 and expected heterozygosities varied from 0.309 to 0.884. The probability of locus identity was ~1.88 x 10-4 and the probability of paternity exclusion was ~0.9367. The 5 microsatellite primer pairs may be suitable for population genetic studies such as parentage and fine-scale genetic analyses of this species.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Fruta tropical; Cerrado; Cagaita; Marcador molecular; Variação genética; Genetic variation; Microsatellite repeats.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/978390
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Development of microsatellite markers for the endangered neotropical tree species Tibouchina papyrus (Melastomataceae). Repositório Alice
TELLES, M. P. C.; PEIXOTO, F. P.; LIMA, J. S.; RESENDE, L. V.; VIANELLO, R. P.; WALTER, M. E. M. T.; COLLEVATTI, R. G..
We isolated and characterized 12 microsatellite loci for Tibouchina papyrus (Melastomataceae), an endangered species with narrow and disjunct range, endemics to a few localities in ?cerrado rupestre? from Central Brazil. These microsatellites were obtained by sequencing of a genomic shotgun library for primer design. Leaves from 96 individuals collected in the three known local populations were genotyped using the 12 primers designed to analyze the polymorphisms at each locus. The number of alleles per locus ranged from one to six; two loci were monomorphic. Among the polymorphic loci, expected heterozygosities ranged from 0.161 to 0.714. Combined paternity exclusion probability was 0.957 and combined genetic identity (0.051) was high for studies on...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Tibouchina papyrus; Pau-papel; Cerrado; Árvore.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/882313
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Dismantling Brazil's science threatens global biodiversity heritage. Repositório Alice
FERNANDES, G. W.; VALE, M. M.; OVERBECK, G. E.; BUSTAMANTE, M. M. C.; GRELLE, C. E. V.; BERGALLO, H. G.; MAGNUSSON, W. E.; AKAMA, A.; ALVES, S.; AMORIM, A.; ARAÚJO, J.; BARROS, C. F.; BRAVO, F.; CARIM, M. J. V.; CERQUEIRA, R.; COLLEVATTI, R. G.; COLLI, G. R.; CUNHA, C. N. da; D?ANDREA, P. S.; DIANESE, J. C.; DINIZ, S.; ESTRELA, P. C.; FERNANDES, M. R. M.; FONTANA, C. S.; GIACOMIN, L. L.; GUSMÃO, L. F. P.; JUNCÁ, F. A.; LINS-E-SILVA, A. C. B.; LOPES, C. R. A. S.; LORINI, M. L.; QUEIROZ, L. P. de; MALABARBA, L. R.; MARIMON, B. S.; MARIMON JUNIOR, B. H.; MARQUES, M. C. M.; MARTINELLI, B. M.; MARTINS, M. B.; MEDEIROS, H. F. de; MENIN, M.; MORAIS, P. B. de; MUNIZ, F. H.; NECKEL-OLIVEIRA, S.; OLIVEIRA, J. A. de; OLIVEIRA, R. P.; PEDRONI, F.; PENHA, J.; PODGAISKI, L. R.; RODRIGUES, D. J.; SCARIOT, A.; SILVEIRA, L. F.; SILVEIRA, M.; TOMAS, W. M.; VITAL, M. J. S.; PILLAR, V. D..
bitstream/item/181019/1/1-s2.0-S2530064417300809-main.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Biodiversity research network; Global environmental commitments; Political and fiscal crisisa.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1080619
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Estrutura genética e fluxo gênico em populações de pequizeiro (caryocar brasiliense Camb., Cariocaraceae) utilizando microssatélites: implicações para conservação. Repositório Alice
COLLEVATTI, R. G.; GRATTAPAGLIA, D.; HAY, J. D..
1998
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Caracterização biológica.
Ano: 1998 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/189170
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Estrutura genética espacial em população natural de Annona crassiflora Mart. (Annonaceae) do cerrado. Repositório Alice
GOUVEIA, F. O.; COLLEVATTI, R. G.; TELLES, M. P. C.; BORBA, T. C. O.; SOARES, T. N..
O objetivo desse estudo foi estimar o nível de diversidade genética e estrutura genética espacial dentro de uma população de A. crassiflora.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Diversidade genética; Araticum; Annona crassiflora; Fruta tropical; Genética; Cerrado.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/857912
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Estrutura genética espacial intrapopulacional em Annona crassiflora Mart. (Annonaceae). Repositório Alice
GOUVEIA, F. O.; COLLEVATTI, R. G.; TELLES, M. P. de C.; BORBA, T. C. de O.; SOARES, T. N..
O objetivo desse estudo foi estimar o nível de diversidade genética e a estrutura genética espacial dentro de uma população de A. crassiflora.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Araticum; Annona crassiflora; Genética.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/886064
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Genome assembly of the Pink Ipê (Handroanthus impetiginosus, Bignoniaceae), a highly valued, ecologically keystone Neotropical timber forest tree. Repositório Alice
SILVA-JUNIOR, O. B.; GRATTAPAGLIA, D.; NOVAES, E.; COLLEVATTI, R. G..
bitstream/item/181067/1/gix125.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Heterozygous genome; RNA-Seq; Quinoids; Transposable elements; Bignoniaceae.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1085131
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Objetivou-se identificar raças fisiológicas, com base em séries diferenciadoras, e linhagens, com base em marcadores microssatélites, em uma população de M. oryzae do sul do Brasil. Repositório Alice
ARAÚJO, L. G.; CARVALHO, J. C. B.; LUZINI, A. P.; COLLEVATTI, R. G.; SOUSA, K. C. I.; SILVA, C. D. S.; OLIVEIRA, R. D. S.; FILIPPI, M. C. C..
O objetivo do trabalho foi diferenciar morfologica, enzimatica e molecularmente os rizoctonioides micorrízicos dos fitopatogênicos.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Fungo.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/993221
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Transferability of microsatellite loci from Cervidae species to the endangered Brazilian marsh deer, Blastocerus dichotomus. Repositório Alice
LEITE, K. C. E.; COLLEVATTI, R. G.; MENEGASSO, T. R.; TOMAS, W. M.; DUARTE, J. M. L..
Blastocerus dichotomus, the marsh deer, is the largest Brazilian Cervidae species. The species is endangered because of hunting and loss of its natural habitat, i.e., flood plain areas, because of hydroeletric power station construction and agricultural land expansion. In the present study we tested 38 microsatellite loci from four Cervidae species: Odocoileus virginianus (7), Rangifer tarandus (17), Capreolus capreolus (7), and Mazama bororo (7). Eleven loci showed clear amplification, opening a new perspective for the generation of fundamental population genetic data dor devising conservation strategies for B. dichtomus.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Blastocerus dichotomus; Cervidae.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/812435
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Variabilidade genética em progênies de pequizeiro provenientes de oito regiões do Cerrado brasileiro. Repositório Alice
MOURA, N. F.; CHAVES, L. J.; AGUIAR, A. V. de; COLLEVATTI, R. G..
2015
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Caryocar brasiliense; Pequi; Análise molecular; Diversidade genética.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1020009
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