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Análise proteômica do estresse hídrico em cafeeiro. Repositório Alice
RAMOS, H. J. O.; CHAVES, D. F. S.; PEREIRA, L. F. P.; CRUZ, L. M.; FUNGARO, M. H.; CUNHA, M. H. da; OSAKU, C.; PETZL-ERLER, M. L.; AYUB, R. A.; PERALTA, R. M.; MARUR, C. J.; SOUZA, E. M.; VIEIRA, L. G. E.; PEDROSA, F. O..
Déficit hídrico é um dos fatores ambientais mais importantes para a diminuição da produtividade do cafeeiro, tanto no Brasil quanto em outros países produtores. O estabelecimento de estratégias para obtenção de cultivares tolerantes ao estresse hídrico depende da compreensão das respostas biológicas ao nível genético, molecular e bioquímico. Para estudar a resposta ao estresse hídrico no gênero Coffea, foi estabelecida uma rede de pesquisa em proteômica (PROTEOPAR ? Programa Proteoma do Paraná) constituída de oito laboratórios. Quatro genótipos de Coffea, com diferentes respostas fisiológicas à seca, foram analisados: C. canephora (Clone 14, tolerante e Clone 109A, sensível) e C. arabica (BA10, tolerante e Geisha, sensível). Proteínas foram extraídas de...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Coffea; Seca; Proteoma; PROTEOPAR.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/906068
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Base de dados genômica de Bacillus thuringiensis subsp. kurstaki - estirpe S76. Infoteca-e
MELO, L. H. V. de; GITAHY, P. de M.; OLIVEIRA, M. de M.; ROCHA, F. Y. O.; CRUZ, L. M.; BALDANI, J. I..
2011
Tipo: Documentos (INFOTECA-E) Palavras-chave: Estirpe; Genômica; Bioinformática; Sequenciamento genético.
Ano: 2011 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/921116
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Base genômica das estirpes que compõem o inoculante de cana-de-açúcar e milho. Infoteca-e
BALDANI, J. I.; GUEDES, H. V.; VIDAL, M. S.; SCHWAB, S.; TEIXEIRA, K. R. dos S.; CRUZ, L. M.; ARAUJO, J. L. S. de.
2011
Tipo: Documentos (INFOTECA-E) Palavras-chave: Inoculante; Genoma; Bioinformática; Sequenciamento genético.
Ano: 2011 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/950789
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Biodiversity of prokaryotes from high-elevation grassland organosols of the Parana State, Brazil. Repositório Alice
ETTO, R. M.; GALVÃO, C. W.; GALVÃO, F.; CURCIO, G. R.; RACHWAL, M. F. G.; PEDROSA, F. O.; CRUZ, L. M.; STEFFENS, M. B. R..
2009
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Procariótica; Biodiversidade; Organosolo; Paraná.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/580077
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Caracterização genômica, seleção e expressão heteróloga dos genes cry de Bacillus thuringiensis subsp. kurstaki S76 para o controle de pragas de interesse agrícola. Repositório Alice
MELO, L. H. V. DE; CRUZ, L. M.; BALDANI, J. I..
2011
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Diatraea saccharalis; Controle biológico; Expressão de genes cry.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/905433
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Direct and indirect effects of a pH gradient bring insights into the mechanisms driving prokaryotic community structures. Repositório Alice
LAMMEL, D. R.; BARTH, G.; OVASKAINEN, O.; CRUZ, L. M.; ZANATTA, J. A.; RYO, M.; SOUZA, E. M. de; PEDROSA, F. O..
Background: pH is frequently reported as the main driver for prokaryotic community structure in soils. However, pH changes are also linked to ?spillover effects? on other chemical parameters (e.g., availability of Al, Fe, Mn, Zn, and Cu) and plant growth, but these indirect effects on the microbial communities are rarely investigated. Usually, pH also co-varies with some confounding factors, such as land use, soil management (e.g., tillage and chemical inputs), plant cover, and/or edapho-climatic conditions. So, a more comprehensive analysis of the direct and indirect effects of pH brings a better understanding of the mechanisms driving prokaryotic (archaeal and bacterial) community structures. Results: We evaluated an agricultural soil pH gradient (from 4...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Sub-tropical soil; 16S rRNA; Illumina sequencing; Ecologia microbiana; Solo sub tropical; Ph; Bactéria; Química do Solo; Microbial ecology; Soil chemistry; Archaea.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1099575
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Draft genome sequence of Paraburkholderia tropica Ppe8 strain, a sugarcane endophytic diazotrophic bacterium. Repositório Alice
SILVA, P. R. A.; ARAUJO, J. L. S. de; VIDAL, M. S.; CRUZ, L. M.; SOUZA, E. M. de; BALDANI, J. I..
Paraburkholderia tropica (syn Burkholderia tropica) are nitrogen-fixing bacteria commonly found in sugarcane. The Paraburkholderia tropica strain Ppe8 is part of the sugarcane inoculant consortium that has a beneficial effect on yield. Here, we report a draft genome sequence of this strain elucidating the mechanisms involved in its interaction mainly with Poaceae. A genome size of approximately 8.75 Mb containing 7844 protein coding genes distributed in 526 subsystems was de novo assembled with ABySS and annotated by RAST. Genes related to the nitrogen fixation process, the secretion systems (I, II, III, IV, and VI), and related to a variety of metabolic traits, such as metabolism of carbohydrates, amino acids, vitamins, and proteins, were detected,...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Diazotrophic; Next generation sequencing; Nitrogen fixing; Secretion system.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1079611
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Genome of Herbaspirillum seropedicae Strain SmR1, a Specialized Diazotrophic Endophyte of Tropical Grasses. Repositório Alice
PEDROSA, F. O.; MONTEIRO, R. A.; WASSEM, R.; CRUZ, L. M.; AYUB, R. A.; COLAUTO, N. B.; FERNANDEZ, M. A.; FUNGARO, M. H. P.; GRISARD, E. C.; HUNGRIA, M.; MADEIRA, H. M. F.; NODARI, R. O.; OSAKU, C. A.; PETZL-ELER, M. L.; TERENZI, H.; VIEIRA, L. G. E.; STEFFENS, M. B. R.; WEISS, V. A.; PEREIRA, L. F. P.; ALMEIDA, M. I. M.; ALVES, L. R.; MARIN, A.; ARAUJO, L. M.; BALSANELLI, E.; BAURA, V. A.; CHUBATSU, L. S.; FAORO, H.; FAVETTI, A.; FRIEDERMANN, G.; GLIENKE, C.; KARP, S.; KAVA-CORDEIRO, V.; RAITTZ, R. T.; RAMOS, H. J. O.; RIBEIRO, E. M. S. F.; RIGO, L. U.; ROCHA, S. N.; SCHWAB, S.; SILVA, A. G.; SOUZA, E. M.; TADRA-SFEIR, M. Z.; TORRES, R. A.; DABUL, A. N. G.; SOARES, M. A. M.; GASQUES, L. S.; GIMENES, C. C. T.; VALLE, J. S.; CIFERRI, R. R.; CORREA, L. C.; MURACE, N. K.; PAMPHILE, J. A.; PATUSSI, E. V.; PRIOLI, A. J.; PRIOLI, S. M. A.; ROCHA, C. L. M. S. C.; ARANTES, O. M. N.; FURLANETO, M. C.; GODOY, L. P.; OLIVEIRA, C. E. C.; SATORI, D.; VILAS-BOAS, L. A.; WATANABE, M. A. E.; DAMBROS, B. P.; GUERRA, M. P.; MATHIONI, S. M.; SANTOS, K. L.; STEINDEL, M.; VERNAL, J.; BARCELLOS, F. G.; CAMPO, R. J.; CHUEIRE, L. M. O.; NICOLÁS, M. F.; PEREIRA-FERRARI, L.; SILVA, J. L. da C.; GIOPPO, N. M. R.; MARGARIDO, V. P.; MENCK-SOARES, M. A.; PINTO, F. G. S.; SIMÃO, R. de C. G.; TAKAHASHI, E. K.; YATES, M. G.; SOUZA, E. M..
The molecular mechanisms of plant recognition, colonization, and nutrient exchange between diazotrophic endophytes and plants are scarcely known. Herbaspirillum seropedicae is an endophytic bacterium capable of colonizing intercellular spaces of grasses such as rice and sugar cane. The genome of H. seropedicae strain SmR1 was sequenced and annotated by The Parana´ State Genome Programme?GENOPAR. The genome is composed of a circular chromosome of 5,513,887 bp and contains a total of 4,804 genes. The genome sequence revealed that H. seropedicae is a highly versatile microorganism with capacity to metabolize a wide range of carbon and nitrogen sources and with possession of four distinct terminal oxidases. The genome contains a multitude of protein secretion...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Plant recognition; Colonization; Nutrient; Herbaspirillum seropedicae.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/902450
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Genome of Herbaspirillum seropedicae Strain SmR1, a specialized diazotrophic endophyte of tropical grasses. Repositório Alice
PEDROSA, F. O.; MONTEIRO, R. A.; WASSEM, R.; CRUZ, L. M.; AYUB, R. A.; COLAUTO, N. B.; FERNANDEZ, M. A.; FUNGARO, M. H. P.; GRISARD, E. C.; HUNGRIA, M.; MADEIRA, H. M. F.; NODARI, R. O.; OSAKU, C. A.; PETZL-ERLER, M. L.; TERENZI, H.; VIEIRA, L. G. E.; STEFFENS, M. B. R.; WEISS, V. A.; PEREIRA, L. F. P.; ALMEIDA, M. I. M.; ALVES, L. R.; MARIN, A.; ARAUJO, L. M.; BALSANELLI, E.; BAURA, V. A.; CHUBATSU, L. S.; FAORO, H.; FAVETTI, A.; FRIEDERMANN, G.; GLIENKE, C.; KARP, S.; KAVA-CORDEIRO, V.; RAITTZ, R. T.; RAMOS, H. J. O.; RIBEIRO, E. M. S. F.; RIGO, L. U.; ROCHA, S. N.; SCHWAB, S.; SILVA, A. G.; SOUZA, E. M.; MICHELLE Z. TADRA-SFEIR; TORRES, R. A.; DABUL, A. N. G.; SOARES, M. A. M.; GASQUES, L. S.; GIMENES, C. C. T.; VALLE, J. S.; CIFERRI, R. R.; CORREA, L. C.; MURACE, N. K.; PAMPHILE, J. A.; PATUSSI, E. V.; PRIOLI, A. J.; PRIOLI, S. M. A.; ROCHA, C. L. M. S. C.; ARANTES, O. M. N.; FURLANETO, M. C.; GODOY, L. P.; OLIVEIRA, C. E. C.; SATORI, D.; VILAS-BOAS, L. A.; WATANABE, M. A. E.; DAMBROS, B. P.; GUERRA, M. P.; MATHIONI, S. M.; SANTOS, K. L.; STEINDEL, M.; VERNAL, J.; BARCELLOS, F. G.; CAMPO, R. J.; CHUEIRE, L. M. O.; NICOLÁS, M. F.; PEREIRA-FERRARI, L.; SILVA, J. L. da C.; GIOPPO, N. M. R.; MARGARIDO, V. P.; MENCK-SOARES, M. A.; PINTO, F. G. S.; SIMÃO, R. de C. G.; TAKAHASHI, E. K.; YATES, M. G.; SOUZA, E. M..
The molecular mechanisms of plant recognition, colonization, and nutrient exchange between diazotrophic endophytes and plants are scarcely known. Herbaspirillum seropedicae is an endophytic bacterium capable of colonizing intercellular spaces of grasses such as rice and sugar cane. The genome of H. seropedicae strain SmR1 was sequenced and annotated by The Paraná State Genome Programme?GENOPAR. The genome is composed of a circular chromosome of 5,513,887 bp and contains a total of 4,804 genes. The genome sequence revealed that H. seropedicae is a highly versatile microorganism with capacity to metabolize a wide range of carbon and nitrogen sources and with possession of four distinct terminal oxidases. The genome contains a multitude of protein secretion...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Genoma; Fixacao nitrogenio; Graminea tropical; Genome; Herbaspirillum seropedicae; Nitrogen fixation; Grasses.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/897676
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Promoção do crescimento de milho por novas estirpes de bactérias associativas: resultados de ensaios em rede conduzidos pelo instituto nacional de ciência e tecnologia da Fixação Biológica do Nitrogênio (INCT-FBN). Repositório Alice
OLIVEIRA, A. L. M. de; GUIMARÃES, V. F.; GALVÃO, C. W.; FERREIRA, E. P. de B.; MARTIN DIDONET, C. C. G.; CRUZ, L. M.; SANTOS, O. J. A. P. dos; DARTORA, J.; ETTO, R. M.; PEDROSA, F. de O..
Foi implementada uma rede de ensaios pelo Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia da Fixação Biológica do Nitrogênio (INCT-FBN) para a validação de novas estirpes de bactérias associativas com capacidade de promover o crescimento vegetal. A rede de ensaios formada abrange cinco estações experimentais, sendo quatro localizadas no Estado do Paraná e uma em Goiás.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Milho; Fixação de nitrogênio; Estirpe.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1047238
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