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An object-oriented framework for virtual diagnosis. Repositório Alice
MASSRUHÁ, S. M. F. S.; DUTRA, J. P.; CRUZ, S. A. B.; SANDRI, S.; WAINER, J.; MORANDI, M. A. B..
2007
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Text mining; Knowledge discovery; Corn diseases; Predictions.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/15856
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PDB-Metrics: a web tool for exploring the PDB contents. Repositório Alice
FILETO, R.; KUSER, P. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; RIBEIRO, A. A.; QUINALIA, T. G.; FRANCO, E. H.; MANCINI, A. L.; HIGA, R. H.; OLIVEIRA, S. R. M.; SANTOS, E. H.; VIEIRA, F. D.; MAZONI, I.; CRUZ, S. A. B.; NESHICH, G..
Abstract. PDB-Metrics (http://sms.cbi.cnptia.embrapa.br/SMS/pdb_metrics/index.html) is a component of the Diamond STING suite of programs for the analysis of protein sequence, structure and function. It summarizes the characteristics of the collection of protein structure descriptions deposited in the Protein Data Bank (PDB) and provides a Web interface to search and browse the PDB, using a variety of alternative criteria. PDB-Metrics is a powerful tool for bioinformaticians to examine the data span in the PDB from several perspectives. Although other Web sites offer some similar resources to explore the PDB contents, PDB-Metrics is among those with the most complete set of such facilities, integrated into a single Web site. This program has been developed...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Bioinformática; Banco de dados de proteína; PDB data distribution statistics; Protein Data Bank; Bioinformatics; Proteins.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/8264
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Tecnologias da informação aplicadas aos dados geoespaciais. Repositório Alice
ESQUERDO, J. C. D. M.; CRUZ, S. A. B.; MACÁRIO, C. G. do N.; ANTUNES, J. F. G.; SILVA, J. dos S. V. da; COUTINHO, A. C..
Este capítulo trata das Tecnologias da Informação aplicadas aos dados geoespaciais, com o objetivo de definir alguns dos principais conceitos abordados nesse tema e apresentar aspectos gerais das tecnologias envolvidas. São apresentados, também, exemplos de iniciativas da Embrapa Informática Agropecuária no desenvolvimento de soluções voltadas à organização, ao compartilhamento e ao tratamento das informações geográficas produzidas pela empresa em seus projetos de pesquisa e de serviços.
Tipo: Capítulo em livro científico (ALICE) Palavras-chave: Dados geoespaciais; Geotecnologias; Geotechnology; Tecnologia da informação; Spatial data; Information technology.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1010731
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The Star STING server: a multiplatform environment for protein structure analysis. Repositório Alice
NESHICH, G.; MAZONI, I.; OLIVEIRA, S. R. M.; YAMAGISHI, M. E. B.; KUSER-FALCÃO, P. R.; BORRO, L. C.; MORITA, D. U.; SOUZA, K. R. R.; ALMEIDA, G. V.; RODRIGUES, D. N.; JARDINE, J. G.; TOGAWA, R. C.; MANCINI, A. L.; HIGA, R. H.; CRUZ, S. A. B.; VIEIRA, F. D.; SANTOS, E. H.; MELO, R. C.; SANTORO, M. M..
ABSTRACT. Star STING is the latest version of the STING suite of programs and corresponding database. We report on five important aspects of this package that have acquired some new characteristics, designed to add key advantages to the whole suite: 1) availability for most popular platforms and browsers, 2) introduction of the STING_DB quality assessment, 3) improvement in algorithms for calculation of three STING parameters, 4) introduction of five new STING modules, and 5) expansion of the existing modules. Star STING is freely accessible at: http://sms.cbi.cnptia.embrapa.br/SMS/, http://trantor.bioc.columbia.edu/SMS, http://www.es.embnet.org/SMS/, http://gibk26.bse.kyutech.ac.jp/SMS/ and http://www.ar.embnet.org/SMS.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Bioinformática; Estrutura de proteina; Protein structure analysis; Sting; Per-residue structure descriptors; Topology similarity; Structure summaries; Bioinformatics; Protein structure.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/9170
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Uma solução flexível para a etapa de pré-processamento em mineração de textos. Repositório Alice
YAMADA, A. K.; MOURA, M. F.; CRUZ, S. A. B.; HIGA, R. H..
A mineração de textos é uma área de PD&I cujo objetivo é a busca por padrões, tendências e regularidades em documentos textuais. O primeiro e mais importante passo do processo de mineração de textos compreende um conjunto de procedimentos para leitura da coleção de documentos, identificação e a seleção dos atributos estatisticamente mais significantes para representar a coleção por meio de uma matriz atributo-valor. O objetivo deste trabalho é apresentar uma solução flexível e expansível para a tarefa de pré-processamento em mineração de textos, capaz de atender às necessidades de diferentes projetos de pesquisa envolvendo esta temática.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Mineração de textos; Pré-processamento de textos; Text mining.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/933203
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