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A comparison of abundance estimators for small mammal populations Rev. Bras. Zool.
Pacheco,Marcelle; Kajin,Maja; Gentile,Rosana; Zangrandi,Priscilla L.; Vieira,Marcus V.; Cerqueira,Rui.
A major difficulty in the application of probabilistic models to estimations of mammal abundance is obtaining a data set that meets all of the assumptions of the model. In this paper, we evaluated the concordance correlation among three population size estimators, the minimum number alive (MNA), jackknife and the model suggested by the selection algorithm in CAPTURE (the best-fit model), using long-term data on three Brazilian small mammal species obtained from three different studies. The concordance correlation coefficients between the abundance estimates indicated that the probabilistic and enumeration estimators were highly correlated, giving concordant population estimates, except for one species in one of the studies. The results indicate the...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Atlantic Rainforest; Capture-mark-recapture; Didelphimorphia; MNA; Rodentia.
Ano: 2013 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1984-46702013000200008
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Abrawayaomys ruschii Cunha & Cruz, 1979 (Rodentia, Cricetidae) no Estado do Rio de Janeiro, Brasil Pap. Avulsos de Zool. (São Paulo)
Pereira,Luciana Guedes; Geise,Lena; Cunha,André Almeida; Cerqueira,Rui.
Abrawayaomys ruschii é considerada como espécie rara devido à escassez de amostras em coleções científicas e em listas de faunas publicadas, dificultando qualquer proposta de classificação supragenérica entre os Sigmodontinae. Aqui apresentamos um novo registro de A. ruschii, sendo o primeiro para o estado do Rio de Janeiro (Aldeia Sapucai - Terra Indígena do Bracuí, Angra dos Reis). Por causa do pequeno número de exemplares existente não é possível definir uma distribuição geográfica precisa, entretanto, todas as localidades conhecidas estão em diferentes ecorregiões da Mata Atlântica. O espécime aqui reportado foi capturado em clareira com bambús na borda de uma floresta contínua aparentemente madura. O cariótipo de A. ruschii revelou um número diplóide...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Abrawayaomys; Espécie rara; Novo registro; Morfologia e cariótipo.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0031-10492008000500001
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Classes de desenvolvimento em marsupiais: um método para animais vivos Mastozool. neotrop.
Macedo,Joana; Loretto,Diogo; Vieira,Marcus Vinícius; Cerqueira,Rui.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Age classes; Atlantic Fores; Dentition; Development classes; Marsupial.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0327-93832006000100011
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Comparing a single observation with a larger sample through Levene's test Genet. Mol. Biol.
Cerqueira,Rui.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Ano: 1998 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47571998000200012
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Comparing the effectiveness of tracking methods for medium to large-sized mammals of Pantanal Rev. Bras. Zool.
Olifiers,Natalie; Loretto,Diogo; Rademaker,Vitor; Cerqueira,Rui.
Most Neotropical mammals are not easily observed in their habitats, and few studies have been conducted to compare the performance of methods designed to register their tracks. We compared the effectiveness of track registry between sand plots and two tracking methods that use artificial materials to record tracks: the sooted paper, and the plastic board methods. The latter is described here for the first time. From 2002 to 2005, we conducted two experiments in three study sites in the Pantanal region of Brazil. We compared the artificial methods with the sand plot by registering track presence/absence, the number of identifiable tracks, and the total number of tracks (identifiable and unrecognizable) in each tracking plot. Individuals avoided artificial...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Mammals; Pantanal; Plastic board; Scent-station; Track-plates.
Ano: 2011 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1984-46702011000200008
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Determinantes da distribuição geográfica de Callithrix flaviceps (Thomas) (Primates, Callitrichidae) Zoologia
Grelle,Carlos E. V.; Cerqueira,Rui.
O clima e a vegetação são conhecidos determinantes das distribuições geográficas de várias espécies de mamíferos. Neste estudo foi testada a importância do clima e da vegetação como fatores limitantes da distribuição geográfica do sagui Callithrix flaviceps (Thomas, 1903). As análises com o clima foram feitas a partir de nove fatores climáticos, estimados para cada localidade de ocorrência da espécie em estudo. Métodos não lineares (regressão logística) foram usados para modelar a distribuição geográfica a partir dos dados climáticos. As análises de vegetação foram feitas a partir do mapa digital das eco-regiões. A sobreposição dos modelos de distribuição climática com os mapas dos tipos de eco-regiões sugeriram que estes dois fatores são limitantes na...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Biogeografia; Clima; Eco-região; Mata Atlântica; Regressão logística.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0101-81752006000200016
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Determinants of geographical distribution in Atlantic Forest species of Drymophila (Aves: Thamnophilidae) Rev. Bras. Zool.
Rajão,Henrique; Cerqueira,Rui; Lorini,Maria Lucia.
Climate, altitude and vegetation are usually considered as limiting factors in plant and animal distribution. Among vertebrates, climate and vegetation have consistently been considered as major determinants of geographical distributions. Here we analyzed the role of climate and the vegetation in limiting the geographical range of Atlantic Forest species of Drymophila Swainson, 1824 and assessed the performance of discriminant analysis to model the distribution of sympatric taxa. From each empirical point (locality) we recorded the values for nine climatic variables and the type of vegetation. The climatic data were obtained from a climate database elaborated by the Laboratório de Vertebrados and vegetation data from the ecoregions digital map of Latin...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Biogeography; Climate; Potential distribution; Sympatric species; Vegetation.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1984-46702010000100004
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Diet variation of the marsupials Didelphys aurita and Philander frenatus (Didelphimorphia, Didelphidae) in a rural area of Rio de Janeiro state, Brazil Mastozool. neotrop.
Ceotto,Paula; Finotti,Ricardo; Santori,Ricardo; Cerqueira,Rui.
We studied the natural diet of two didelphid marsupial species, Didelphis aurita and Philander frenatus, at a rural area on southeastern Brazil, through fecal sample analysis. Data analysis included intraspecific comparisons (age, gender, and climatic seasons) and interespecific comparisons. Frequencies of food items were compared with other studies to analyze diet differences in a spatial scale. Invertebrates were the most frequent food category found in samples of both species, followed by fruits and vertebrates. There were no differences in the consumption of invertebrates, vertebrates and fruits between sexes in the two species, but both consumed more fruits in more humid months. Juveniles of P. frenatus consumed less vertebrates than adults or...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Didelphimorphia; Food habits; Mammal ecology; Neotropics.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0327-93832009000100005
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Distribuição altitudinal e simpatria das aves do gênero Drymophila Swainson (Passeriformes, Thamnophilidae) na Mata Atlântica Zoologia
Rajão,Henrique; Cerqueira,Rui.
Foram descritas e analisadas as distribuições altitudinais das seis espécies de Drymophila Swainson, 1824, endêmicas da Mata Atlântica e identificados e discutidos os casos de simpatria. Para isso, foram usados dois conjuntos de dados, um em escala local (a Serra dos Órgãos, um segmento da Serra do Mar no Estado do Rio de Janeiro) e outro em escala regional (Mata Atlântica). Os registros e as altitudes na Serra dos Órgãos foram obtidos diretamente no campo enquanto que os dados da Mata Atlântica foram obtidos principalmente a partir de exemplares depositados em museus de história natural. Os dois conjuntos de dados mostraram um padrão similar de distribuição altitudinal das espécies: D. squamata (Lichtenstein, 1823) e D. ferruginea (Temminck, 1822) nas...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Bambu; Biogeografia; Espécies endêmicas; Serra do Mar; Serra da Mantiqueira.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0101-81752006000300002
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Ecology of small mammals in a Brazilian rural area Zoologia
D'Andrea,Paulo Sergio; Gentile,Rosana; Cerqueira,Rui; Grelle,Carlos Eduardo V; Horta,Claudia; Rey,Luis.
A small mammal study was carried out in Pamparrão valley, Sumidouro, State of Rio de Janeiro, Brazil, from June 1991 to July 1996. The area was characterised by small rural properties with vegetable plantations, pasture lands and small forest fragments. Small mammals were captured in seven line transects along the valley. Eleven small mammal species were captured: the didelphid marsupials Didelphis aurita, Philander frenata and Monodelphis americana, and the rodents Nectomys squamipes, Akodon cursor, Oligoryzomys nigripes, Bolomys lasiurus, Oecomys concolor (Sigmodontinae), Rattus ratlus (Murinae), Proechimys iheringi and Euryzygo-matomys guiara (Echimyidae). The heterogeneous habitat configuration probably allowed the occurrence of marsupials and more...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Marsupials; Rodents; Cultivated areas; Brazil.
Ano: 1999 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0101-81751999000300002
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Estimating the relative abundance of small mammals when there is no record of catching effort Rev. Bras. Zool.
Cerqueira,Rui; Kajin,Maja.
ABSTRACT Estimates of local population abundances, which require carefully designed sampling procedures, can provide valuable information on population size and density. Even though small mammals are one of the most widely studied vertebrate groups, many surveys have not recorded basic information to estimate local abundances, for instance catching effort. Here we suggest a simple comparative trapping frequency index that can be used as an alternative to the relative abundance index in data sets that only contain the number of species and individuals collected, thus lacking information on sampling effort. To compare trapping frequency and relative abundances we used capture records from more than four years, from seven species of rodents and two marsupial...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/other Palavras-chave: Mammal collections; Population index; Removal; Trapping.
Ano: 2015 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1984-46702015000400325
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Indices of movement behaviour: conceptual background, effects of scale and location errors Rev. Bras. Zool.
Almeida,Paulo J. A. L.; Vieira,Marcus V.; Kajin,Maja; Forero-Medina,German; Cerqueira,Rui.
A fundamental step in the emerging Movement Theory is the description of movement paths, and the identification of its proximate and ultimate drivers. The most common characteristic used to describe and analyze movement paths is its tortuosity, and a variety of tortuosity indices have been proposed in different theoretical or empirical contexts. Here we review conceptual differences between five movement indices and their bias due to locations errors, sample sizes and scale-dependency: Intensity of Habitat use (IU), Fractal D, MSD (Mean Squared Distance), Straightness (ST), and Sinuosity (SI). Intensity of Habitat use and ST are straightforward to compute, but ST is actually an unbiased estimator of oriented search and ballistic movements. Fractal D is...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Diffusion; Fractal dimension; Oriented search; Random walk; Search behaviour.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1984-46702010000500002
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Nine-year demography of the black-eared opossum Didelphis aurita (Didelphimorphia: Didelphidae) using life tables Zoologia
Kajin,Maja; Cerqueira,Rui; Vieira,Marcus V.; Gentile,Rosana.
A population of the black-eared opossum, Didelphis aurita Wied-Neuwied 1826, was studied during 1997-2006 by capture-mark-recapture in the Atlantic Forest in the state of Rio de Janeiro. Cohorts were established with females marked still in the pouch, classified into five age classes. Population parameters were estimated using life tables. Survival was type III and mortality was greatest in age classes I and II, just after weaning. Fecundity was inversely correlated with survival, reproductive value was inversely correlated with mortality and residual reproductive value was inversely correlated with fecundity. The intrinsic rate of increase was always close to zero and tended to be slightly negative. The black-eared opossum can be considered a good model...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Atlantic forest; Cohort; Intrinsic factors; Small mammals; Survival.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0101-81752008000200007
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Population structure and genetic variability of mainland and insular populations of the Neotropical water rat, Nectomys squamipes (Rodentia, Sigmodontinae) Genet. Mol. Biol.
Almeida,Francisca C.; Maroja,Luana S.; Moreira,Miguel A.M.; Seuánez,Héctor N.; Cerqueira,Rui.
Seven microsatellite loci were used to investigate the genetic variability and structure of six mainland and two island populations of the Neotropical water rat Nectomys squamipes, a South American semi-aquatic rodent species with a wide distribution. High levels of variability were found within mainland populations while island populations were less variable but the more differentiated in respect to allele number and frequency. The time of biological divergence between mainland and island populations coincided with geological data. A significant geographic structure was found in mainland populations (theta = 0.099; rho = 0.086) although the degree of differentiation was relatively low in respect to the distance between surveyed localities (24 to 740 km)....
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Microsatellites; Population genetics; Islands; Population expansion; Population size; Divergence time.
Ano: 2005 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572005000500008
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RAPD analysis of Nectomys squamipes (Rodentia, Sigmodontinae) populations Genet. Mol. Biol.
Almeida,Francisca C.; Moreira,Miguel A.M.; Bonvicino,Cibele R.; Cerqueira,Rui.
Random amplified of polymorphic DNA (RAPD) analysis was used to assess genetic distance and the genetic structure of populations of Nectomys squamipes, a semiaquatic rodent species distributed along watercourses. DNA samples of five populations were analyzed using three primers, producing 45 scorable bands, 31 of which were polymorphic. There was a significant differentiation among populations [F ST = 0.17; phiST = 0.14 (P < 0.004)] but gene flow (Nm = 1.25) was sufficient to overcome genetic drift effects. No fixed specific markers were found for any population. The Mantel's test and UPGMA cluster analysis showed a lack of relationship between genetic and geographic distances. The apparent homogeneity indicated by RAPD markers coincided with...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Ano: 2000 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572000000400014
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Variação na estrutura diamétrica, composição florística e características sucessionais de fragmentos florestais da bacia do rio Guapiaçu (Guapimirim/Cachoeiras de Macacu, RJ, Brasil) Acta Botanica
Finotti,Ricardo; Kurtz,Bruno Coutinho; Cerqueira,Rui; Garay,Irene.
O presente trabalho compara a composição e estrutura de assembléias vegetais de fragmentos florestais, com diferentes características em relação ao tipo de propriedades rurais do entorno, tamanho e histórico de uso, com uma área localizada dentro de uma unidade de conservação (área controle), na bacia do rio Guapiaçu. Em cada fragmento foram delimitadas duas parcelas de 50 x 100m, na mesma orientação sudoeste, no interior das quais foram medidos os DAP (Diâmetro Acima do Peito) e altura de todos indivíduos com DAP ≥ 5 cm e identificados até o menor nível taxonômico possível. A densidade, área basal total, riqueza e diversidade foram calculados. As assembléias foram comparadas quanto aos seus valores diâmétricos e proporção de indivíduos em classes de...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Fragmentos florestais; Estágio sucessionais; Classes de diâmetro; Distúrbios; Fitossociologia.
Ano: 2012 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-33062012000200022
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