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Alexandrium minutum growth controlled by phosphorus An applied model ArchiMer
Chapelle, Annie; Labry, Claire; Sourisseau, Marc; Lebreton, Carole; Youenou, Agnes; Crassous, Marie-pierre.
Toxic algae are a worldwide problem threatening aquaculture public health and tourism Alexandrium a toxic dinoflagellate proliferates in Northwest France estuaries (i e the Penze estuary) causing Paralytic Shellfish Poisoning events Vegetative growth and in particular the role of nutrient uptake and growth rate are crucial parameters to understand toxic blooms With the goal of modelling in situ Alexandrium blooms related to environmental parameters we first try to calibrate a zero-dimensional box model of Alexandrium growth This work focuses on phosphorus nutrition Our objective is to calibrate Alexandrium minutum as well as Heterocapsa triquetra (a non-toxic dinoflagellate) growth under different rates of phosphorus supply other factors being optimal and...
Tipo: Text Palavras-chave: Toxic algal blooms; Alexandrium; Phosphorus uptake; Models; Competition; Northwest France.
Ano: 2010 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00018/12901/9905.pdf
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Analysis of hydrobiological pattern in the Bizerte lagoon (Tunisia) ArchiMer
Bejaoui, B; Harzallah, A; Moussa, M; Chapelle, Annie; Solidoro, C.
This study deals with the use of a multivariate analysis method in order to understand the functioning of the Bizerte lagoon ecosystem. A set of hydrobiological parameters was collected during 10 monthly campaigns in 2004. A variant of the EOF (Empirical Orthogonal Function) technique is used to examine hydrobiological variability modes in this lagoon. The permanent features characterising the lagoon are obtained by applying the EOF technique to data after removing the annual cycle. Two major modes were obtained. The first one shows a contrast between the northern sector of the lagoon, influenced by the Mediterranean Sea, and the southern one influenced by continental waters. This mode is mostly prominent for temperature and salinity. The second mode shows...
Tipo: Text Palavras-chave: Nutrient cycles; EOF analysis; Bizerte lagoon.
Ano: 2008 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2008/publication-4808.pdf
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Competition for phosphorus between two dinoflagellates: A toxic Alexandrium minutum and a non-toxic Heterocapsa triquetra ArchiMer
Labry, Claire; Erard-le Denn, Evelyne; Chapelle, Annie; Fauchot, Juliette; Youenou, Agnes; Crassous, Marie-pierre; Le Grand, Jacqueline; Lorgeoux, Benedicte.
The understanding of the dominance of one species with respect to others is a pertinent challenge in HAB growth dynamics studies and the nutrient supply mode is one of the factors potentially involved. The competition for phosphorus (P) between a toxic species, Alexandrium minutum, and a non-toxic species, Heterocapsa triquetra, was studied (1) along a gradient of P depletion, (2) testing different P depletion degrees before a single PO4 supply and (3) experimenting different PO4 supply frequencies. In conditions Of PO4 depletion, H. triquetra stopped growing after two days both in monospecific and mixed batch cultures whereas A. minutum grew progressively from day 2 until the end of the experiment. This time-lag growth of A. minutum is associated to its...
Tipo: Text Palavras-chave: Semi continuous culture; Batch culture; Ecophysiology; Pulse; Phosphorus storage; Dinoflagellates; Heterocapsa triquetra; Alexandrium minutum.
Ano: 2008 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2008/publication-4067.pdf
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Comprendre, Prédire et Agir sur les efflorescences toxiques. Jusqu'où peut-on aller aujourd'hui dans le cas d'Alexandrium minutum en Penzé ? ArchiMer
Chapelle, Annie; Andrieux, Francoise; Fauchot, Juliette; Guillaud, Jean-francois; Labry, Claire; Sourisseau, Marc; Verney, Romaric.
Tipo: Text
Ano: 2007 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00105/21651/19232.pdf
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Contribution of climate variability to occurrences of anoxic crises 'malaigues' in the Thau lagoon (southern France) ArchiMer
Harzallah, Ali; Chapelle, Annie.
The Thau lagoon, located in southern France, suffers episodically in summer from anoxic crises known as 'malaigues'. Such crises mostly occur under warm conditions and low winds. In this paper we investigated effects of local weather conditions (air temperature, wind speed and precipitation over southern France), and two climate oscillations (the North Atlantic Oscillation and the El Ni (n) over tildeo Oscillation) on malaigue occurrences based on 33-year data series and dates when malaigues appeared. The study shows that the probability of occurrence of malaigues increases with increasing temperature and decreasing winds in August both mostly associated to the high phase of an index of North Atlantic Oscillation. Malaigues are found to be frequently...
Tipo: Text Palavras-chave: Lagoon; Thau; Malaigues; Anoxic crises; Climate variability; Lagune; Thau; Malaïgue; Eutrophisation; Variabilité climatique.
Ano: 2002 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2002/publication-517.pdf
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DYNAPSE - DYNamiques des efflorescences et de la toxicité des espèces phytoplanctoniques nuisibles du genre PSEudo nitzschia en région Loire Bretagne ArchiMer
Belin, Catherine; Chapelle, Annie; Delmas, Daniel; Nezan, Elisabeth; Siano, Raffaele.
Les efflorescences de la diatomée Pseudo-nitzschia sont largement répandues sur les côtes Manche-Atlantique depuis une trentaine d’années (source Rephy). Depuis les années 2000 elles y sont parfois associées des événements toxiques du type ASP (Amnesic Shellfish Poisonning) qui perturbent grandement les pêcheries de coquillages et notamment celles de coquilles Saint Jacques. Les efflorescences et toxicités liées aux Pseudo-nitzschia sont des phénomènes en augmentation sur les côtes françaises mais aussi mondialement. Le genre Pseudo-nitzschia comprend plusieurs espèces très difficiles à identifier en routine or certaines sont toxiques et d’autres pas. Les facteurs environnementaux abiotiques et biotiques contrôlent à la fois la croissance des microalgues...
Tipo: Text Palavras-chave: Algues toxiques; Pseudo nitzschia; Toxicité des coquillages; Pêcheries; Facteurs environnementaux.
Ano: 2013 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00189/30035/28521.pdf
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Effet des changements environnementaux sur les communautés phytoplanctoniques et évaluation des risques d’efflorescences d’algues toxiques (PhytoRisk) ArchiMer
Guallar Morillo, Carlos; Chapelle, Annie; Bacher, Cedric.
En résumé, ce rapport présente les éléments suivants : 1. Identification et inventaire des données environnementales disponibles en relation avec l‟espèce A. minutum et Pseudo-nitzschia sur les côtes bretonnes et atlantiques françaises. 2. Description de la méthodologie développée pour l‟étude de la phénologie des efflorescences et la niche écologique des espèces cibles. 3. Présentation des résultats obtenus sur l‟étude de la phénologie d‟A. minutum. 4. Présentation des résultats obtenus sur l‟étude de la niche écologique d‟A. minutum et Pseudo-nitzschia. 5. Tableau de bord récapitulant les facteurs explicatifs, leur évolution et les risques associés en termes d‟efflorescences des espèces ciblées.
Tipo: Text
Ano: 2015 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00315/42640/42019.pdf
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Effet des changements environnementaux sur les communautés phytoplanctoniques et évaluation des risques d’efflorescences d’algues toxiques (PhytoRisk). Livrable : Données environnementales utilisées et modèles de la phénologie des espèces de phytoplancton ArchiMer
Guallar Morillo, Carlos; Chapelle, Annie; Bacher, Cedric.
Ce rapport d'étape présente les éléments suivants : 1. Identification et inventaire des données environnementales disponibles en relation avec l’espèce A. minutum sur les côtes bretonnes et atlantiques françaises. 2. Description de la méthodologie développée pour l’étude de la phénologie des efflorescences d’A. minutum. 3. Présentation des premiers résultats obtenus sur l’étude de la phénologie.
Tipo: Text
Ano: 2015 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00278/38878/37417.pdf
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Etude écophysiologique et paramétrisation du rôle du phosphore sur la croissance d'Alexandrium minutum, espèce responsable d'eaux colorées toxiques en estuaire de Penzé, et de son principal compétiteur Heterocapsa triquetra - Rapport final PNEC-ART3 ArchiMer
Labry, Claire; Erard-le Denn, Evelyne; Chapelle, Annie; Youenou, Agnes; Crassous, Marie Pierre; Martin-jezequel, Véronique; Le Grand, Jacqueline.
Suite à un premier criblage des facteurs environnementaux favorables à la croissance d'Alexandrium minutum comparativement à celle d'une espèce compétitrice en rivière de Penzé, Heterocapsa triquetra (rapport ART3 2002-2003) cette étude vise à préciser et quantifier les réponses physiologiques respectives des deux espèces à différentes conditions d'apports en phosphate (taux de croissance, vitesse d'assimilation des phosphates, capacité à stocker le phosphore intracellulaire). Elle montre qu'Alexandrium minutum a plutôt une stratégie de « stockage », capable d'assimiler rapidement le phosphate après un apport mais le stockant pour une meilleure croissance ultérieure quand la ressource sera à nouveau épuisée. Comparativement, Heterocapsa triquetra aurait,...
Tipo: Text
Ano: 2004 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00105/21598/19178.pdf
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Étude sur la prolifération de la micro algue Alexandrium minutum en rade de Brest ArchiMer
Chapelle, Annie; Le Bec, Claude; Amzil, Zouher; Dreanno, Catherine; Guillou, Laure; Klouch, Khadidja; Labry, Claire; Le Gac, Mickael; Pineau-guillou, Lucia; Siano, Raffaele; Abernot, Chantal; Andrieux, Francoise; Caradec, Florian; Destombe, Christophe; Dia, A.; Doner, Anne; Duval, Julia; Gouriou, Jeremie; Lazure, Pascal; Le Brun, Luc; Le Gal, Dominique; Malestroit, Pascale; Petton, Sebastien; Plus, Martin; Quere, Julien; Savar, Veronique; Schmitt, Sophie; Terre, A.; Youenou, Agnes.
Suite à l’événement de grande ampleur d’efflorescence d’Alexandrium minutum et des toxicités associées en Rade de Brest en 2012, un projet a été élaboré avec la Région Bretagne dans le cadre du développement du port de Brest. L’Ifremer a organisé un échantillonnage dans l’estuaire de la rivière de Daoulas, zone la plus touchée en 2012, au cours des printemps-été 2013 et 2014. Un suivi de la présence d’A. minutum dans les sédiments a également été réalisé en hiver 2014. De ces suivis, des mesures réalisées au laboratoire à ce jour, des simulations du modèle Prévimer ainsi que des résultats du réseau Rephy et Velyger, il ressort que: * La rade de Brest peut aujourd’hui être considérée comme une zone à risque pour Alexandrium minutum. En effet, depuis 2012...
Tipo: Text
Ano: 2014 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00254/36487/35029.pdf
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Étude sur la prolifération de la micro algue Alexandrium minutum en rade de Brest. Projet Daoulex. Rapport d’avancement n° 2 : Analyse des traces biologiques d’Alexandrium minutum dans les sédiments de la Rade de Brest. ArchiMer
Chapelle, Annie; Le Bec, Claude; Siano, Raffaele; Caradec, Florian; Andrieux, Francoise.
Suite à l’efflorescence de grande ampleur d’Alexandrium minutum et des événements toxiques associés en Rade de Brest en 2012, un projet a été monté avec la Région dans le cadre du développement du port de Brest, pour élucider les contrôles de cette efflorescence. De juillet à août 2013, l’Ifremer a organisé un échantillonnage serré dans l’estuaire de Daoulas, zone la plus touchée en 2012 (rapport d’avancement n°1). Une autre partie de ce projet vise à la détection (rapport d’avancement n°2) et à la quantification (rapport d’avancement n°3) des traces biologiques d’A. minutum dans les sédiments de surface en différentes stations de la Rade de Brest présentant des caractéristiques sédimentaires différentes. Pour la détection des traces biologiques (ADN...
Tipo: Text
Ano: 2014 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00191/30231/28647.pdf
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Evolutionary processes and cellular functions underlying divergence in Alexandrium minutum ArchiMer
Le Gac, Mickael; Metegnier, Gabriel; Chomerat, Nicolas; Malestroit, Pascale; Quere, Julien; Bouchez, Olivier; Siano, Raffaele; Destombe, Christophe; Guillou, Laure; Chapelle, Annie.
Understanding divergence in the highly dispersive and seemingly homogeneous pelagic environment for organisms living as free drifters in the water column remains a challenge. Here, we analyzed the transcriptome wide mRNA sequences, as well as the morphology of 18 strains of Alexandrium minutum, a dinoflagellate responsible for Harmful Algal Blooms worldwide, to investigate the functional bases of a divergence event. Analysis of the joint site frequency spectrum (JSFS) pointed toward an ancestral divergence in complete isolations followed by a secondary contact resulting in gene flow between the two diverging groups, but heterogeneous across sites. The sites displaying fixed SNPs were associated with a highly restricted gene flow and a strong...
Tipo: Text Palavras-chave: Dinoflagellates; Harmful algal blooms; Populations Genomics; Pseudocryptic species; Speciation.
Ano: 2016 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00347/45857/45529.pdf
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Global and local factors driving the phenology of Alexandrium minutum (Halim) blooms and its toxicity ArchiMer
Guallar, Carles; Bacher, Cedric; Chapelle, Annie.
The dinoflagellate Alexandrium minutum is a toxic bloom-forming species distributed worldwide. The mechanisms driving and promoting the species blooms and their toxicity are studied and presented here. Most previously published work focuses on local and/or short-term scales. In this study, a broad temporal and spatial approach is addressed using time series covering several sites over several years and combining environmental variables and A. minutum abundances from the French English Channel − Atlantic coasts. Data were explored by means of phenology and threshold analysis. The A. minutum bloom characteristics are defined. Only one bloom per year is measured and it may reach more than a million of cells L−1. Bloom period extends from April to October and...
Tipo: Text Palavras-chave: Alexandrium minutum; PSP toxicity; HAB; Bloom phenology; Threshold analysis; Monitoring long time-series.
Ano: 2017 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00390/50130/51076.pdf
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Influence of gametogenesis pattern and sex on paralytic shellfish toxin levels in triploid Pacific oyster Crassostrea gigas exposed to a natural bloom of Alexandrium minutum ArchiMer
Hermabessiere, Ludovic; Fabioux, C.; Lassudrie, Malwenn; Boullot, F.; Long, Marc; Lambert, Christophe; Le Goic, N.; Gouriou, Jeremie; Le Gac, Mickael; Chapelle, Annie; Soudant, P.; Hegaret, Helene.
This study investigated the effect of gametogenesis pattern and sex on levels of paralytic shellfish toxins (PST) accumulated by triploid oysters Crassostrea gigas exposed to a natural bloom of the toxic dinoflagellate Alexandrium minutum in the Bay of Brest (Western Brittany, France), over the summer 2014. Toxin accumulation in oysters was proposed to be influenced by the proportion of energy allocated to reproduction versus other metabolisms, as proposed by Haberkorn et al. (2010). Thus, we hypothesized that triploid oysters with different gametogenesis patterns (α or β, producing respectively numerous gametes or rare gametes) could result in differences in toxin accumulation. Toxin level could also be different according to the gender of the oysters. To...
Tipo: Text Palavras-chave: Crassostrea gigas; Alexandrium minutum; Harmful algal bloom (HAB); Paralytic shellfish toxin (PST); Gametogenesis pattern; Triploid.
Ano: 2016 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00307/41801/41010.pdf
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L'eutrophisation des eaux marines et saumâtres en Europe, en particulier en France ArchiMer
Menesguen, Alain; Aminot, Alain; Belin, Catherine; Chapelle, Annie; Guillaud, Jean-francois; Joanny, Michel; Lefebvre, Alain; Merceron, Michel; Piriou, Jean-yves; Souchu, Philippe.
In order to be able to count the cases of coastal eutrophication and to propose methods to monitor as well as to reduce these phenomena, first of all it is necessary to precisely define the word eutrophication itself. Instead of the strict etymological definition, that is to say a progression of the enrichment of a medium, we will rather retain the concept of a state enriched at a point such as it causes harmful effects on the ecosystem, and nuisances to man's activities. Based on the average chemical equations of the organic matter synthesis/degradation in the sea, this operational definition thus puts forwards the harmful consequences of enrichment, i.e. the production of an excessive algal biomass, sometimes unbalanced from the point of view of...
Tipo: Text Palavras-chave: Alexandrium; Phaeocystis; Monostroma; Ulva; Dilution plume; Water trapping; Anoxia; Nitrogen and phosphorus loadings; Red tides; Phytoplankton blooms; Green tides; Eutrophication; Alexandrium; Phaeocystis; Monostroma; Ulva; Panache de dilution; Confinement; Anoxie; Phosphate; Nitrate; Apports terrigènes; Eaux colorées; Blooms phytoplanctoniques; Marées vertes; Eutrophisation.
Ano: 2001 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2001/rapport-22.pdf
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Modèle des cycles de l'azote et du phosphore à l'interface eau-sédiment. Application à l'étang de Thau ArchiMer
Chapelle, Annie.
Le programme de recherche Oxythau a pour but l'étude des relations concyliculture - milieu dans l'étang de Thau. Dans ce contexte, l'interface eau-sédiment apparait comme une structure majeure intervenant dans les cycles de la matière et dans les problèmes de dysfonctionnement de l'écosystème (malaïgues). Un modèle en azote et en phosphore simule les étapes de transformation de la matière organique sédimentée jusqu'au relargage de sels nutritifs, ainsi que la concentration en oxygène qui intervient dans les cinétiques de dégradation. L'ensemble de ces réactions est simulé au moyen d'un modèle vertical. La colonne d'eau est scindée en cinq boîtes de 1m superposées et le sédiment en deux boîtes de 5 cm. Ce modèle est mis au point en situation d'équilibre...
Tipo: Text
Ano: 1993 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00060/17091/14604.pdf
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Modélisation de l'eutrophisation de la Baie de Vilaine et des phénomènes d'anoxie associés ArchiMer
Chapelle, Annie.
The Vilaine bay (South Brittany) has been showing for many years eutrophication troubles (red tides, anoxia, toxic blooms...). Facing these biological and economical problems, scientific studies have been performed and the results are joined in an ecological box model of the bay. It simulates the primary production through nitrogen cycle, dissolved oxygen, and salinity, used to calibrate the advection-dispersion fluxes of the physical submodel. The model is running several years to bring out the seasonal characteristics of this site. A special attention is reported on the oxygen balance sheet. Simulations try to quantify the oxygen demand and to recognize the major cause of anoxia. These results are applied to reproduce the July 1982 anoxia, which caused...
Tipo: Text
Ano: 1990 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00480/59124/61752.pdf
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Modélisation des cycles de l'azote et du phosphore dans les sédiments d'une lagune soumise à une exploitation conchylicole ArchiMer
Chapelle, Annie; Mesnage, Valérie; Mazouni, Nabila; Deslous-paoli, Jean-marc; Picot, Bernadette.
A simulation of nitrogen and phosphorus exchanges for the sediment-water interface is presented, The aim of the sttudy is to understand the dynamic behaviour of an eutrophie coastal lagoon (Thau, France), ln situ experiments were performed to estimate the different pools of nitrogen and phosphorus in the water column and in the sediment. The diffusive fluxes between them were also estimated. A numerical mode1, simulating nitrogen and phosphorus cycles, was developed and calibrated with data recorded .at two seasons (winter and summer). This study leads to the conclusion that is necessary to know the different pools of nitrogen and phosphorus in order to estimate which fraction is bioavailable and the rate of nutrient exchange between sediment and water. It...
Tipo: Text Palavras-chave: Modèle; Phosphore; Azote; Sédiment; Ecosystème conchylicole; Modelling; Phosphorus; Nitrogen; Sediment; Shellfish ecosystem.
Ano: 1994 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00039/15026/12360.pdf
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Modélisation du phytoplancton dans les écosystèmes côtiers. Application à l’eutrophisation et aux proliférations d’algues toxiques ArchiMer
Chapelle, Annie.
Le phytoplancton, de par sa diversité et sa fonction de producteur primaire, est le support de l’ensemble des réseaux trophiques des eaux douces et marines. Il est aussi responsable de la production de la moitié de l’oxygène de notre atmosphère. Il participe à la productivité des écosystèmes côtiers et il témoigne également de leur dégradation. La modélisation numérique permet d’appréhender les multiples liens entre le phytoplancton et les autres composantes de l’écosystème côtier et de centrer le modèle sur les questions posées. Dans ce manuscrit sont abordés les principes de modélisation du phytoplancton dans les écosystèmes côtiers, et les applications du modèle à l’étude de l’eutrophisation et des proliférations de phytoplancton toxique, dans un...
Tipo: Text
Ano: 2016 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00360/47141/47092.pdf
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Modélisation d'un écosysteme marin côtier soumis a l'eutrophisation : la baie de vilaine (sud bretagne). Etude du phytoplancton et du bilan en oxygène ArchiMer
Chapelle, Annie.
The Bay of Vilaine (South-Brittany, France ) has been affected for many years by eutrophication process . Discoloured waters, oxygen depletion in bottom waters occured, being sometimes so drastic as in July 1982 that several ten tons of fishes and invertebrates were killed by anoxia. This coastal ecosystem is studied using a box model simulating the nitrogen cycle, oxygen and salinity. The model takes into account river inputs and exchanges with the ocean. It is calibrated and validated against several year measurements. The understanding of primary production and oxygen budget is improved. Phosphorus cycle simulation is then added in the model. The impact of different reductions of river nutrients on chlorophyll concentration and on hypoxia in the Bay are...
Tipo: Text
Ano: 1991 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00015/12611/9490.pdf
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