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| Beaumont, M.A.; Nielsen, R.; Robert, C.; Hey, J.; Gaggiotti, O; Knowles, L.; Estoup, A.; Panchal, M.; Corander, J.; Hickerson, M.; Sisson, S.A.; Fagundes, N.; Chikhi, L.; Beerli, P.; Vitalis, R.; Cornuet, J.M.; Huelsenbeck, J.; Foll, M.; Yang, Z.; Rousset, F.; Balding, D.; Excoffier, L.. |
| Recent papers have promoted the view that model-based methods in general, and those based on Approximate Bayesian Computation (ABC) in particular, are flawed in a number of ways, and are therefore inappropriate for the analysis of phylogeographic data. These papers further argue that Nested Clade Phylogeographic Analysis (NCPA) offers the best approach in statistical phylogeography. In order to remove the confusion and misconceptions introduced by these papers, we justify and explain the reasoning behind model-based inference. We argue that ABC is a statistically valid approach, alongside other computational statistical techniques that have been successfully used to infer parameters and compare models in population genetics. We also examine the NCPA method... |
| Tipo: Journal Article |
Palavras-chave: PHYLOGEOGRAPHIE MOLECULAR EVOLUTION; PHYLOGEOGRAPHY; POPULATION GENETICS-EMPIRICAL; POPULATION GENETICS-THEORETICAL. |
| Ano: 2010 |
URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2010a6a04229&uri=/notices/prodinra1/2010/12/ |
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| Chikhi, L.; Bonhomme, F.; Agnèse, Jean-François. |
| La génétique des organismes marins a longtemps souffert du manque de confiance des gestionnaires des pêches par l'absence de résultats spectaculaires. Nous avons analysé la variabilité génétique de deux espèces de sardinelles (#Sardinella aurita$ et #S. maderensis$) par l'intermédiaire de sa variabilité allozymique. Nous n'avons pas trouvé de variabilité suffisante chez #S. aurita$ pour pouvoir conclure sur sa structuration génétique. En revanche #S. maderensis$ s'est révélée plus variable. Nous avons donc pu chercher à mettre en évidence sa différenciation génétique sur son aire de répartition. La valeur de l'indice Fst de WRIGHT estimé selon WEIR et COCKERHAM (1984) s'est révélée faible (Fst = 0.0085) mais significativement différente de zéro... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: POISSON MARIN; ESPECE PELAGIQUE; VARIABILITE GENETIQUE; ANALYSE DE DONNEES. |
| Ano: 1995 |
URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:42087 |
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