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A histological examination of grafting success in pearl oyster Pinctada margaritifera in French Polynesia ArchiMer
Cochennec-laureau, Nathalie; Montagnani, Caroline; Saulnier, Denis; Fougerouse, Angelique; Levy, Peva; Lo, Cedrik.
Pearl oyster grafting is a complex surgical operation that should lead to pearl formation after approximately eighteen months. Although this technique has been used for many years in French Polynesia, the grafting process is still not standardised. While studies have been carried out in order to improve graft performance and yield, these remain highly variable due to post-grafting mortality, nucleus rejection and unreliable pearl quality, all of which constrain pearl farm profitability. The present study uses histological analysis to monitor oysters that either rejected or retained their nuclei. Both groups of oysters are compared in terms of evolution of the graft, which could influence retention, and the development of a pearl sac in cases where grafting...
Tipo: Text Palavras-chave: Grafting process; Pearl formation; Pearl oyster; Pteriidae; Pinctada margaritifera.
Ano: 2010 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00002/11288/7823.pdf
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Analyse bibliographique: historique de l'huître plate, Ostrea edulis, et la Bonamiose, maladie due au protozoaire Bonamia ostreae ArchiMer
Cochennec-laureau, Nathalie.
Oyster productions represent an important part of the french aquaculture. However, diseases are considered as the first limiting factors for the development of this activity around the world. Two exemples point out this problem for the french flat oyster production: Marteiliosis, the disease of the digestive gland, caused by Marteilia refringens, and Bonamiosis, the hemocytic disease, caused by Bonamia ostreae. This report proposes a bibliography analysis of major results obtained for Bonamiosis studies.
Tipo: Text Palavras-chave: Huître plate; Ostrea edulis; Bonamia ostreae; Bonamiose; Pathologie; European flat oyster; Oslrea edulis; Bonamia ostreae; Bonamiosis; Pathology.
Ano: 2002 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00105/21661/19242.pdf
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Apport des images satellite à l'évaluation de la qualité des masses d'eau DCE. Analyse des données de Chlorophylle a sur la période 2011-2016 dans les masses d'eau côtière du bassin versant Loire-Bretagne ArchiMer
Bizzozero, Lucie; Gohin, Francis; Lampert, Luis; Fortune, Mireille; Cochennec-laureau, Nathalie.
Afin de répondre aux objectifs de la Directive Cadre sur l’eau, l’Ifremer met en oeuvre, en appui à l’Agence de l’eau Loire Bretagne, la surveillance de l’élément de qualité phytoplancton. Le suivi sur des points fixes et à une fréquence mensuelle ne permet pas de suivre l’ensemble des masses d’eau du bassin Loire Bretagne. C’est pourquoi l’évaluation de l’indicateur phytoplancton a été complétée par une évaluation à partir des images satellite, notamment sur les masses d’eau non suivies. L’indice biomasse (représenté par le percentile 90 de la Chl-a) a pu être calculé à partir des données satellite pour la quasi-totalité des masses d’eau côtières RCS et non RCS, c’est-à-dire 34 masses d’eau sur 39. Pour les cinq masses d’eau restantes, les limites liées à...
Tipo: Text Palavras-chave: Images satellite; Indice Biomasse; Directive Cadre sur l’eau; Chlorophylle a; Bassin Loire Bretagne; Qualité des masses d’eau; Indicateur Phytoplancton.
Ano: 2018 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00453/56465/58162.pdf
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Bilan 2005-2006 du Réseau de Veille Zoosanitaire des huîtres perlières, Pinctada margaritifera, en Polynésie française ArchiMer
Cochennec-laureau, Nathalie; Fougerouse, Angelique; Pellan, Antoine; Levy, Peva.
En 2005 et 2006, un total de 1333 analyses réparties en 1109 huîtres perlières, P. margaritifera, 93 pipi, P. maculata, 27 chama, Chamidae sp, 46 kapi kapi, Saccostrea cucullata et 58 Isognomon sp. ont été effectuées dans le cadre du REseau de PAthologie des huîtres perlières (REPANUI). Les analyses histologiques ont révélé comme les années précédentes la présence de sporozoaires de type grégarine, des parasites de type Rickettsien, des kystes de cestodes (Tylocephalum sp.). Une infection par des vers trématodes a été détectée chez S. cucullata. Depuis la mise en place de cette surveillance active en 2003, aucun agent pathogène à déclaration obligatoire de la liste de l’Office International des Epizooties (OIE) n’a été diagnostiqué, confirmant le bon état...
Tipo: Text
Ano: 2006 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00168/27882/26136.pdf
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Bilan 2015 du dispositif national de surveillance de la santé des mollusques marins ArchiMer
Lupo, Coralie; Osta Amigo, Axel; Fleury, Elodie; Robert, Stephane; Garcia, Celine; Arzul, Isabelle; Baillon, Laury; Bechemin, Christian; Canier, Lydie; Chollet, Bruno; Dechamps, Lucie; Dubreuil, Christine; Faury, Nicole; Francois, Cyrille; Godfrin, Yoann; Lapegue, Sylvie; Morga, Benjamin; Travers, Marie-agnes; Tourbiez, Delphine; Masson, Jean-claude; Verin, Francoise; Cordier, Remy; Gangnery, Aline; Louis, Wilfried; Mary, Charlotte; Normand, Julien; Penot, Julia; Cheve, Julien; Dagault, Francoise; Le Jolivet, Aurore; Le Gal, Dominique; Lebrun, Luc; Bellec, Gwenael; Bouget, Jean-francois; Cochennec-laureau, Nathalie; Palvadeau, Hubert; Grizon, James; Chabirand, Jean-michel; Pepin, Jean-francois; Seugnet, Jean-luc; D'Amico, Florence; Maurer, Daniele; Le Gall, Patrik; Mortreux, Serge; Baldi, Yoann; Orsoni, Valerie; Bouchoucha, Marc; Le Roy, Valerian; Pouvreau, Stephane; Queau, Isabelle; Lamoureux, Alice.
Depuis 1992, la surveillance de la santé des mollusques marins du littoral français est assurée par le réseau de Pathologie des Mollusques (Repamo). Ses activités s’inscrivent dans le cadre de la Directive Européenne 2006/88/CE. Depuis son évaluation par la plateforme nationale d’épidémiosurveillance en santé animale en 2012, l’objectif de surveillance est la détection précoce des infections dues à des organismes pathogènes exotiques et émergents affectant les mollusques marins sauvages et d’élevage. L’année 2015 est la première année de transition pour laquelle un début d’évolution des modalités de surveillance de la santé des mollusques marins animées par l’Ifremer a été amorcé. Un dispositif hybride de surveillance a été mis en place, s’appuyant sur...
Tipo: Text Palavras-chave: Réseau; Surveillance; Pathologie; Mollusques; Coquillages; Santé; Mortalité; Maladie.
Ano: 2016 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00324/43486/42945.pdf
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Bilan des « Journées Surmortalité des huîtres creuses, Crassostrea gigas » du Programme P7 « Aquaculture Durable » des 8 et 9 décembre 2009 ArchiMer
Cochennec-laureau, Nathalie; Baud, Jean-pierre; Bedier, Edouard; Boudry, Pierre; Huvet, Arnaud; Nicolas, Jean-louis; Pepin, Jean-francois; Petton, Bruno.
Ce bilan comprend deux parties : la première est dédiée à une synthèse des travaux présentés lors des journées « Surmortalités des huîtres creuses, Crassostrea gigas » les 8 et 9 décembre 2009 et, la seconde partie, à une proposition d'un projet de recherche spécifique 2010-2012 en complément des propositions de « sortie de crise ». Contexte Les mortalités estivales de l'huître creuse, Crassostrea gigas, sont décrites depuis une vingtaine d'années en France mais également au Japon, en Corée, aux USA et en Australie. Ces phénomènes ou « syndrome des mortalités estivales » ont fait l'objet d'une étude pluridisciplinaire en France entre 2001 et 2006 (Défi MOREST). Toutefois, en 2008 et 2009, l'ostréiculture française a du faire face à deux épisodes de...
Tipo: Text
Ano: 2010 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2010/acte-7393.pdf
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Bilan des observations hydrologiques du secteur côtier au large de la Loire et de la Vilaine en 2016 ArchiMer
Retho, Michael; Bizzozero, Lucie; Le Merrer, Yoann; Manach, Soazig; Collin, Karine; Fortune, Mireille; Schmitt, Anne; Gabellec, Raoul; Souchu, Philippe; Cochennec-laureau, Nathalie.
Ce rapport décrit le contexte hydrologique du littoral côtier du Morbihan, de la Loire Atlantique et de la Vendée Nord, sous l'influence des deux fleuves la Loire et la Vilaine, durant l'année 2016. Il s'appuie sur les suivis environnementaux réalisés dans le cadre des réseaux REPHY et DCE, complétés par les données acquises en haute fréquence sur la bouée MOLIT (réseau COAST HF-HOSEA).
Tipo: Text Palavras-chave: Hydrologie; DCE; Nutriment; Loire Bretagne; REPHY; Phytoplancton.
Ano: 2017 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00416/52720/53593.pdf
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Bilan des observations hydrologiques du secteur côtier au large de la Loire et de la Vilaine en 2017 ArchiMer
Collin, Karine; Bizzozero, Lucie; Le Merrer, Yoann; Retho, Michael; Souchu, Philippe; Cochennec-laureau, Nathalie; Schapira, Mathilde; Manach, Soazig.
Ce rapport décrit le contexte hydrologique du littoral côtier du Morbihan, Pays de Loire et Nord Vendée, sous l’influence de la Loire et de la Vilaine, durant l’année 2017. Il s’appuie sur les suivis environnementaux réalisés dans le cadre des réseaux REPHY et de la DCE, complétés des données acquises en haute fréquence sur la bouée MOLIT (réseau COAST-HF).
Tipo: Text Palavras-chave: Hydrologie; DCE; Nutriment; Loire Bretagne; Rephy; Phytoplancton.
Ano: 2018 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00472/58410/60972.pdf
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Bilan final 2004-2007 du Réseau de Veille Zoosanitaire REPANUI des huîtres perlières Pinctada margaritifera en Polynésie francaise ArchiMer
Saugeon, Cecile; Fougerouse, Angelique; Pellan, Antoine; Levy, Peva; Cochennec-laureau, Nathalie.
De nombreuses pathologies affectent les mollusques, dont les huîtres perlières. Celles-ci peuvent être sensibles à des maladies, ce qui peut entraîner parfois de fortes mortalités au sein d’une population. La présence de certains agents pathogènes dans la région Asie-Pacifique ainsi que les fortes mortalités dans les années 1985 sur le cheptel de Pinctada margaritifera en Polynésie française, permet de se rendre compte de la vulnérabilité de la filière perlicole. De part l’importance socio-économique de la perliculture en Polynésie française, le Service de la Perliculture, en collaboration avec l’Ifremer de Tahiti, a mis en place en 2003 un réseau de surveillance épidémiologique des pathologies de l’huître perlière P. margaritifera (REPANUI). Après cinq...
Tipo: Text
Ano: 2007 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00168/27883/26137.pdf
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Characterization of two new genes implicated in mineralization process of Pinctada margaritifera ArchiMer
Cochennec-laureau, Nathalie; Fleury, Elodie; Belliard, Corinne; Levy, Peva.
A transplant is a complex surgical procedure performed to obtain a pearl after about 12 to 18 months. One of the key steps in this procedure is the transfer of the graft (piece of mantle) from the donor oyster. A functional relationship exists between the coating nature of the pearl and the cellular structure of the pearl bag portion of the graft. We have identified two genetic markers of biomineralisation in Pinctada margaritifera, the pearl oyster: Perline and Calcine, responsible for secretion of aragonite and calcite, respectively. After isolating and sequencing a portion of each of these genes, we verified the specificity of these sequences using molecular methods (RT-PCR, in situ hybridisation) and biocomputing methods (alignments, phylogenetic...
Tipo: Text
Ano: 2005 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00168/27888/26143.pdf
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Colour or no colour in the juvenile shell of the black lip pearl oyster, Pinctada margaritifera? ArchiMer
Trinkler, Nolwenn; Le Moullac, Gilles; Cuif, Jean-pierre; Cochennec-laureau, Nathalie; Dauphin, Yannicke.
Pinctada margaritifera mollusc is cultivated in French Polynesia for the production of black pearls. For this study, the colour of juvenile samples (48 days old) was investigated in the visible range spectra (430-700 nm) using spectrophotometry. A first measurement was done with the soft parts still inside the shell (entire animal). Then, the soft parts were removed in order to do a second measurement on the growing edge of the shell. Comparison of the two measurements shows that the estimation of the living animal colour with unaided eye is strongly influenced by the colour of the soft parts. The use of the International Commission on Illumination (ISI) chromaticity diagram shows that at this growth stage, the shells are "white"; i.e. present no...
Tipo: Text Palavras-chave: Juvenile shell; Colour-scoring; Mollusc; Pearl oyster; Pinctada margaritifera.
Ano: 2012 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00078/18883/16449.pdf
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Compte rendu du Bilan DCE 2014 Loire Bretagne. Point sur l’état chimique ArchiMer
Cochennec-laureau, Nathalie; Fera, Philippe; Grouhel-pellouin, Anne.
Elle rappelle brièvement les objectifs de ces rendez-vous annuels qui permettent de présenter les résultats acquis au cours de l’année et leur traitement par les experts correspondants, d’informer tous les acteurs impliqués dans l’acquisition et la diffusion des résultats et d’échanger sur les retours d’expérience. Cette restitution a fait le point en 2015 sur l’état chimique des eaux.
Tipo: Text Palavras-chave: Directive Cadre sur l’Eau Loire Bretagne; Chimie; Qualité des eaux littorales.
Ano: 2016 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00314/42552/41924.pdf
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Contamination des coquillages par les norovirus en rivière d'Auray en lien avec la rénovation d'une station d'épuration littorale ArchiMer
Treguier, Cathy; Schaeffer, Julien; Le Saux, Jean-claude; Le Guyader, Soizick; Cochennec-laureau, Nathalie.
Tipo: Text
Ano: 2015 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00312/42358/41693.pdf
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Contamination des coquillages par les norovirus en rivière d'Auray (Norocoqauray) ArchiMer
Treguier, Cathy; Schaeffer, Julien; Le Saux, Jean-claude; Cochennec-laureau, Nathalie; Le Guyader, Soizick.
Les norovirus (NoV) sont responsables des épidémies hivernales de gastroentérites aiguës dans la population. Ils sont excrétés dans les fèces humains, puis se retrouvent, après épuration insuffisante, dans le milieu marin naturel où ils peuvent contaminer des coquillages, qui à leur tour risquent de déclencher des gastroentérites chez les consommateurs. Cette étude vise à améliorer les connaissances sur la contamination des coquillages en élevage en rivière d’Auray par les NoV, en lien avec les bactéries témoins de contamination fécale Escherichia coli (E. coli). L’objectif est de suivre les flux de NoV et d’E. coli apportés par différents rejets (dont une station d’épuration) impactant la zone conchylicole et leur influence sur la qualité des coquillages...
Tipo: Text Palavras-chave: Norovirus; Coquillages; Contamination; Station d’épuration; Flux; Rivière d’Auray; Escherichia coli..
Ano: 2015 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00267/37778/35829.pdf
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Diagnostic étendu de l'eutrophisation (DIETE). Rôle des sédiments dans le cycle des nutriments et impacts sur l'eutrophisation de la baie de Vilaine (2014-2017) ArchiMer
Souchu, Philippe; Cochennec-laureau, Nathalie; Ratmaya, Widya; Retho, Michael; Andrieux, Francoise; Le Merrer, Yoann; Barille, Laurent; Barille, Anne-laure; Goubert, Evelyne; Plus, Martin; Laverman, Anniet.
Le projet DIETE a exploré les données hydrobiologiques (paramètres physico-chimiques, nutriments, phytoplancton) acquises depuis les années 80 dans les eaux côtières au large de la Loire et de la Vilaine, parallèlement à celles des deux fleuves. L’augmentation des concentrations de nitrates dans les eaux de la Loire, appuyée par les réserves sédimentaires de phosphates et de silicate ont entraîné de profonds bouleversements dans la dynamique du phytoplancton de la baie de Vilaine ces deux dernières décennies avec 1) une augmentation substantielle de la biomasse, 2) une modification importante de l’évolution saisonnière, 3) un changement dans les proportions entre diatomées et dinoflagellés au profit des diatomées. Ces résultats ouvrent tout un champ...
Tipo: Text Palavras-chave: Eutophisation; Azote; Phosphore; Silicium; Sédiments; Modélisation.
Ano: 2018 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00425/53695/54593.pdf
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Different secretory repertoires control the biomineralization processes of prism and nacre deposition of the pearl oyster shell ArchiMer
Marie, Benjamin; Joubert, Caroline; Tayale, Alexandre; Zanella-cleon, Isabelle; Belliard, Corinne; Piquemal, David; Cochennec-laureau, Nathalie; Marin, Frederic; Gueguen, Yannick; Montagnani, Caroline.
Mollusca evolutionary success can be attributed partly to their efficiency to sustain and protect their soft body with an external biomineralized structure, the shell. Current knowledge of the protein set responsible for the formation of the shell microstructural polymorphism and unique properties remains largely patchy. In Pinctada margaritifera and Pinctada maxima, we identified 80 shell matrix proteins, among which 66 are entirely unique. This is the only description of the whole "biomineralization toolkit" of the matrices that, at least in part, is thought to regulate the formation of the prismatic and nacreous shell layers in the pearl oysters. We unambiguously demonstrate that prisms and nacre are assembled from very different protein repertoires....
Tipo: Text Palavras-chave: Mantle; Mollusk shell matrix proteins; Proteome; Transcriptome; Evolution.
Ano: 2012 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00118/22959/20922.pdf
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Directive cadre sur l'eau. Bassin Loire-Bretagne. Contrôle de surveillance dans les masses d'eau côtière et de transition. Actions menées par Ifremer en 2016. ArchiMer
Bizzozero, Lucie; Cochennec-laureau, Nathalie.
Le contrôle de surveillance 2016 pour la DCE appliquée dans les eaux littorales de Loire-Bretagne a porté sur 25 masses d’eau côtière (sur 39 au total) et 16 masses d’eau de transition (sur 30 au total) retenues au titre du contrôle de surveillance. L’ensemble des résultats acquis, aussi bien sur les paramètres biologiques que chimiques, a permis de mettre à jour l’évaluation de l’état de ces masses d’eau. L’évaluation de la qualité des masses d’eau présentée dans ce document est basée sur les critères DCE 2000/60/CE. Elle est réalisée à partir des derniers résultats validés (incluant les données 2016). Elle ne se substitue pas à l'état des lieux officiel des masses d'eau, réalisé en 2013, qui figure dans le programme de mesures en ligne sur le site de...
Tipo: Text Palavras-chave: DCE; Bassin Loire-Bretagne; Contrôle de surveillance; Eaux côtières et eaux de transition; WFD; Loire Bretagne district; Monitoring; Coastal waters and transitional waters.
Ano: 2018 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00454/56533/58238.pdf
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Etude de la qualité microbiologique et chimique du gisement de tellines de St Jean de Monts et St Hilaire de Riez. 85.05 « Sud Pont d’Yeu ». Département de Vendée ArchiMer
Blouin, Antoine; Cochennec-laureau, Nathalie.
Etude de la qualité microbiologique et chimique du gisement naturel de tellines « Sud Pont d’Yeu », St Jean de Monts et St Hilaire de Riez – groupe 2. Département de Vendée. Rapport final 2017. L’étude de zone 85.05 « Sud Pont d’Yeu » conduite pour le groupe 2 avait pour objectifs de déterminer la qualité de la zone et de définir la stratégie d’échantillonnage à appliquer dans le cadre de la surveillance REMI. Le bassin versant se restreint à la plage, les principales sources de contamination potentielles sont essentiellement diffuses et liées aux activités à proximité très immédiate de la plage. Aucun exutoire (eaux pluviales ou usées) pouvant impacter la qualité microbiologique de la zone de production n’a pu être identifié. Il existe cependant des...
Tipo: Text Palavras-chave: Ifremer; REMI; Etude sanitaire; E. Coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Saint Jean de Monts; Classement sanitaire des zones de production; Département de la Vendée..
Ano: 2017 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00374/48553/48879.pdf
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Etude épidémiologique et écopathologique dans le cadre des mortalités de naissains d'huîtres creuses, Crassostrea gigas ArchiMer
Gaussem, Florian; Thebault, Anne; Mazurie, Joseph; Stanisiere, Jean-yves; Cuzzucoli, Diane; Cochennec-laureau, Nathalie.
Dans le cadre d’une convention Ifremer-DGAL (2010-2011), une étude épidémiologique et écopathologique intégrative a été conduite en Rivière de Pénerf (Morbihan). Elle a permis de mettre en place un outil d’objectivation pour i) l’évaluation des mortalités par une enquête réalisée auprès de tous les professionnels et pour ii) l’acquisition de données sur la biomasse, les stocks présents (élevés et non élevés) et la bathymétrie du site. Une régression logistique multivariée a permis d’ajuster la relation entre ces variables explicatives et d’étudier toutes leurs combinaisons pour comprendre les différences de mortalité déclarées sur les lots de naissains analysés. Le meilleur modèle prend en compte l’origine du naissain (écloserie, naturel), la date de...
Tipo: Text
Ano: 2012 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00119/22996/20827.pdf
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Etude sanitaire de la presqu'île de Quiberon - Département du Morbihan ArchiMer
Allenou, Jean-pierre; Treguier, Cathy; Manach, Soazig; Piquet, Jean-come; Cochennec-laureau, Nathalie.
L’étude de zone de la presqu’île de Quiberon (56-07-01) a été menée, à la demande des pêcheurs professionnels, afin de classer cette zone de gisement naturel d’huîtres. Une étude de dossier a été réalisée afin de recenser les principales sources de contamination. Celles-ci sont essentiellement d’origine anthropique, avec la présence de nombreux émissaires d’eaux pluviales, d’un poste de relèvement, et la proximité d’un important port de plaisance (Port Haliguen, 1180 emplacements). Des prélèvements d’huîtres ont été réalisés d’août 2013 à septembre 2014 avec une fréquence bimensuelle. Les résultats des analyses microbiologiques (indicateur Escherichia coli) permettent d’estimer la qualité de la zone de production à B au regard des critères du règlement CE...
Tipo: Text Palavras-chave: Coli; Contamination bactériologique des coquillages; Contaminants chimiques; Milieu marin; Étude de zone; Département du Morbihan.
Ano: 2015 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00256/36710/35322.pdf
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