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Effects of extraction method and storage of dry tissue on marine lipids and fatty acids ArchiMer
Sardenne, Fany; Bodin, Nathalie; Metral, Luisa; Crottier, Anais; Le Grand, Fabienne; Bideau, Antoine; Brisset, Blandine; Bourjea, Jerome; Saraux, Claire; Bonhommeau, Sylvain; Kerzerho, Vincent; Bernard, Serge; Rouyer, Tristan.
Various protocols are currently used to study marine lipids, but there is a growing interest in working on dry samples that are easier to transport. However, reference protocols are still lacking for dry samples. In order to make recommendations on this use, lipid classes and fatty acids (FA) obtained from six analytical protocols using two different tissue states (dry vs wet) and three extraction methods (automat vs manual potter vs leaving the solvent to work on tissue) were compared. Three dry storage modes of tissue (freezer vs gas nitrogen vs dry room) during one and three months were also compared. These comparisons were made on seven marine species with different lipid profiles, including fishes, crustaceans and mollusks. Lipid classes and FA...
Tipo: Text Palavras-chave: Degradation; Freeze-drying; Lyophilization; Lipid class; Marine animal; Protocol.
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00467/57898/60189.pdf
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Etude sanitaire de la zone de production conchylicole n°11.05 "Etang du Grazel" ArchiMer
Rousselet, Mathilde; Crottier, Anais; Fiandrino, Annie.
Une étude sanitaire est réalisée en vue du classement de la zone par l’administration. Dans le cas présent, la zone d’étude « Etang du Grazel » n°11.05 est déjà classée en B pour le groupe 3 dans l’arrêté n°2010/11/2754 du 9 août 2010 avec une période de pêche décrite du 1er avril au 30 septembre. Cette zone n’était pas suivie dans le cadre du REMI pour la surveillance de ce groupe de coquillage en raison d’une absence d’information sur l’exploitation de cette ressource (moules). Cette zone est suivie dans le cadre du REMI pour la surveillance du groupe de coquillages fouisseurs (palourdes, groupe 2) depuis 2004.
Tipo: Text
Ano: 2013 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00168/27929/26208.pdf
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Etude sanitaire de la zone de production conchylicole n°34.09 "Bande littorale de Port Ambonne au feu ouest du brise lames extérieur du port des Quilles". Partie 2 : Etude de zone ArchiMer
Rousselet, Mathilde; Crottier, Anais; Roque D'Orbcastel, Emmanuelle.
Suite à la demande d’exploitation de cette zone par les professionnels, la Direction Départementale des Territoires et de la Mer (DDTM) a fait remonter à la DGAL le souhait de réaliser une étude de zone en vue du classement de la zone de production de coquillages n°34.09 « Bande littorale de Port Ambonne au feu ouest du brise lames extérieur du port des Quilles ». Cette étude a été acceptée dans le cadre de la convention DGAL/ IFREMER 2010-2011. Cette étude a été réalisée par le Laboratoire Environnement Ressources du Languedoc-Roussillon. L’étude de dossier réalisée en Septembre 2010 (voir rapport RST.DOP.LER/LER/10.010) a conclu à une insuffisance des rendements pour permettre une exploitation de la zone par des pêcheurs professionnels. De ce fait,...
Tipo: Text
Ano: 2012 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00152/26322/24387.pdf
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Etude sanitaire de la zone n° 34.39 "Lotissements conchylicoles de la lagune de Thau" Groupe III. Département de l'Hérault ArchiMer
Marzin, Anahita; Crottier, Anais; Piquet, Jean-come; Abadie, Eric; Roque D'Orbcastel, Emmanuelle; Fiandrino, Annie.
L’étude de zone des lotissements conchylicoles de la lagune de Thau (34.39) a été menée, à la demande du Comité Régional de la Conchyliculture en Méditerranée et du préfet de l’Hérault, pour étudier la possibilité de sectoriser la zone de production en sous-zones, au regard du risque microbiologiques (REMI). Une étude de dossier a été réalisée afin de recenser les principales sources de contamination. Celles-ci sont essentiellement d’origine anthropique et impactent différemment les secteurs envisagés. Des prélèvements de coquillages du groupe 3 ont été réalisés de mai 2017 à mai 2018 avec une fréquence bimensuelle. Au regard des critères du règlement (CE) n° 854/2004, les résultats des analyses microbiologiques (indicateur Escherichia coli) ont permis...
Tipo: Text Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Étude de zone; Lagune de Thau; Département de l’Hérault.
Ano: 2018 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00459/57056/58965.pdf
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Etude sanitaire des zones de production conchylicole n°34.03 et n°34.04 – zone d’étude "Ile du Brescou et bande littorale du Cap d’Agde" ArchiMer
Rousselet, Mathilde; Baehr, Antoine; Crottier, Anais; Roque D'Orbcastel, Emmanuelle.
Ce rapport présente l’étude sanitaire de la zone Ile du Brescou et Bande Littorale du Cap d’Agde réalisée en 2013 et 2014. Dans un premier temps, le contexte et les objectifs de l’étude sont rappelés. Puis les caractéristiques de cette zone d’étude sont présentées : bassin versant, données climatiques, données existantes sur la qualité microbiologique du milieu. Un inventaire exhaustif des sources de contamination microbiologique de la zone est ensuite donné. L’étude de zone proprement dite a consisté en un suivi de la qualité chimique et microbiologique des moules (gisements naturels exploitables) en deux points de la zone : « Pointe de Roche longue », appartenant à la zone 34.03 et « Buse du Natu », appartenant à la zone 34.04. Les résultats montrent des...
Tipo: Text Palavras-chave: E. Coli; Contamination bactériologique des coquillages; Contaminants chimiques; Milieu marin; Classement sanitaire des zones de production; REMI; Bassin versant; Ruissellement.
Ano: 2015 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00251/36256/34804.pdf
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Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole. Région Occitanie. Edition 2019 ArchiMer
Serais, Ophelie; Cimiterra, Nicolas; Fiandrino, Annie; Crottier, Anais; Grouhel-pellouin, Anne; Piquet, Jean-come.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats du réseau de contrôle microbiologique (REMI) et du réseau de surveillance chimique (ROCCH), ce rapport comprend un bilan national et décrit le programme annuel 2018 de la région Occitanie. Il présente l’ensemble des résultats obtenus, en particulier l’estimation de la qualité microbiologique et chimique des zones de production de coquillages classées. En 2018, 28 zones de production ont été suivies par le REMI en Occitanie dont 12 dans l’Aude, 14 dans l’Hérault, 1 dans le Gard et 1 interdépartementale Hérault-Gard. Le taux de réalisation de la surveillance régulière microbiologique est de 94,9%, et 116 alertes ont été déclenchées au cours de l’année. La qualité...
Tipo: Text Palavras-chave: REMI; E. Coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Occitanie; Hérault; Gard; Aude; Classement sanitaire des zones de production; Estimation de la qualité; Élevage et pêche de coquillages..
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00502/61320/64892.pdf
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Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole.Départements des Pyrénées orientales, de l’Aude, de l’Hérault et du Gard. Edition 2018 ArchiMer
Crottier, Anais; Abadie, Eric; Brun, Melanie; Piquet, Jean-come; Fiandrino, Annie.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats des réseaux de contrôle microbiologique (REMI) et de surveillance chimique (ROCCH), ce rapport inclut un bilan national et décrit le programme annuel des départements de l’Hérault, du Gard et de l’Aude. Il présente l’ensemble des résultats obtenus, en particulier l’estimation de la qualité microbiologique et chimique des zones de production de coquillages classées pour la période 2015-2017. Sur les 29 zones de production conchylicole classées et suivies en Occitanie, la qualité a pu être estimée pour 23 d’entre elles. Selon les critères réglementaires pris en compte (règlement CE n°854/2004, modifié par le règlement n°2285/2015), dans les départements de...
Tipo: Text Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Classement sanitaire des zones de production; Département de l’Hérault; Départemen tdu Gard; Département de l’Aude.
Ano: 2018 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00445/55635/57280.pdf
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OBSLAG 2018 - volet eutrophisation. Lagunes méditerranéennes (période 2013-2018). Etat DCE de la colonne d'eau et du phytoplancton, tendance et variabilité des indicateurs ArchiMer
Derolez, Valerie; Bec, Béatrice; Munaron, Dominique; Foucault, Elodie; Fiandrino, Annie; Ouisse, Vincent; Messiaen, Gregory; Hatey, Elise; Connes, Coralie; Soudant, Dominique; Brun, Melanie; Fortune, Martine; Mortreux, Serge; Serais, Ophelie; Crottier, Anais; Malet, Nathalie.
Cette étude est réalisée dans le cadre du projet OBSLAG (OBServatoire des LAGunes) et porte sur les 10 masses d’eau lagunaires méditerranéennes situées à l’aval des cours d’eau suivis depuis 2015 par le « réseau flux » de l'Agence de l’Eau Rhône Méditerranée Corse. Le rapport correspond aux actions réalisées en 2018 dans le cadre du volet « eutrophisation » d’OBSLAG, répondant aux objectifs suivants : (1) réaliser un suivi estival en 2018 du phytoplancton et de la physico-chimie de l’eau et évaluer l’état DCE de ces compartiments pour la période 2013-2018 sur les 10 masses d’eau lagunaires du suivi « réseau flux », regroupant 13 lagunes poly-euhalines. Ce suivi permet de renforcer la fréquence des suivis DCE sur la colonne d’eau et le phytoplancton, qui ne...
Tipo: Text Palavras-chave: Directive Cadre sur l’Eau (DCE); Lagunes; Masses d’eau de transition; Eutrophisation; Phytoplancton; Confiance; Précision; Tendance..
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00507/61862/65959.pdf
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What are the main environmental factors driving the development of the neurotoxic dinoflagellate Vulcanodinium rugosum in a Mediterranean ecosystem (Ingril lagoon, France)? ArchiMer
Abadie, Eric; Chiantella, Claude; Crottier, Anais; Rhodes, Lesley; Masseret, Estelle; Berteaux, Tom; Laabir, Mohamed.
Vulcanodinium rugosum, a dinoflagellate developing in Ingril Lagoon (Mediterranean, France) is responsible for shellfish intoxications due to the neurotoxin pinnatoxin G. A one year survey (March 2012–April 2013) was conducted in this oligotrophic shallow lagoon and key environmental parameters were recorded (temperature, salinity and nutrients). The spatio-temporal distribution of V. rugosum in water column and on macrophytes was also determined. Planktonic cells of V. rugosum were observed at all sampling stations, but in relatively low concentrations (maximum of 1000 cell/L). The highest abundances were observed from June to September 2012. There was a positive correlation between cell densities and both temperature and salinity. Non-motile cells were...
Tipo: Text Palavras-chave: Vulcanodinium rugosum; Neurotoxins; Ingril lagoon; Environmental factors; Development dynamic.
Ano: 2018 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00437/54862/56478.pdf
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