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Chlorophyll a might structure a community of potentially pathogenic culturable Vibrionaceae. Insights from a one-year study of water and mussels surveyed on the French Atlantic coast ArchiMer
Deter, Julie; Lozach, Solen; Derrien, Annick; Veron, Antoine; Chollet, Jaufrey; Hervio-heath, Dominique.
The present study focused on the isolation of culturable bacteria from mussels and sea water to identify Vibrionaceae potentially pathogenic for humans. Three sites located on the French Atlantic coast were monitored monthly (twice each month during summer) for 1 year. Environmental parameters were surveyed (water temperature, salinity, turbidity, chlorophyll a) and bacteria were detected by culture and identified by API 20E(R) systems (BioMerieux) and PCR. A total of seven species were detected (Grimontia hollisae, Photobacterium damselae, Vibrio alginolyticus, V. cholerae, V. fluvialis, V. vulnificus and V. parahaemolyticus) and species diversity was higher at the end of summer. Surprisingly, V. cholerae non-O1/non-O139 was detected in spring. No site...
Tipo: Text
Ano: 2010 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00008/11928/8636.pdf
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Dénombrement des Escherichia coli dans des sédiments de la baie de l'Aiguillon ArchiMer
Derrien, Annick.
Le rôle des sédiments dans la contamination du milieu marin en baie de l'Aiguillon est une des problématiques du laboratoire. Pendant quinze mois des dénombrements d'Escherichia coli dans des sédiments de la baie ont été effectués. Deux méthodes de numération ont été comparées: la technique NPP en tubes et la technique NPP en microplaque. En période printemps-été, la méthode NPP miniaturisée a conduit à des résultats sensiblement supérieurs à ceux obtenus par la méthode NPP en tubes. Cette différence pourrait s'expliquer par une fluorescence parasite du sédiment pendant cette période (éventuellement par du plancton; hypothèse non confirmée). Les concentrations en E.coli des sédiments sont variables au cours de l'année avec un niveau de contamination faible...
Tipo: Text Palavras-chave: Sédiments; Escherichia coli; Dénombrement.
Ano: 2004 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00107/21811/19386.pdf
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Diagnostic des contaminations microbiologiques des chenaux de Payré ArchiMer
Thomas, Gerard; Stanisiere, Jean-yves; Fillon, Alain; Paticat, Francois; Chabirand, Jean-michel; Derrien, Annick; Grizon, James.
De 2007 à 2010, deux études ont été menées sur le Havre du Payré pour recueillir des éléments permettant de mieux appréhender les épisodes de pollution microbiologique menaçant la zone ostréicole. L’objectif est de fournir aux collectivités des informations en vue d’appuyer la politique de reconquête de la qualité du milieu et d’aider la profession à optimiser la gestion de sa production. Ces études ont montré le caractère particulier de l’hydraulique de ce site avec une forte réactivité vis à vis des apports du bassin versant et un fonctionnement estuarien favorisant la rétention de l’eau selon certaines conditions de marée et lors de circonstances météorologiques particulières. Elles ont également permis de hiérarchiser les flux bactériens provenant des...
Tipo: Text Palavras-chave: Chenaux du Payré; Vendée; Bassins versants; Hydraulique; Microbiologie; Contamination; Huîtres.
Ano: 2011 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00123/23421/21248.pdf
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Directive cadre sur l’eau. Bassin Loire-Bretagne. Contrôle de surveillance dans les masses d’eau côtières et de transition. Actions menées par Ifremer en 2013 ArchiMer
Grouhel-pellouin, Anne; Dupraz, Valentin; Allenou, Jean-pierre; Chauvin, Jacky; Cheve, Julien; Collin, Karine; Dagault, Francoise; Derrien, Annick; Doner, Anne; Duval, Audrey; Faure, Sandra; Fortune, Mireille; Gabellec, Raoul; Legendre, Aurelie; Lejolivet, Aurore; Le Merrer, Yoann; Retho, Michael; Robert, Serge; Truquet, Isabelle.
Le contrôle de surveillance 2013 pour la DCE appliquée dans les eaux littorales de Loire Bretagne a porté sur les 25 masses d’eau côtières (sur 39 au total) et les 16 masses d’eau de transition (sur 30 au total) retenues au titre du contrôle de surveillance. L’ensemble des résultats acquis, aussi bien sur les paramètres biologiques que chimiques, a permis de mettre à jour l’évaluation de l’état des masses d’eau affiché sur l’atlas DCE accessible sur la page web d’Envlit correspondante.
Tipo: Text Palavras-chave: DCE; Bassin Loire-Bretagne; Contrôle de surveillance; Eaux côtières et eaux de transition; WFD; Loire Bretagne district; Monitoring; Coastal waters and transitional waters.
Ano: 2014 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00254/36502/35049.pdf
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Directive cadre sur l’eau - Bassin Loire-Bretagne. Contrôle de surveillance dans les masses d’eau côtières et de transition. Actions menées par Ifremer en 2014 ArchiMer
Grouhel-pellouin, Anne; Allenou, Jean-pierre; Le Gac-abernot, Chantal; Chauvin, Jacky; Cheve, Julien; Collin, Karine; Dagault, Francoise; Derrien, Annick; Doner, Anne; Duval, Audrey; Fortune, Mireille; Gabellec, Raoul; Josset, Quentin; Legendre, Aurelie; Lejolivet, Aurore; Le Merrer, Yoann; Retho, Michael; Robert, Serge.
Le contrôle de surveillance 2014 pour la DCE appliquée dans les eaux littorales de Loire Bretagne a porté sur les 25 masses d’eau côtières (sur 39 au total) et les 16 masses d’eau de transition (sur 30 au total) retenues au titre du contrôle de surveillance. L’ensemble des résultats acquis, aussi bien sur les paramètres biologiques que chimiques, a permis de mettre à jour l’évaluation de l’état des masses d’eau affiché sur l’atlas DCE accessible sur la page web d’Envlit correspondante.
Tipo: Text Palavras-chave: DCE; Bassin Loire-Bretagne; Contrôle de surveillance; Eaux côtières et eaux de transition; WFD; Loire Bretagne district; Monitoring; Coastal waters and transitional waters.
Ano: 2015 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00308/41897/41163.pdf
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Directive cadre sur l’eau Bassin Loire-Bretagne. Contrôles de surveillance et opérationnel dans les masses d’eau côtières et de transition. Actions menées par Ifremer en 2011 ArchiMer
Oger-jeanneret, Helene; Allenou, Jean-pierre; Cheve, Julien; Collin, Karine; Dagault, Francoise; Derrien, Annick; Doner, Anne; Duval, Audrey; Faure, Sandra; Fortune, Mireille; Gabellec, Raoul; Genauzeau, Sylvie; Le Merrer, Yoann; Queau, Julie; Piriou, Jean-yves; Retho, Michael; Schmitt, Anne; Truquet, Isabelle.
La Directive Cadre sur l’Eau 2000/60/CE établit un nouveau cadre pour une politique communautaire dans le domaine de l’eau. Elle fixe comme objectif général l’atteinte, à l’horizon 2015, d’un bon état écologique et chimique des masses d’eau souterraines et de surface, ces dernières incluant les eaux côtières et de transition (estuaires en particulier). Les masses d’eau côtières et de transition sont des unités géographiques cohérentes, qui ont été définies sur la base de critères physiques ayant une influence avérée sur la biologie : * critères hydrodynamiques (courant, marnage, stratification, profondeur… ), * critères sédimentologiques (sable, vase, roche… ). Dans le bassin Loire-Bretagne, qui s’étend du Mont Saint-Michel à La Rochelle, le groupe de...
Tipo: Text
Ano: 2012 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00108/21940/19534.pdf
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Dragages et environnement marin Etat des connaissances ArchiMer
Alzieu, Claude; Abarnou, Alain; Bassoullet, Philippe; Boutier, Bernard; Chiffoleau, Jean-francois; Crenn, Isabelle; Derrien, Annick; Erard-le Denn, Evelyne; Gourmelon, Michele; Guiliaud, Jean-françois; Silva Jacinto, Ricardo; Le Cann, Pierre; Le Guyader, Françoise; Le Hir, Pierre; L'Yavanc, Jacky; Mauvais, Jean-louis; Menard, Dominique; Michel, Pierre; Monbet, Yves; Pommepuy, Monique; Quiniou, Francoise.
Port activities require continuous or occasional dredging of considerable quantities of sediments : approximately 50 million m3 along the French coastline. A large proportion of the dredgings is authorized for dumping at sea in geographically delimited areas and following an impact evaluation of their potential harmfulness to the marine environment. The environmental risks assessment linked to dredging operations relies on knowledge related to several scientific disciplines contributing to changes in the regulations. This work, intended both for managers and for environmental scientists and engineers, is designed to take stock of the current state-of-the-art in the field of sediment contamination and related ecotoxicological hazards, along with a review of...
Tipo: Text Palavras-chave: Regulations; Management; Impact; Contaminants; Dredging; Réglementation; Gestion; Impact; Contaminants; Dragages.
Ano: 1999 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/1999/rapport-1040.pdf
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Ecology of pathogenic and non-pathogenic Vibrio parahaemolyticus on the French Atlantic coast. Effects of temperature, salinity, turbidity and chlorophyll a ArchiMer
Deter, Julie; Lozach, Solen; Veron, Antoine; Chollet, Jaufrey; Derrien, Annick; Hervio Heath, Dominique.
Vibrio parahaemolyticus is one of the principal bacterial causes for seafood-borne gastroenteritis in the world. In the present study, three sites located on the French Atlantic coast were monitored monthly for environmental parameters over 1 year. The presence of total and pathogenic V. parahaemolyticus in sediment, water and mussel samples was detected following enrichment by culture and real-time PCR (toxR gene, tdh, trh1 and trh2 virulence genes). Using generalized linear models, we showed that the presence of V. parahaemolyticus in water could be explained by a combination of mean temperature over the 7 days before the day of sampling (P < 0.001) and turbidity (P = 0.058). In mussels, an effect of chlorophyll a (P = 0.005) was detected when an...
Tipo: Text
Ano: 2010 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00003/11420/8363.pdf
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Essai de détermination d'une typologie des sédiments côtiers en fonction de l'apparition d'eaux colorées ArchiMer
Arzul, Genevieve; Youenou, A.; Derrien, Annick; Gentien, Patrick; Crassous, M.p.; Lunven, M..
The study of different chemical parameters characterizing the coastal sediment, showed a possible relation between, respectively, high levels in organic matter and total copper, and the "red tide"  phenomenon.
Tipo: Text Palavras-chave: Sédiment côtier; Eaux colorées; Matière organique; Cuivre; Coastal sediment; Red time; Organic matter; Copper.
Ano: 1988 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00425/53708/54565.pdf
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Essais de décrochage de bactéries de sédiments côtiers par action chimique et physique ArchiMer
Derrien, Annick; Dupray, Elisabeth; Caprais, Marie-paule.
Afin d'améliorer les numérations bactériennes du sédiment, nous avons testé différentes méthodes physiques et chimiques pour relarguer les bactéries des particules. Une étude préliminaire a permis de définir des concentrations et des temps d'action non toxiques pour des bactéries d'intérêt sanitaire. Les différentes techniques testées ne permettent d'augmenter la numération, dans le meilleur des cas (action du lauryl sulfate de sodium), que d'une demi unité log.
Tipo: Text
Ano: 1992 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00040/15130/12467.pdf
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Etat de la situation sanitaire des zones de production conchylicole dans les Pertuis Charentais. Volet 2 : Phytoplancton ArchiMer
Ryckaert, Mireille; Margat, Sylvie; Derrien, Annick; Schmitt, Anne; Thomas, Gerard.
Après un rappel de la réglementation concernant la qualité sanitaire des coquillages d’élevage, ainsi qu’une présentation du (REPHY*), un bilan sur les risques sanitaires liés au phytoplancton toxique est réalisé en 2008. Trois familles de toxines sont passées en revue, ainsi que les espèces phytoplanctoniques potentiellement émettrices de ces toxines. Il s’agit des toxines diarrhéiques (DSP) associées aux dinoflagellés du genre Dinophysis, paralysantes (PSP) émises par le dinoflagellé Alexandrium et amnésiantes (ASP) sécrétées par des diatomées du genre Pseudo-nitzschia. Le bilan fait la synthèse des données issues du REPHY depuis 1984 avec une analyse plus précise de 1998 à 2008. La hiérarchisation des risques montre une prépondérance des évènements liés...
Tipo: Text Palavras-chave: Zones conchylicoles; Pertuis Charentais; Phytoplancton; Phycotoxine.
Ano: 2009 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00123/23419/21246.pdf
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Etude sanitaire de la zone 17.42 du Fiers d'Ars. Charente-Maritime ArchiMer
Derrien, Annick; Piquet, Jean-come; Fillon, Alain.
Suite à la demande d'exploitation de la zone du Fier d’Ars par le Comité Régional de la Conchyliculture du Poitou-Charentes (CRCPC), la Direction Départementale du Territoire et de la Mer (DDTM) a demandé la réalisation d'une étude sanitaire en vue du classement de cette zone de production pour les bivalves fouisseurs (groupe 2). Cette étude réalisée par le Laboratoire Environnement Ressources des Pertuis Charentais bénéficie d'un financement de la Direction Générale de l 'Alimentation (DGAL). Basée sur le paramètre microbiologique (Escherichia coli) et chimiques (plomb, mercure, cadmium). L'étude sanitaire a pour objectifs : d'estimer la qualité microbiologique et chimique de la zone en vue du classement sanitaire de la zone par l'administration...
Tipo: Text Palavras-chave: Etude sanitaire; Contamination bactériologique des coquillages; Classement sanitaire des zones de production; E. Coli; Flux d'E. coli; Fier d'Ars; Pertuis Breton; Lay; Sèvre Niortaise; Département Charente-Maritime.
Ano: 2013 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00137/24820/22905.pdf
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Etude sanitaire de la zone 17.58 Fosse de Loix. Charente-Maritime ArchiMer
Derrien, Annick; Fillon, Alain.
Suite à la demande d’exploitation de la zone de la Fosse de Loix par les professionnels, la Direction Départementale des Territoires et de la Mer (DDTM) a demandé la réalisation d’une étude sanitaire en vue du classement de cette zone de production pour le groupe 2. Cette étude réalisée par le Laboratoire Environnement Ressources des Pertuis Charentais (LER/PC), bénéficie d’un financement DPMA-DGAL. Basée sur le caractère microbiologique (Escherichia coli) et les paramètres chimiques (plomb, mercure et cadmium), l’étude a pour objectifs d’estimer la qualité microbiologique et chimique de la zone en vue du classement sanitaire de la zone par l’Administration conformément aux exigences du règlement CE n° 854/2004 et de déterminer la stratégie...
Tipo: Text Palavras-chave: Etude sanitaire; Contamination bactériologique des coquillages; Classement sanitaire des zones de production; E. Coli; T90; Flux d’E.coli; Fosse de Loix; Pertuis Breton; Lay; Sèvre Niortaise; Département de la Charente-Maritime..
Ano: 2014 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00239/35035/33573.pdf
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Impacts microbiologiques comparés des fleuves côtiers dans le Pertuis Breton 2002-2004. Rapport final ArchiMer
Ryckaert, Mireille; Thomas, Gerard; Derrien, Annick.
Les résultats du réseau REMI et de l’étude de salubrité 1998-2000 contractualisée entre la SRC Ré-Centre-Ouest et l’IFREMER, ont établi la responsabilité de la Sèvre, du Lay et du Curé dans les épisodes de contaminations microbiologiques du pertuis Breton. Toutefois, ces résultats ne permettent pas de préciser le rôle respectif de chaque cours d’eau. Des investigations complémentaires s’avèrent nécessaires pour répondre à cette question. Le présent rapport synthétise l’ensemble résultat acquis au cours de cette étude.
Tipo: Text Palavras-chave: Microbiologie; Surveillance; Réseau REMI; Contamination; Pertuis Charentais; Charente-Maritime.
Ano: 2004 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00140/25081/23189.pdf
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Merchant ships discharging unwanted marine species in close proximity of a French aquaculture area: Risks involved ArchiMer
Masson, Daniel; Thomas, Gerard; Genauzeau, Sylvie; Le Moine, Olivier; Derrien, Annick.
The most important oyster farming area in Europe is in a close proximity of two medium size merchant ports. Cargo ships deballast in this area before loading, releasing unwanted or noxious marine species. During a sampling campaign aboard these arriving ships, we found in some ballast water samples a huge number of potentially toxic dinoflagellates and some potentially pathogenic bacteria. A model was applied to find the potential geographical spread of the discharged ballast water. This model predicts the water to reach highly vulnerable shellfish farmed areas in six to eight days.
Tipo: Text Palavras-chave: Ballast water; Risk assessment; Toxin producing dinoflagellates; Shellfish farming; La Rochelle; Pathogenic bacteria.
Ano: 2013 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00160/27130/25328.pdf
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Microbial balance, and triggering of recent mussel mortality events in France: Is there a link? ArchiMer
Guesdon, Stephane; Travers, Marie-agnes; Hervio Heath, Dominique; Derrien, Annick; Genauzeau, Sylvie; Schmitt, Anne; Quintric, Laure; Leroi, Laura; Pepin, Jean-francois.
Since the spring of 2014, the mussel farming of Charente-Maritime and Vendée (French Atlantic coast) has experienced an unprecedented crisis. Mass mortality events of blue mussel (M. edulis) have affected livestock areas, decimating up to 100% of production in some farming areas. Investigation for infectious agents in moribund mussels revealed presence of bacteria capable of inducing mortalities. In this context, the MORBLEU research project (DPMA-Ifremer agreement) was initiated to explore potentially aggravating factors, associated or correlated with mortality of mussels. The aim of the present study is to support the hypothesis that these mortality episodes can be linked to an evolution of microbial communities. Based on historical data from Ifremer...
Tipo: Text
Ano: 2017 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00415/52696/53566.pdf
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Responses of enteric bacteria to environmental stresses in seawater ArchiMer
Troussellier, Marc; Bonnefont, Jean-luc; Courties, Claude; Derrien, Annick; Dupray, Elizabeth; Gauthier, Michel; Gourmelon, Michele; Joux, Fabien; Lebaron, Philippe; Martin, Yvan; Pommepuy, Monique.
The effects of different environmental factors (nutrient deprivation, hyperosmotic shock, exposure to light) on enteric bacteria which have been transferred into the marine environment, have been studied experimentally (microcosms) by considering demographic, physiological and genetic responses in Escherichia coli or Salmonella typhimurium populations. Short-term experiments (less than or equal to 48 h) showed that nutrient deprivation induced limited changes in measured bacteriological variables, but when combined with hyperosmotic shock, it results in an energy charge decrease and inactivation of membrane transport. Light exposure mainly affects the colony-forming capacity of bacterial populations. Combining different stress factors confirmed the rapid...
Tipo: Text Palavras-chave: Genetics; Cellular states; Physiology; Seawater; Enteric bacteria; Génétique; Etats cellulaires; Physiologie; Eau de mer; Entérobactéries.
Ano: 1998 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/1998/publication-845.pdf
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Suivi hydrologie et phytoplancton des masses d'eau du bassin hydrographique Adour-Garonne en 2003-2008 ArchiMer
Auby, Isabelle; D'Amico, Florence; Duval, Magali; Neaud-masson, Nadine; Plus, Martin; Rumebe, Myriam; Tournaire, Marie-pierre; Trut, Gilles; Ryckaert, Mireille; Derrien, Annick; Genauzeau, Sylvie; Schmitt, Anne; Charpentier, Gabriel; Grizon, James; Seugnet, Jean-luc; Thomas, Gerard; Llevot, Gérard; Beaugrand, Philippe; Carrere, Christian; Michel, Valérie; Petrau, Christian; Bariou, Jean; Debinski, Olivier; Le Mao, André.
La Directive Cadre sur l’Eau 2000/60/CE établit un nouveau cadre pour une politique communautaire dans le domaine de l’eau. Elle fixe comme objectif général l’atteinte, à l’horizon 2015, d’un bon état écologique et chimique des masses d’eau souterraines et de surface, ces dernières incluant les eaux côtières et de transition (estuaires en particulier).
Tipo: Text
Ano: 2010 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00032/14354/11640.pdf
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Suivi hydrologie et phytoplancton des masses d'eau du bassin hydrographique Adour-Garonne en 2005-2010 ArchiMer
Auby, Isabelle; D'Amico, Florence; Barbier, Claire; Duval, Magali; Neaud-masson, Nadine; Plus, Martin; Rumebe, Myriam; Tournaire, Marie-pierre; Trut, Gilles; Ryckaert, Mireille; Derrien, Annick; Margat, Sylvie; Schmitt, Anne; Charpentier, Gabriel; Seugnet, Jean-luc; Thomas, Gerard; Guesdon, Stephane; Llevot, Gerard; Beaugrand, Philippe; Carrere, Christian; Michel, Valérie; Petrau, Christian; Bariou, Jean; Landier, Pascal; Debinski, Olivier; Le Mao, André.
Ce rapport rend compte des résultats acquis entre 2005 et 2010 sur les paramètres hydrologiques et le phytoplancton, dans le cadre des réseaux REPHY et ARCHYD (pour les points du Bassin d’Arcachon), et celui du contrôle de surveillance des masses d'eau du district Adour-Garonne qui ne faisaient pas l’objet de suivi avant la mise en œuvre de la DCE. Ce document contient des résultats concernant les éléments de qualité physico-chimique (oxygène dissous pour les deux types de masses d’eau, température et transparence pour les masses d’eau côtières exclusivement) selon des méthodes présentées dans trois documents (Daniel, 2009 a et b ; Daniel et Soudant, 2011), qui sont rapportées dans l’annexe 1 de ce rapport. Sont également inclues dans ce document les...
Tipo: Text
Ano: 2011 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00069/18021/15553.pdf
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Suivi « hydrologie » et « phytoplancton » des masses d'eau du bassin hydrographique Adour-Garonne en 2006-2011 ArchiMer
Auby, Isabelle; D'Amico, Florence; Neaud-masson, Nadine; Rumebe, Myriam; Barbier, Claire; Duval, Magali; Tournaire, Marie-pierre; Trut, Gilles; Plus, Martin; Maurer, Daniele; Ryckaert, Mireille; Derrien, Annick; Margat, Sylvie; Schmitt, Anne; Charpentier, Gabriel; Seugnet, Jean-luc; Grizon, James; Geairon, Philippe; Guilpain, Patrice; Thomas, Gerard; Guesdon, Stephane; Llevot, Gerard; Beaugrand, Philippe; Carrere, Christian; Michel, Valerie; Petrau, Christian; Bariou, Jean; Landier, Pascal; Debinski, Olivier; Le Mao, André; Miguel, Valérie.
Ce rapport rend compte des résultats acquis entre 2006 et 2011 sur les paramètres hydrologiques et le phytoplancton, dans le cadre des réseaux REPHY et ARCHYD (pour les points du Bassin d’Arcachon), et celui du contrôle de surveillance des masses d'eau du district Adour-Garonne qui ne faisaient pas l’objet de suivi avant la mise en œuvre de la DCE. Ce document contient des résultats concernant les éléments de qualité physico-chimique (oxygène dissous pour les deux types de masses d’eau, température et transparence pour les masses d’eau côtières exclusivement) selon des méthodes présentées dans trois documents (Daniel, 2009 a et b ; Daniel et Soudant, 2011), qui sont rapportées dans une annexe de ce rapport. Sont également inclues dans ce document les...
Tipo: Text
Ano: 2012 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00111/22193/19862.pdf
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