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Nuclear DNA content in the subgenus Coffea (Rubiaceae) : inter and intra-specific variation in African species IRD
Cros, Joëlle; Combes, Marie-Christine; Chabrillange, Nathalie; Duperray, C.; Monnot des Angles, A.; Hamon, Serge.
La cytométrie en flux a été utilisée pour estimer la quantité d'ADN nucléaire chez 13 espèces de #Coffea$ (Rubiacea) originaires d'Afrique. Douze espèces diploïdes (#2n$=22) et l'espèce tétraploïde #C. arabica$ (#2n$=44) ont été analysées. Pour 77 génotypes, des populations de noyaux isolés ont été colorées par l'iodure de propidium (IP ; non spécifique des bases). Pour trente neuf génotypes, le 4',6-diamidino-2-phenylindole (DAPI; AT spécifique) a été également utilisé. Les quantités 2C d'ADN nucléaire, estimées avec l'IP, oscillent entre 0,95 et 1,78 pg. Trois groupes correspondant à des quantités croissantes d'ADN ont été mis en évidence. Les trois espèces #C. sessiliflora, C. racemosa$ et #C. pseudozanguebariae$ se classent dans le groupe des plus...
Tipo: Text Palavras-chave: AMELIORATION DES PLANTES; ADN; NOYAU; VARIABILITE; EVOLUTION; CYTOMETRIE EN FLUX; GENOME; VARIATION INTERSPECIFIQUE; VARIATION INTRASPECIFIQUE.
Ano: 1995 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:41767
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Reliable flow cytometric estimation of nuclear DNA content in coffee trees IRD
Barre, Philippe; Noirot, Michel; Louarn, Jacques; Duperray, C.; Hamon, Serge.
La cytométrie en flux a permis d'obtenir des mesures précises de la taille des génomes de deux taxons (#C. liberica dewevrei$ et #C. pseudozanguebariae$). L'iodure de propidium (IP) et le #Petunia hybrida$ ont été utilisés, respectivement, comme fluorochrome et standard interne. La linéarité de la relation entre la quantité d'ADN et le signal fluorescent digitalisé a été vérifiée. Cinq résultats majeurs ressortent : des conditions expérimentales optimales ont été définies pour l'estimation de la position des pics (moyenne et mode), le temps de coloration (au moins deux minutes), le voltage du photomultiplicateur (557 V) et de la concentration en IP (330 microg/ml) ; les effets du voltage et de la concentration en IP ont été paramétrés ; deux biais dus aux...
Tipo: Text Palavras-chave: BOTANIQUE; GENETIQUE; GENOTYPE; NOYAU CELLULAIRE; ADN; CYTOGENETIQUE; ANALYSE STATISTIQUE; CYTOTAXONOMIE.
Ano: 1996 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010006011
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Variations in the total nuclear DNA content in African Coffea species (Rubiaceae) IRD
Cros, Joëlle; Gavalda, Marie-Christine; Chabrillange, Nathalie; Récalt, Christine; Duperray, C.; Hamon, Serge.
La quantité d'ADN totale par noyau a été estimée pour soixante-quinze génotypes de #Coffea$ appartenant à seize espèces diploïdes (2n=22) et #C. arabica$ (tétraploïde 2n=44) par cytofluorométrie en flux. L'agent fluorochrome utilisé est l'iodure de propidium (intercalent). La valeur 2C du génome des caféiers varie de 0,9 pg d'ADN par noyau à 1,9 pg. Trois espèces, originaires d'Afrique de l'Est (#C. sessiliflora, C. racemosa$ et #C. pseudozanguebariae$) ont le plus petit génome (environ 1 pg par noyau). A l'opposé, trois espèces de forêt tropicale humide (#C. humilis, C.$ sp. Moloundou et #C. liberica$) correspondent aux valeurs les plus élevées (1,6 pg). L'espèce tétraploïde #C. arabica$, originaire d'Ethiopie, a un génome de 2,5 pg. Au sein des espèces...
Tipo: Text Palavras-chave: ADN; NOYAU CELLULAIRE; MESURE; ESPECE; DIPLOIDE; TETRAPLOIDE; POLYMORPHISME INTRASPECIFIQUE; ETUDE COMPARATIVE; GENOME; CYTOFLUOROMETRIE EN FLUX; VARIATION INTERSPECIFIQUE.
Ano: 1994 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:40073
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Variations in the total nuclear DNA content in African Coffea species (Rubiaceae) IRD
Cros, Joëlle; Gavalda, Marie-Christine; Chabrillange, Nathalie; Récalt, Christine; Duperray, C.; Hamon, Serge.
La quantité d'ADN par noyau a été estimée pour 75 génotypes de #Coffea$ appartenant à 16 espèces diploïdes (2n=22) et #C. arabica$ (tetraploide 2=44) par cytofluorométrie en flux. L'agent fluochrome utilisé est l'iodure de propidium (intercalent). La valeur 2-C du génome des caféiers oscille de 0,9 pg d'ADN par noyau à 1,9 pg. Trois espèces, originaires d'Afrique de l'Est (#C. sessiliflora, C. racemosa$ et #C. pseudozanguebariae$) ont le plus petit génome (environ 1 pg par noyau). A l'opposé 3 espèces de forêt tropicale humide (#C. humilis, C. sp$ Moloundou and #C. liberica$) correspondent aux valeurs les plus élevées (1.6). L'espèce tétraploide #C. arabica$, originaire d'Ethiopie, a 2.5 pg par noyau. Au sein des espèces diploides on note une importante...
Tipo: Text Palavras-chave: AMELIORATION DES PLANTES; ADN; NOYAU; VARIABILITE; METHODOLOGIE; FLUORESCENCE; ETUDE COMPARATIVE; CYTOMETRIE EN FLUX; ANGIOSPERME; GENOME.
Ano: 1993 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:39121
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