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Avanços e perspectivas no estudo das doenças virais e subvirais em videira com ênfase na realidade brasileira. Repositório Alice
BASSO, M. F.; FAJARDO, T. V. M.; PIO-RIBEIRO, G.; EIRAS, M.; ZERBINI, F. M..
A videira (Vitis spp.) é cultivada em praticamente todos os continentes e o intercâmbio de material de propagação vegetativa entre países tem contribuído para a disseminação de vírus e agentes subvirais. Até o presente, foram detectadas, em todo o mundo, cerca de 60 espécies de vírus e agentes subvírais nesta cultura, além de inínneras estirpes virais distintas. No Brasil já foram relatadas em videira pelo menos 13 espécies de vírus, dois viroides, um possível novo vírus de DNA circular e duas possíveis viroses, cujos agentes ainda não foram caracterizados. Embora nem todas essasviroses tenham importância econômica, de modo geral apresentam influência negativa no rendimento, qualidade e longevidade dos vinhedos. O uso de material propagativo livre de vírus...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Videira; Viticultura; Uva; Doenca de planta; Virus; Controle integrado; Material de propagacao.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/993440
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Caracterização molecular do gene da proteína capsidial do Prune dwarf virus. Repositório Alice
FAJARDO, T. V. M.; POPPE, J. K.; EIRAS, M.; NICKEL, O..
bitstream/item/194881/1/Caracterizacao-molecular-do-gene-da-proteina-capsidial-do-Prune-dwarf-virus..pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Vírus do nanismo; Protéina capsidial; Identificação genética; Ameixa; Doença de Planta; Fruticultura; Vírus.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/544101
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Caracterização molecular parcial de um isolado de Prunus necrotic ringspot virus de roseira. Repositório Alice
NASCIMENTO, M. B.; FAJARDO, T. V. M.; EIRAS, M.; NICKEL, O.; PIO-RIBEIRO, G..
O objetivo deste trabalho foi identificar o agente causal do mosaico da roseira e caracterizar um isolado de PNRSV de roseira.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Roseira; Prunus necrotic ringspot; Virus; Doença de planta; DNA.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/994026
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Caracterização molecular parcial do gene da proteína capsidial do Grapevine fanleaf virus. Repositório Alice
RADAELLI, P.; FAJARDO, T. V. M.; EIRAS, M.; KUHN, G. B.; PIO-RIBEIRO, G.; NICKEL, O..
bitstream/item/194604/1/CARACTERIZACAO-MOLECULAR-PARCIAL.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Caracterização molecular; Doença de Planta; Genética; Uva; Vírus; Viticultura; Grapevine fanleaf virus.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/542406
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Citrus exocortis viroid and Hop stunt viroid doubly infecting grapevines in Brazil. Repositório Alice
EIRAS, M.; TARGON, M. L. P. N.; FAJARDO, T. V. M.; FLORES, R.; KITAJIMA, E. W..
Viroids, non-protein-coding small (246-40 I nt) eircular single-stranded RNAs with autonornous replication, are currently classified into two farnilics. Within the farnily Pospiviroidae, Citrus exocortis viroid (CEVd) belongs to lhe genus Pospiviroid while Hop stunt viroid (HSVd) is the single rnembcr of the genus Hostuviroid. These pathogens are distributcd worldwide and infect a large nurnbcr of hosts. In Brazil, isolates of CEVd and HSVd have been detected in both citrus and grapevine. To characterize and study the genetic variability of thcse viroids, total RNA frorn leaves of grapevine Vitis vinifera 'Cabemet Sauvignon' and V Iabrusca 'Niagara Rosada' frorn Bento Gonçalves, RS, was used as a tcmplate for RTPCR amplification with specific primers for...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: CEVd; HSVd; Doença de Planta; Uva; Vírus; Viticultura; Hostuviroid; Pospiviroid; Pospiviroidae.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/541733
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Comparação de duas técnicas moleculares para detecção de vírus e viroide em videira: RT-qPCR e Hibridização com poliribossonda. Repositório Alice
MOURA, C. F. M. de; FAJARDO, T. V. M.; EIRAS, M..
RESUMO-Os vírus podem afetar tanto a qualidade quanto a quantidade da produção da videira. O objetivo deste trabalho foi comparar a detecção de vírus e viroide em videiras por meio de RT -qPCR e hibridização com poliribossonda. Em cerca de 86% dos casos, houve concordância entre os resultados obtidos com os dois métodos de indexação avaliados. Assim, demonstrou-se que as duas técnicas foram sensíveis e eficientes na detecção de infecções virais em videira, recaindo a opção pelo emprego de uma ou outra técnica em razão da finalidade da indexação.Palavras-chave: Vitis, sonda não-radioativa, indexação, RT-PCRem tempo real.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Viroide; Infecções virais; RT -qPCR; Vírus; Videira.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1071576
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Complexo do lenho rugoso da videira (Grapevine rupestris stem pitting-associated virus (GRSPaV), Grapevine virus A (GVA) e Grapevine virus B (GVB)). Infoteca-e
FAJARDO, T. V. M.; EIRAS, M..
2016
Tipo: Capítulo em livro técnico (INFOTECA-E) Palavras-chave: Vitis spp; Lenho rugoso (videira); Grapevine rupestris; Virus (GRSPaV)(videira); Grapevine virus A (GVA); Grapevine virus B (GVB); Grapevine rupestris stem pitting-associated virus (GRSPaV); Vitis vinifera; Vitis labrusca (Vitaceae) (videira); Grapevine rugose wood complex; Intumescimento dos ramos (videira); Caneluras do tronco de Rupestris (videira); Acanaladura do lenho de Kober (videira); Acanaladura do lenho de LN33 (videira); Cultura; Videira; Corky bark; Rupestris stem pitting; Kober stem grooving; LN33 stem grooving.
Ano: 2016 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1052558
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Desempenho agronômico de videiras com e sem sintomas de viroses, e comparação molecular de isolados virais. Repositório Alice
NASCIMENTO, M. B.; FAJARDO, T. V. M.; EIRAS, M.; CZERMAINSKI, A. B. C.; NICKEL, O.; PIO-RIBEIRO, G..
2015
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Vitis; Complexo do lenho rugoso; Enrolamento-da-folha; PCR em tempo real; Grapevine.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1021374
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Detecção e caracterização molecular do gene da proteína capsidial do Rupestris stem ptting-associated virus. Repositório Alice
RADAELLI, P.; FAJARDO, T. V. M.; EIRAS, M.; KUHN, G. B.; PIO-RIBEIRO, G.; NICKEL, O..
bitstream/item/194609/1/DETECCAO-E-CARACTERIZACAO.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Rupestris stem pitting-associated virus; Caracterização molecular; Doença de Planta; Genética; Uva; Vírus; Viticultura.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/542404
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Detecção e caracterização molecular dos genes da proteína capsidial de ilarvírus e ampelovírus que infectam fruteiras temperadas. Repositório Alice
FAJARDO, T. V. M.; NICKEL, O.; EIRAS, M..
Dentre os principais patógenos que incidem em fruteiras temperadas, destacam-se o Prune dwarf virus (PDV), o Apple mosaic virus (ApMV) e o Grapevine leafroll-associated virus 1 (GLRaV-1). Neste trabalho foram realizadas a detecção e a caracterização molecular dos genes da proteína capsidial de isolados destas três espécies virais. RNAs totais foram extraídos de amostras de folhas de pessegueiros, macieiras e videiras e, nas reações de RT-PCR, foram utilizados oligonucleotídeos específicos para cada espécie viral. Os cDNAs amplificados foram clonados e sequenciados. Foram verificadas altas identidades entre as sequências de nucleotídeos dos genes da proteína capsidial dos isolados brasileiros de PDV, ApMV e GLRaV-1 e isolados de outros países, independente...
Tipo: Nota Técnica/Nota Científica (ALICE) Palavras-chave: Proteína capsidial de ilarvírus; Proteína capsidial de ampelovírus; PDV; ApMV; GLRaV-1; Fruticultura; Uva; Maçã; Pêssego; Doença de planta; Vírus.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/874030
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Detecção e identificação molecular de vírus associados a videiras sintomáticas e assintomáticas. Repositório Alice
BASSO, M. F.; FAJARDO, T. V. M.; EIRAS, M.; AYUB, R. A.; NICKEL, O..
A propagação vegetativa da videira favorece infecções virais múltiplas, com expressão diferencial de sintomas em função da combinação da cultivar ou espécie da hospedeira com a espécie viral. Os objetivos deste trabalho foram detectar e identificar as espécies virais presentes em duas espécies/cultivares de videira: uma sintomática e outra assintomática. DsRNA de ambas as amostras foi submetido à RT-PCR com 17 pares de oligonucleotídeos específicos para a detecção de Grapevine virus A (GVA), Grapevine virus B (GVB), Grapevine virus D (GVD), Grapevine fleck virus (GFkV), Grapevine fanleaf virus (GFLV), Arabis mosaic virus (ArMV), Grapevine chrome mosaic virus (GCMV), Rupestris stem pitting-associated virus (RSPaV), Grapevine leafroll-associated virus 1 a 4...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Identificação; Diagnose; RSPaV; GLRaV-2; GLRaV-3; Variabilidade; Viticultura; Uva; Doença de planta; Vírus.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/871826
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Detecção por RT-PCR em Tempo Real e caracterização molecular do Grapevine virus D e Grapevine leafroll-associated virus 5 em videira. Repositório Alice
DUBIELA, C. R.; FAJARDO, T. V. M.; EIRAS, M.; REVERS, L. F.; SOUTO, E. R. de; NICKEL, O..
O objetivo deste trabalho foi verificar a ocorrência destes dois vírus em videiras por meio de RT-PCR em Tempo Real, além de caracterizar molecularmente três dos isolados obtidos.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Viticultura; Uva; Doença de planta; Vírus; Genética; Complexo do lenho rugoso; Enrolamento da folha da videira; Grapevine leafroll-associated virus 5; Grapevine virus D.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/908445
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Detection and coat protein gene characterization of grapevine virus B isolates from different grapevine species. Repositório Alice
CATARINO, A. M.; FAJARDO, T. V. M.; EIRAS, M.; PIO-RIBEIRO, G.; NICKEL, O..
2013
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Capa protéica; Detecção; Caracterização; Gene; Viticultura; Uva; Doença de planta; Vírus.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/978756
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Detection and molecular characterization of Grapevine yellow speckle viroid 1 isolates infecting grapevines in Brazil. Repositório Alice
FAJARDO, T. V. M.; EIRAS, M.; NICKEL, O..
Abstract Presently, Hop stunt viroid(HSVd) and Citrus exocortis viroid (CEVd) are the only viroids reported to infect grapevines (Vitis spp.) in Brazil, among the seven viroid species already reported infecting this host in other countries. All grapevine viroid diseases are graft-transmissible and can induce losses especiallywhenassociatedwithviruses.Theaimofthisworkwas to confirm infection by Grapevine yellow speckle viroid 1(GYSVd-1) in grapevine samples exhibiting yellow speckle symptoms in the leaves and in asymptomatic samples sequenced by next generation sequencing (NGS). The occurrence of this viroid in Brazil was further investigated in a second study. Total RNAs and dsRNAs were extracted from five symptomatic plants and 16 asymptomatic samples,...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Next generation; Secondary structure; GYSVd-1; Vinho; Incidence; Vine; Hop stunt viroid; Citrus exocortis viroid.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1051941
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Detection and partial molecular characterization of Grapevine fleck virus, Grapevine virus D, Grapevine leafroll-associated virus -5 and -6 infecting grapevines in Brazil. Repositório Alice
FAJARDO, T. V. M.; EIRAS, M.; NICKEL, O.; DUBIELA, C. R.; SOUTO, E. R..
2012
Tipo: Nota Técnica/Nota Científica (ALICE) Palavras-chave: Diagnóstico; Sequenciamento genético; Maculavirus; Vitivirus; Ampelovirus; Detecção; Caracterização; Brasil; Viticultura; Uva; Doença de planta; Vírus.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/941752
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Detection and partial molecular characterization of isolates of Grapevine leafroll-associated virus 4 and Grapevine rupestris vein feathering virus. Repositório Alice
CATARINO, A. D. M.; FAJARDO, T. V. M.; EIRAS, M.; RIBEIRO, G. P..
2013
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Caracterização molecular parcial de isolados; Grapevine leafroll-associated virus 4; Grapevine rupestris vein feathering virus; Viticultura; Uva; Doença de planta; Vírus.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/979484
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Detection of three Allexivirus species infecting garlic in Brazil. Repositório Alice
MELO FILHO, P. de A.; NAGATA, T.; DUSI, A.N.; BUSO, J.A.; TORRES, A.C.; EIRAS, M.; RESENDE, R. de O..
Garlic viruses often occur in mixed infections under field conditions. In this study, garlic samples collected in three geographical areas of Brazil were tested by Dot-ELISA for the detection of allexiviruses using monoclonal specific antibodies to detect Garlic virus A (GarV-A), Garlic virus B (GarV-B), Garlic virus C (GarV-C) and a polyclonal antiserum able to detect the three virus species mentioned plus Garlic virus D (GarV-D). The detected viruses were biologically isolated by successive passages through Chenopodium quinoa. Reverse Transcriptase Polimerase Chain Reaction (RT-PCR) was performed using primers designed from specific regions of the coat protein genes of Japanese allexiviruses available in the Genetic Bank of National Center of...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Allium sativum; Virus detection; Coat protein; Dot-ELISA; RT-PCR; Detecção de vírus; Proteínas capsidiais.
Ano: 2004 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/112506
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Enrolamento da folha da videira (Grapevine leafroll-associated virus 3). Infoteca-e
EIRAS, M.; FAJARDO, T. V. M..
2016
Tipo: Capítulo em livro técnico (INFOTECA-E) Palavras-chave: Vitis vinifera; Folha da videira; Enrolamento da folha da videira; Videira; Virus; Doenca de planta.
Ano: 2016 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1059489
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First report of Hop stunt viroid infecting Vitis gigas, V. flexuosa and Ampelopsis heterophylla. Repositório Alice
FAJARDO, T. V. M.; EIRAS, M.; NICKEL, O..
Hop stunt viroid (HSVd) is one of the most common viroids that infect grapevine ( Vitis spp.) worldwide. Sixteen sequences of the HSVd genome were obtained from infected grapevines in Brazil by next generation sequencing (NGS). Multiple alignments of the sequences showed nucleotide identities ranging from 94.6% to 100%. This is the first report of HSVd infecting two wild grape species and Ampelopsis heterophylla . These HSVd isolates along with others from V. vinifera and V. labrusca were phylogenetically analyzed. Keywords: Next generation sequencing . HSVd . Incidence . Genetic variability . Vitis
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Next generation sequencing; HSVd; Grapevine; Genetic variability; Vitis Labrusca; Vitis Vinifera; Incidence; Vitis; Hop stunt viroid; Viroids; Brazil.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1088430
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Grapevine fleck virus: detecção via RT-PCR em tempo real e caracterização molecular do gene da proteína capsidial. Repositório Alice
FAJARDO, T. V. M.; DUBIELA, C. R.; EIRAS, M.; SOUTO, E. R.; NICKEL, O..
2011
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Detecção de vírus; Mancha das nervuras; Caracterização molecular; Proteína capsidial; Gene; Viticultura; Uva; Doença de planta; Vírus; Genética.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/898419
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