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Evidence for reductive genome evolution and lateral acquisition of virulence functions in two Corynebacterium pseudotuberculosis strains. Repositório Alice
RUIZ, J. C.; D'AFONSECA, V.; SILVA, A.; ALI, A.; PINTO, A. C.; SANTOS, A. R.; ROCHA, A. A. M. C.; LOPES, D. O.; DORELLA, F. A.; PACHECO, L. G. C.; COSTA, M. P.; TURK, M. Z.; SEYFFERT, N.; MORAES, P. M. R. O.; SOARES, S. C.; ALMEIDA, S. S.; CASTRO, T. L. P.; ABREU, V. A. C.; TROST, E.; BAUMBACH, J.; TAUCH, A.; SCHNEIDER, M. P. C.; McCULLOCH, J.; CERDEIRA, L. T.; RAMOS, R. T. J.; ZERLOTINI, A.; DOMINITINI, A.; RESENDE, D. M.; COSER, E. M.; OLIVEIRA, L. M.; PEDROSA, A. L.; VIEIRA, C. U.; GUIMARAES, C. T.; BARTHOLOMEU, D. C.; OLIVEIRA, D. M.; SANTOS, F. R.; RABELO, E. M.; LOBO, F. P.; FRANCO, G. R.; COSTA, A. F.; CASTRO, I. M.; DIAS, S. R. C.; FERRO, J. A.; ORTEGA, J. M.; PAIVA, L. V.; ALMEIDA, J. F.; GOULART, L. R.; FERRO, M. I. T.; CARNEIRO, N. P.; FALCÃO, P. R. K.; GRYNBERG, P.; TEIXEIRA, S. M. R.; BROMMONSCHENKEL, S.; OLIVEIRA, S. C.; MEYER, R.; MOORE, R. J.; MIYOSHI, A.; OLIVEIRA, G. C.; AZEVEDO, V..
Background: Corynebacterium pseudotuberculosis, a Gram-positive, facultative intracellular pathogen, is the etiologic agent of the disease known as caseous lymphadenitis (CL). CL mainly affects small ruminants, such as goats and sheep; it also causes infections in humans, though rarely. This species is distributed worldwide, but it has the most serious economic impact in Oceania, Africa and South America. Although C. pseudotuberculosis causes major health and productivity problems for livestock, little is known about the molecular basis of its pathogenicity. Methodology and Findings: We characterized two C. pseudotuberculosis genomes (Cp1002, isolated from goats; and CpC231, isolated from sheep). Analysis of the predicted genomes showed high similarity in...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Patógeno; Genética; Genome.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/906799
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Evidence for reductive genome evolution and lateral acquisition of virulence functions in two Corynebacterium pseudotuberculosis strains. Repositório Alice
RUIZ, J. C.; D'AFONSECA, V.; SILVA, A.; ALI, A.; PINTO, A. C.; SANTOS, A. R.; ROCHA, A. A. M. C.; LOPES, D. O.; DORELLA, F. A.; PACHECO, L. G. C.; COSTA, M. P.; TURK, M. Z.; SEYFFERT, N.; MORAES, P. M. R. O.; SOARES, S. C.; ALMEIDA, S. S.; CASTRO, T. L. P.; ABREU, V. A. C.; TROST, E.; BAUMBACH, J.; TAUCH, A.; SCHNEIDER, M. P. C.; McCULLOCH, J.; CERDEIRA, L. T.; RAMOS, R. T. J.; ZERLOTINI, A.; DOMINITINI, A.; RESENDE, D. M.; COSER, E. M.; OLIVEIRA, L. M.; PEDROSA, A. L.; VIEIRA, C. U.; GUIMARÃES, C. T.; BARTHOLOMEU, D. C.; OLIVEIRA, D. M.; SANTOS, F. R.; RABELO, É. M.; LOBO, F. P.; FRANCO, G. R.; COSTA, A. F.; CASTRO, I. M.; DIAS, S. R. C.; FERRO, J. A.; ORTEGA, J. M.; PAIVA, L. V.; GOULART, L. R.; ALMEIDA, J. F.; FERRO, M. I. T.; CARNEIRO, N. P.; FALCÃO, P. R. K.; GRYNBERG, P.; TEIXEIRA, S. M. R.; BROMMONSCHENKEL, S.; OLIVEIRA, S. C.; MEYER, R.; MOORE, R. J.; MIYOSHI, A.; OLIVEIRA, G. C.; AZEVEDO, V..
Background: Corynebacterium pseudotuberculosis, a Gram-positive, facultative intracellular pathogen, is the etiologic agent of the disease known as caseous lymphadenitis (CL). CL mainly affects small ruminants, such as goats and sheep; it also causes infections in humans, though rarely. This species is distributed worldwide, but it has the most serious economic impact in Oceania, Africa and South America. Although C. pseudotuberculosis causes major health and productivity problems for livestock, little is known about the molecular basis of its pathogenicity. Methodology and Findings: We characterized two C. pseudotuberculosis genomes (Cp1002, isolated from goats; and CpC231, isolated from sheep). Analysis of the predicted genomes showed high similarity in...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Genoma de C pseudotuberculosis; Análise de genoma; Ilhas de patogenicidade; Corynebacterium Pseudotuberculosis; Caseous lymphadenitis; Pathogenicity.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/914696
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Gene expression in the salivary gland of Rhipicephalus (Boophilus) microplus fed on tick-susceptible and tick-resistant hosts. Repositório Alice
GIACHETTO, P. F.; CUNHA, R. C.; NHANI JUNIOR, A.; GARCIA, M. V.; FERRO, J. A.; ANDREOTTI, R..
The success of cattle tick fixation largely depends on the secretion of substances that alter the immune response of the host. The majority of these substances are expressed by the parasite salivary gland and secreted in tick saliva. It is known that hosts can mount immune responses against ticks and bovine European breeds, and bovine industrial crossbreeds are more susceptible to infestations than are Bos indicus cattle. To identify candidates for the development of novel control strategies for the cattle tick Rhipicephalus (Boophilus) microplus, a salivary gland transcriptome analysis of engorged females fed on susceptible or resistant hosts was performed. Using RNA-Seq, transcriptomes were de novo assembled and produced a total of 235,451 contigs with...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Bioinformática; Expressão gênica; RNA-Seq; Cattle tick; Host-parasite interaction; Gado de Corte; Carrapato; Sialome; Transcriptome; Cattle; Bioinformatics; Rhipicephalus microplus.
Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1124241
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Gene Expression in the Salivary Gland of Rhipicephalus (Boophilus) microplus Fed on Tick-Susceptible and Tick-Resistant Hosts. Repositório Alice
GIACHETTO, P. F.; CUNHA, R. C.; NHANI JUNIOR, A.; GARCIA, M. V.; FERRO, J. A.; ANDREOTTI, R..
The success of cattle tick fixation largely depends on the secretion of substances that alter the immune response of the host. The majority of these substances are expressed by the parasite salivary gland and secreted in tick saliva. It is known that hosts can mount immune responses against ticks and bovine European breeds, and bovine industrial crossbreeds are more susceptible to infestations than are Bos indicus cattle. To identify candidates for the development of novel control strategies for the cattle tick Rhipicephalus (Boophilus) microplus, a salivary gland transcriptome analysis of engorged females fed on susceptible or resistant hosts was performed. Using RNA-Seq, transcriptomes were de novo assembled and produced a total of 235,451 contigs with...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: RNA-Seq; Cattle tick; Host-parasite interaction; Sialome; Transcriptome; Cattle.
Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1119455
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Sugarcane genes differentially expressed during water deficit. Repositório Alice
RODRIGUES, F. A.; GRAÇA, J. P. da; LAIA, M. L. de; NHANI JUNIOR, A.; GALBIATI, J. A.; FERRO, M. I. T.; FERRO, J. A.; ZINGARETTI, S. M..
2011
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Drought; Induced genes; Macroarray; Repressed genes; Saccharum sp; Transcriptone.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/882945
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Sugarcane (Saccharum X officinarum): a reference study for the regulation of genetically modified cultivars in Brazil. Repositório Alice
CHEAVEGATTI VIANOTTO, A.; ABREU, H. M. C. de; ARRUDA, P.; BESPALHOK FILHO, J. C.; BURNQUIST, W. L.; CRESTE, S.; CIERO, L. di; FERRO, J. A.; FIGUEIRA, A. V. de O.; FIULGUEIRAS, T. de S.; SA, M. F. G. de; GUZZO, E. C.; HOFFMANN, H. P.; LANDELL, M. G. de A.; MACEDO, N.; MATSUOKA, S.; REINACH, F. de C.; PINTO, E. R. de C.; SILVA, W. J. da; SILVA FILHO, M. de C.; ULIAN, E. C..
bitstream/item/183558/1/12042-2011-Article-9068.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Cana-de-açúcar; Artigo em periódico; Sugarcane.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/916699
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The Genome of Anopheles darlingi, the main neotropical malaria vector. Repositório Alice
MARINOTTI, O.; CERQUEIRA, G. C.; ALMEIDA, L. G. P. de; FERRO, M. I. T.; LORETO, E. L. da S.; ZAHA, A.; TEIXEIRA, S. M. R.; WESPISER, A. R.; SILVA, A. A.; SCHLINDWEIN, A. D.; PACHECO, A. C. L.; SILVA, A. L. da C.; GRAVELEY, B. R.; WALENZ, B. P.; LIMA, B. de A.; RIBEIRAO, C. A. G.; NUNES-SILVA, C. G.; CARVALHO, C. R. de; SOARES, C. M. de A.; MENEZES, C. B. A. de; MATIOLLI, C.; CAFFREY, D.; ARAÚJO, D. A. M.; OLIVEIRA, D. M. de; GOLENBOCK, D.; GRISARD, E. C.; FANTINATTI-GARBOGGINI, F.; CARVALHO, F. M. de; BARCELLOS, F. G.; PROSDOCIMI, F.; MAY, G.; AZEVEDO JUNIOR, G. M. de; GUIMARÃES, G. M.; OLDMAN, G. H.; PADILHA, I. Q. M.; BATISTA, J. da S.; FERRO, J. A.; RIBEIRO, J. M. C.; FIETTO, J. L. R.; DABBAS, K. M.; CERDEIRA, L.; AGNEZ-LIMA, L. F.; BROCCHI, M.; CARVALHO, M. O. de; TEIXEIRA, M. de M.; MAIA, M. de M. D.; GOLDMAN, M. H. S.; SCHNEIDER, M. P. C.; FELIPE, M. S. S.; HUNGRIA, M.; NICOLÁS, M. F.; PEREIRA, M.; MONTES, A. M.; CANTAO, M. E.; VINCENTZ, M.; RAFAEL, M. S.; SILVERMAN, N.; STOCO, P. H.; SOUZA, R. C.; VICENTINI, R.; GAZZINELLI, R. T. G.; NEVES, R. de O.; SILVA, R.; ASTOLFI-FILHO, S.; MACIEL, T. E. F.; ÜRMÉNYI, T. P.; TADEI, W. P.; CAMARGO, E. P.; VASCONCELOS, A. T. R. de.
Anopheles darlingi is the principal neotropical malaria vector, responsible for more than a million cases of malaria per year on the American continent. Anopheles darlingi diverged from the African and Asian malaria vectors 100 million years ago (mya) and successfully adapted to the New World environment. Here we present an annotated reference A. darlingi genome, sequenced from a wild population of males and females collected in the Brazilian Amazon. A total of 10 481 predicted protein-coding genes were annotated, 72% of which have their closest counterpart in Anopheles gambiae and 21% have highest similarity with other mosquito species. In spite of a long period of divergent evolution, conserved gene synteny was observed between A. darlingi and A....
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Genoma; Genome.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/960215
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