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A bioinformática na pesquisa de microrganismos. Infoteca-e
FORMIGHIERI, E. F..
2012
Tipo: Artigo de divulgação na mídia (INFOTECA-E) Palavras-chave: Embrapa; Laboratório Multiusuário de Bioinformática; Laboratório de Bioinformática em Bioenergia; Estudos de microrganismos; Embrapa Agroenergia.
Ano: 2012 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/955049
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Biodiversity bioprospecting for xylitol production: selection, physiological and genetic characterization of new yeast strains. Repositório Alice
TRICHEZ, D.; CARNEIRO, C. V. G. C.; SOARES, C. E. V. F.; STEINDORFF, A. S.; FORMIGHIERI, E. F.; ALMEIDA, J. R. M. de.
bitstream/item/170444/1/ISSY-JA.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Biodiversidade; Produção de xilitol.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1084425
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Bioenergy Metabolomics DB. Repositório Alice
SOUZA, M. S.; SOARES, V. de A.; BRITO, L. S. de.; ABDELNUR, P. V.; FORMIGHIERI, E. F..
2016
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Bioenergy Metabolomics DB; Estágio atual; Desenvolvimento; Funcionalidades planejadas.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1057107
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Bioinformática e anotação de genes em Xanthomonas axonopodis pv. citri e Xylella fastidiosa: metabolismo de ferro e biossíntese de pequenas moléculas. Repositório Alice
FORMIGHIERI, E. F..
2011
Tipo: Tese/dissertação (ALICE) Palavras-chave: Biologia molecular; Genomas; Sequência de aminoácidos; Sequenciamento.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/891185
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Bioinformatics and physic nut. Repositório Alice
RODRIQUES, E; LIMA, R. S.; LAVIOLA, B. G.; FORMIGHIERI, E. F..
2012
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Bioinformatics; Brjatropha; Physic nut.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/937609
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Brazilian coffee genome project: an EST-based genomic resource. Repositório Alice
VIEIRA, L. G. E.; ANDRADE, A. C.; COLOMBO, C. A.; MORAES, A. H. de A.; METHA, A.; OLIVEIRA, A. C. de; LABATE, C. A.; MARINO, C. L.; MONTEIRO-VITORELLO, C. de B.; MONTE, D. C.; GIGLIOTI, E.; KIMURA, E. T.; ROMANO, E.; KURAMAE, E. E.; LEMOS, E. G. M.; ALMEIDA, E. R. P. de; JORGE, E. C.; ALBUQUERQUE, E. V. S.; SILVA, F. R. da; VINECKY, F.; SAWAZAKI, H. E.; DORRY, H. F. A.; CARRER, H.; ABREU, I. N.; BATISTA, J. A. N.; TEIXEIRA, J. B.; KITAJIMA, J. P.; XAVIER, K. G.; LIMA, L. M. de; CAMARGO, L. E. A. de; PEREIRA, L. F. P.; COUTINHO, L. L.; LEMOS, M. V. F.; ROMANO, M. R.; MACHADO, M. A.; COSTA, M. M. do C.; SÁ, M. F. G. de; GOLDMAN, M. H. S.; FERRO, M. I. T.; TINOCO, M. L. P.; OLIVEIRA, M. C.; VAN SLUYS, M-A.; SHIMIZU, M. M.; MALUF, M. P.; EIRA, M. T. S. da; GUERREIRO FILHO, O.; ARRUDA, P.; MAZZAFERA, P.; MARIANI, P. D. S. C.; OLIVEIRA, R. L. B. C. de; HARAKAVA, R.; BALBAO, S. F.; TSAI, S. M.; MAURO, S. M. Z. di; SANTOS, S. N.; SIQUEIRA, W. J.; COSTA, G. G. L.; FORMIGHIERI, E. F.; CARAZZOLLE, M. F.; PEREIRA, G. A. G..
bitstream/item/177955/1/ID-26742-1.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Projeto genoma; Brasil; Café.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/187149
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Divergence of DNA methylation and gene expression in Setaria viridis accessions under drought stress. Repositório Alice
SANTIAGO, T. R.; DUARTE, K. E.; SOUZA, W. R. de; STEINDORFF, A. S.; FORMIGHIERI, E. F.; KOBAYASHI, A. K.; MOLINARI, H. B. C..
bitstream/item/184332/1/EnPI-2018-20.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Methylomes; TE menthylation; Whole genome bisulphite sequencing; Differential methylation.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1097377
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Elaeis oleifera genome draft - genomics of american oil palm. Repositório Alice
LIMA, R. S.; LOBO, F. P.; CARAZZOLLE, M. F.; COSTA, G. G. L.; RODRIGUES, E. L. de C.; ALVES, A. A.; YAMAGISHI, M. E. B.; SOUZA JUNIOR, M. T.; FORMIGHIERI, E. F..
In that scenario, Embrapa Agroenergy is making efforts to improve bioenergy generation and accelerate selection of superior genotypes, through NGS and large-scale genotyping technologies. Some colleagues have already estimated of Elaeis species genome size using flow cytometry, and in parallel, we sequenced one lane of Illumina HiSeq 2000 for three E. oleifera and one E. guineensis accessions, for initial comparison.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Genoma de palmeira; Elaeis guineensis; Óleo de palma; Palm oils; Genomics.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/946637
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Embrapa agrienergy and bioinformatics. Repositório Alice
LIMA, R. S.; FORMIGHIERI, E. F.; SOUZA JUNIOR, M. T..
2011
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Bioinformática.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/918427
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Embrapa Agrienergy oil palm research platform focuses in developing biotechnology and bioinformatics to assist breeding. Repositório Alice
FORMIGHIERI, E. F.; LIMA, R. S.; ALVES, A. A.; CAPDEVILLE, G. de; SOUZA JUNIOR, M. T..
2011
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Bioinformática.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/918432
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Estabelecimento de coleção nuclear da Palma de Óleo Americana [Elaeis oleifera (Kunth) Cortés]. Repositório Alice
FERREIRA FILHO, J. A.; LEAO, A. P.; CUNHA, R. N. V. da; FORMIGHIERI, E. F.; ALVES, A. A.; SOUZA JUNIOR, M. T..
bitstream/item/186153/1/Eposter-605-CBRG2018-Ferreira-Filho-et-al.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Palma de óleo americana.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1099507
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Exploring American Oil Palm (Elaeis oleifera) genetic resources in Brazil through a combination of genetic and genomic approaches. Repositório Alice
ALVES, A. A.; FORMIGHIERI, E. F.; LEAO, A. P.; LOBO, F. P.; RIOS, S. A.; CAPDEVILLE, G. de; SOUZA JUNIOR, M. T..
We started a project to explore American Oil Palm genetic resources through a combination of genetic and genomic approaches.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Óleo de palma; Recursos genéticos; Sequenciamento de genoma; Elaeis guineensis; Genetic resources; Genome.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1008610
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Genoma de Moniliophthora perniciosa: montagem e anotação da mitocôndria e desenvolvimento de sistema de anotação semi-automática de genes. Repositório Alice
FORMIGHIERI, E. F..
2006
Tipo: Tese/dissertação (ALICE) Palavras-chave: Genoma; Miticôndria; Bioinformática; Vassoura-de-bruxa.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/891107
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Genome sequencing of thermofilic fungus Humicola grisea var. thermoidea and effect of pH in sugarcane biomass transformation. Repositório Alice
STEINDORFF, A. S.; FORMIGHIERI, E. F.; FARIA, F. P. de.; POÇAS-FONSECA, M. J.; ALMEIDA, J. R. M. de.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Humicola grisea; Transcriptome; Genome sequencing; Sugarcane bagasse pH.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1075990
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Genomic and mitochondrial assembly of xylose-fermenting yeasts from Debaryomycetaceae family. Repositório Alice
STEINDORFF, A. S.; SOUZA, M. S.; ALMEIDA, J. R. M. de; FORMIGHIERI, E. F..
2016
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Projecto genético; Leveduras; Debaryomycetaceae; Genomas mitocondriais.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1056939
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Highly efficient pipeline to perform integrated analysis of transposable elements and tandem repeats in complex genomes. Repositório Alice
BRITO, L. S. de.; FERREIRA FILHO, J. A.; SOUZA, M. S.; FORMIGHIERI, E. F..
2016
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Pipeline; Transposable elements; Microsatellites; Bioinformatics; Perl; Elementos transponíveis; Microsatélites; Bioinformática.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1057082
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Insights into soybean transcriptome reconfiguration under hypoxic stress: Functional, regulatory, structural, and compositional characterization. Repositório Alice
NAKAYAMA, T. J.; RODRIGUES, F. A.; NEUMAIER, N.; GOMES, J. M.; MOLINARI, H. B. C.; SANTIAGO, T. R.; FORMIGHIERI, E. F.; BASSO, M. F.; FARIAS, J. R. B.; EMYGDIO, B. M.; OLIVEIRA, A. C. B. de; CAMPOS, A. D.; BORÉM, A.; HARMON, F. G.; MERTZ-HENNING, L. M.; NEPOMUCENO, A. L..
Soybean (Glycine max) is one of the major crops worldwide and flooding stress affects the production and expansion of cultivated areas. Oxygen is essential for mitochondrial aerobic respiration to supply the energy demand of plant cells. Because oxygen diffusion in water is 10,000 times lower than in air, partial (hypoxic) or total (anoxic) oxygen deficiency is important component of flooding. Even when oxygen is externally available, oxygen deficiency frequently occurs in bulky, dense or metabolically active tissues such as phloem, meristems, seeds, and fruits. In this study, we analyzed conserved and divergent root transcriptional responses between flood-tolerant Embrapa 45 and flood-sensitive BR 4 soybean cultivars under hypoxic stress conditions with...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Soja.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1082111
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Molecular characterization and genetic structure of american oil palm (Elaeis oleifera) based on genome-wide SNP markers. Repositório Alice
PEREIRA, V. M.; FILHO, J. A. F.; LEAO, A. P.; FORMIGHIERI, E. F.; SOUZA JUNIOR, M. T.; RIOS, S. de A.; ALVES, A. A..
2015
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Elaeis oleifera; American oil palm; SNP markers; Molecular characterization; Genetic structure.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1031520
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O Programa de PD&I em Ômica de Palma de Óleo (Elaeis spp.) na Embrapa Agroenergia. Infoteca-e
SOUZA JUNIOR, M. T.; ALVES, A. A.; SOUSA, C. A. F. de.; SIQUEIRA, F. G. de; SIQUEIRA, F. G. de; FORMIGHIERI, E. F.; CAPDEVILLE, G. de; ABDELNUR, P. V.; MENDONCA, S..
bitstream/item/173812/1/DOC-28-CNPAE.pdf
Tipo: Documentos (INFOTECA-E) Palavras-chave: Palma de óleo; Ômica.
Ano: 2017 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1085341
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Pinhão-manso na Embrapa Agroenergia. Infoteca-e
LAVIOLA, B. G.; ALVES, A. A.; KOBAYASHI, A. K.; FORMIGHIERI, E. F..
2015
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E) Palavras-chave: Pinhão-manso; Cultura; Torta.
Ano: 2015 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1014162
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