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Draft genome sequence of the D-xylose-fermenting yeast Spathaspora arborariae UFMG-HM19.1AT. Repositório Alice
LOBO, F. P.; GONÇALVES, D. L.; ALVES JÚNIOR, S. L.; GERBER, A. L.; VASCONCELOS, A. T. R. de; BASSO, L. C.; FRANCO, G. R.; SOARES, M. A.; CADETE, R. M.; ROSA, C. A.; STAMBUK, B. U..
The draft genome sequence of the yeast Spathaspora arborariae UFMG-HM19.1AT (CBS 11463 = NRRL Y-48658) is presented here. The sequenced genome size is 12.7 Mb, consisting of 41 scaffolds containing a total of 5,625 predicted open reading frames, including many genes encoding enzymes and transporters involved in D-xylose fermentation.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Sequência genômica; Genome.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1008143
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Draft genome sequencing of the Yeast Spathaspora arborariae sp. Repositório Alice
SANTOS, E. de M.; FRANCO, G. R.; STAMBUK, B. J. C. U.; ROSA, C. A.; LOBO, F. P..
This work provides the description of a draft genome of S. arborariae.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Sequência de genoma; Yeast Spathaspora arborariae sp.; Sequence analysis; Yeasts; Genomics.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/946642
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Evidence for reductive genome evolution and lateral acquisition of virulence functions in two Corynebacterium pseudotuberculosis strains. Repositório Alice
RUIZ, J. C.; D'AFONSECA, V.; SILVA, A.; ALI, A.; PINTO, A. C.; SANTOS, A. R.; ROCHA, A. A. M. C.; LOPES, D. O.; DORELLA, F. A.; PACHECO, L. G. C.; COSTA, M. P.; TURK, M. Z.; SEYFFERT, N.; MORAES, P. M. R. O.; SOARES, S. C.; ALMEIDA, S. S.; CASTRO, T. L. P.; ABREU, V. A. C.; TROST, E.; BAUMBACH, J.; TAUCH, A.; SCHNEIDER, M. P. C.; McCULLOCH, J.; CERDEIRA, L. T.; RAMOS, R. T. J.; ZERLOTINI, A.; DOMINITINI, A.; RESENDE, D. M.; COSER, E. M.; OLIVEIRA, L. M.; PEDROSA, A. L.; VIEIRA, C. U.; GUIMARAES, C. T.; BARTHOLOMEU, D. C.; OLIVEIRA, D. M.; SANTOS, F. R.; RABELO, E. M.; LOBO, F. P.; FRANCO, G. R.; COSTA, A. F.; CASTRO, I. M.; DIAS, S. R. C.; FERRO, J. A.; ORTEGA, J. M.; PAIVA, L. V.; ALMEIDA, J. F.; GOULART, L. R.; FERRO, M. I. T.; CARNEIRO, N. P.; FALCÃO, P. R. K.; GRYNBERG, P.; TEIXEIRA, S. M. R.; BROMMONSCHENKEL, S.; OLIVEIRA, S. C.; MEYER, R.; MOORE, R. J.; MIYOSHI, A.; OLIVEIRA, G. C.; AZEVEDO, V..
Background: Corynebacterium pseudotuberculosis, a Gram-positive, facultative intracellular pathogen, is the etiologic agent of the disease known as caseous lymphadenitis (CL). CL mainly affects small ruminants, such as goats and sheep; it also causes infections in humans, though rarely. This species is distributed worldwide, but it has the most serious economic impact in Oceania, Africa and South America. Although C. pseudotuberculosis causes major health and productivity problems for livestock, little is known about the molecular basis of its pathogenicity. Methodology and Findings: We characterized two C. pseudotuberculosis genomes (Cp1002, isolated from goats; and CpC231, isolated from sheep). Analysis of the predicted genomes showed high similarity in...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Patógeno; Genética; Genome.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/906799
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Evidence for reductive genome evolution and lateral acquisition of virulence functions in two Corynebacterium pseudotuberculosis strains. Repositório Alice
RUIZ, J. C.; D'AFONSECA, V.; SILVA, A.; ALI, A.; PINTO, A. C.; SANTOS, A. R.; ROCHA, A. A. M. C.; LOPES, D. O.; DORELLA, F. A.; PACHECO, L. G. C.; COSTA, M. P.; TURK, M. Z.; SEYFFERT, N.; MORAES, P. M. R. O.; SOARES, S. C.; ALMEIDA, S. S.; CASTRO, T. L. P.; ABREU, V. A. C.; TROST, E.; BAUMBACH, J.; TAUCH, A.; SCHNEIDER, M. P. C.; McCULLOCH, J.; CERDEIRA, L. T.; RAMOS, R. T. J.; ZERLOTINI, A.; DOMINITINI, A.; RESENDE, D. M.; COSER, E. M.; OLIVEIRA, L. M.; PEDROSA, A. L.; VIEIRA, C. U.; GUIMARÃES, C. T.; BARTHOLOMEU, D. C.; OLIVEIRA, D. M.; SANTOS, F. R.; RABELO, É. M.; LOBO, F. P.; FRANCO, G. R.; COSTA, A. F.; CASTRO, I. M.; DIAS, S. R. C.; FERRO, J. A.; ORTEGA, J. M.; PAIVA, L. V.; GOULART, L. R.; ALMEIDA, J. F.; FERRO, M. I. T.; CARNEIRO, N. P.; FALCÃO, P. R. K.; GRYNBERG, P.; TEIXEIRA, S. M. R.; BROMMONSCHENKEL, S.; OLIVEIRA, S. C.; MEYER, R.; MOORE, R. J.; MIYOSHI, A.; OLIVEIRA, G. C.; AZEVEDO, V..
Background: Corynebacterium pseudotuberculosis, a Gram-positive, facultative intracellular pathogen, is the etiologic agent of the disease known as caseous lymphadenitis (CL). CL mainly affects small ruminants, such as goats and sheep; it also causes infections in humans, though rarely. This species is distributed worldwide, but it has the most serious economic impact in Oceania, Africa and South America. Although C. pseudotuberculosis causes major health and productivity problems for livestock, little is known about the molecular basis of its pathogenicity. Methodology and Findings: We characterized two C. pseudotuberculosis genomes (Cp1002, isolated from goats; and CpC231, isolated from sheep). Analysis of the predicted genomes showed high similarity in...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Genoma de C pseudotuberculosis; Análise de genoma; Ilhas de patogenicidade; Corynebacterium Pseudotuberculosis; Caseous lymphadenitis; Pathogenicity.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/914696
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Identificação de genes diferencialmente expressos nas folhas de uma linhagem de milho (Zea mays) resistente à seca em resposta ao déficit hídrico. Repositório Alice
DELAAT, D. M.; CARNEIRO, N. P.; GUIMARAES, C. T.; OLIVEIRA, G. C.; FRANCO, G. R..
2009
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: DNA; Estresse hídrico; Milho.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/514050
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Molecular studies of the brazilian infectious bronchitis virus isolates. Repositório Alice
ABREU, J. T.; MOURÃO, M. M.; SANTOS, C. E.; VELOSO, C. J. M.; RESENDE, J. S.; FLATSCHART, R. B.; FOLGUERAS-FLATSCHAR, A. V.; JUNIOR, S. N.; SANTORO, M. M.; MENDES, A. C. R.; FRANCO, G. R.; SILVA, A.; CAMPOS, A. B.; FERNANDEZ, S..
Avian infectious bronchitis virus (IBV) isolates have been widely characterized by reverse transcription followed by polymerase chain reaction and DNA sequencing. In present study, these techniques were applied to three viral genomic regions comprising the complete and/or a partial S1 segment, S2 and nucleocapsid genes. DNA sequences from viral isolates obtained from 1972 to 1989 and from 2006 to 2008 were compared. High similarity (>90%) was observed among some of the genomic segments, including S1 hypervariable region, which could suggest a common origin or ancestry. DNA sequences from S2 and N protein genes obtained from different infected tissues of the same flock were analyzed, and a clear segregation between respiratory and intestinal tract was...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Genética; Virus.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/865545
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Proteomic analysis of Trypanosoma cruzi response to ionizing radiation stress. Repositório Alice
VIEIRA, H. G. S. V.; GRYNBERG, P.; BITAR, M.; PIRES, S. da F.; HILÁRIO, H. O.; MACEDO, A. M.; MACHADO, C. R.; ANDRADE, H. M. de; FRANCO, G. R..
bitstream/item/115488/1/journal.pone.0097526.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Chagas; Trypanosoma Cruzi.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1005485
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Revealing new perspectives on the regulation of gene expression by the trans-splicing mechanism in Shistosoma mansoni. Repositório Alice
MOURÃO, M. M.; BITAR, M. L.; LOBO, F. P.; GRYNBERG, P.; BORONI, M.; WAISBERG, M.; MACEDO, A. M.; MACHADO, C. R.; FRANCO, G. R..
Schistosomiasis is the second most prevalent neglected tropical disease caused by a Trematode flatworm from the genus Schistosoma. Schistosomes possess a complex life cycle requiring numerous and intricate mechanisms to rule transcriptional and post-transcriptional gene regulation. Thus, it is believed that spliced leader (SL) trans-splicing could play an important role in the parasite biology. The purpose of this study was is to shed light on the function of the trans-splicing mechanism in S. mansoni by searching gene categories that could be target of this process and attempting to silence transcripts harboring the SL sequence. Here, we analyze different life stages cDNA libraries enriched on SL-transcripts of S. mansoni. Our results show that, contrary...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Expressão gênica; Gene expression; Schistosoma mansoni.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/908752
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